MANUALE OPERATIVO PROGRAMMA DI GESTIONE DATI DI SENSIBILITÀ AGLI ANTIBIOTICI.

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1 MANUALE OPERATIVO PROGRAMMA DI GESTIONE DATI DI SENSIBILITÀ AGLI ANTIBIOTICI. Per utilizzare il programma di gestione dati di sensibilità agli antibiotici, occorre utilizzare un browser Web (Internet Explorer) specificando nella barra degli indirizzi la seguente URL: (Figura 1), oppure selezionando l apposito link (collegamento) dal sito dell Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Regioni Lazio e Toscana ( Centro di Referenza Nazionale per l Antibioticoresistenza (CRAB). Figura 1 Comando Log in Per poter accedere al programma selezionare il comando Log in. Questo comando consente di eseguire la procedura di Autenticazione (Figura 2). Ad ogni Utente verrà fornita una User Name ed una Password per accedere al programma. 1

2 Figura 2 Gli Utenti saranno riuniti in Gruppi di appartenenza ai differenti IIZZSS presenti sul territorio, e di conseguenza verranno abilitati degli Utenti Locali con funzioni di amministratore e degli Utenti Locali con funzioni limitate alle diverse fasi di Accettazione, Cancellazione etc. Dal Menù Gruppi e Utenti sono disponibili le opzioni di amministrazione dei gruppi e dei profili utente ; selezionando il comando Gruppi sarà disponibile un elenco dei gruppi di lavoro inseriti (solo per Amministratore Globale del CRAB) (Figura 3), selezionandone uno specifico, verrà visualizzato il dettaglio. Selezionando il comando Utenti Globali (solo per Amministratore Globale del CRAB) (Figura 4) sarà possibile visualizzare elenco degli utenti presenti sia Globali che Locali. E inoltre possibile visualizzare il proprio Profilo Personale scegliendo il comando Il Mio Profilo (Figura 5). Ogni Amministratore Locale può accedere esclusivamente all elenco degli Utenti del proprio Gruppo di lavoro potendo modificare le caratteristiche di ogni singola Utenza e/o aggiungerne di nuove 2

3 Figura 3 Figura 4 3

4 Figura 5 4

5 Eseguita la procedura di Autenticazione il programma si apre sulla pagina iniziale (Figura 6) Figura 6 Attraverso il comando Elenco Codici nel Menù personalizzato, saranno disponibili i codici di varie entità quali Comuni, Aziende, Ente di prelievo/analisi, luogo di prelievo etc. (Figure 7 e 8). Attraverso l opzione File XML, presente nel menù Azioni, sarà possibile scaricare il file XML contenente i codici dell entità interessata. N.B. l elenco codici delle aziende verrà aggiornato automaticamente ogni volta che dalla maschera Accettazione fase (1), l inserimento dell anagrafica prevedrà un azienda nuova (Vedi pagina 8). 5

6 Figura 7 Figura 8 6

7 Nel Menù Gestione Campioni (Figura 6) sono presenti diversi comandi da cui si può accedere a maschere successive, di seguito specificate. 1.ACCETTAZIONE Il comando apre la finestra Lista Numeri di Registrazione (Figura 9) che consente di visualizzare i Numeri di Registrazione già inseriti su cui sono possibili le Azioni elencate nel menù Gestione Campioni. Sono inoltre presenti dei comandi nel menù Azioni, di seguito elencate e descritte: Nuova Registrazione Nuovo Camp./Matr./Isol. Lista Accettati Home Figura 9 7

8 Nuova Registrazione Consente l inserimento di un Nuovo Numero di Registrazione, il pulsante apre su una maschera di ACCETTAZIONE fase(1) (Figura 10), che consente l inserimento degli Estremi di Registrazione e dell Anagrafica del Campione. Alla voce Proprietario/Azienda è possibile effettuare l inserimento di una nuova Azienda i cui dati saranno automaticamente associati ad un codice (vedi ELENCO CODICI PER UPLOAD FILE CSV) e resi disponibili per un futuro inserimento. Per gli utenti abilitati è possibile consultare l elenco codici dalla pagina Home. Scegliendo l opzione Aggiungi si passa alla maschera ACCETTAZIONE fase(2) (Figura 11). Allo stesso Numero di Registrazione possono appartenere 1 o più N Progr. Campione ad ognuno dei quali corrisponde un solo animale dal quale possono essere processate diverse matrici. N.B. Qualora si è in presenza di un solo campione si dovrà comunque attribuire il N Progr. Campione uguale ad 1. Scegliendo l opzione Aggiungi sarà possibile inserire un ulteriore Campione. Scegliendo l opzione Salva ed Esci si torna alla maschera Lista Numeri di Registrazione. 8

9 Figura 10 9

10 Figura 11 10

11 Figura 12 Nuovo Camp./Matr./Isol. Permette di inserire un Nuovo Campione o una nuova Matrice o un Nuovo Isolato richiamando il Numero di Registrazione relativo (Figura 12). 11

