BANCHE DATI PRIMARIE E SECONDARIE PUBMED

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1 BANCHE DATI PRIMARIE E SECONDARIE PUBMED Per Il Corso di Laurea Specialistica in Scienze Infermieristiche ed Ostetriche A cura di Laura Colombo

2 BANCHE DATI PRIMARIE Indicizzano articoli originali pubblicati sulle principali riviste biomediche. (Es.: Medline, Cinahl, Embase,, Banche Dati Specialistiche)

3 BANCHE DATI SECONDARIE Indicizzano prodotti della ricerca caratterizzati dalla revisione critica con metodologia appropriata degli studi primari (articoli originari) relativi ad un determinato argomento. (Es.: Cochrane Library,, linee Guida, BD di analisi economiche, etc. )

4 PUBMED: : http:

5 Cos è PubMed Banca dati bibliografica prodotta dalla National Library of Medicine. Copre le discipline della medicine, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria, organizzazione sanitaria, scienze pre-cliniche cliniche,, farmacia. Presente gratuitamente online dal 1997.

6 Cosa contiene Pubmed più che un database è un insieme di diversi database, che possono essere interrogati insieme o separatamente. Il nucleo di Pubmed è Medline che forma la parte più consistente delle citazioni presenti.

7 Pubmed: : l interfaccial Il portale Entrez, Predisposto dal NCBI, offre l accesso l non solo a Pubmed,, ma anche a diversi altri databases. Si tratta principalmente di databases di ambito biochimico e genetico.

8 Medline: : selezione delle riviste Include 17 milioni di citazioni derivate da 5197 riviste. Le riviste vengono selezionate da un comitato di esperti composto da medici, editori e bibliotecari che esamina periodicamente i nuovi titoli. Alcune riviste sono indicizzate completamente, altre in modo selettivo, solo per gli articoli attinenti la medicina.

9 Medline: : copertura geografica, linguistica e temporale Copertura geografica: : vengono spogliate riviste provenienti da tutto il mondo (Stati Uniti e altri 70 paesi). Il 47% delle riviste sono pubblicate negli USA. Copertura linguistica: : 53 lingue correnti. Il 90% delle citazioni riguardano articoli in inglese. Copertura temporale: : parte dal 1966 a oggi.

10 OLTRE MEDLINE OLDMEDLINE Questo database contiene le citazioni tra il 1950 e il Si tratta di citazioni pubblicate originariamente su riviste cartacee, il Cumulated Index Medicus (CIM) e il Current List of Medical Literature (CLML). I dati vengono in seguito convertiti in formato elettronico, ma non aggiunti a medline perché differenti (in particolare, non sono indicizzati con i MeSH ma con altri tipi di parole chiave), perciò sono tenuti separati in un database chiamato OldMedline.

11 PREMEDLINE( O IN PROCESS) In process citations sono citazioni di articoli appena pubblicati inserite con i soli dati basilari e ancora non completate dai catalogatori della NLM. Una citazione viene indicizzata dopo 60 giorni entrando a far parte di medline.. Ogni giorno da martedì a sabato vengono aggiunte a Pubmed nuove citazioni in process. EPUB AHEAD OF PRINT Citazioni di articoli elettronici, in attesa di essere pubblicati su riviste cartacee.

12 Pubmed tutorial Il tutorial ufficiale della National Library of Medicine, accessibile dalla pagina iniziale di PUBMED: aggiornato al 20/08/2005 (Consultato l ultima l volta 4/10/2007)

13 Wildcards PUBMED Simboli di troncamento. Va usato l asterisco l (*) PubMed utilizza le prime 150 variazioni del termine troncato. Se una radice ha più di 150 variazioni PubMed visualizza il messaggio: "Warnings: Wildcard search for 'term* term*' used only the first 150 variations. Lengthen the root word to search for all endings." PubMed non trova le parole separate dallo spazio Esempio: inserendo infection* troverà infections ma non infection control. Il troncamento disabilita l'automatic term mapping.

