SIEROLOGIA,VIROLOGIA e BIOLOGIA MOLECOLARE

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1 AREA OPERATIVA SIEROLOGIA, VIROLOGIA E BIOLOGIA MOLECOLARE Pag. 1 di 15 SIEROLOGIA,VIROLOGIA e BIOLOGIA MOLECOLARE Il materiale biologico su cui vengono eseguite le indagini virologiche, tranne rarissime eccezioni,e il sangue. Il laboratorio utilizza per la diagnosi delle malattie virali metodiche di tipo indiretto e di tipo diretto. Le prime consistono in tecniche immunologiche volte alla ricerca di antigeni virali o di anticorpi da tali antigeni indotti.si tratta di tecniche di immunoenzimatica(eia),di immunofluorescenza(ifa),di Immunoblotting (W.B.),di agglutinazione (AD), di chemiluminescenza (CLIA) e di loro variazioni evolutesi nel corso degli anni (CMIA, ELFA, IHA ). Le seconde consistono nella ricerca diretta dell acido nucleico virale con tecniche in biologia molecolare.si tratta di tecniche che sfruttano reazioni di amplificazione genetica (PCR e LCR) e sonde genetiche specifiche. Dallo studio del genoma dell agente infettivo si possono anche ricavare informazioni sulla sua virulenza o farmacoresistenza.

2 Pag. 2 di 15 ELENCO ESAMI SIEROLOGICI-VIROLOGICI E DI BIOLOGIA MOLECOLARE ESEGUITE DAL LABORATORIO DI MICROBIOLOGIA * Tariffa come da codice tariffario DRG n del 26/07/04 e aggiornamenti e ticket ANALISI CODICE TARIFFA* CHLAMYDIA PNEUMONIAE Chlamydia Pneumoniae IgG - IgM EURO Codice TARIFFARIO ACLP 13,90 x Ticket 11,85 x 2 MATERIALE METODO VALORI DI RIFERIMENTO Siero ELISA TEMPO MASSIMO DI REFERTAZIONE CHLAMYDIA TRACHOMATIS Chlamydia Trachomatis IgG - IgA ACLM 13,90 x siero ELISA Ticket 11,85 x 2 Chlamydia Trachomatis TRA1 Secreto uretrale Chlamydia Trachomatis TRA2 Secreto cervicale Chlamydia Trachomatis TRA3 Liquido seminale Chlamydia Trachomatis TRA4 Urina (primo mitto) Chlamydia Trachomatis TRA5 Secreto oculare BARTONELLA (ROCHALIMAEA) Bartonella IgG - IgM (Rochalimaea) BORDETELLA PERTUSSIS Bordetella Pertussis IgG IgA BART 9,15 x Ticket 7,80 APER 10,95 x Siero IFA Assenti. Titolo: Siero ELISA Valore numerico Assenti (<9 UA/ml)

3 Pag. 3 di 15 Ticket 9,30 Non discriminanti (9-11 UA/ml) ( > 11 UA/ml) BORRELIA Borrelia IgG IgM BORR 9,00 x 2 PARVOVIRUS B 19 Parvovirus B19 IgG Parvovirus B19 IgM RICKETTSIA CONORI Rickettsia conori IgG IgM Rickettsia conori IgG IgM MYCOPLASMA PNEUMONIAE Mycoplasma pneumoniae IgM TIFO-PARATIFO BRUCELLA Reazione di Widal- Wright SIFILIDE Sifilide VDRL(RPR) (PARV) PRVG 9,15 Ticket 07, PRVM 9,15 Ticket 7, ARCO 6,00 Ticket 7, ARCOL 6,00 Ticket 5, Ticket 5,10 MICO 13, WIDA 7,95 Ticket 11, VDRL 4,00 Ticket 6, Ticket 3,40 Siero ELFA Assenti. Siero ELISA Assenti Siero ELISA Assenti Siero IFA Assenti. Titolo Liquor IFA Assenti. Titolo Siero EIA Assenti Siero AD.Titolo Siero AD

