Banche dati primarie per Medicina. di Laura Colombo

Transcript

1 Banche dati primarie per Medicina di Laura Colombo Ultimo aggiornamento: novembre 2013

2 Sommario PubMed (medicina) EMBASE (medicina) Cinahl (infermieristica) PsycINFO (psicologia) Altre Banche dati ProQuest (medicina e scienze sociali)

3 PubMed Profilo Banca dati bibliografica (free on line dal 1996) ente: National center for biotechnology and information (NCBI), divisione della National Library of Medicine (NLM), USA ambiti tematici: medicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria, organizzazione sanitaria, scienze pre-cliniche, farmacia copertura: dal 1879 ad oggi (più di 23 milioni di record) documenti selezionati: riviste ed e-book tipi di ricerca: Libera (base e avanzata), per MeSH (= thesaurus) informazioni sui documenti: descrizione bibliografica, abstract, MeSh di PubMed, tanti full text Il nucleo di PubMed è Medline che forma la parte più consistente delle citazioni presenti Presentazione record dal più recente, rilevante, ecc. MeSH ricco, interrogabile in vari modi ed esplicativo Tante funzioni per raffinare la ricerca e salvare i record (v. Tutorials)

4 PubMed Accesso La versione free è disponibile all indirizzo: Se accediamo a PubMed dall Università o autenticandoci da casa, entriamo in MetaBib (Biblioteca Digitale), selezioniamo Trova banche dati e scegliamo PubMed. Si attiverà il bottone vedremo se possiamo accedere a quell articolo in full text. e

5 PubMed Ricerca nel MeSH VANTAGGI: I risultati sono pertinenti e non devo pensare a tutti i sinonimi. E consigliabile iniziare sempre la ricerca nel MeSH Database (il thesaurus o vocabolario controllato di PubMed). SVANTAGGI: Non si trovano gli articoli più recenti, non ancora indicizzati. Il tempo richiesto per l inserimento in MEDLINE varia da 15 giorni a due mesi.

6 PubMed Il MeSH Database Il MeSH ha una struttura ad albero. Si parte da categorie molto ampie per arrivare a soggetti (descrittori) sempre più specifici. E possibile scegliere se: Limitare la ricerca al termine più ampio (Restrict to MeSH Major Topic). Non esplodere nella ricerca ogni termine anche ai termini sottostanti (Do Not include MeSH terms found below this term ).

7 PubMed I Subheadings del MeSH Sono termini che qualificano l aspetto di un descrittore MeSH. E possibile spuntare uno o più Subheadings. Per lanciare la ricerca cliccare su «Add to search builder». La ricerca verrà portata dentro il riquadro. Basterà cliccare su Search PubMed per vedere i risultati.

8 PubMed Il MeSh in italiano La traduzione italiana del MeSH Database è stata realizzata in collaborazione tra l Istituto Superiore di Sanità (ISS) e la National Library of Medicine (NLM). VANTAGGI L accesso è gratuito. Si può ricercare partendo dall italiano o dall inglese. Si può esplorare la struttura ad albero. SVANTAGGI Non sono ancora stati tradotti tutti i sinonimi. In caso di mancato reperimento di un termine, pensiamo a possibili sinonimi oppure utilizziamo l operatore di troncamento * sia a sinistra che a destra del termine cercato.

9 PubMed Ricerca libera (1) VANTAGGI: Si trovano gli articoli più recenti, non ancora indicizzati. E consigliabile fare sempre anche la ricerca libera. SVANTAGGI: Si trovano spesso troppi articoli, molti non pertinenti. Dobbiamo pensare ai sinonimi e alle forme varianti e utilizzare gli operatori booleani e i caratteri speciali.

10 OPERATORI BOOLEANI Se non vengono inseriti i booleani, viene sottinteso AND. PubMed li processa da sinistra a destra; per alterare tale ordine è necessario inserire tra parentesi tonde i termini che si vuole siano processati per primi. PubMed Ricerca libera (2) CARATTERI SPECIALI *: Il carattere di troncamento * cerca tutti i termini che iniziano con una determinata radice individuando fino a 600 variazioni. ATTENZIONE: disattiva la ricerca nel MeSH. : Le virgolette indicano al sistema di ricercare l intera frase. SINONIMI E VARIANTI Alcuni termini in inglese e in americano si scrivono diversamente.

