Sistemi di codifica automatica o assistita

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Jacopo Carraro
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1 Nuove strategie per la standardizzazione delle informazioni per la clinica, l epidemiologia, la salute Bologna, 29 novembre 2008 Sistemi di codifica automatica o assistita Stefano Ferretti Associazione Italiana Registri Tumori Registro Tumori della provincia di Ferrara

Sistemi di codifica automatica o assistita Stefano Ferretti

2 I nodi culturali I nodi tecnici

3 Oggettività Completezza Riproducibilità Copertura Universalità Stabilità nel tempo Descrizione dei concetti Reperimento degli oggetti Navigazione tra le categorie Sistemi di codifica e classificazione ICD, DRG Sistemi di codifica e terminologia controllata SNOMED (Systematized NOmenclature in Medicine) LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Meta thesauri: UMLS (Unified Medical Language System)

ICD, DRG Sistemi di codifica e terminologia controllata SNOMED (Systematized NOmenclature in Medicine)

4 i problemi della comunicazione Diversi software proprietari Disomogeneità dei dati raccolti Difficoltà di condivisione dei dati Assenza di sistemi informativi integrati Incompleta standardizzazione

Difficoltà di condivisione dei dati Assenza di

5 Topografia Morfologia ICD WHO MOTNAC 1951 ACS SNDO AMA ICDA USA H-ICDA USA ICD WHO ICD WHO Cap. II - neopl. SNOP 1965 CAP MOTNAC 1968 ACS SNOMED 1977 CAP ICD-9 CM 1979 CPHA ICD WHO ICD WHO Cap. II - neopl. Cap. II - neopl. ICD-O 1976 WHO ICD-O WHO SNOMED 1977 CAP SNOMED III 1993 CAP ICD-O WHO SNOMEDRT 2000 CAP SNOMEDCT 2002 CAP-ANSI

SNOP 1965 CAP MOTNAC 1968 ACS SNOMED 1977 CAP ICD-9 CM 1979 CPHA ICD-9 1975 WHO ICD-10 1992 WHO Cap.

6 Modalità pratiche Codificazione libera: minima restrizione, massima possibilità di errore Codificazione con supporto decisionale: strumenti di navigazione nella terminologia Codificazione (semi)strutturata massima assistenza, minima adattabilità

decisionale: strumenti di navigazione nella terminologia

7 Qualità della codifica Determinanti: Quantità e qualità dell informazione Sistema di classificazione Intervallo temporale Uso e controllo

9 Scenario storico Elaborazione dei dati Data entry Record linkage Scenario attuale Case finding Codifica di casi e variabili Registrazione automatica

10 Le esperienze (NAACCR, CDC, SEER, AIM) Il sistema AUTOCODE Caricamento archivi Conversione dei testi in codice Selezione dei dati di interesse Produzione di report di assegnazione Le procedure Dizionari: ICD-O 3 Trasmissione. TransMed EDI Archiviazione: ISIS Registrar Completezza 95,0% Sensibilità: 98,3% Specificità: 99,4 VPP: 98,3%

report di assegnazione Le procedure Dizionari: ICD-O 3 Trasmissione.

11 FIND & CODE Software per la cattura e la codificazione automatica delle diagnosi istopatologiche Uno strumento per la registrazione dei tumori e la valutazione dei programmi di screening CPO Piemonte AIRTUM Procedure Eliminazione punteggiatura Eliminazione termini ridondanti Costruzione algoritmi sede/morfologia (modalità tabellare) Tabella topografia Tabella morfologia Tabella gravità link morfologia link topografia link gravità link morfologia

Eliminazione punteggiatura Eliminazione termini ridondanti Costruzione algoritmi sede/morfologia (modalità

12 FIND & CODE Software per la cattura e la codificazione automatica delle diagnosi istopatologiche Algoritmo mammella Uno strumento per la registrazione dei tumori e la valutazione dei programmi di screening test preliminare Sensibilità: 88% Specificità 100% Algoritmo cervice uterina Algoritmo App. digerente Sensibilità: 95,3% Specificità 100% Sensibilità: 92% Specificità 99,7%

valutazione dei programmi di screening test preliminare Sensibilità: 88% Specificità 100%

13 Il test su Find & Code Bologna Ospedale Maggiore Istopatologia ( casi) Modena (Policlinico Reg. Tumori) Citopatologia ( casi) Istopatologia ( casi) Citopatologia ( casi) Ferrara (Az. Osped.-Universitaria) Lunghezza record testo: 255 caratteri Istopatologia ( casi) Codifica SNOMED Citopatologia (8.417 casi)

999 casi) Istopatologia (10.000 casi) Citopatologia (10.000 casi) Ferrara (Az. Osped.

14 Categorie diagnostiche Mammella: 1. Altra lesione 2. Malign. Non definibile 3. Neoplasia in situ 4. Neoplasia invasiva 5. Metastasi 6. Caso non identificato 7. Sola topografia F&C Golden standard Codici SNOMED assegnati alla diagnosi Colon-retto retto-ano: 1. Altra lesione 2. Displasia indeterminata 3. Displasia moderata 4. Displasia grave 5. Neoplasia invasiva 6. Caso non identificato 7. Sola topografia F&C Cervice uterina: 1. Altra lesione 2. Displasia indeterminata 3. Displasia moderata 4. Displasia grave 5. Neoplasia invasiva 6. Caso non identificato 7. Sola topografia F&C

Displasia indeterminata 3. Displasia moderata 4. Displasia grave 5. Neoplasia invasiva 6. Caso non identificato 7.