4 Pag. 4 di 15 Sifilide VDRQ 4,00 x 4 Siero AD 5 giorni VDRL semiquantitativa Liquor.Titolo Sifilide TPHA 6,80 Siero IHA TPHA (diluizione di partenza 1/80) Ticket 06,25.Titolo Sifilide WES2G 82,10 Siero Immuno 15 giorni Western blot IgG (test di conferma) Ticket 69,80 Liquor blotting Presenza di una sola banda/di due bande in posizione. Sifilide Western blot IgM Risultato non significativo per la diagnosi di Sifilide.Presenza di bande specifiche (47,17, 15,5) per anticorpi anti Treponema pallidum Sifilide ATREP 7,80 Siero CLIA Titolo indice Anticorpi totali IgG-IgM (< 1,1) (test di screening) Ticket 6,65 (>1,1) LEGIONELLA PNEUMOPHILA Legionella pneumophila R67 8,20 Urine EIA Antigene Ticket 7,00 (contenitore sterile) ALEN 7,85 x 2 Siero EIA Assenti Legionella pneumophila IgG e IgM sierotipo Ticket 6,70. PNEUMOCOCCO Pneumococco R61 8,20 Urine EIA Antigene Ticket 7,00 (contenitore sterile) HELICOBACTER PYLORI AELI 9,80 Siero ELFA Assenti Helicobacter ilori IgG Ticket 8,35 Helicobacter ilori R 74 8,20 Feci EIA Antigene Ticket 7,00 (contenitore sterile)

5 Pag. 5 di 15 LEPTOSPIRA leptospira LEPT 16,75 CLOSTRIDIUM DIFFICILE Clostridium difficile Tossina A e B Clostridium difficile ANTIGENI BATTERICI SOLUBILI Antigeni batterici solubili Antigeni batterici solubili Antigeni batterici solubili ASPERGILLUS CLOS 7,05 Ticket 14, Ticket 6,00 R3L 1,55 x Ticket 1,35 R3S 1,55 x Ticket 1,35 R3U 1,55 x Ticket 1,35 Antigeni solubili R76 12,95 CRIPTOCOCCO Criptococco Antigene Criptococco Antigene titolazione Criptococco Antigene R68 7,15 R71 Ticket 11, Ticket 06,10 7,15 x R69 7,15 Ticket 06, Ticket 06,10 Siero ELISA a basso titolo(si consiglia di ricontrollare tra 15 giorni) Feci EIA Assente Presente Liquor AD Siero AD Urine AD Siero EIA Indice antigenemia <0,5 negativo Liquor AD Indice antigenemia 0,5 positivo. 1 giorno 1 giorno 1 giorno Liquor AD Titolo Siero AD 6 giorni

6 Pag. 6 di 15 Criptococco Antigene Titolazione R72 7,15 x Ticket 6,10 Siero AD Titolo 6 giorni VIRUS RESPIRATORIO SINCIZIALE Virus respiratorio Sinciziale R30 10, Ticket 09,20 Secrezione naso-faringea Aspirato tracheale EIA PNEUMOCYSTIS JIROVECI (CARINII) Pneumocystis jiroveci (carinii) R60 8, BAL IFA Ticket 7,40 Pneumocystis jiroveci (carinii) R65 8, Espettorato IFA Ticket 7,40 Pneumocystis jiroveci (carinii) R66 8, Broncoaspira to IFA Ticket 7,40 ECHINOCOCCO Echinococco anticorpi AECH 9, Ticket 8,25 LEISHMANIA Leishmania anticorpi ALEIS 12, Ticket 10,85 Leishmania viscerale PARS 4, Ticket 03,65 Siero IHA Assenti Titolo Siero IFA Assenti Striscio di aspirato splenico o midollare colorazione di Giemsa Titolo

7 Pag. 7 di 15 Leishmania cutanea e muco-cutanea PARS 4, Ticket 3,65 Striscio di materiale biologico ottenuto da rattamento o aspirazione dei bordi dell ulcera colorazione di Giemsa PLASMODIUM SPP. MALA 4, Ticket 3,65 Sangue in EDTA (provetta da emocromo) colorazione di Giemsa Inviare immediatamente in laboratorio prelevato durante la puntata febbrile TRYPANOSOMA SPP. PARS 4, Ticket 3,65 Sangue in EDTA (provetta da emocromo) colorazione di Giemsa 1 giorno MICROFILARIE PARS 4, Ticket 3,65 Sangue in EDTA (provetta da emocromo) colorazione di Giemsa Concordare con il laboratorio i tempi di prelievo e invio FILARIE IN FORMA ADULTA PARS 4, Ticket 3,65 Raccogliere i parassiti in contenitore con tappo verde (Ecofix) 1 giorno SCHISTOSOMA HAEMATOBIUM uova PARS 5, Ticket 4,80 CRIPTOSPORIDIUM R29 12, Ticket 11,00 Tutte le urine della mattinata concentrazione delle urine Feci IFA Assenti 1 giorno

