Manifesto degli Studi del Corso di Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale a.a

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1 CIBIO - Centre for Integrative Biology Manifesto degli Stu del Corso Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale a.a Approvato dal Consiglio del Centro Biologia Integrata dd. 16/05/2018 Approvato dal Dipartimento Ingegneria e Scienza dell Informazione dd. 26/02/2018 Approvato dal Dipartimento Matematica dd. 28/02/2018 Approvato dal Dipartimento Fisica dd. 06/03/ Attivazione Nell anno accademico 2018/2019 è attivato presso il Centro per la Biologia Integrata (CIBIO) il Corso Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale appartenente alla classe LM-8 Biotecnologie Industriali. Il stuo è attivato con tre strutture dattiche associate: il Dipartimento Ingegneria e Scienza dell Informazione, il Dipartimento Matematica e il Dipartimento Fisica. 2. Requisiti per l accesso al e norme ammissione Per essere ammessi al Corso Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale occorre essere in possesso un titolo Laurea primo livello nelle seguenti scipline e relative classi laurea: Biotecnologie (L-2), Ingegneria dell Informazione (L-8), Scienze biologiche (L-13), Scienze e tecnologie agro-alimentari (L-26), Scienze e tecnologie chimiche (L-27), Scienze e tecnologie farmaceutiche (L-29), Scienze e tecnologie fisiche (L-30), Scienze e tecnologie informatiche (L-31), Scienze matematiche (L-35), ovvero altro titolo stuo conseguito all'estero e riconosciuto idoneo. Per informazioni più dettagliate consultare il regolamento dattico sul sito web del laurea magistrale ( Vista la caratteristica innovativa dei contenuti e dei meto del, considerata la sponibilità limitata attrezzature e laboratori scientifici per lo svolgimento del tirocinio e quin il numero limitato tirocini attivabili, i Consigli del Centro Biologia Integrata, del Dipartimento Ingegneria e Scienza dell Informazione, del Dipartimento Matematica e del Dipartimento Fisica dell'università Trento hanno accertato che la sponibilità ad accogliere studenti per questo Corso Laurea nell'anno accademico 2018/2019 non può essere superiore a Attività formative previste per l a.a 2018/19 per gli studenti iscritti dall a.a. 2018/19 L'offerta dattica è organizzata in tre percorsi detti "Biotechnological Track", "Computational Track" e Physical Track, che offrono l opportunità agli studenti integrare il proprio background a seconda della preparazione in ingresso. I tre percorsi fferenziano l'offerta dattica con una maggior attenzione rispettivamente ai contenuti biotecnologici, a quelli delle scienze dell informazione e a quelli biofisici. Le lezioni del I anno inizieranno martedì 25 settembre Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 1 12

2 INSEGNAMENTI OBBLIGATORI - PERCORSO BIOTECNOLOGICAL TRACK Coce Denominazione dell insegnamento T.A.F. all attività dattica CFU SSD Periodo Partizionamento/ Sdoppiamento Docente Biostatistics Mod. Biostatistics and Probability 6 MAT/ A. Pugliese Mod. Biostatistical Computing 6 INF/ O. Kahramanogullari Scientific Programming Mod. Programming 24 ore lab 6 INF/ A. Montresor Mod. Algorithms and Data Structures 24 ore lab. 6 INF/ A. Montresor Genomics Mod. Computational Human Genomics 20 ore front. 28 ore lab. 6 BIO/ F. Demichelis A. Romanel Mod. Computational Microbial Genomics 24 ore lab. 6 BIO/ N. Segata Biotechnology Engineering Mod. Genetic and Metabolic Engineering 36 ore front. 12 ore lab. 6 ING- IND/ M. Hanczyc Mod. Tissue Engineering 40 ore front. 8 ore lab. 6 ING- IND/ A. Motta English B2 Ulteriori attività formative 33 3 L-LIN/ CLA Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 2 12

