Alessandra Giorgi, PhD

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1 Alessandra Giorgi, PhD 1999: laurea in Scienze Biologiche (110/110 e lode) presso l Università di Roma La Sapienza (tesi sperimentale in biochimica, dal titolo Regolazione in vivo dell espressione dei peptidi antimicrobici in Rana esculenta 2000: contratto di collaborazione coordinata e continuativa erogato dal Dipartimento di S. Biochimiche A. Rossi Fanelli 2001: abilitazione all esercizio della professione di Biologo 2001: borsa di studio, erogata dall Istituto Pasteur Fondazione Cenci Bolognetti, svolta presso il laboratorio della prof.ssa Donatella Barra A.a : conseguimento Dottorato di Ricerca in Biochimica, XV ciclo 2002: stage volto all apprendimento di strumentazioni tipo spettrometria di massa, presso Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Southern Denmark, Odense : assegno di ricerca, settore disciplinare BIO/10, erogato dalla II Facoltà di Medicina e Chirurgia dell Università degli Studi di Roma Sapienza, sulla caratterizzazione di peptidi antimicrobici da anfibi : contratto di collaborazione coordinata e continuativa, erogato dal Dipartimento di S. Biochimiche, sullo studio proteomico dei fattori proteici che regolano le interazioni tra apparato mitotico ed involucro nucleare, nell ambito del progetto di Cooperazione Scientifica e Tecnologica degli accordi Italia-Israele FIRB oggi: Tecnico, dell area tecnico-scientifica ed elaborazione dati, categoria D, posizione economica D3, contratto a tempo indeterminato, in servizio presso il Dipartimento di Scienze Biochimiche A.Rossi Fanelli, Università Sapienza A.a : affidamento dell incarico per l insegnamento di Proteomics, in lingua inglese, 3CFU, A.a : affidamento dell incarico per l insegnamento di Proteomics, in lingua inglese, 3CFU, A.a : affidamento dell incarico per l insegnamento di Proteomics, in lingua inglese, 3CFU, Membro della Società Italiana di Biochimica (SIB) Cultore della materia nelle commissioni d esame di Chimica Biologica (corso di laurea in Odontoiatria e protesi dentaria) e Struttura, Biosintesi ed Analisi delle Proetine (S. Biologiche) Partecipazione, anche in qualità di relatore, a congressi nazionali ed internazionali e a corsi teoricopratici incentrati sulla proteomica e sulla spettrometria di massa Interessi scientifici principali: l attività scientifica è da sempre orientata allo sviluppo, ottimizzazione ed applicazione di metodologie per l'identificazione e la caratterizzazione strutturale e funzionale di molecole proteiche e peptidiche da matrici biologiche complesse mediante tecniche biochimiche (separazione di miscele proteiche mediante elettroforesi mono e bidimensionale, separazione di miscele peptidiche mediante cromatografia, processamento enzimatico delle componenti proteiche sia in miscela che dopo separazione, analisi del peptide mass fingerprint ed analisi della struttura primaria di catene polipeptidiche mediante spettrometria di massa, con strumentazione di tipo MALDI-ToF ed ESI-LTQ-Orbitrap) nonché per la caratterizzazione di acidi nucleici mediante