15 Mammella Bologna, Ferrara performance % parametri Fraz. intercettata da F&C Fraz. morfologia valida F&C Concordanze per categoria Discordanze minori Discordanze maggiori Sola topografia F&C Falsi+ F&C (invas.) Falsi F&C Sola rilevazione F&C Sola rilevazione locale BO (838 casi) 85,2 80,0 77,3 1,2 1,4 5,3 1,6 0,2 35 casi 14,8 FE (519 casi) 77,8 67,2 65,5 1,5 0,6 10,6 0,6 0,0 11 casi 22,2

16 Mammella Bologna, Ferrara Ca. is, ca. invasivi, metastasi parametri Fraz. intercettata da F&C Fraz. morfologia valida F&C Concordanze per categoria Discordanze minori Discordanze maggiori Sola topografia F&C Falsi+ F&C (invas.) Falsi F&C Sola rilevazione F&C Sola rilevazione locale performance % BO FE (382 casi) (303 casi) 94,0 89,8 93,2 87,1 92,7 87,1 0,0 2,6 0,5 0,0 0,8 2,6 13 casi 3 casi 0,5 0,0 27 casi 7 casi 6,0 10,2

17 Colon-retto retto-ano Bologna, Ferrara parametri Fraz. intercettata da F&C Fraz. morfologia valida F&C Concordanze per categoria Discordanze minori Discordanze maggiori Sola topografia F&C Falsi+ F&C (invas.) Falsi F&C Sola rilevazione F&C Sola rilevazione locale performance % BO FE (2.610 casi) (2.348 casi) 54,0 50,0 51,3 32,8 48,3 29,9 2,5 1,7 0,4 1,1 2,8 17,2 0,5 0,3 0,0 1,5 119 casi 52 casi 46,0 50,0

18 Colon-retto retto-ano Bologna, Ferrara Ca invasivi, metastasi parametri Fraz. intercettata da F&C Fraz. morfologia valida F&C Concordanze per categoria Discordanze minori Discordanze maggiori Sola topografia F&C Falsi+ F&C (invas.) Falsi F&C Sola rilevazione F&C Sola rilevazione locale performance % BO FE (438 casi) (383 casi) 70,3 55,9 70,1 43,1 68,0 36,6 1,8 2,9 0,2 3,7 0,2 12,8 12 casi 8 casi 0,2 2,6 73 casi 21 casi 29,7 44,1

19 Cervice uterina Bologna, Ferrara parametri Fraz. intercettata da F&C Fraz. morfologia valida F&C Concordanze per categoria Discordanze minori Discordanze maggiori Sola topografia F&C Falsi+ F&C (invas.) Falsi F&C Sola rilevazione F&C Sola rilevazione locale performance % BO FE (965 casi) (885 casi) 88,7 70,7 84,5 60,3 80,1 51,1 4,4 6,1 0,0 3,2 4,2 10,4 0,2 1,9 0,0 0,0 331 casi 255 casi 11,3 29,3

20 Cervice uterina Bologna, Ferrara Ca. invasivi parametri Fraz. intercettata da F&C Fraz. morfologia valida F&C Concordanze per categoria Discordanze minori Discordanze maggiori Sola topografia F&C Falsi+ F&C (invas.) Falsi F&C Sola rilevazione F&C Sola rilevazione locale performance % BO FE (12 casi) (14 casi) 25,0 57,1 25,0 57,1 25,0 57,1 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 2 casi 17 casi 0,0 0,0 54 casi 11 casi 75,0 42,9

21 Curiosando falsi positivi F&C (ambito lesioni neoplastiche) FERRARA Cervice(17): Colon-retto retto(8): 4 ca. endometriali 1 aden.. tubulare. 2 ca. intramucosi 4 metastasi altri ca. BOLOGNA Cervice(2): Colon-retto retto(12): Mammella(13) 2 ca. in situ 7 ca. intramucosi 4 carcinoidi 1 metastasi altro ca 4 neg./sospetti 2 ca. mammarii 3 det.. biologiche MODENA Cervice(5): Colon-retto retto(1): 5 ca. in situ 1 adenocarcinoma

22 Argomenti Buona coerenza in realtà diverse Errori codifica locale (rari) Variabilità forme letterarie diagnostiche Report di esportazione dei casi dagli archivi di AP Lunghezza stringa riconoscimento diagnosi Attitudine alla codifica quadri secondari e concomitanti Report in sede locale (gruppi patologie, gruppi codifiche) Codifica sospetto di primitività (metastasi) Sensibilità F&C ( falsi positivi )

23 Prospettive medio termine Costruzione e correzione unico campione per test Rielaborazione controlli concordanza Traduzione programma (Visual Basic) Possibilità personalizzazione libraries Citopatologia Approfondimenti lesioni premaligne Altre sedi utilizzo (apparato emolinfopoietico)

24 classificazione e codifica alla diagnosi classificazione e codifica automatica Completezza Copertura Recupero casistica storica Aggiornamento classificazione Integrazione informativa

25 Progetto Find & Code Partecipanti: Registro Tumori Piemonte (project leader) Registro Tumori Friuli-Venezia Giulia Registro Tumori Veneto Registro Tumori Milano Registro Tumori della provincia di Ferrara Registro Tumori di Modena Registro Tumori ASL 4 Napoli Registro Tumori Toscano Registro Tumori del Canton Ticino (Svizzera).

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