11 Dalla pagina dei risultati è possibile aggiungere dei filtri per limitare i PubMed I limiti risultati di una ricerca utilizzando una serie di possibili criteri. NB: Automaticamente se ne attivano alcuni. Per attivare gli altri cliccate su «Show addictional filters». Tra questi: Journal categories: sono dei gruppi di riviste costituiti in base all area disciplinare di cui le riviste si occupano (es. Nursing Journals o Dental Journals) Ages: dal neonato all anziano Sex: maschio o femmina

12 PubMed Ricerca combinata Serve per combinare più ricerche (fatte con 2 MeSH o 2 ricerche libere o 1 MeSH e 1 libera). Nella History (clicca su Advanced search per accedervi) si vedono le ricerche fatte. Clicca il bottone Add per ogni ricerca utile che verrà portata in alto (Builder). Poi unisci le ricerche con gli operatori booleani.

13 PubMed I risultati della ricerca (1) Di default vengono visualizzati 20 risultati per pagina. E possibile cambiare questa opzione utilizzando il menu a discesa Display Settings, Items per page. Gli articoli vengono ordinati per data (dal più recente). E possibile cambiare questa opzione utilizzando il menu a discesa Display Settings, Sort By.

14 PubMed I risultati della ricerca (2) Filter your results: Per guardare solo gli articoli free o le revisioni. Titles with your search terms: per trovare articoli che hanno nel titolo i termini cercati Search details: ti mostra i termini Mesh e le parole libere cercate

15 PubMed Accedere al full text (1) Cliccando sul titolo dell articolo, si vede la citazione completa. Spesso c è il link all editore. E visibile il full text se la rivista è free. Cliccando su SFX si accede alla pagina dei servizi Bicocca- Insubria che permette di sapere se l articolo è consultabile in formato elettronico o cartaceo e accedere ai servizi avanzati.

16 PubMed Accedere al full text (2) Articolo disponibile in elettronico: si vedono gli Editori. Articolo disponibile in cartaceo: trovi la scritta «E presente». Articolo non disponibile in Biblioteca di Ateneo: Richiesta di Document Delivery.

17 PubMed Il Record PubMed MeSH terms: riporta i descrittori dell articolo. Related citations: articoli correlati all argomento. Funzione utile quando la ricerca iniziale da pochi risultati. LinkOut: riporta siti gratuiti sull argomento.

18 PubMed Altri tipi di ricerche (1) PMID: l identificativo del record Single Citation Matcher: Topic-Specific Queries: per trovare una citazione di cui per fare ricerche cliniche si hanno alcuni dati (es. autore, o per argomento (anche parole del titolo, nome della per accedere a rivista) MedlinePlus)

19 PubMed Altri tipi di ricerche (2) Clinical Trials: archivio dei trial clinici in corso Journals in NCBI Databases: archivio di titoli di riviste biomediche completi di ISSN e rimandi alle possibili abbreviazioni

20 PubMed Salvataggio (1) E possibile salvare i risultati in un file testo (File) o spedirseli per ( ) o salvarli temporaneamente (8 ore) nella Clipboard.

21 PubMed Salvataggio (2) Per salvare in modo permanente le strategie di ricerca: Registrarsi in My NCBI. Una volta identificati, lanciare la ricerca. Salvarla cliccando su Save Search. Per creare collezioni (raccolte di articoli): Registrarsi in My NCBI. Una volta identificati, lanciare la ricerca. Spuntare gli articoli di interesse. Cliccare su Send to Collections.

22 PubMed Alert ed RSS Per creare un alert: Registrarsi in My NCBI. Una volta identificati, lanciare la ricerca. Salvarla cliccando su Save Search. Scegliere di avere aggiornamenti ( update). Per ricevere nel proprio Reader gli aggiornamenti: Lanciare la ricerca in PubMed. Cliccare su RSS, Create RSS, XML. Se si usa Mozilla Firefox, si apre il Segnalibri Live. Se si usa Internet Explorer, utilizzare un reader (es. google Reader).

23 PubMed Tutorial Dalla Home page di PubMed, nella sezione Using PubMed, si trovano i PubMed Tutorials, per imparare meglio l utilizzo di PubMed (in inglese).

