Il test a tre punti. Dipartimento di Scienze Agronomiche e Genetica Vegetale Agraria Giovanna Attene

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1 Il test a tre punti Dipartimento di Sienze Agronomihe e Genetia Vegetale Agraria Giovanna Attene

2 Riombinazione tra geni assoiati La frequenza di riombinazione tra due loi dipende dalla frequenza di rossing over La frequenza di rossing over fra due loi è funzione della loro distanza sul romosoma (Morgan) La frequenza di riombinazione viene assunta ome misura della distanza dei geni sul romosoma

3 Riombinazione tra geni assoiati rossing-over singolo tra il gene A ed il gene B rossing-over doppio a due filamenti tra il gene A ed il gene B

4 Riombinazione tra geni assoiati Due geni rossing-over doppio a due filamenti tra il gene A ed il gene B rossing-over doppio a tre filamenti tra il gene A ed il gene B rossing-over doppio a tre filamenti tra il gene A ed il gene B Il rossing-over è avvenuto ma non è osservabile. 50% parentali 50% riombinanti rossing-over doppio a quattro filamenti tra il gene A ed il gene B b b B B

5 rossing-over doppio a due filamenti e tre geni Riombinazione tra geni assoiati Tre geni Tipo di gamete Non rossover rossover doppio rossover doppio Non rossover Tipo di gamete senza gene entrale () rossing-over doppio a tre filamenti e tre geni rossing-over doppio a tre filamenti e tre geni rossover singolo rossover doppio rossover singolo Non rossover Non rossover rossover singolo rossover doppio rossover singolo Il gene entrale onsente una stima più preisa degli eventi di riombinazione tra A e B e quindi della loro distanza di mappa rossing-over doppio a quattro filamenti e tre geni b b B B rossover singolo rossover singolo rossover singolo rossover singolo

6 IMPORTANTE: NEI ROSSOVER DOPPI I GENI ESTREMI NON MOSTRANO RIOMBINAZIONE SOLO IL GENE ENTRALE MOSTRA RIOMBINAZIONE IL ONFRONTO FRA I FENOTIPI DEI PARENTALI E QUELLI DEI ROSSOVER DOPPI ONSENTE DI STABILIRE LA POSIZIONE DEL GENE ENTRALE E DI ONSEGUENZA L ORDINE DEI GENI SUL ROMOSOMA (ATTENZIONE: I FENOTIPI DELLA PROGENIE DEL REINROIO ORRISPONDONO AGLI APLOTIPI DEI GAMETI DEL TRIIBRIDO!!) INSIEME DELLE FORME ALLELIHE PRESENTI IN UN GAMETE

7 Riombinazione tra geni assoiati Mappatura genia: Il test a tre punti Reinroio (B1) ShshWxwx X shshwxwx Gameti Fenotipo N. ariossidi % Sh wx pieno, olorato, eroso sh wx ollassato, olorato, eroso Sh wx pieno, non olorato, eroso sh wx ollassato, non olorato, eroso Sh Wx pieno, olorato, normale sh Wx ollassato, olorato, normale Sh Wx pieno, non olorato, normale sh Wx ollassato, non olorato, normale Totale on assortimento indipendente 1:1:1:1:1:1:1:1

8 Quale è l ordine e la distanza tra i geni sul romosoma???? Sh? Wx? Gameti Fenotipo N. ariossidi % Sh wx pieno, non olorato, eroso sh wx ollassato, non olorato, eroso Sh Wx pieno, olorato, normale sh Wx ollassato, olorato, normale

9 Quali sono i genotipi dei parentali del triibrido? ShShWxWx X shshwxwx ShshWxwx X shshwxwx Gameti Fenotipo N. ariossidi % sh wx non olorato, ollassato, eroso Sh Wx olorato, pieno, normale

10 Quale è la distanza tra i geni sul romosoma? Sh Wx sh wx romosomi parentali Riombinanti della regione I sh wx Sh Wx Tipi di rossing over Sh Wx Riombinanti sh wx sh Wx Sh wx sh wx Sh Wx 1065 Sh Wx Sh wx Riombinanti della regione II sh wx sh Wx Sh wx sh Wx Sh Wx sh Wx Sh wx sh Wx Sh wx sh wx 9141

11 Quale è la distanza tra i geni sul romosoma???? Sh? Wx? Riombinanti della regione -Sh Riombinanti della regione Sh-Wx sh wx Sh Wx Sh wx sh Wx sh Wx Sh wx sh Wx Sh wx / * / * 100 = 2.32% = 2.32 M = 19.94% = M

12 Quale è la distanza tra i geni sul romosoma? 2.32 M M?? Sh? Wx? M Riombinanti della regione -Sh Riombinanti della regione Sh-Wx sh wx Sh Wx Sh wx sh Wx sh Wx Sh wx sh Wx Sh wx / * / * 100 = 2.32% = 2.32 M = 19.94% = M

13 2.32 M M 2.25 M M Sh Wx M M SOTTOSTIMA DISTANZE!!! Senza onsiderare rossing over doppi: Riombinanti della regione -Sh Riombinanti della regione Sh-Wx sh wx Sh Wx Sh wx sh Wx sh Wx Sh wx sh Wx Sh wx / * / * 100 = 2.32% = 2.32 M = 19.94% = M = 2.25% = 2.25 M = 19.87% = M

14 Grado di interferenza e oeffiiente di oinidenza Nell ipotesi he i due rossing over singoli siano due eventi indipendenti la probabilità he questi avvengano ontemporaneamente (= rossing over doppi attesi) è data dal prodotto delle probabilità dei rossing over singoli: rossover doppi attesi rossover doppi osservati = Probabilità rossover -Sh 2.32% X Probabilità rossover Sh-Wx 19.94% = 0.46% = 0.07%? Interferenza oeffiiente di oinidenza = rossover doppi osservati rossover doppi attesi = 0.07% /0.46% = 15.22% Grado di interferenza = = 84.78%

15 Grazie ai test a due punti e a tre punti è possibile mappare i geni e stabilire il loro ordine sul romosoma Il alolo delle distanze tra i geni è alla base della ostruzione delle mappe genetihe La mappa genetia è la rappresentazione grafia dei gruppi di assoiazione di una speie on l indiazione dell ordine e della posizione relativa dei geni lungo il romosoma I gruppi di assoiazione sono tanti quante sono le oppie di romosomi omologhi di una speie Le distanze tra i geni nelle mappe genetihe sono misurate in M (unità di riombinazione, unità di mappa)

16 Oltre alle mappe genetihe è ora possibile ostruire le mappe fisihe, misurate in bp (oppie di basi) La relazione tra mappe genetihe e mappe fisihe spesso non è uniforme pur onservando i loi lo stesso ordine tra le due mappe (olinearità) y w y w s s Mappa genetia Mappa fisia