2 spettrometria di massa. In particolare, l attività è inserita in varie collaborazioni incentrate sullo studio delle neuro degenerazioni da sistemi modello e sullo studio delle origini della vita. Pubblicazioni rilevanti dal 2008 Giorgi A., Mignogna G., Bellapadrona G., Gattoni M., Chiaraluce R., Consalvi V., Chiancone E., and Stefanini S. The unusual co-assembly of H- and M-chains in the ferritin molecule from the Antarctic teleosts Trematomus bernacchii and Trematomus newnesi. Arch Biochem Biophys 2008 Oct 1;478(1):69-74 IF: Gorlero M, Wieczorek R, Adamala K, Giorgi A, Schininà ME, Stano P, Luisi PL. Ser-His catalyses the formation of peptides and PNAs. FEBS Lett Jan 5;583(1): IF: Giorgi A., Di Francesco L., Principe S., Mignogna G., Sennels L., Mancone C., Alonzi T., Sbricioli M., De Pascalis A., Rappsilber J., Cardone F., Pocchiari M., Maras B. and Schinina` M.E. Proteomic profiling of PrP27-30-enriched preparations extracted from the brain of hamsters with experimental scrapie Proteomics 2009, 9, 1 13 A.M. Mileo, C. Abbruzzese, S. Mattarocci, E. Bellacchio, P. Pisano, A. Federico, V. Maresca, M. Picardo, A. Giorgi, B. Maras, M.E. Schinina`, M.G. Paggi Human Papillomavirus-16 E7 Interacts with Glutathione S-Transferase P1 and Enhances Its Role in Cell Survival PLoS One Oct 13; 4(10):e7254 Canettieri G, Di Marcotullio L, Greco A, Coni S, Antonucci L, Infante P, Pietrosanti L, De Smaele E, Ferretti E, Miele E, Pelloni M, De Simone G, Pedone EM, Gallinari P, Giorgi A, Steinükhler C, Vitagliano L, Pedone C, Schininà ME, Screpanti I, Gulino A Histone Deacetylase and Cullin3/RENKCTD11 Ubiquitin Ligase interplay regulates Hedgehog signaling through Gli acetylation Nat Cell Biol Feb;12(2): Epub 2010 Jan 17. IF: Perluigi M., Di Domenico F., Giorgi A., Schininà M.E., Coccia R., Cini C., Bellia F., Cambria M., Cornelius C., Butterfield A.D., Calabrese V. Redox proteomics in aging rat brain: involvement of mitochondrial GSH status and mitochondrial protein oxidation in the aging process. Journal of Neuroscience Research 2010 Dec; 88(16): Neri A., Mignogna G., Fazio C., Giorgi A., Schininà M.E. and Stefanelli P. Neisseria meningitidis rifampicin resistant strains: analysis of protein differentially expressed BMC Microbiology 2010 Sep 24;10(1):246 IF: 2.99 Pino S., Costanzo G., Giorgi A. and Di Mauro E. Sequence complementarity-driven non-enzymatic ligation of RNA Biochemistry, 2011, Apr 12;50(14): IF: Perluigi M., Di Domenico F, Fiorini A., Cocciolo A., Giorgi A, Foppoli C., Butterfield D.A., Giorlandino C., Schininà M.E., and Coccia R. Oxidative stress occurs early in Down Syndrome pregnancy: a redox proteomics analysis of amniotic fluid Proteomics Clin Appl Feb 16.

3 Palermo R., Checquolo S., Giovenco A., Ferrara G., Kumar V., Grazioli P., Campese A. F., Giorgi A., Napolitano M., Canettieri G., Schininà M.E., Maroder M., Frati L., Gulino A., Vacca A., and Screpanti I. Acetylation/deacetylation balance controls Notch3 stability and function in T Cell Acute Lymphoblastic Leukemia. Oncogene, 2011 Nov 28 IF: Costanzo G., Saladino R., Botta G., Giorgi A., Scipioni A., Pino S and Di Mauro E. Generation of RNA Molecules by a Base-Catalysed Click-Like Reaction ChemBioChem 30 MAR 2012 DOI: /cbic Rinaldo C., Moncada A., Gradi A., Ciuffini L., D Eliseo D., Siepi F., Giorgi A., Pierantoni G.M., Prodosmo A., Trapasso F., Guarguaglini G., Cundari E., Schininà M.E., Fusco A., and Soddu S. HIPK2 Controls Cytokinesis through Histone H2B Phosphorylation at the Midbody Molecular cell, 2012 May 31 IF: Di Domenico F., Coccia R., Cocciolo A., Murphy M.P., Cenini G., Head E., Butterfield D.A., Giorgi A., Schininà M.E., Mancuso C., Cini C., and Perluigi M. Impairment of proteostasis network in down syndrome prior to the development of Alzheimer s disease neuropathology: redox