14 Come è fatto un record Pubmed Ogni record di Pubmed è costituito da diversi campi. Per visualizzare TUTTI i campi del record è necessario scegliere tra le visualizzazioni proposte il formato Medline. Ogni campo è indicato da un TAG, scritto in maiuscolo e tra parentesi quadre. Es.: [AU] = Author E possibile limitare la ricerca ai termini che si trovano in un determinato campo scrivendo accanto al termine di ricerca il tag relativo al campo.

15 Un record Pubmed

16 RICERCA CON LINGUAGGIO CONTROLLATO e LIBERO TERMINE CONTROLLATO Ricavato da un Thesaurus/dizionario controllato e inserito nel campo descrittori (Mesh) TERMINE LIBERO Parola presente nel titolo, nell abstract, in altri campi del record bibliografico, nel MeSH,, nei Subheadings. FARE SEMPRE ENTRAMBE LE RICERCHE!

17 TERMINE CONTROLLATO TERMINE LIBERO

18 Il MeSH Per ottimizzare la pertinenza dei risultati di una ricerca in una banca dati e e bene utilizzare il suo thesaurus. Il thesaurus di Pubmed è il MeSH (Medical Subject Headings). E prodotto dalla NLM che ne cura la manutenzione continua. Il MeSH ha una struttura ad albero. Si parte da categorie molto ampie per arrivare a soggetti (descrittori) sempre più specifici. E possibile scegliere se esplodere nella ricerca ogni termine anche ai termini sottostanti oppure limitare la ricerca al termine più ampio.

19 COME FUNZIONA IL MESH Dalla pagina iniziale selezionare il bottone MeSH Database. Scrivere il termine cercato nello spazio bianco for. Il sistema propone uno o più MeSH. Si può selezionare tutto il termine o uno o più Subheadings. Si può limitare la ricerca al Major Topic (cliccando dal MeSh su Links). Scegliere dal menù Send To e Search Box with AND. La ricerca viene portata in alto alla pagina. Cliccare sul bottone PubMed Search per lanciare la ricerca.

20 L albero dei MeSH 2007 Anatomy [A] Organisms [B] Diseases [C] Chemicals and Drugs [D] Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment [E] Psychiatry and Psychology [F] Biological Sciences [G] Natural Sciences [H] Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena [I] Technology, Industry, Agriculture [J] Humanities [K] Information Science [L] Named Groups [M] Health Care [N] Publication Characteristics [V] Geographicals [Z]

21 I Subheadings Sono 83 (nel Mesh 2007) termini che qualificano l aspetto (punto di vista) del MeSH. Spesso sostituiscono somme di MeSH. Alcuni subheadings sono identici a descrittori MeSH ma vengono utilizzati in contesti diversi. Per un elenco dei qualificatori con i loro significati vedi: (Consultato l l ultima volta il 5/10/2007)

22 La garanzia letteraria I descrittori MeSH vengono revisionati ed aggiornati annualmente sulla base dell evoluzione evoluzione delle scienze biomediche (criterio della garanzia letteraria) Specialisti di ogni area della biomedicina effettuano il monitoraggio della letteratura scientifica e tengono sotto osservazione le aree emergenti della ricerca.

23 Il Mesh in italiano L Istituto superiore di sanità offre una traduzione italiana dei Mesh,, disponibile previa registrazione al sito Mesh/ La traduzione fa parte di un progetto per la creazione di un thesaurus multilingue per la medicina che unifichi i molteplici thesauri ora in uso. Si veda in proposito (Consultati l ultima l volta 4/10/2007)

24 LIMITS La funzione limits serve per limitare i risultati di una ricerca già fatta, utilizzando una serie di possibili criteri.

25 Subsets Sono dei gruppi di riviste costituiti in base all area area disciplinare di cui le riviste si occupano. Scegliere di limitare la ricerca ad un solo subset elimina tutti gli articoli tratti da riviste che non fanno parte di quel subset. Molto utile il Subsets: : NURSING JOURNALS. I limiti di lingua (Languages( Languages) Anche se gli articoli sono in lingue diverse dall inglese, il titolo e l abstractl saranno sempre dati in inglese. Se il titolo dell articolo è racchiuso tra parentesi quadre [ ] la lingua originale non sarà l inglese.