24 PubMed Per approfondire Nella Sede di Medicina della Biblioteca ci sono i libri: Salvatore C. (2007) Conoscere e usare Pubmed. Guida al più noto sistema di ricerca bibliografica in campo Biomedico. Roma: Il pensiero scientifico. Bassi C. (2010) PubMed : istruzioni per l uso. Roma: Il pensiero scientifico Alcuni siti internet con guide: NUOVA INTERFACCIA DI PUBMED Alma Mater Studiorum Università di Bologna, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Biblioteca Centralizzata Clinica

25 EMBASE Profilo Banca dati bibliografica: (a pagamento, da Elsevier) ente: Elsevier, deriva da Excerpta Medica ambiti tematici: letteratura biomedica, in particolare: farmacologia e tossicologia, politiche sanitarie, salute pubblica, abuso e dipendenza da sostanze, psichiatria, riabilitazione, medicina forense, medicina alternativa, ingegneria biomedica, biotecnologie. copertura: dal 1974 ad oggi (più di 20 milioni di record) documenti selezionati: riviste e abstract di conferenze tipi di ricerca: libera (veloce, avanzata, per farmaco, per malattia, per articolo) e per argomento (Emtree = thesaurus) informazioni sui documenti: descrizione bibliografica, abstract, parole chiave, alcuni full text Presentazione record dal più recente, rilevante ecc. Emtree ricco, interrogabile in vari modi ed esplicativo Tante funzioni per raffinare la ricerca e salvare i record (v. Help)

26 EMBASE Accesso Possiamo accedere ad EMBASE dalla Facoltà di Medicina o dall Ospedale San Gerardo. Una volta entrati in MetaBib (Biblioteca Digitale), selezioniamo Trova banche dati e scegliamo EMBASE.

27 EMBASE Quick Automaticamente si apre la Quick search. Di defaut appare Extensive search che permette di interrogare tramite parole chiave mappate automaticamente il vocabolario controllato.

28 EMBASE Advanced E possibile scegliere se effettuare la ricerca solo in Embase o anche in MEDLINE. E preferibile cercare anche nel vocabolario controllato (Map to preferred terminology). Se si trovano troppi risultati, si può cercare solo il concetto principale (major focus). Se si trovano pochi risultati si può cercare a testo libero (free), si possono cercare i concetti derivati (explosion) o i sinonimi (synonymus).

29 EMBASE Drug / Disease DRUG SEARCH: E possibile cercare il principio attivo o il nome commerciale. Si può specificare la ricerca con Subheadings specifici o scegliere la modalità di somministrazione del farmaco. DISEASE SEARCH: Si può specificare la ricerca con Subheadings specifici.

30 EMBASE Article Questa modalità di ricerca serve per recuperare un articolo di cui si ha la citazione (anche non completa).

31 EMBASE Emtree Emtree è il thesaurus o vocabolario controllato di Embase. Nella finestra Find Term inseriamo il termine cercato. Automaticamente ci verrà suggerito il termine controllato corrispondente. NB: i termini di PubMed sono diversi (ad es. Il Mesh di PubMed per ulcere da pressione è Pressure Ulcer, per l Emtree di EMBASE è Decubitus). Nella finestra Browse by Facet, possiamo anche cercare per argomento.

32 EMBASE Emtree Find Term Viene visualizzato l albero. Cliccare su + o per espandere o contrarre il livello del termine. Si può scegliere se esplodere la ricerca ai termini sottostanti (explosion) o se scegliere il termine come argomento principale (major focus). Per lanciare la ricerca cliccare su Add to Query Builder e Find Term

33 EMBASE Journals ed Authors Journals fornisce l elenco completo delle riviste indicizzate dalla banca dati. E possibile sfogliarle per anno, volume, fascicolo. Authors permette di cercare tutti gli autori presenti nella banca dati. Fornisce quasi sempre la dell autore.

34 EMBASE Ricerca combinata E possibile combinare due o più ricerche. Sopra la ricerca appare l elenco delle ricerche fatte (Search Query). Bisogna spuntare le ricerche che si vogliono unire e cliccare su Combine (automaticamente si combina con l And).

35 EMBASE Limiti Automaticamente vengono proposti dei limiti (Quick Limits) ma cliccando su expand all è possibile vederli tutti. E possibile scegliere per tipo di studio, tipo di pubblicazione, argomento, lingua, genere, età, tipo di studio sugli animali.