12 Figura MODIFICA REGISTRAZIONE Questo comando permette di modificare alcune informazioni relative al Numero di Registrazione selezionato (Figura 13). N.B. non tutte le informazioni sono suscettibili di modifica, si consiglia nel caso di eliminare il Numero di Registrazione e procedere ad un nuovo inserimento. Con il comando Modifica posto a piè di pagina sarà possibile modificare e tornare alla pagina iniziale. 3. ELIMINA REGISTRAZIONE Consente di eliminare tutti i dati relativi ad un Numero di Registrazione con i campioni relativi. 4. ELIMINA CAMPIONE Consente di eliminare il campione selezionato senza eliminare il Numero Registrazione relativo 5. AGGIORNA ISOLATO Consente di inserire in un momento successivo l identificazione dell isolato di un Numero di Registrazione già inserito. Il campione relativo apparirà sulla maschera con una immagine in movimento che lo evidenzia. 12

13 6. ELIMINA ISOLATO Consente di eliminare l isolato senza eliminare il Numero Progressivo campione relativo e di conseguenza senza cancellare il Numero di Registrazione Relativo. 7. ESITI ABG AGAR D. MM Consente in una fase successiva all inserimento dei dati anagrafici di inserire i valori numerici relativi alla metodica di Agar Diffusion (Figura 14). Selezionando il Numero di Registrazione e l anno comparirà una maschera che consente di visualizzare il/i campione/i presenti (Figura 15). Ad ogni campione corrisponde un icona, selezionando quest ultima si aprirà la maschera per l inserimento dei dati dell Antibiogramma (Figura 16). Scegliendo il comando Conferma a piè di pagina a destra si torna alla pagina precedente. Figura 14 13

14 Figura 15 Figura 16 14

15 8. ESITI ABG MIC MG/L Consente in una fase successiva all inserimento dei dati anagrafici di inserire i valori numerici relativi alla metodica di Micro Broth Dilution seguendo la procedura già descritta per l Agar Diffusion. Nella sezione di inserimento Esiti ABG Mic mg/l è possibile inserire valori decimali utilizzando il punto come separatore. Per valori di MIC superiori a 16 occorrerà inserire la stringa >16 Per valori di MIC superiori a 32 occorrerà inserire la stringa >32 Per valori di MIC superiori a 2048 occorrerà inserire il codice RICERCA ABG Consente di visionare i dati dell Antibiogramma già inserito e di poter stampare il Report relativo. 15

16 UPLOAD DEI DATI I dati potranno essere inseriti nel database anche attraverso la procedura di Upload (importazione dati), mediante l'importazione di file nel formato CSV (Comma Separated Value) in base al tracciato record che verrà distribuito. Nel menù Gestione campioni (Figura 6) sono presenti le opzioni per l importazione dei dati nel database del CRAB, attraverso i File nel formato CSV. Sono disponibili due opzioni: Upload Accettaz. CSV (Figura 17) e Upload Campioni. CSV (Figura 18). I file interessati al caricamento dei dati nel database saranno due; un file (Accettazione.CSV) contenente i dati di accettazione comuni a più campioni e matrici di uno stesso numero di registrazione, ed un file (Campioni.CSV) contenente occorrenze multiple relative ad uno o più campioni/matrici/microrganismi presenti nella stessa scheda. Occorrerà eseguire l'upload (importazione dati) dei file sul programma di gestione dati del CRAB nella seguente sequenza: 1). Nella prima fase occorrerà importare il file contenente i dati anagrafici utilizzando il File Accettazione.CSV (Figura 19). Figura 17 16

17 Per ogni numero di registrazione verrà visualizzato l esito dell Upload (Figura 20). Nel caso l esito sia negativo, occorre prendere visione degli errori di importazione dati e comunicarli al settore informatico di propria competenza per trovare la giusta soluzione. Quindi eseguire la seconda fase. 2) Nella seconda fase dalla maschera che si apre con il comando Upload Campioni CSV (Figura 18) si dovrà eseguire l upload del secondo file Campioni.CSV (Figura 19), contenente occorrenze multiple relative ad uno o più campioni presenti nella stessa scheda. Figura 18 17

18 Figura 19 Figura 20 Per ogni numero di registrazione verrà visualizzato l esito dell Upload (Figura 20). Nel caso l esito sia negativo, occorre prendere visione degli errori di importazione dati e comunicarli al settore informatico di propria competenza per trovare la giusta soluzione. 18

19 12. ESPORTAZIONE DATI E' possibile gestire localmente i dati del proprio gruppo attraverso la procedura di esportazione dati nei formati Microsoft Excel (file XLS) e Microsoft Access (file MDB) (figura 21). Nel file MDB (Microsoft Access) è presente anche una query a campi incrociati (Pivot) predefinita che una volta eseguita in locale sul proprio computer, visualizzerà un report nel formato Pivot. Figura 21 19