3 In aggiunta ai corsi obbligatori, gli studenti del per Biotechnological Track acquisiscono almeno altri 36 creti (3 corsi) a scelta vincolata elencati nella tabella seguente. INSEGNAMENTI A SCELTA VINCOLATA PERCORSO BIOTECHNOLOGICAL TRACK Coce Denominazione dell insegnamento T.A.F. all attività dattica CFU SSD Periodo Partizionamento/ Sdoppiamento Docente Molecular Physics Mod. Quantum mechanics 48 ore front. 6 FIS/01 Mod. Quantum chemistry 48 ore front. 6 FIS/ P. Faccioli --- P. Faccioli Bioinformatics Mod. Algorithms for Bioinformatics In convisione con LM Informatica 0517H, cod ING- --- E. Blanzieri Mod. Bioinformatic Resources In convisione con LM Informatica 0517H, cod ore lab. 6 INF/ A. Romanel Biological Networks and Data Analysis Mod. Network-based Data Analysis 6 INF/ M. Lauria Mod. Network Modeling and Simulation 48 ore front. 6 INF/ O. Kahramanogullari Computational Biophysics Mod. Physical Modeling in Biomolecules 48 ore front. 6 FIS/ Lattanzi Mod. Computer Simulations of Biomolecules 8 ore front. 40 ore lab. 6 FIS/ Lattanzi Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 3 12

4 Data Mining Mod. Machine Learning In convisione con LM Informatica 0517H, cod INF/ A. Passerini Mod. Laboratory of Biological Data Mining 6 ING- --- E. Blanzieri Mathematical Modeling Mod. Mathematical Modeling in Biology 6 MAT/ A. Pugliese Mod. Spatio-temporal Models in Cell and Tissue Biology 6 MAT/ A. Pugliese Biotechnology Management and Regulations Mod. Economics and Management 48 ore front. 6 SECS- P/ M. Bannò Mod. Biotechnology Regulations 48 ore front. 6 IUS/ M. Maffeis Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 4 12

5 INSEGNAMENTI OBBLIGATORI - PERCORSO COMPUTATIONAL TRACK Coce Denominazione dell insegnamento T.A.F. all attività dattica CFU SSD Periodo Partizionamento/ Sdoppiamento Docente Molecular Biology of the Cell Mod. Molecular Basis of Cell Structure and Function 48 ore front. 6 BIO/ L. Tiberi Mod. Cellular and Molecular Dynamics 48 ore front. 6 BIO/ G. Piccoli Chemistry and Biochemistry Mod. General and Organic Chemistry 48 ore front. 6 CHIM/ G. Lolli Mod. Analytical Chemistry and Biochemistry Biological Networks and Data Analysis 48 ore front. 6 CHIM/ E. Biasini Mod. Network-based Data Analysis 6 INF/ M. Lauria Mod. Network Modeling and Simulation 48 ore front. 6 INF/ O. Kahramanogullari Mathematical Modeling Mod. Mathematical Modeling in Biology 6 MAT/ A. Pugliese Mod. Spatio-temporal Models in Cell and Tissue Biology 6 MAT/ A. Pugliese English B2 Ulteriori attività formative 33 3 L-LIN/ CLA Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 5 12

6 In aggiunta ai corsi obbligatori, gli studenti del per Computational Track acquisiscono almeno altri 36 creti (3 corsi) a scelta vincolata elencati nella tabella seguente. INSEGNAMENTI A SCELTA VINCOLATA PERCORSO COMPUTATIONAL TRACK Coce Denominazione dell insegnamento T.A.F. all attività dattica CFU SSD Periodo Partizionamento/ Sdoppiamento Docente Molecular Physics Mod. Quantum mechanics 48 ore front. 6 FIS/01 Mod. Quantum Chemistry 48 ore front. 6 FIS/ P. Faccioli --- P. Faccioli Bioinformatics Mod. Algorithms for Bioinformatics In convisione con LM Informatica 0517H, cod ING- --- E. Blanzieri Mod. Bioinformatic Resources In convisione con LM Informatica 0517H, cod ore lab. 6 INF/ A. Romanel Computational Biophysics Mod. Physical Modeling of Biomolecules 48 ore front. 6 FIS/ Lattanzi Mod. Computer Simulations of Biomolecules 8 ore front. 40 ore lab. 6 FIS/ Lattanzi Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 6 12