8 Pag. 8 di 15 ESAME PARASSITOLOGICO Protozoi: cisti trofozoiti PARF 5, Ticket 4,80 Feci conservate (Ecofix) concentrazione delle feci Elminti : uova larve ENTEROBIUS VERMICULARIS (OSSIURI) Test di Graham OSSI 3, Ticket 03,40 Scotch trasparente su vetrino portaoggetti M.O. (Scotch test) Uova GIARDIA INTESTINALIS R75 12, Ticket 11,00 Feci conservate (Ecofix) EIA MICETI (Esame micologico generico) EM1 4,00 (coltura) Ticket 03,70 3,30 Annessi cutanei (cute, peli, unghie, capelli) Es. colturale Microscopico 25 giorni (micro) Ticket 03,05 Identificazione MICETI EM7 4,00 Feci Es. colturale (Esame micologico sulle feci ) Ticket 03,40 MICETI in coltura Identificazione MICID Ticket 2,80 Miceti cresciuti su appositi terreni Microscopia ottica Identificazione delle colonie 25 giorni MANTOUX (cutireazione) MANTU 6, Ticket 05,20 Valutazione della reazione eritematoindurativa Negativa Positiva Misurazione della reazione indurativa in mm

9 Pag. 9 di 15 MICOBATTERI Ricerca diretta (BAAR) DI 4, Ticket 03,65 Esame colturale M.. 19,25 Identificazione da coltura ricerca Micobatteri atipici Micobacterium tubercolosis (Ricerca diretta DNA) EPATITE A Ticket 16,40 MATIP 45, Ticket 38,25 MDNA 126,55+ 53, Ticket 107,60 Ticket 45,50 Epatite A Ig G HAVG 11, Ticket 9,35 Epatite A IgM HAVM 12,95 EPATITE B Ticket 11,00 HbsAg BSAG 12, Ticket 10,40 HbsAb BSAB 10, Ticket 09,05 HbcAb BCAB 10, Ticket 08,85 HbcAb IgM COREM 11, Ticket 9,50 Coltura batterica Tutti I materiali colorazione di Kinyoun Coltura su terreni solidi e liquidi Sonda genetica INNOLIPA Amplificazione genetica Negativa Positiva (+/++++) siero CMIA Assent siero CMIA Assenti siero CMIA Assenti 60 giorni 20 giorni siero CMIA Valore numerico siero CMIA Assenti siero CMIA Assenti

10 Pag. 10 di 15 HbeAg BEAG 10, Ticket 09,05 HbeAb BEAB 11, Ticket 9,35 HBV-DNA BDNA 126,55+ EPATITE C 53, Ticket 107,60 Ticket 45,50 EPATITE C HCV 12,20 HCV test di conferma (RIBA) Ticket 10,40 RIB1 82, Ticket 69,80 HCV RNA HCVRN 126,55+ HCV tipizzazione genomica 53, Ticket 107,60 Ticket 45,50 HCVT 126,55+ 53,50+ 91, Ticket 116,45 Ticket 49,25 Ticket 83,85 siero CMIA Assenti siero CMIA Assenti siero 2 provette Real time siero CMIA Assenti Dna non rilevato < 20 IU/ml : Dna rilevato con carica al di sotto del limite del test Fra milioni IU/ml : Dna quantizzabile siero Immuno blot Siero 2 provette Siero Real time RT-PCR Ibridazione su strisce di nitrocellulosa Indeterminato positivo RNA non rilevato < 15 IU/ml: RNA rilevato con carica al di sotto del limite del test Fra milioni IU/ml: RNA quantizzabile Vari genotipi 10 giorni

11 Pag. 11 di 15 EPATITE D Epatite delta DELTA 14, Ticket 12,10 siero EIA Assenti HIV HIV 1-2 Combo HIV 10, Ticket 0 siero CMIA /R /N Antigene HIV 1-2 Ag/ab combo HIVCO 30, siero Immunocromatografia Ticket 25,75 HIVU (puntura accidentale) HIV 1-2 test di conferma WEST 82, siero Immuno blot Indeterminato 5 giorni Ticket 69,80 HIV 1 RNA (carica virale) (viral load) TOXOPLASMA toxoplasma IgG toxoplasma IgM HIVR 74, , Ticket 107,60 Ticket 45,50 (TOXO) TOXG 13, Ticket 11,15 TOXM 13, Ticket 11,15 Plasma 2 provette con EDTA da 7 ml Real time Rna non rilevato < 20 copie/ml:rna rilevato con carica al di sotto del limite del test milioni di copie/ml: RNA quantizzabile siero CLIA Sogg. Recettivo(<6 UI/ml) Non discriminante(6-8 UI/ml) Sogg. Immune(>8 UI/ml) siero CLIA <6 assenza di IgM 6-8 non discriminante >8 presenza di IgM