proteomics analysis of human brain. BBA - Molecular basis of disease, 2013; 1832(8): doi: /j.bbadis Fiorini A, Koudriavtseva T, Bucaj E, Coccia R, Foppoli C, Giorgi A, Schininà ME, Di Domenico F, De Marco F, Perluigi M. Involvement of oxidative stress in occurrence of relapses in multiple sclerosis: the spectrum of oxidatively modified serum proteins detected by proteomics and redox proteomics analysis. PloSOne, 2013 Jun 7;8(6):e doi: Pino S., Costanzo G., Giorgi A., Sponer J.E., Sponer J., Di Mauro E. Ribozyme Activity of RNA Nonenzymatically Polymerized from 3ʹ,5ʹ-Cyclic GMP Entropy 2013, 15(12), doi: /e IF: Di Domenico F., Pupo G., Tramutola A., Giorgi A., Schininà M.E., Coccia R., Head E., Butterfield D.A., Perluigi M. Redox proteomics analysis of HNE-modified proteins in DS brain: clues for understanding development of Alzheimer disease Free Radic Biol Med Jun; 71: doi: /j.freeradbiomed Lori C., Pasquo A., Montanari R., Capelli D., Consalvi V., Chiaraluce R., Cervoni L., Loiodice F., Laghezza A., Aschi M., Giorgi A., and Pochetti G. Structural basis of the transactivation deficiency oh human PPARγ F360L mutant associated with familial partial lipodystrophy Acta Crystallographica Section D, 2014 Jul 1; 70(Pt7): doi: /S IF: 2.68 Giardina G., Brunotti P., Fiascarelli A., Cicalini A., Costa M.G., Buckle A.M., di Salvo M.L., Giorgi A., Marani M., Paone A., Rinaldo S., Paiardini A., Contestabile R., Cutruzzola F. How pyridoxal 5 -phosphate differentially regulates human cytosolic and mitochondrial serine hydroxymethyltransferase oligomeric state FEBS Journal, 2015 Jan 25. doi: /febs IF: Correani V., Di Francesco L., Cera I., Mignogna G., Giorgi A., Mazzanti M., Fabrizi C., Maras B., Schininà M.E. Reversible redox modifications in microglia proteome challenged by beta amyloid Mol Biosyst Jun;11(6): doi: /c4mb00703d Sponer JE, Sponer J, Giorgi A, Di Mauro E, Pino S, Costanzo GM.

4 Untemplated Non-Enzymatic Polymerization of 3',5' cgmp: A Plausible Route to 3',5'-Linked Oligonucleotides in Primordia. J Phys Chem B Feb 19;119(7): doi: /acs.jpcb.5b Rossi S., Serrano A., Gerbino V., Giorgi A., Di Francesco L., Nencini M., Bozzo F., Schinina' M.E., Bagni C., Cestra G., Carri' M.T., Achsel T., and Cozzolino M. Nuclear accumulation of mrnas underlies G4C2 repeat-induced translational repression in a cellular model of C9orf72 ALS Journal of Cell Science, 2015 may 1; 128(9): IF: Cattaneo L., Cicconi R., Mignogna G., Giorgi A., Mattei M., Graziani G., Ferracane R., Grosso A., Aducci P., Schininà M.E., Marra M. Anti-proliferative Effect of Rosmarinus officinalis L. Extract on Human Melanoma A375 Cells PlosOne, 2015 Jul 15;10(7):e doi: Di Domenico F., Pupo G., Giraldo E., Lloret A., Badìa M.C., Schininà M.E., Giorgi A., Allan Butterfield D., Viña J., Perluigi M. Autoantibodies Profile in Matching CSF and Serum from AD and amci patients: Potential Pathogenic Role and Link to Oxidative Damage. Curr Alzheimer Res Dec 18. Spadaccio C., Coccia R., Perluigi M., Pupo G., Schininà M.E., Giorgi A., Blarzino C., Nappi F., Sutherland F.W., Chello M., and Di Domenico F. Redox proteomics analysis of serum from aortic aneurysm patients: insights on oxidation of specific protein target. Molecular BioSystems, 2016 apr 28 Cutone A., Howes B., Miele A., Miele R., Giorgi A., Battistoni A., Smulevich G., Musci G., and Bonaccorsi di Patti M.C. Pichia pastoris Fep1 is a [2Fe-2S] protein with a Zn finger that displays an unusual