36 EMBASE Risultati della ricerca Per vedere i dettagli della ricerca cliccare su Search Details. I risultati vengono presentati in ordine di data (dal più recente) ma è possibile scegliere se averli per rilevanza. E possibile selezionare i risultati spuntandoli e scegliere di vedere i dettagli, stamparli, esportarli, spedirseli nella o inviarli alla Clipboard.

37 EMBASE Record EMBASE Viene riportato: citazione e abstract nomi dei farmaci, nomi delle malattie e altre parole chiave nomi e recapiti di tutti gli autori CAS Registry Numbers

38 EMBASE Accedere al full text Sia la citazione sintetica che quella completa riportano i riferimenti bibliografici necessari per localizzare il documento. La citazione completa riporta la lingua dell articolo e, ove presente, anche il PMID. Per verificare se possiamo accedere al full text, andare sul sito della Biblioteca, scegliere «Riviste elettroniche» e «Cerca la citazione».

39 EMBASE Salvare 1 Per salvare in modo temporaneo, ricordati di spuntare gli articoli trovati e di Cliccare su Add to Clipboard. I risultati saranno visibili nella Clipboard.

40 EMBASE Salvare 2 Per salvare in modo permanente bisogna registrarsi (Register). Lascia in bianco il campo Subscription key, spunta gli articoli che ti interessano e clicca su Add to Clipboard. Spunta i risultati da salvare e clicca su Save this Clipboard. I risultati saranno depositati nella Saved Clipboard.

41 EMBASE Alert Per ricevere sulla propria gli aggiornamenti di una determinata ricerca bisogna essersi registrati (Register). Effettuare la ricerca e spuntarla nella Session Results. Cliccare sul simbolo della bustina (Send alert).

42 EMBASE Help Dalla Homepage di EMBASE, nella sezione Help, si trova una guida (in inglese).

43 Cinahl with Full Text Profilo Banca dati bibliografica: Cumulative Index to Nursing and Allied Health Literature versione with Full Text (a pagamento, da EBSCO HOST) ente: American Nurses Association e National League for Nursing, USA ambiti tematici: infermieristica e discipline correlate (es. riabilitazione) copertura: dal 1981 ad oggi (più di 2.9 milioni di record) documenti selezionati: riviste, abstract di libri di argomento sanitario, dissertazioni di tesi, atti di convegni, rapporti tecnici, materiale audiovisivo tipi di ricerca: Libera (base e avanzata), per CINAHL Headings informazioni sui documenti: descrizione bibliografica, abstract, CINAHL Headings, alcuni full text Presentazione record dal più recente, rilevante, ecc. CINAHL Headings ricco, interrogabile in vari modi ed esplicativo Tante funzioni per raffinare la ricerca e salvare i record (v. Help)

44 Cinahl with Full Text Accesso Accediamo dall Università o autenticandoci da casa, entriamo in MetaBib (Biblioteca Digitale) e selezioniamo Trova banche dati. E possibile cercare per Nome o per Categoria. CINAHL with Full Text è all interno della Categoria «Medicina», Sotto-categoria Infermieristica».

45 Cinahl with Full Text CINAHL Headings Si tratta della versione dei MeSH di PubMed. Cinhal riprende le intestazioni create dalla NLM e le adatta alle esigenze specifiche delle discipline infermieristiche, semplificandole in alcuni casi e aggiungendo in altri dei termini tipicamente infermieristici.

46 Cinahl with Full Text Quality Subheadings Ogni soggetto può essere visto sotto un particolare aspetto, detto Subheadings. Esso serve a delimitare la ricerca ai documenti che affrontano solo quel particolare aspetto. Selezionando Major concept si trovano solo i documenti in cui il termine cercato è l argomento principale. Selezionando explode si estende la ricerca a tutti i termini che nell albero si trovano sotto il termine cercato.

47 Cinahl with Full Text Ricerca libera Automaticamente si apre la ricerca avanzata che offre tre campi per ricercare. Per aumentarne il numero cliccare sul +. Si può cercare un tutti i campi (consigliabile) o selezionarne uno specifico. Ricordarsi di mettere anche sinonimi e varianti. Si possono usare i caratteri speciali (es.*). Di default prende come modo di ricerca la frase (Boolean/Phrase) che cerca termini vicini entro 5 posizioni.