26 Tipi di pubblicazione (Type of Article) L elenco dei tipi di pubblicazione presenti in Pubmed si trova alla pagina web books/bv.fcgi?rid=helppu bmed.table.pubmedhelp.t42 (consultati 4/10/2007) Practice Guideline si usa per articoli che parlano di linee guida solo se sono pubblicate su riviste. Il posto più giusto per trovare linee guida sono i siti governativi (v. incontro linee guida). Tra i Publication Types non troviamo le systematic review.

27 LA RICERCA LIBERA La ricerca libera si effettua con il linguaggio naturale. Più termini vengono automaticamente combinati con l operatore l AND. I termini inseriti vengono cercati in tutti i campi. E la ricerca da utilizzare per argomenti specifici e quando il termine non è un MeSH.

28 RICORDARSI SEMPRE DI CONSIDERARE: SINONIMI Considerare tutti i sinonimi mettendoli tra l l operatore booleano OR SINGOLARE / PLURALE E possibile usare il carattere di troncamento * al termine della parola singolare. Il troncamento disabilita il term mapping e l esplosione l automatica del MeSH quindi usarlo con cautela. INGLESE / AMERICANO Es. Tumor / Tumour; Haematology / Hematology

29 I suggerimenti automatici Quando vengono immessi dei termini, il sistema propone automaticamente delle forme alternative. Questa funzionalità è utile quando non si conosce la grafia esatta di un termine. Se viene immesso un termine con errori ortografici, il sistema presenta suggerimenti per forme alternative di ortografia. La mappatura automatica Quando si inseriscono dei termini di ricerca senza specificare i campi o la sintassi, scatta la mappatura automatica dei termini cioè una serie di automatismi con cui PubMed interpreta la ricerca.

30 LIMITI del MeSH E utilizzato solo sul subset Medline,, non su OldMedline o sulle citazioni in process. Non trova articoli su argomenti nuovi, argomenti poco studiati o poco consueti. Non trova i record inseriti da poco nel database. LIMITI della RICERCA LIBERA Trova molti articoli non pertinenti.

31 ALTRI TIPI DI RICERCHE BASE PMID TITOLO RIVISTA CONTROLLA LA CITAZIONE

32 RICERCA PER TITOLO DI RIVISTA JOURNAL DATABASE Contiene un archivio di titoli di riviste biomediche completi di ISSN e rimandi alle possibili abbreviazioni. Si usa spesso per avere la forma completa di un titolo di cui si conosce solo l abbreviazione. l Una volta trovato il periodico si possono visualizzare record relativi a tutti gli articoli pubblicati in quel periodico.

33 RICERCA PER PMID PMID : ogni record ha un suo identificativo univoco (PubMed( unique Identifier). La ricerca per PMID e e utile per recuperare rapidamente un record già noto senza il rischio di confonderlo con uno simile.

34 CONTROLLA LA CITAZIONE Il Single Citation Matcher si usa per completare una citazione di cui si hanno solo dati incompleti. C è il completamento automatico quindi è utile quando non si è certi di come vada scritto un nome. Utile per far la ricerca per AUTORE. NB: PubMed indicizza fino a un massimo di 99 autori per articolo.

35 RICERCA AVANZATA PREVIEW HISTORY VISUALIZZAZIONE DEI RISULTATI SALVARE I RISULTATI

36 La funzione Preview/index index Questa funzione permette di avere subito il sommario con il numero di risultati ottenuto. Permette di raffinare la ricerca introducendo un nuovo termine. Permette di combinare più ricerche già fatte utilizzando gli operatori booleani.

37 La visualizzazione dei risultati Summary E il formato standard, dal quale si possono avere le informazioni essenziali e l indicazione della presenza dell abstract e del full text. Abstract - Include: nome del periodico, link a Comment/Correzioni, il titolo, lingua dell articolo (se non inglese), Autori, Corporate Author (enti), Author Affiliation (istituzione di cui l autore l fa parte), Abstract (se presente), il PMID e la citazione sullo stato di indicizzazione. DA IL PUBLICATION TYPES.

