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85 Executable = "extract.sh"; Arguments = " "; 1 StdOutput StdError = "extract.out"; = "extract.err"; 2 3 InputSandbox = {"extract.sh","extract.exe","cnaflist.ffl","x.509up_u1000"}; OutputSandbox = {"extract.out","extract.err"}; 4 Requirements = Member(other.RunTimeEnvironment,"VIRGO1.0") && other.ceid =="dell10.cnaf.infn.it:2119/jobmanager-pbs-workq"; 0!

86 < 2"(B( 2"(41GEEH )5GE)HP41);" " GEEH;1 5 61( (;" ;(("8A GE)H;4 " 0,

87 ####### Shell script extract.sh # #!/bin/sh # # Memorizza il nome della directory corrente nella # variabile curdir # curdir=`pwd` # # Memorizza il contenuto del certificato proxy nella # variabile myproxy # myproxy=`echo $X.509_USER_PROXY` # # Assegna i diritti di accesso al certificato proxy # chmod u+r ${curdir}/x.509up_u1000 chmod go-rwx ${curdir}/x.509up_u1000 # # Esporta il contenuto della variabile X.509_USER_PROXY # export X.509_USER_PROXY=${curdir}/X.509up_u1000 # # Assegna un nome al file di output # outfile=`echo V-$1-$2.out` # # Esegue l estrazione dei dati con il programma # extract.exe # echo $outfile $curdir/extract.exe cnaflist.ffl $1 $2 $outfile # # Copia i dati estratti in una directory dello # Storage Element # cp $outfile /flatfile/virgo # # # # Pubblica i dati estratti sul Replica Catalogue # globus-job-run dell11.cnaf.infn.it /bin/bash -c 'export LD_LIBRARY_PATH=/opt/globus/lib:/opt/edg/lib:/usr/local/lib; gdmp_register_local_file -d /flatfile/virgo' # globus-job-run dell11.cnaf.infn.it /bin/bash -c 'export LD_LIBRARY_PATH=/opt/globus/lib:/opt/edg/lib:/usr/local/lib; gdmp_publish_catalogue' 0&

88 < GEBH 1 6GEH86GEH8B( < '; 1; 4 2 ) 2 /(E 2% /(E B( < GH 24 2 G3!:ZHE7 <+;;AB( 1 ) F> ) B(1"" ))((1( ( G# $%H4GH 6) A /" F"8 A 2B(1C" /" ; 1 R 5 1 " '8 4 Y*)1B(22" ) 9 ( 2"( 2" )9) G EH 5 6 G 5H8;"5 6 G"H8 Y*; )) G BH1C" 00

89 Executable = "compute.sh"; Arguments = "template-200"; 1 StdOutput StdError = "mf.out"; = "mf.err"; 2 3 InputData = "LF:V out"; 4 InputSandbox = {"compute.sh","x.509up_u1000","mf.exe","template-200", "Mf.cfg","LFN2PFN.pl"}; OutputSandbox = {"mf.out","mf.err"}; 5 ReplicaCatalog = "ldap://grid011g.cnaf.infn.it:9011/rc=virgo Testbed1 Replica Catalog,dc=grid011g,dc=cnaf,dc=infn,dc=it"; 6 DataAccessProtocol = "gridftp"; Rank = other.freecpus; 7 Requirements = Member(other.RunTimeEnvironment,"VIRGO1.0"); 0:

90 < 2"(B( 6 8)A ;2"(4)5; G )H;); 1 "( 2" ) 9; " 6 1( (; 5 "9< )79< ;5 /" " 1C " B(8 G )H 4 5 " ####### Shell script compute.sh # #!/bin/sh # # Memorizza il nome della directory corrente nella # variabile curdir # curdir=`pwd` # # Memorizza il contenuto del certificato proxy nella # variabile myproxy # myproxy=`echo $X.509_USER_PROXY` # # Assegna i diritti di accesso al certificato proxy # chmod u+r ${curdir}/x.509up_u1000 chmod go-rwx ${curdir}/x.509up_u1000 # # Esporta il contenuto della variabile X.509_USER_PROXY # export X.509_USER_PROXY=${curdir}/X.509up_u1000 # # Effettua la traduzione da LFN a PFN del file di input # pfn=`$curdir/lfn2pfn.pl` # # # Trasferisce il file di input dallo Storage Element # al Computing Element # /opt/globus/bin/globus-url-copy $pfn file://`/bin/hostname`$curdir/file.input # # # Esegue l algoritmo Matched Filter # $curdir/mf.exe Mf.cfg $1 file.input :

91 <G BH 1 6G H86G H8B( <';1;4"9< ;" 9 < )7 9 < 4 2 G )H; ) 5 G9<9<H 1 9< 9< 4 F>; 2 B( 2F 1 9< ; ; 7 G(>H ) 57 2 "? 5G9<9<H) ""9<5 G(>H <+; GEBH45 2 ) 2 /(E 2% /(EB( <! 4 " ) 2" <, ( /" " 6"86>8 " "B(69? )4()B("N? 8 < &; ; 4 2 A 2 B(# ) ) 2F ) B( )((1( ( G# $%H B( P )5"? J" ;1 G"5B(5( H G BH 1; " 1; A 1 2 ) 9 1 (; " G"5B(5( H; 1 "; * 6 *8;)1 B(2" 1 *4(;""""=F>>" :

92 G"5B(5H; B(?()5)" B(4" ######### Shell-script submit.sh # #!/bin/sh # # # # Viene assegnato un nome ad un file contenente i PID # dei job sottomessi alla grid # TIMESTAMP=`date +%s` JOBLIST=`echo dgjoblist-$timestamp` # # # La directory templates-archive contiene tutti i # sottoinsiemi di template # for TEMPLATE_FILE in `ls -1 templates-archive`; do cp -f templates-archive/$template_file./template-200 /opt/edg/bin/dg-job-submit compute.jdl -output $JOBLIST rm -f template-200 sleep 2 done :

93 %#.!!#7.#;"#%!! &# " B( "((""5 1 1 " " "? 1"?")""""4;1; A " 1 5 (C 1 1? ; ; 4 1 " <9<5$ G.(H "" ' '& 6'(.(1 B(( 8K''L $<?/41 "I " 6 " E78; Y*;"(* "" B(1 "12 5.( ; 9" '5 4 ) " ) 1 2 " 1.( $<?/ '&)" :'

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