La microbiologia di. IDEXX Vet Med Lab. Informazioni corrette e complete. Identificazione batterica ed antibiogramma rapidi.
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- Filomena Calabrese
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1 Informazioni corrette e complete Identificazione batterica ed antibiogramma rapidi. La microbiologia di : i vantaggi per i nostri clienti Per i laboratori di microbiologia la riduzione del formazioni relative ad ogni campione isolato, la sua tempo di risposta e l invio ai clinici dell informazione posizione occupata sulla piastrina porta-campioni di cui hanno bisogno per gestire il trattamento del del MALDI biotyper e la posizione della relativa card paziente costituiscono la massima priorità. I clinici per antibiogramma nella cassetta VITEK 2. Questo Utilizzo di metodiche di laboratorio consolidate associate alle tecnologie più moderne si basano sempre più sull informazione proveniente consente di ottenere un integrazione facile e sicura per un risultato diagnostico affidabile e veloce, di facile e sicura applicazione clinica dal laboratorio di microbiologia poiché le resistenze tra il dato dell identificazione con la spettrometria di batteriche hanno reso più difficili le decisioni sul massa e quello dell antibiogramma con VITEK 2. trattamento terapeutico. Elaborazione dei campioni e refertazione da parte di veterinari specializzati, biologi e tecnici di laboratorio con esperienza pluriennale. Offerta completa: diagnostica di routine, profili specifici, colture ematiche, esami dell igiene ambientale e allestimento di autovaccini Tenendo conto di queste necessità, recentemente Il collaudatissimo strumento VITEK 2 fornisce nuove tecnologie e soluzioni automatizzate hanno risultati dell antibiogramma in giornata. Il software ridotto il tempo necessario per fornire al clinico risul- Advanced Expert System, un componente critico tati decisivi e migliorato l accuratezza dei risultati. del VITEK 2, risulta unico perché analizza i valori La tecnologia MALDI-TOF MS (Matrix Assisted Laser di MIC per determinare fenotipi di resistenza aiuta Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spec- a rilevare meccanismi di resistenza emergenti e trometry) consiste in uno strumento per la spettro- nuovi fenotipi. metria di massa ed in una soluzione informatica Dopo la prima fase colturale gli isolati vengono progettati per l identificazione rapida di microrganismi. simultaneamente processati con gli strumenti L identificazione microbica viene raggiunta tra- MALDI biotyper e VITEK 2: in pochi minuti il MALDI mite la messa in evidenza di spettri, analizzati biotyper può fornire l identificazione microbica men- con l ausilio del database presente nel sistema tre i risultati dei test di sensibilità sono disponibili dove picchi di questi spettri vengono confrontati successivamente su VITEK 2. Questo consente di con il profilo tipico di una specie, genere o famiglia far pervenire l informazione corretta ai medici veteri- di microorganismo. Questi sistemi includono una nari più rapidamente. stazione di preparazione ed un software che consentono all operatore di assicurare un link tra le in- di IDEXX Laboratories Italia S.r.l. Via Guglielmo Silva, Milano Laboratorio di riferimento Assistenza clienti: lunedì venerdì sabato Numero Verde opz 1 Fax Verde italia@idexx.com La politica di tutela della privacy di IDEXX è disponibile sul sito idexx.it 2013 IDEXX Laboratories, Inc. Tutti i diritti riservati IT La microbiologia di
2 arbejder med mikroorganismer men behandler dyr Esperienza pluriennale e tecnologia Lettura delle colonie tramite VITEK 2 all avanguardia La microbiologia è uno dei settori di eccellenza del nostro laboratorio. Un team composto da medici veterinari specializzati, biologi e tecnici di laboratorio è responsabile della processazione e refertazione di campioni inviati da tutta Europa. In questo dipartimento vengono associate metodiche consolidate e tecnologie all avanguardia per la corretta identificazione degli agenti patogeni e le successive prove di sensibilità antibiotica. La nostra diagnostica microbiologica si avvale di sistemi automatizzati che utilizzano dei database molto ampi (MALDI-TOF MS Matrix Assisted Laser Desorption/Ionisation