Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute

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Beata Stefani
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1 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute Ente capofila: Partners: Fondazione E. Mach San Michele all Adige Università di Bologna Università di Padova Università di Milano Università di Udine Centro Regionale Sviluppo Cuneo

2 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute Budget complessivo: Budget finanziato: Gruppi di lavoro: Coordinamento del progetto FEM-IASMA WP1. Sviluppo ed applicazione di tecnologie avanzate di genomica applicata, metabolomica e analisi non-invasive a supporto del breeding per resistenze genetiche e qualità del frutto (resp. FEM-IASMA) WP2. Sviluppo ed utilizzo di marcatori molecolari e selezione di nuove varietà con resistenze multiple (resp. UniUD) WP3. Nuovi approcci conoscitivi per intervenire sui punti sensibili del processo preraccolta (resp. CReSO) WP4. Ottimizzazione della filiera produttiva e tracciabilità (resp. UniBO) WP5. Qualità e salute (resp. UniPD) WP6. Trasferimento tecnologico e disseminazione dei risultati (resp. UniBO)

Sviluppo ed applicazione di tecnologie avanzate di genomica applicata, metabolomica e analisi non-invasive a supporto del breeding per resistenze genetiche e qualità del frutto (resp. FEM-IASMA) WP2.

3 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute WP 1. Conoscenza e strumenti molecolari WP2. Nuovi genotipi con resistenze genetiche e alti standard qualitativi WP3. Passaggi chiave WP4. Catena WP5. Nutraceutica e nella gestione della produttiva, tracciabilità, allergeni. Qualità e pianta in pre-raccolta standard qualitativi salute. WP 6. Trasferimento scientifico e tecnologico Data di avvio Prima rendicontazione (17 mese) il Primo audit (con esito positivo) Data fine prevista (salvo proroga)

Nutraceutica e nella gestione della produttiva, tracciabilità, allergeni. Qualità e pianta in pre-raccolta standard qualitativi salute. WP 6.

Sviluppo ed applicazione di tecnologie avanzate di genomica applicata, metabolomica e analisi non-invasive a supporto

4 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute WP1. Sviluppo ed applicazione di tecnologie avanzate di genomica applicata, metabolomica e analisi non-invasive a supporto del breeding per resistenze genetiche e qualità del frutto (resp. FEM-IASMA) Norm R RosBREEDSNP_SNP_AC_ _L g6_roscos1869_maf40_ _e Norm Theta

5 Analisi integrata per lo sviluppo della maturazione in post-raccolta delle mele Obiettivo: identificazione del set genico coinvolto nell evoluzione della texture del frutto, della produzione dei VOCs e di importanti metaboliti secondari (polifenoli) genes from the GD genome 7000 new ripening genes (RNA-seq) specific sequences 3 probes/seq.: (-27000) final probes target genes Raccolta Shelf Life (crtl vs. 1-MCP) 2 mesi Storage (crtl vs. 1-MCP) Texture Analyzer TAXT Control Golden Delicious Shelf-life Storage 1-MCP Control Granny Smith Shelf-life Storage 1-MCP Control PTR-TOF-MS (volatili) Shelf-life Storage Fuji 1-MCP Materiali: Golden Delicious Granny Smith Risultati: Analisi completate Gene set disponibile Correlazioni e network in preparazione Fonotipizzazioni texture, VOCs e metaboliti completate RNA in estrazione GC-MS (polifenoli)

: 165507 (-27000) 138207 final probes target 46098 genes Raccolta 1-2-3 Shelf Life (crtl vs. 1-MCP) 2 mesi Storage (crtl vs.

6 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute Dalla lettura del codice genetico (genoma) alle nuove varietà

7 apparenza aroma croccantezza nutraceutica

8 Durezza e croccantezza Test sperimentale Test ideale carotaggio profilo Meccanico. Acustico

9 Md-PG1 SSR _10.3Kd_297 Md-PG1 SSR _10.1Kd_ Md-PG1 SSR _10.3Kd_297 Md-PG1 SSR _10.2Kd_ o 2 presente 3 presente

2Kd_291 2 3 1 o 2 presente 3 presente 26 70 26 70 24 24 22 65 22 65

10 suscettibilità Sintomi resistenza resistenza ontogenica 2. Sviluppo ed utilizzo di marcatori molecolari e tratti qualitativi(qtl) selezione di nuove varietà con resistenze multiple geni di resistenza (resp. UniUD) 17 R-avirulenza: interazione genica identificata e distinta in tre tipologie principali 1- HR (Vm, Vh4, Vr2) Marker assisted selection (MAS) per la scab resistance Marker disponibili per 10 su 17 geni di melo resistente (Vf, Vg, Vd, Vb, Vbj, Vr2, Vm, Vh2, Vh8). Possibilità nell uso in fast breeding strategy to piramidare resistance genes in one new cultivars. 2- Stellate necrosis (Vh2, Vh8, Vg) 3- Chlorosis (Vb, Vmis, Vf) Mickael Malnoy

UniUD) 17 R-avirulenza: interazione genica identificata e distinta in tre tipologie principali 1- HR (Vm, Vh4, Vr2) Marker assisted selection (MAS) per la scab

11 Va Fine mapping in progress (FEM Vf cloned (4 LRR genes in cluster, 2 functional) Vh4, vh8 Fine mapping possible at PR Va1 Fine mapping in progress (INRA) Vr2 3 LRR candidate (ETH) TIR-NBSpotential genes Vr cloning in progress ETH geni di resistenza identificati in melo Vb cloning started at FEM Vg 5 TIR-NBS- LRR potential candidate genes (FEM) Vm cloning in progress at FEM

TIR-NBSpotential genes Vr cloning in progress ETH geni di resistenza identificati in melo Vb

12 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute WP2. Sviluppo ed utilizzo di marcatori molecolari e selezione di nuove varietà con resistenze multiple (resp. UniUD)

13 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute WP3. Nuovi approcci conoscitivi per intervenire sui punti sensibili del processo pre-raccolta (resp. CReSO)

14 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute WP4. Ottimizzazione della filiera produttiva e tracciabilità (resp. UniBO) Il DA-meter è uno strumento facile, portatile, che permette la misurazione di un paramentro, la differenza di assorbanza La differenza di assorbanza misura il contenuto in clorofilla nel frutto, che è un preciso indice del grado di maturazione del frutto

UniBO) Il DA-meter è uno strumento facile, portatile, che permette la misurazione di un paramentro, la

15 Qualità della mela nell era della post-genomica, dalla creazione di nuovi genotipi alla post-raccolta: nutrizione e salute WP5a - Nutrizione

16 WP5a - Nutrizione Esperimento carica/qualità (UniPD + FEM-IASMA) Alcuni campioni cv Pink Lady cv Golden Delicious cv Fuji

17 WP5b - Allergeni Sono stati raccolti i sieri di 28 pazienti con differenti profili clinici di allergia alla mela (UniPD in collaborazione con un allergologo). I sieri sono in corso di valutazione sugli estratti di mela, al fine di creare dei pool da sieri con profili immunologici simili (UniPD). I pool saranno impiegati per valutare in vitro l allergenicità di diversi campioni di mela raccolti da 24 cultivar con caratteristiche diverse e altri campioni di interesse per il progetto (UNIPD + UNIBO). Sono in corso test cutanei per verificare l allergenicità in vivo di campioni di mela (UniBO).

I sieri sono in corso di valutazione sugli estratti di mela, al fine di creare dei pool da sieri con profili immunologici simili (UniPD).

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