PubMed. Visione generale. Panoramica 11/01/2013. Cos è PubMed?

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1 PubMed Informatica Medica e Biologica, a.a. 2011/12 Facoltà di Medicina Veterinaria Visione generale Cos è PubMed Come si accede Strategia di ricerca Operatori Booleani Ricerca intuitiva Come PubMed esegue una ricerca standard Associare i risultati Limitare la ricerca Trovare i riferimenti più recenti Panoramica Cos è PubMed? Medical Subject Headings (MeSH) Trovare e usare MeSH nella ricerca con PubMed Aggiungere termini alla propria ricerca Consultare la history Vedere i risultati Utilizzare i risultati Salvarli Altre Caratteristiche Banca dati biomedica Versione elettronica dell Index Medicus Istituito dalla National Library of Medicine (NLM), U.S. Copre i settori della medicina, infermieristica, odontoiatria, veterinaria, organizzazione sanitaria.. 1

2 Cosa Contiene? Contiene più di 21 milioni di citazioni bibliografiche di articoli su riviste Medline ha indicizzato circa 5400 riviste Contiene citazioni di pubblicazioni internazionali (75% English) di 70 paesi (40% USA) Attiva dal 1950 Aggiornamenti quotidiani Gratuita dal 1997 Altri dettagli: Strategia di ricerca Esempio: vorrei sapere se è possibili prevenire il tumore alla mammella negli animali con una dieta specifica e/o vitamine. Parole chiave: tumore al seno prevenzione vitamine alimentazione Breast cancer Prevention Vitamins Nutritional Supplements Operatori logici (booleani) AND Unisce 2 o più differenti concetti. Aiuta a restringere i risultati della ricerca. OR Collega 2 o più sinonimi o termini correlati. Amplia i risultati della ricerca. NOT Vengono esclusi i termini o i concetti non desiderati. Riduce il numero dei risultati. Strategia di ricerca Relazioni tra concetti: Breast cancer AND prevention AND (vitamins OR nutritional supplements) 2

3 Ricerca intuitiva Facile, veloce Richiede una conoscenza minima degli operatori logici Il sistema fa tutto lui! (mappando i termini in modo appropriato) Ricerca molto ampia Bassa precisione PubMed: Ricerca e funzioni di ricerca Accesso National Center for Biotechnology Information 3

4 Risultati utilizzando Basic Search, inserire le parole chiave nella search box. In PubMed, non è necessario usare citazioni, AND, OR, o speciali formati. Nella ricerca libera, PubMed ti aiuta a scegliere i termini. Quando inizi a scrivere una parola, in automatico si evidenzia una lista di termini possibili. Seleziona quello che vuoi. Anatomia dei risultati Caratteristiche dell abstract Il titolo la lingua in cui è scritto l articolo Gli autori Se vogliamo avere altre informazioni come l abstract o l intero testo dobbiamo cliccare Il contenuto dell articolo 4

5 Non ci sono comandi speciali per cercare un articolo di un autore, inserisci il nome dell autore (non è necessario il punto): Ricerca per autore Combinare diversi concetti Cognome e iniziali del nome PubMed lo riconosce come autore e automaticamente lo ricerca Note: PubMed trova l autore, indipendentemente da dove si trova nella lista degli autori primo, secondo o terzo posto Scrivi una frase che comprenda tutti i termini della ricerca. Non usare AND o OR, in modo da non interferire con la ricerca di PubMed. Non ha importanza l ordine della parole. Se vuoi vedere esattamente cosa PubMed sta cercando, guarda sul Search Details per il percorso. Traduttori PubMed traduce automaticamente e in modo corretto utilizzando AND con le tue parole, e OR + i sinonimi. Ora guarda il metodo di ricerca utilizzato in fondo ai Details. Cercare una rivista usando il titolo con: L abbreviazione ufficiale di Medline - New Engl J Med Abbreviazioni più note, meno ufficiali - NEJM Il titolo completo - New England Journal of Medicine note: È possibile ottenere diversi risultati. Utilizzare l abbreviazione ufficiale è il modo migliore per ottenere una buona ricerca. Si può utilizzare il database Journals dalla home page di PubMed per trovare la sigla ufficiale e per recuperare il numero esatto di tutti gli articoli di una particolare rivista. Trovare le riviste 5

6 Limitare la ricerca Cliccare Clicca sull etichetta Limit Limitare la ricerca Applica i tuoi limiti Scegli i limiti Clicca su PubMed applica i tuoi limiti ed esegue la ricerca 6