7 Data Mining Mod. Machine Learning In convisione con LM Informatica 0517H, cod INF/ A. Passerini Mod. Laboratory of Biological Data Mining 6 ING- --- E. Blanzieri Biotechnology Management and Regulations Mod. Economics and Management 48 ore front. 6 SECS- P/ M. Bannò Mod. Biotechnology Regulations 48 ore front. 6 IUS/ M. Maffeis Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 7 12

8 INSEGNAMENTI OBBLIGATORI - PERCORSO PHYSICAL TRACK Coce Denominazione dell insegnamento T.A.F. all attività dattica CFU SSD Periodo Partizionamento/ Sdoppiamento Docente Molecular Biology of the Cell Mod. Molecular Basis of Cell Structure and Function 48 ore front. 6 BIO/ L. Tiberi Mod. Cellular and Molecular Dynamics 48 ore front. 6 BIO/ G. Piccoli Analytical Chemistry and Biochemistry 48 ore front. 6 CHIM/ E. Biasini Algorithms and Data Structures ore lab. 6 INF/ A. Montresor Genetic and Metabolic Engineering ore front. 12 ore lab. 6 ING- IND/ M. Hanczyc Machine Learning In convisione con LM Informatica 0517H, cod INF/ A. Passerini Computational Biophysics Mod. Physical Modeling in Biomolecules 48 ore front. 6 FIS/ Lattanzi Mod. Computer Simulations of Biomolecules 8 ore front. 40 ore lab. 6 FIS/ Lattanzi English B2 Ulteriori attività formative 33 3 L-LIN/ CLA Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 8 12

9 In aggiunta ai corsi obbligatori, gli studenti del per Physical Track acquisiscono almeno altri 36 creti a scelta vincolata (3 corsi da 12 CFU, o 2 corsi da 12CFU e due corsi da 6CFU) elencati nella tabella seguente. INSEGNAMENTI A SCELTA VINCOLATA PERCORSO PHYSICAL TRACK Coce Denominazione dell insegnamento T.A.F. all attività dattica CFU SSD Periodo Partizionamento/ Sdoppiamento Docente Programming ore lab 6 INF/ A. Montresor Bioinformatics Mod. Algorithms for Bioinformatics In convisione con LM Informatica 0517H, cod ING- --- E. Blanzieri Mod. Bioinformatic Resources In convisione con LM Informatica 0517H, cod ore lab. 6 INF/ A. Romanel Biological Networks and Data Analysis Mod. Network-based Data Analysis 6 INF/ M. Lauria Mod. Network Modeling and Simulation Theoretical methods for soft matter Mod. Statistical field theory In convisione con LM Fisica 0518H cod Mod. Multi-scale methods in soft matter In convisione con LM Fisica 0518H cod ore front. 6 INF/01 48 ore front. 6 FIS/02 48 ore front. 6 FIS/03 s emestre --- O. Kahramanogullari --- P. Faccioli --- R. Potestio Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 9 12

10 Laboratory of Biological Data Mining 48 6 ING- --- E. Blanzieri Mathematical Modeling Mod. Mathematical Modeling in Biology 6 MAT/ A. Pugliese Mod. Spatio-temporal Models in Cell and Tissue Biology 6 MAT/ A. Pugliese Biotechnology Management and Regulations Mod. Economics and Management 48 ore front. 6 SECS- P/ M. Bannò Mod. Biotechnology Regulations 48 ore front. 6 IUS/ M. Maffeis Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 10 12