Time-Of-Flight Mass Spectrometry e VITEK 2 Advanced Expert System ) e che ci permettono di garantire una maggiore rapidità ed accuratezza dei risultati, sia in merito all identificazione degli agenti patogeni che alla determinazione dell antibiotico-sensibilità. L esecuzione dell antibiogramma per la maggioranza degli agenti patogeni, si basa sulla determinazione della CMI (concentrazione minima inibente) secondo le linee guida del CLSI (Istituto Internazionale per gli Stardard Clinici e di Laboratorio): queste ultime prevedono l esame di un ampio spettro di principi attivi in diverse concentrazioni, permettendo la ripartizione degli agenti patogeni in diverse classi di sensibilità (SIR). La nostra collaborazione con istituti universitari e laboratori IDEXX in tutto il mondo consente un importante scambio di esperienze sui casi di microbiologia clinica da cui i nostri clienti possono trarre grande vantaggio ricevendo dei risultati affidabili e veloci, di facile e sicura applicazione clinica. ➊ ➋
3 Dal campione al referto 1 2 Arrivo del campione in laboratorio e registrazione. Semina del campione in diversi terreni di coltura solidi (piastra) per l esame batteriologico e micologico e semina supplementare in terreni di arricchimento liquidi (brodo colturale). 3 4 Ogni campione viene coltivato, in media, su 4 diversi terreni solidi e su 1 o 2 terreni liquidi. La scelta dei terreni si basa sul tipo e localizzazione del prelievo del campione, sulla specie animale e sull anamnesi del paziente. Per determinati sospetti diagnostici o per richieste di esami particolari può essere necessario l impiego di ulteriori terreni di coltura specifici. Per alcuni agenti patogeni (per es. Yersinia, Campylobacter e Salmonella) utilizziamo di routine terreni di coltura selettivi e terreni liquidi supplementari. L arricchimento in un brodo di coltura rende possibile la crescita batterica anche in caso di microrganismi danneggiati e/o presenza di un numero esiguo di germi nel campione. Realizzazione di preparati per la colorazione, se necessario (ad esempio, per la colorazione di Gram in caso di tamponi auricolari, liquido cefalorachidiano o campioni da versamenti cavitari). Incubazione in atmosfera (aerobia, anaerobia, microaerofilia) e temperatura adeguate a seconda del materiale di partenza e dell agente patogeno da ricercare. Lo spettro delle temperature varia da quella ambientale fino a 42 C, ma per determinati agenti patogeni può arrivare alla temperatura di refrigerazione. Identificazione ed antibiogramma rapidi con il MALTI biotyper e VITEK 2: l informazione giusta nei tempi giusti. Anche la durata dell incubazione dipende dal materiale e dall agente patogeno. Alcune colture possono essere valutate già dopo 24 ore (per es. i campioni di urina), mentre altre colture necessitano di un ulteriore valutazione dopo 48 ore. Per alcuni campioni è necessaria un incubazione complessiva più prolungata con valutazioni intermedie: per le colture anaerobiche si considerano almeno 72 ore, per quelle finalizzate alla ricerca di Malassezia fino a 6 giorni e per i dermatofiti fino a 4 settimane. Per completare l iter diagnostico di alcuni esami colturali sono richiesti tempi di incubazione minimi, per esempio 10 giorni per le emocolture e almeno 7 giorni per la diagnosi di CEM (metrite equina contagiosa). La corrretta valutazione delle colture e la differenziazione di microrganismi patogeni e patogeni facoltativi richiede conoscenze specialistiche e una grande esperienza. A seconda delle esigenze diagnostiche si programmano colorazioni, test biochimici, sottocolture e test per il rilevamento di determinate caratteristiche specifiche degli agenti patogeni. Se questi sono presenti in concentrazioni molto esigue o mostrano una crescita stentata, è necessaria la differenziazione in terreni liquidi con un periodo di incubazione supplementare. ➌ ➍ ➎ ➏