oxygen-dependent role in cluster binding. Sci Rep Aug 22;6: doi: /srep31872 Paiardini A., Tramonti A., Schirch D., Guiducci G., di Salvo M.L., Fiascarelli A., Giorgi A., Maras B., Cutruzzolà F., Contestabile R., Differential 3-Bromopyruvate Inhibition of Cytosolic and Mitochondrial Human Serine Hydroxymethyltransferase Isoforms, Key Enzymes in Cancer Metabolic Reprogramming. Biochim Biophys Acta Aug 13; 1864(11): doi: /j.bbapap Tramutola A., Di Domenico F., Barone E., Giorgi A., Di Francesco L., Schinina E., Coccia R., Arena A., Head E., Butterfield D.A., Perluigi M.. Poly-Ubiquitinylation Profile in Down Syndrome Brain before and after the Development of Alzheimer Neuropathology. Antioxid Redox Signal Sep 14. [Epub ahead of print] Petrosino M., Lori L., Pasquo A., Lori C., Consalvi V., Minicozzi V., Morante S., Laghezza A., Giorgi A., Capelli D., Chiaraluce R. Single-Nucleotide Polymorphism of PPARγ, a Protein at the Crossroads of Physiological and Pathological Processes. Int J Mol Sci Feb 10;18(2). pii: E361. doi: /ijms Costanzo G, Giorgi A, Scipioni A, Timperio AM, Mancone C, Tripodi M, Kapralov M, Krasavin E, Kruse H, Sponer J, Sponer JE1, Ranc V, Otyepka M, Pino S, Di Mauro E. Non-Enzymatic Oligomerization of 3',5' Cyclic CMP Induced by Proton- and UV-Irradiation Hints at a Non-Fastidious Origin of RNA

5 Chembiochem May 4. doi: /cbic [Epub ahead of print] Giorgi A., Tempera I., Napoletani G., Drovandi D., Potesta` C., Martire S., Mandosi E., Filardi T., Schinina` M.E., Morano S., d Erme M., Maras B. Poly(ADP-ribosylated) proteins in mononuclear cells from patients with type 2 diabetes identified by proteomic studies Acta Diabetol, 2017 Jun 12. DOI /s y Correani V., Di Francesco L., Mignogna G., Fabrizi C., Leone S., Giorgi A., Passeri A., Casata R., Fumagalli L., Maras B., Schininà M.E. Plasma membrane protein profiling in beta-amyloid-treated microglia cell line. Proteomics 2017 Aug 16. doi: /pmic Capuozzo E., Giorgi A., Canterini S., Baseggio Conrado A., Giarrusso P., Schininà M.E., Fontana M. A Proteomic Approach to Study the Effect of Thiotaurine on Human Neutrophil Activation Adv Exp Med Biol. 2017;975: doi: / _44. Scaglione A., Monteonofrio L., Parisi G., Cecchetti C., Siepi F., Rinaldo C., Giorgi A., Verzili D., Zamparelli C., Savino C., Soddu S., Vallone B., Montemiglio LC. Effects of Y361-auto-phosphorylation on structural plasticity of the HIPK2 kinase domain. Protein Sci Mar;27(3): doi: /pro IF: 2.42 Correani V, Martire S, Mignogna G, Caruso LB, Tempera I, Giorgi A, Grieco M, Mosca L, Schininà ME, Maras B, d'erme M. Poly(ADP-ribosylated) proteins in β-amyloid peptide-stimulated microglial cells. Biochem Pharmacol Nov 9. pii: S (18) doi: /j.bcp IF: Antonucci L, Di Magno L, D'Amico D, Manni S, Serrao SM, Di Pastena F, Bordone R, Yurtsever ZN, Caimano M, Petroni M, Giorgi A, Schininà ME, Yates Iii JR, Di Marcotullio L, De Smaele E, Checquolo S, Capalbo C, Agostinelli E, Maroder M, Coni S, Canettieri G Mitogen-activated kinase kinase kinase 1 inhibits hedgehog signaling and medulloblastoma growth through GLI1 phosphorylation. Int J Oncol Feb;54(2): doi: /ijo Epub 2018 Nov 19. IF: Cocchiola R, Rubini E, Altieri F, Chichiarelli S, Paglia G, Romaniello D, Carissimi S, Giorgi A, Giamogante F, Macone A, Perugia G, Gurtner A, Eufemi M STAT3 Post-Translational Modifications Drive Cellular Signaling Pathways in Prostate Cancer Cells Int. J. Mol. Sci. 2019, 20, 1815; doi: /ijms IF: 4.183