11 CORSI A LIBERA SCELTA DELLO STUDENTE 12 CREDITI La lista degli esami si completa con almeno 12 creti a scelta libera fra tutti i corsi attivi presso il Centro Biologia Integrata, il Dipartimento Ingegneria e Scienza dell Informazione, il Dipartimento Fisica e il Dipartimento Matematica. Possono anche essere scelti corsi dei percorsi Biotechnological Track, Computational Track o Physical Track non inseriti nel proprio piano stu o corsi attivi presso altri Dipartimenti o Centri, meante approvazione del piano degli stu. Gli insegnamenti a scelta offerti agli studenti sono: ATTIVITÀ FORMATIVE A LIBERA SCELTA Coce Denominazione dell insegnamento all attività dattica CFU SSD Periodo Docente High Throughput Technology In convisione con LM Biotecnologie cellulari e molecolari 0520H, cod ore lab 6 BIO/13 M. Denti Genomics and Drug Discovery In convisione con LM Biotecnologie cellulari e molecolari 0520H, cod BIO/10 E. Domenici Knowledge and Data Integration In convisione con LM Ing. Inf. e Com. 0340H, cod ING- da definire Digital signal processing In convisione con LM Ing. Inf. e Com. 0340H, cod ING- INF/03 da definire Computational Physics In convisione con LM Fisica 0518H, cod FIS/04 F. Pederiva Statistics of Stochastic Processes In convisione con LM Matematica 0519H, cod MAT/06 C. Agostinelli Bayesian Statistics In convisione con LM Matematica 0519H, cod SECS-S/01 C. Agostinelli, P. Novi Inverar Gli insegnamenti sopra elencati e quelli suggeriti dallo strumento compilazione dei piani stuo ESSE3 sono approvati automaticamente. In tutti gli altri casi, è necessaria la compilazione un piano stuo cartaceo che sarà valutato dalla struttura dattica responsabile. Il Consiglio del Centro Biologia Integrata si riserva la facoltà non attivare i corsi a scelta elencati nella precedente tabella per i quali non si riscontrino almeno 5 opzioni. Agli studenti sarà richiesto in tempo utile presentare il piano stu. Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 11 12

12 TIROCINIO 6 CREDITI (INTERNSHIP) - cod Il tirocinio rappresenta un esperienza formativa professionalizzante, coerente con il per stuo seguito dagli studenti iscritti al laurea magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale. Il tirocinio ha il duplice scopo consentire allo studente un riscontro ed un arricchimento delle nozioni apprese nel degli stu universitari e orientare le future scelte professionali; consiste in un attività formazione o collaborazione alla ricerca svolta presso le strutture accademiche dell Università Trento (tirocinio interno) o presso un azienda, altre Università o altri enti convenzionati esterni all Università, Italiani o esteri (tirocinio esterno). Al tirocinio vengono attribuiti 6 creti. Il tirocinio è obbligatorio e norma legato allo svolgimento della prova finale. Le modalità accesso, svolgimento e valutazione del tirocinio sono sciplinate nel Regolamento delle attività tirocinio, approvato dai Consigli delle strutture accademiche coinvolte. PROVA FINALE 15 CREDITI (FINAL THESIS) - cod Per essere ammessi alla prova finale occorre avere conseguito tutti i creti previsti nelle altre attività formative del piano degli stu. Alla prova finale sono riservati 15 creti. La prova finale consiste nella realizzazione un progetto sperimentale, nella stesura una tesi ed un esame finale. Il lavoro tesi ha come obiettivo portare lo studente a retto contatto con un argomento frontiera della ricerca in Biologia Quantitativa e Computazionale e fornisce l opportunità allo studente contribuire personalmente all avanzamento della ricerca. In generale la prova finale ha lo scopo verificare la maturità scientifica raggiunta al termine del laurea magistrale. Le procedure per l ammissione all esame finale, i criteri per la formazione del voto laurea, le modalità presentazione dell elaborato finale, la composizione della commissione valutazione sono sciplinati nel Regolamento per lo svolgimento della prova finale, approvato dai Consigli delle strutture accademiche coinvolte ( ***** I programmi dettagliati dei corsi e le modalità valutazione sono resi pubblici all'inizio dell'anno accademico. Per tutto quello non espressamente scritto nel manifesto fa fede il regolamento dattico del Corso Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale. Manifesto degli Stu a.a. 2018/19 Laurea Magistrale in Biologia Quantitativa e Computazionale Pagina 12 12