4 5 Referto positivo o nessuna dimostrazione di microrganismi patogeni La corretta differenziazione tra agenti patogeni obbligati o facoltativi e la flora locale fisiologica riveste particolare importanza in medicina veterinaria e varia in relazione al materiale esaminato e alla specie animale. Sebbene dai campioni microbiologici si riescano ad isolare molti germi diversi, non si tratta sempre di patogeni. La conoscenza e l utilizzo degli attuali standard internazionali per la valutazione degli agenti patogeni sono alla base del lavoro del nostro reparto e quindi parte integrante del servizio diagnostico offerto. Nel referto vengono specificati e riportati solo gli agenti possibilmente patogeni. Tuttavia, specialmente sulla cute e sulle mucose si osservano confini labili tra microrganismi facenti parte della flora fisiologica e possibili agenti patogeni. Una depressione immunitaria dell animale può, per esempio, alterare il delicato equilibrio tra ospite e microrganismo a tal punto che agenti commensali riescono ad acquisire una valenza patogena. Per lo specialista impegnato nella valutazione del campione è utile poter disporre di una breve anamnesi da parte del veterinario richiedente, al fine di poter prescrivere immediatamente appropriati test supplementari nell ambito dell esame. L anamnesi, il quadro clinico e il referto microbiologico si integrano a vicenda e solo se considerati nel loro complesso rendono possibile una diagnosi corretta. La semina di terreni di coltura solidi (piastra) Nell allestimento dei campioni vengono utilizzati tutti i materiali idonei inviati. Nel caso, ad esempio, siano stati inviati tre campioni di feci dello stesso animale, si prepara da tutti e tre un unico campione rappresentativo; nel caso vengano inviati diversi tamponi derivanti dalla stessa localizzazione, per esempio orecchio destro e sinistro, si esamina ciascun campione ed il referto finale si basa sull insieme dei singoli risultati ottenuti. Campioni prelevati da apparati diversi (ad esempio tampone cloacale e nasale) vengono, viceversa, refertati singolarmente. ➊ Escherichia coli ➏ Citrobacter freundii ➋ Pseudomonas aeruginosa ➐ Streptococcus agalactiae ed enterococci ➌ MRSA ➑ Salmonella spp. ➍ Rhodotorula mucilaginosa ➒ Antibiogramma per ➎ Trichophyton mentagrophytes streptococchi var. erinacei ➓ Microsporum gypseum ➐ ➑ ➒ ➓
5 Informazioni corrette e complete Identificazione batterica ed antibiogramma rapidi. La microbiologia di : i vantaggi per i nostri clienti Per i laboratori di microbiologia la riduzione del formazioni relative ad ogni campione isolato, la sua tempo di risposta e l invio ai clinici dell informazione posizione occupata sulla piastrina porta-campioni di cui hanno bisogno per gestire il trattamento del del MALDI biotyper e la posizione della relativa card paziente costituiscono la massima priorità. I clinici per antibiogramma nella cassetta VITEK 2. Questo Utilizzo di metodiche di laboratorio consolidate associate alle tecnologie più moderne si basano sempre più sull informazione proveniente consente di ottenere un integrazione facile e sicura per un risultato diagnostico affidabile e veloce, di facile e sicura applicazione clinica dal laboratorio di microbiologia poiché le resistenze tra il dato dell identificazione con la spettrometria di batteriche hanno reso più difficili le decisioni sul massa e quello dell antibiogramma con VITEK 2. trattamento terapeutico. Elaborazione dei campioni e refertazione da parte di veterinari specializzati, biologi e tecnici di laboratorio con esperienza pluriennale. Offerta completa: diagnostica di routine, profili specifici, colture ematiche, esami dell igiene ambientale e allestimento di autovaccini Tenendo conto di queste necessità, recentemente Il collaudatissimo strumento VITEK 2 fornisce nuove tecnologie e soluzioni automatizzate hanno risultati dell antibiogramma in giornata. Il software ridotto il tempo necessario per fornire al clinico risul- Advanced Expert System, un componente critico tati decisivi e migliorato l accuratezza dei risultati. del VITEK 2, risulta unico perché analizza i valori La tecnologia MALDI-TOF MS (Matrix Assisted Laser di MIC per determinare fenotipi di resistenza aiuta Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spec- a rilevare meccanismi di resistenza emergenti e trometry) consiste in uno strumento per la spettro- nuovi fenotipi. metria di massa ed in una soluzione informatica Dopo la prima fase colturale gli isolati vengono progettati per l identificazione rapida di microrganismi. simultaneamente processati con gli strumenti L identificazione microbica viene raggiunta tra- MALDI biotyper e