12 Pag. 12 di 15 toxoplasma IgG (test di avidità) AVITX 13,10 x Ticket 11,15 siero ELFA Indice <0,200 bassa avidità (possibile infezione acuta o recentemeno di 4 mesi) Indice 0,200-0,300 avidità borderline non discriminante Indice >0,300 alta avidità (infezione non recente- oltre 4 mesi) ROSOLIA (ROSO) rosolia IgG ROSG 13, Ticket 11,15 siero CLIA <9 UI/ml soggetto recettivo 9-11 UI/ml non discriminante > 11 UI/ml soggetto immune rosolia IgM ROSM 13,10 91,26,4 Ticket 11,15 siero CLIA < 20,00 AU/ml assenza di IgM 20,00-25,00 AU/ml non discriminante > 25,00 AU/ml presenza di IgM CITOMEGALOVIRUS CMV DNA (ricerca acidi nucleici) RCMV 126,55+ 53, Ticket 107,60 Sangue in EDTA ( 1 provetta con EDTA da 7 ml) PCR quantitativa n. copie/ml (limite di sensibilità :459 copie/ml) < 459 copie/ml (limite di sensibilità: 459 copie/ml) Ticket 45,50 CMV DNA (ricerca acidi nucleici) RCMVU 126,55+ 53, Ticket 107,60 Urine in contenitore sterile senza conservante PCR quantitativa n. copie/ml (limite di sensibilità :459 copie/ml) < 459 copie/ml (limite di sensibilità: 459 copie/ml)

13 Pag. 13 di 15 Ticket 45,50 Citomegalovirus IgG II (CITO) CITG 9, siero CLIA < 12 UI/ml soggetto recettivo UI/ml non discriminante >14 UI/ml soggetto immune Citomegalovirus IgM II CITM 9, siero CLIA < 18 AU/ml assenza di IgM AU/ml non discriminante >22 AU/ml presenza di IgM Citomegalovirus IgG (test di avidità) AVICM 13,10 + 9, Ticket 12,05 Ticket 08,45 siero ELFA Indice < 0,200 bassa avidità (fortemente indicativo di infezione recente-meno di 3 mesi) Ripetere per conferma Indice 0,200-0,800 Non consente una valutazione Indice > 0,800 Alta avidità (prima infezione non recente-più di 3 mesi) HERPES VIRUS (HERV) HVG1 9,15 siero CLIA < 1,1 HSV 1-2 IgG >1,1 HVG2 9,15 siero CLIA < 1,1 HSV 2 IgG >1,1 HVM 9,15 siero CLIA < 1,1 HSV 1-2 IgM >1,1

14 Pag. 14 di 15 VIRUS DI EPSTEIN-BARR EBV DNA EBVDN 126,55+ Plasma RT < giorni 53, Ticket 107,60 Ticket 45,50 (1 provetta con EDTA da 7 ml) (limite di sensibilità :353 copie/ml) : n copie/ml (limite di sensibilità :353 copie/ml) Monospot (Zebra) EBV IgM (VCA1) MONS 9, Ticket 03,65 EBVM 15, Ticket 13,55 VCA IgG VCA2 15,90 EBNA IgG MORBILLO morbillo IgG morbillo IgM Valutazione immunità morbillo (solo IgG) Ticket 13,55 EBNA 15,90 (MORB) AMOG 9,15 Ticket 13, AMOM 9, AMOG1 9, siero Immunofiltra zione.risultato indicativo di infezione primaria da EBV o sua riattivazione siero CLIA <40 U/ml > 40 U/ml siero CLIA <20 U/ml > 20 U/ml siero CLIA <20 U/ml siero ELFA Assenti > 20 U/ml siero IFA Assenti siero ELFA Assenti 5 giorni PAROTITE (APAR) parotite IgG IPVG 10, siero ELFA Assenti Ticket 09,20

15 Pag. 15 di 15 parotite IgM Valutazione immunità parotite (solo IgG) VARICELLA-ZOSTER (VARI) varicella IgG varicella IgM Valutazione immunità varicella-zoster (solo IgG) IPVM 6, Ticket 05,90 IPVG1 10, IVZG 9,15 Ticket 9, IVZM 9, IVZG1 9, ROTAVIRUS R5 7, ADENOVIRUS R6 7,45 ANTIGENI DI CAMPYLOBACTER Ticket 06, R3 10,80 Ticket 06, Ticket 09,20 siero IFA Assenti siero ELFA Assenti siero CLIA Assenti siero CLIA Assenti siero CLIA Assenti feci AD feci AD feci Immuno cromatografia 5 giorni 5 giorni