DETERMINAZIONE SPERIMENTALE DEI pka E DEL pi DI UN AMMINOACIDO DIPROTICO: CURVA DI TITOLAZIONE DELLA GLICINA COO - + Zwitterione

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1 DETERMINAZIONE SPERIMENTALE DEI pka E DEL pi DI UN AMMINOACIDO DIPROTICO: CURVA DI TITOLAZIONE DELLA GLICINA p pka1 pka2 pi COO + 3 N- C + 3 N- C 2 N- C AA +1 Catione AA 0 Zwitterione AA -1 anione Vale la regola che a valori di p superiori al punto isoelettrico l amminoacido diprotico è prevalentemente nella forma ionica negativa (completamente deprotonata) A valori di p inferiori al p. isoelettrico è prevalente la sua forma ionica positiva (completamente protonata) Il punto isoelettrico corrisponde ad un punto di equivalenza della curva di titolazione mentre i pka corrispondono a punti di semiequivalenza

2 COO + 3 N C = COO + 3 N C p = pka 1 abbiamo un uguale concentrazione delle forme ioniche AA +1 e AA 0 p > pka 2 prevale la forma AA p 7 COO 2 N C 0 0 0,5 1,0 1,5 2,0 COO 2 N C = COO + 3 N C p = pka 2 abbiamo un uguale concentrazione delle forme ioniche AA 0 e AA -1 p < pka 1 prevale la forma AA +1 COO + 3 N C Moli O - /mole di amminoacido A valori di p compresi fra il pka1 e il pka2 prevale la forma ionica AA 0 e raggiunge la massima concentrazione a p uguale al p. Isoelettrico COO + 3 N C

3 1 punto di semiequivalenza. Ordinata: p uguale al pka 1 Ascissa: 0.5 moli di titolante/mole di AA COO + 3 N C = COO + 3 N C 13 p ,5 1,0 1,5 2,0 Moli O - /mole di amminoacido 1 punto di equivalenza. Ordinata: p uguale al pi Ascissa: 1 mole di titolante/mole di AA COO 2 N C = COO + 3 N C 2 punto di semiequivalenza. Ordinata: p = pka 2 Ascissa: 1.5 moli di titolante/mole di AA. COO + 3 N C

4 GLI AMMINOACIDI FUNZIONANO DA TAMPONI ESISTONO ALMENO DUE REGIONI NELLA SCALA DEL p IN CUI L AMMINOACIDO è UN BUON TAMPONE Es.: Glicina: due gruppi dissociabili che funzionano da acidi deboli in due diverse zone della scala del p α-coo (pka1 2.34) e α-n 3+ (pka2 9.60). (50% di AA - e AA 0 ) (50% di AA + e AA 0 ) In corrispondenza del pka si ha la massima capacità tamponante Nelson Cox, I PRINCIPI DI BIOCIMICA DI LENINGER, Zanichelli editore S.p.A. Copyright

5 Ciascuno dei 2 gruppi dissociabili dell amminoacido ha capacità tamponante in un pka p = pka1 + log [AA0 ] [AA +1 ] intervallo di p p = pka ± 1 tra p 1.34 e p 3.34 la glicina funziona da tampone p = 1.34 = Log [AA 0 ]/[AA + ] Log [AA 0 ]/[AA + ] = -1 [AA 0 ]/[AA + ] = 10-1 = 1/10 a p 1.34 avremo il 90% di AA + e il 10% di AA 0 (cioè il 10% della glicina presenta il gruppo α-coo in forma deprotonata α- ) p = 3.34 = Log [AA 0 ]/[AA + ] Log [AA 0 ]/[AA + ] = 1 [AA 0 ]/[AA + ] = 10 1 = 10/1 a p 3.34 avremo il 10% di AA + e il 90% AA 0 (il 90% della glicina presenta il gruppo α-coo in forma deprotonata α- )

6 frazione molare (%) AA Entrambi i gruppi protonati AA 0 AA -1 [AA +1 ]= [AA 0 ] [AA 0 ]= [AA -1 ] pka2 = 9.60 pka1 = 2.34

7 Il pka2 vale 9.60 (gruppo α-n 3+ ) quali sono i limiti della seconda regione tamponante della glicina? Quali forme ioniche della glicina sono coinvolte e in quale rapporto si trovano tra di loro in corrispondenza dei p limite della seconda regione tamponante?