7 I risultati dopo avere eseguito la ricerca con i limiti Per recuperare i riferimenti più recenti Clicca sull etichetta Limit Scegli il parametro tempo Scegli il periodo desiderato Clicca su Go (in alto o in fondo allo schermo) Ricerca diretta da citazioni specifiche (1) Ricerca diretta da citazioni specifiche (2) Vai su Single Citation Matcher e clicca sull etichetta Inserisci i dati che conosci poi vai su Go e dai l invio 7

8 Ricerca diretta da citazioni specifiche (3) Scegli l autore, clicca su Go e guarda i risultati MeSH (Medical Subject Headings) I descrittori di soggetto MeSH (Medical Subject Headings) È una lista di parole o frasi standardizzate: cancer=neoplasms Elimina le diverse trascrizioni : tumor or tumour=neoplasms Copre una grande quantità di sinonimi o termini più specifici : neoplasms include Lung neoplasms, Kidney neoplasms, Breast neoplasms, etc. I termini sono disposti in una gerarchia «ad albero» in cui i termini generali contengono i termini più specifici. MeSH (2) Permette di trovare un numero contenuto di articoli riguardanti un soggetto utilizzando l opzione Major topic Consente di ridurre un argomento a sottovoci (subheadings) che rappresentano specifici aspetti dell argomento stesso - ex. : Breast Neoplasms prevention & control 8

9 MeSH (3) Per trovare MeSH e usarlo nella ricerca con PubMed Clicca su MeSH Database scegli MeSH database Scrivi il concetto nella query box Consulta le informazioni su MeSH Fai le scelte opportune in base alla stringa di ricerca (major topic, subheadings a seconda delle necessità) Trova e usa MeSH.. Trova e usa MeSH. Scegli una o più subheadings per MeSH Spedisci a Search box 9

10 Scegli MeSH Trova e usa MeSH Spedisci MeSH alla Search box Trova e usa MeSH.. Click su Search PubMed (scegliendo MeSH-Subheadings queste sono cercate su PubMed) Questi sono i risultati della tua ricerca Videata dei risultati Aggiungi termini alla tua ricerca Ripeti il processo con altri concetti 10

11 Aggiungi termini alla tua ricerca Combina i termini usando Send to search box con AND o OR Completa la tua ricerca dando l invio su Search PubMed Consulta il tuo percorso di ricerca Con history : Si visualizzano le ultime strategie di ricerca che sono automaticamente salvate e cancellate dopo 8 ore di inattività Le ricerche sono indicate da un numero preceduto da # È possibile combinare le strategie nella history con gli operatori logici. Va riportato il simbolo # seguito dal numero Consultare il tuo percorso di ricerca Dai l invio sull etichetta History Partendo dalla tua history seleziona gli argomenti Clicca sul primo argomento Scegli l operatore clicca sul secondo argomento Scegli nuovamente l operatore Clicca su Go 11

12 I tuoi risultati Guarda i risultati Clicca su Display per vedere il menù Scegli il formato MEDLINE se vuoi esportare i dati a un software di gestione bibliografica Gestisci i tuoi risultati Tutti i risultati in assenza di ulteriori specifiche Selezione dei risultati Invio dei risultati alla Clipboard Invia per Feed RSS Salva Testo File Gestisci i tuoi risultati Scegli file, apri la tendina di format, scegli MEDLINE poi clicca su crea file 12

13 Salvare la ricerca - 1 Salva la ricerca - 2 MyNCBI Save Search (salvataggio della ricerca) Sign In (registrazione) Dare un nome alla ricerca URL Clicca su Details Clicca su URL per evidenziare l indirizzo web della pagina con i risultati della ricerca Usa la funzione preferiti del browser per salvare e ritrovare la pagina con i risultati Richiamare la ricerca Funzioni aggiuntive MyNCBI entra Clicca di nuovo MyNCBI Gestisci i tuoi dati Database delle riviste Ricerca diretta da citazioni specifiche Feed RSS Collegamenti agli articoli in full text, se accessibili 13

14 Altre risorse utili Altre risorse utili PubMed Help file : p.html PubMed FAQ (domande ricorrenti Frequently Asked Questions) : Tutorial PubMed interattivo : build.html MeSH Medical Subject Headings/traduzione italiana a cura dell Istituto Superiore di Sanità (ISS); l accesso è gratuito, previa registrazione. Dizionario dei termini medici in Internet Vocabolario on line italiano inglese, ospitato sul sito Pneumonet 14