48 Cinahl with Full Text I limiti Entrando nella banca dati appare attiva la funzione Limit your results. Il Journal Subset Nursing è molto utile per trovare articoli infermieristici. Seleziona il bottone Evidece-Based Practice per cercare solo le evidenze.

49 Cinahl with Full Text Ricerca combinata Selezionare Search History. Questa funzione presenta le ultime ricerche fatte. E possibile da qui combinare due ricerche con un operatore booleano. Si spuntano le ricerche fatte e si seleziona Search with AND.

50 Cinahl with Full Text I risultati della ricerca (1) I risultati appaiono in ordine di rilevanza. E possibile cambiare l opzione di visualizzazione mettendo l ordinamento dal più recente. La colonna a sinistra (Refine Results) permette di aggiungere dei limiti come Anno di pubblicazione, Tipo di documento (ad esempio Academic Journals), Soggetti principali, Età e Genere. Per scegliere ulteriori limiti cliccare su Advanced Search.

51 Le citazioni riportano: Cinahl with Full Text I risultati della ricerca (2) I dati bibliografici (titolo, autori, rivista, ecc.). I soggetti principali (Subjects). Quanti hanno citato l articolo all interno della banca dati (Cited References). Il PDF o il Full Text in formato HTML se disponibile. Il formato HTML permette di sentire il testo e di avere una traduzione approssimativa in italiano. Il bottone SFX per collegarti agli abbonamenti della Biblioteca. Per maggiori informazioni apri il record completo cliccando sul titolo dell articolo.

52 Cinahl with Full Text Il record Cinahl (1) Viene riportato il tipo di pubblicazione (Publication Type). Vengono riportati sia i soggetti principali e secondari. Troviamo l Abstract. Nella colonna di destra Tools abbiamo gli strumenti per salvare, spedire per , citare in diversi formati, esportare.

53 Cinahl with Full Text Salvataggio (1) E possibile salvare una selezione dei risultati cliccando su Add to folder. Questo li inserisce in una cartella (Folder) da cui poterli recuperare per salvarli, stamparli o inviarli per . Il folder dura solo il tempo della sessione.

54 Cinahl with Full Text Salvataggio (2) Il Folder non è personale e viene mantenuto solo durante la sessione. Se si vogliono conservare in modo permanente delle ricerche, è necessario creare il proprio account personale. Per avere un Folder personale è necessario cliccare su Sign in to My EBSCOhost, inserire i propri dati e scegliere un nome utente e una password, da utilizzare per i successivi login.

55 Cinahl with Full Text Alert Registrarsi in My EBSCO host. Una volta identificati, lanciare la ricerca. Cliccare su Search History e spuntare la ricerca fatta. Cliccare su Save Searches / Alerts. Scrivere a quale indirizzo si vogliono ricevere gli aggiornamenti, ogni quanto e in quale formato.

56 Cinahl with Full Text Tutorial Dalla Homepage di Cinahl, cliccare su Help (in inglese).

57 PsycINFO Profilo Banca dati bibliografica a pagamento (CSA) ente: American Psychological Association (APA), USA ambiti tematici: psicologia e discipline collegate copertura: dal 1800 ad oggi (più di 3 milioni di record) documenti selezionati: riviste, monografie, capitoli di monografie, tesi, rapporti tecnici, siti web tipi di ricerca: base e avanzata informazioni sui documenti: descrizione bibliografica, abstract, soggetti di psycinfo, tanti full text Interfaccia in inglese e in italiano Funzionalità 2.0 presentazione record dal più rilevante, recente etc. Thesaurus ricco, interrogabile in vari modi ed esplicativo tante funzioni per raffinare la ricerca e salvare i record v. Help

58 PsycINFO Accesso Accediamo dall Università o autenticandoci da casa, entriamo in MetaBib (Biblioteca Digitale) e selezioniamo Trova banche dati. E possibile cercare per Nome o per Categoria. La psicologia è all interno della Categoria «Medicina».