VITEK 2: in pochi minuti il MALDI mite la messa in evidenza di spettri, analizzati biotyper può fornire l identificazione microbica men- con l ausilio del database presente nel sistema tre i risultati dei test di sensibilità sono disponibili dove picchi di questi spettri vengono confrontati successivamente su VITEK 2. Questo consente di con il profilo tipico di una specie, genere o famiglia far pervenire l informazione corretta ai medici veteri- di microorganismo. Questi sistemi includono una nari più rapidamente. stazione di preparazione ed un software che consentono all operatore di assicurare un link tra le in- di IDEXX Laboratories Italia S.r.l. Via Guglielmo Silva, Milano Laboratorio di riferimento Assistenza clienti: lunedì venerdì sabato Numero Verde opz 1 Fax Verde italia@idexx.com La politica di tutela della privacy di IDEXX è disponibile sul sito idexx.it 2013 IDEXX Laboratories, Inc. Tutti i diritti riservati IT La microbiologia di
6 Informazioni corrette e complete Identificazione batterica ed antibiogramma rapidi. La microbiologia di : i vantaggi per i nostri clienti Per i laboratori di microbiologia la riduzione del formazioni relative ad ogni campione isolato, la sua tempo di risposta e l invio ai clinici dell informazione posizione occupata sulla piastrina porta-campioni di cui hanno bisogno per gestire il trattamento del del MALDI biotyper e la posizione della relativa card paziente costituiscono la massima priorità. I clinici per antibiogramma nella cassetta VITEK 2. Questo Utilizzo di metodiche di laboratorio consolidate associate alle tecnologie più moderne si basano sempre più sull informazione proveniente consente di ottenere un integrazione facile e sicura per un risultato diagnostico affidabile e veloce, di facile e sicura applicazione clinica dal laboratorio di microbiologia poiché le resistenze tra il dato dell identificazione con la spettrometria di batteriche hanno reso più difficili le decisioni sul massa e quello dell antibiogramma con VITEK 2. trattamento terapeutico. Elaborazione dei campioni e refertazione da parte di veterinari specializzati, biologi e tecnici di laboratorio con esperienza pluriennale. Offerta completa: diagnostica di routine, profili specifici, colture ematiche, esami dell igiene ambientale e allestimento di autovaccini Tenendo conto di queste necessità, recentemente Il collaudatissimo strumento VITEK 2 fornisce nuove tecnologie e soluzioni automatizzate hanno risultati dell antibiogramma in giornata. Il software ridotto il tempo necessario per fornire al clinico risul- Advanced Expert System, un componente critico tati decisivi e migliorato l accuratezza dei risultati. del VITEK 2, risulta unico perché analizza i valori La tecnologia MALDI-TOF MS (Matrix Assisted Laser di MIC per determinare fenotipi di resistenza aiuta Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spec- a rilevare meccanismi di resistenza emergenti e trometry) consiste in uno strumento per la spettro- nuovi fenotipi. metria di massa ed in una soluzione informatica Dopo la prima fase colturale gli isolati vengono progettati per l identificazione rapida di microrganismi. simultaneamente processati con gli strumenti L identificazione microbica viene raggiunta tra- MALDI biotyper e VITEK 2: in pochi minuti il MALDI mite la messa in evidenza di spettri, analizzati biotyper può fornire l identificazione microbica men- con l ausilio del database presente nel sistema tre i risultati dei test di sensibilità sono disponibili dove picchi di questi spettri vengono confrontati successivamente su VITEK 2. Questo consente di con il profilo tipico di una specie, genere o famiglia far pervenire l informazione corretta ai medici veteri- di microorganismo. Questi sistemi includono una nari più rapidamente. stazione di preparazione ed un software che consentono all operatore di assicurare un link tra le in- di IDEXX Laboratories Italia S.r.l. Via Guglielmo Silva, Milano Laboratorio di riferimento Assistenza clienti: lunedì venerdì sabato Numero Verde opz 1 Fax Verde italia@idexx.com La politica di tutela della privacy di IDEXX è disponibile sul sito idexx.it 2013 IDEXX Laboratories, Inc. Tutti i diritti riservati IT La microbiologia di
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