8 frazione molare (%) pka la glicina funziona da tampone tra p 8.60 e p p = 8.60 [AA -1 ]/[AA 0 ] = 10-1 = 1/10 p = [AA -1 ]/[AA 0 ] = 10 1 = 10/1 AA Entrambi i gruppi protonati AA 0 AA -1 [AA 0 ]= [AA -1 ] pka2 = 9.60

9 A che p si trova la soluzione di Glicina se il rapporto fra le sue forme ioniche AA 0 e AA +1 è 100:1 (~99% AA 0 e ~1% AA +1 )?

10 Se [AA 0 ]/[AA + ] = 100/1 (~99% AA0 e ~1% AA+1) [AA 0 ]/[AA + ] = 100/1 = 10 2 vuol dire che Log [AA 0 ]/[AA + ] = 2 Devo considerare la dissociazione dell α-coo (pka1 2.34) p = pka1 + log [AA0 ] [AA +1 ] p = = 4.34 a p 4.34 (2 unità sopra il valore del pka1) avremo l ~1% di AA + e il ~99% AA 0 (il 99% della glicina presenta il gruppo α-coo in forma deprotonata α- )

11 Fondamenti di biochimica 3E. Donald Voet Judith G. Voet Charlotte W. Pratt. Copyright 2013 Zanichelli editore S.p.A.

12 Fondamenti di biochimica 3E. Donald Voet Judith G. Voet Charlotte W. Pratt. Copyright 2013 Zanichelli editore S.p.A.

13 Fondamenti di biochimica 3E. Donald Voet Judith G. Voet Charlotte W. Pratt. Copyright 2013 Zanichelli editore S.p.A.

14 Fondamenti di biochimica 3E. Donald Voet Judith G. Voet Charlotte W. Pratt. Copyright 2013 Zanichelli editore S.p.A.

15 AMMINOACIDO TRIPROTICO (3 gruppi ionizzabili): in soluzione saranno presenti 4 forme ioniche dell AA in equilibrio tra loro. Sono 3 i pka da considerare (α-carbossilico, α-amminico, catena laterale). Es.: Acido glutammico (Glu, E) AA +1 COO + 3 N C COO pka1 AA 0 AA -1 AA N C COO pkar + 3 N C pka2 2 N C CATIONE - αcoo - αn 3 + (R) - COO ZWITTERIONE - α - αn 3 + (R) - COO ANIONE -1 - α - αn 3 + (R) - ANIONE -2 -α - αn 2 -(R) -

16 AA +1 COO + 3 N C COO pka2 = 9.67 p pkar = pka1 = pka1 AA +1 AA 0 AA -1 AA N C COO AA +1 = AA 0 pkar AA 0 =AA -1 AA N C AA -1 = AA -2 AA -1 pka2 AA Moli di O - /moli amminoacido 2 N C Quante moli di O - devo aggiungere per avere l ac. glutammico al suo p. isoelettrico? 1 Come calcolo il punto isoelettrico di un amminoacido acido? pi = A quali valori di p avrò la massima concentrazione di AA +1, AA 0, AA -1, AA -2? pka1 + pkar 2 pi = ( )/2 =3.22

17 10 pka2 = p 6 pkar = pka1 = QUALI SONO E QUANTE SONO LE REGIONI TAMPONANTI? Individuare gli intervalli di p Le regioni tamponanti sono 3: pka1 ± 1 ( ); pkar ± 1 ( ); pka2 ± 1 ( ) Moli di O - /moli amminoacido

18 Come si dissociano i gruppi ionizzabili della tirosina (Tyr)? Quale sarà la forma ionica prevalente a p neutro? Disegnare su un grafico la curva di titolazione della Tyr (pka1 = 2.2; pka2 = 9.1; pkar = 10.1) Calcolare il suo punto isoelettrico e individuarlo sul grafico

19 Tyr: pka1 = 2.2; pka2 = 9.1; pkar = moli O - / mole di Tyr

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