59 PsycINFO Basic Search Basic Search è utile come punto di partenza, inserendo termini liberi, ma non efficace per una ricerca approfondita e completa sull argomento. In fase di inserimento i termini vengono suggeriti automaticamente. NB: aprendo la banca dati esce automaticamente la ricerca avanzata. Cliccando su si accede alla pagina dei servizi Bicocca-Insubria che permette di sapere se l articolo è consultabile in formato elettronico o cartaceo.

60 PsycINFO Advanced Search Selezionando Subject Heading (all)=su dal menù a tendina e inserendo i termini individuati si ottengono risultati più pertinenti all argomento. E possibile scegliere di cercare solo gli articoli e di iniziare la ricerca da un certo anno di pubblicazione. I risultati vengono presentati dal più rilevante e si può scegliere l ordine cronologico.

61 PsycINFO Raffinare i risultati E possibile raffinare la ricerca scegliendo: il tipo di pubblicazione (articoli, tesi, libri, ecc.), il soggetto, la classificazione, la fascia d età, la popolazione, la metodologia, la lingua, la data, ecc. Per ciascun aspetto per cui è possibile restringere la ricerca, si apre un menù che permette di scegliere cosa includere (evidenziazione gialla) e cosa escludere (evidenziazione grigia).

62 PsycINFO Scheda e Nuova ricerca Dalla lista dei risultati, cliccando sul titolo, si vede la scheda bibliografica con l abstract. I soggetti e la classificazione sono selezionabili per rilanciare la ricerca.

63 PsycINFO Thesaurus (1) Il Thesaurus può essere interrogato da Advanced Search. Cliccando sul termine si apre la scheda sul soggetto con i livelli gerarchici (Broader o Related) e le specificazioni. Si può selezionare un soggetto per effettuare una ricerca.

64 PsycINFO Thesaurus (2) E possibile cercare anche più soggetti contemporaneamente. - Selezionare il 1 termine e spuntare l operatore booleano scelto. - Selezionare il 2 termine e spuntare ancora l operatore booleano. NB: automaticamente appare selezionato OR, utile quando vogliamo considerare due termini come sinonimi. Quando invece vogliamo incrociare più ricerche per trovare i risultati comuni ai due termini, dobbiamo usare AND.

65 PsycINFO Ricerca combinata Per fare ricerche più elaborate è possibile riutilizzare le ricerche fatte. E utile se si sono usati termini diversi nelle ricerche effettuate e/o si vuole aggiungere un altro termine più generale o più specifico. Per vedere le ricerche andare su «Recent searches».

66 PsycINFO Salvare i risultati Lanciata la ricerca, i risultati possono essere salvati o esportati. Basta spuntare i risultati di interesse e cliccare su Export/Save. Tra i formati di esportazione c è a disposizione anche EndNote. E possibile cambiare lo stile della citazione cliccando su Cite. Si posso spedire i risultati per o stamparli.

67 PsycINFO Creare un alert Per ricevere aggiornamenti direttamente sulla propria è possibile impostare un alert. E sufficiente lanciare la ricerca e cliccare su Create alert. Si può scegliere il formato, quando deve scadere l alert e il metodo di invio.

68 PsycINFO Funzionalità 2.0 La piattaforma ProQuest offre funzioni del web 2.0, utili per personalizzare lo strumento di ricerca e condividere i risultati: creazione di Tags e di elenchi condivisi, gestione di Feed RSS, preferenze di interfaccia, collegamento a RefWorks etc. Per utilizzare queste funzioni è necessario registrarsi (click su My Research). Per maggiori informazioni sull uso della banca dati, si ricorda di cliccare su Help (Guida).

69 Banche dati CSA Ricerca nelle Scienze Sociali Dalla Home page delle banche dati CSA si può selezione un area disciplinare e cercare contemporanemente in più banche dati. Ti segnaliamo che nell area delle Scienze Sociali, oltre a PsycINFO, possono esserti utili: Applied Social Sciences Index and Abstracts (ASSIA): salute, servizi sociali, psicologia PsycCRITIQUES: recensioni di libri di psicologia Linguistics and Language Behavior Abstracts: studio del linguaggio e linguistica PILOTS: disturbi post-traumatici Physical Education Index: educazione fisica

70 Per saperne di più Riferimenti della Biblioteca di Ateneo vai nella Sede di Medicina edificio U8 (Monza), piano terra visita MetaBib sul sito scrivici contattami (reference per medicina) - 02/