38 Citation - Questo formato include: Authors,, Corporate Authors,, Titolo, nome del periodico, tipo di pubblicazione, lingua dell articolo (se non inglese), l annotazione "No abstract available in in caso di abstract non disponibile, il PMID, i termini MeSH,, Sostanze chimiche, n. di identificazione corrispondente delle banche dati secondarie di Pubmed,, nome della persona se soggetto di pubblicazione, i Grant numbers,, il PMID e la citazione sullo stato di indicizzazione. DA I MeSH TERMS E I PUBLICATION TYPES Medline E il formato completo in assoluto, contiene ogni tipo di campo: identificato dal nome del tag di ogni specifico campo.

39 History e combinazione delle ricerche La funzione History permette di visualizzare le ultime ricerche fatte e di combinarle tra loro utilizzando gli operatori booleani. Per combinare due ricerche è necessario scrivere il loro numero preceduto dal carattere #. La History contiene fino a 100 ricerche per un massimo di 8 ore.

40 Esempio di ricerca combinata Combiniamo le ricerche -assistenza infermieristica preoperatoria -tumore alla prostata

41 Salvare i risultati: clipboard Permette di salvare fino a 500 record per un massimo di 8 ore (o fino alla chiusura della sessione di ricerca). Per salvare nella Clipboard: selezionare i risultati che si desidera salvare, poi selezionare send to e clipboard.

42 My NCBI Richiede una registrazione e una password. Permette di salvare i risultati in modo permanente in una propria cartella. Una volta selezionati i risultati da salvare, dalla preview cliccare sul numero della ricerca e selezionare Save in My NCBI. Permette di avere aggiornamenti (Alert( Alert) ) sulla ricerca fatta, direttamente al proprio indirizzo .

43 I RISULTATI DELLA RICERCA E possibile selezionare gli articoli spuntandoli. Cliccando sul bottone Send to e scegliendo Text, si visualizzano gli articoli selezionati ed è possibile stamparli. Cliccando sulla singola citazione, si apre accanto o sotto la citazione il bottone dell editore. Provare sempre a cliccarlo se c èc scritto FREE. Se l l articolo è disponibile gratuitamente si aprirà il full text.

44 Related Articles Selezionando un articolo e poi Related Articles PubMed ritrova gli articoli correlati allo stesso, comparando le parole del titolo, dell abstract e dei termini MeSH. Questo tipo di ricerca permette di partire da un articolo particolarmente mirato sull argomento della ricerca per trovarne altri correlati.

45 Links Permette di accedere a collegamenti con risorse esterne a Pubmed ma correlate all articolo. articolo. La funzione LinkOut indica documenti presenti su pagine web esterne a PubMed. Questi documenti non sono sempre ad accesso libero.

46 NLM gateway

47 Medline Plus medlineplus/ Si può accedere tramite l opzione l Consumer Health di PubMed. E un sito curato dalla National Library of Medicine con lo scopo di fornire al pubblico informazione scientificamente valida, anche se in forma semplificata per essere accessibile a tutti. E disponibile anche una versione in lingua spagnola.

48 Health Topics include tutorial interattivi che usano la grafica animata e il suono per spiegare le condizioni e le procedure in un linguaggio semplice. Drug & Supplement per cercare farmaci. Encyclopedia contiene immagini mediche e 4000 articoli. Dictionary è un utile vocabolario medico. News raccoglie le ultime novità della sanità.

49 ALTRE RISORSE ClinicalTrials.gov, il database di sperimentazioni Controllate (clinical trials) sponsorizzate principalmente dal NIH ad uso del paziente. DIRLINE, la directory di organizzazioni operanti nel Settore della sanità. Genetic Home Reference,, sito per l l informazione ai consumatori sulle condizioni genetiche e i geni o cromosomi responsabili di queste condizioni. HSRProj, il database delle citazioni relative a progetti di ricerca in progress nel settore delle tecnologie sanitarie e dello sviluppo di linee guida per la pratica clinica.

50 Clinical Queries Permette di cercare le prognosi delle malattie, cosa che sfugge in pubmed. -Trova citazioni corrispondenti a una specifica categoria di studio clinica. -Trova solo revisioni sistematiche. -Trova citazioni di vari argomenti di genetica medica.

51 Pubmed central E un archivio di articoli a testo pieno che la NLM mette a disposizione gratuitamente alla comunità scientifica. Il progetto è partito nel 2000 e per ora il database contiene qualche centinaio di migliaia di articoli. Gli editori partecipano al progetto su base volontaria.