Road Map. metodi statistici. WebGIS epidemiologico. Fonti dati ed indicatori Correzione piccole aree
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- Antonia Bellucci
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1 FOSS4g-IT Lugano Febbraio WebGIS Open Source: Cancer Atlas Trentino C. Dolci, R. De Filippi, S. Droghetti, G. Franch, S. Marchetti, S. Riccadonna, C. Furlanello
2 Road Map metodi statistici Fonti dati ed indicatori Correzione piccole aree WebGIS epidemiologico Struttura logica Tecnologie Open Source utilizzate Funzionalità della piattaforma Lugano febbraio 2010, FOSS4G-IT Dolci et al., WebGIS Open Source per un Cancer Atlas
3 Obiettivi : Piattaforma informatica basata su tecnologie WebGIS per un uso interattivo di indicatori epidemiologici standard (Cancer Atlas Trentino): incidenza, prevalenza e rischio relativo delle patologie tumorali. : variazione spazio-temporale dell incidenza dei tumori in Trentino In collaborazione con Unità di ricerca FBK / e-health Progetto OncoCure(Fond. CaRiTRo) Dip. di Stat. Mat. Appl. all Economia (Univ. di Pisa) Osservatorio Epidemiologico APSS Trentino Dip. di Oncologia Osp. S.Chiara Trento
4 Esempi di CancerAtlas CancerMortalityMaps(NIH-NCI, USA) United States Atlas of Cancer(Penn State Univ., USA) Krebsregister(Schleswig-Holstein, DE) Online Cancer e-atlas(ncin, GB) Atlanti di mortalità della Provincia di Torino e della Valle d Aosta (correzione piccole aree) Lugano febbraio 2010, FOSS4G-IT Dolci et al., WebGIS Open Source per un Cancer Atlas
5 Lugano febbraio 2010, FOSS4G-IT Dolci et al., WebGIS Open Source per un Cancer Atlas
6 Lugano febbraio 2010, FOSS4G-IT Dolci et al., WebGIS Open Source per un Cancer Atlas
7 Lugano febbraio 2010, FOSS4G-IT Dolci et al., WebGIS Open Source per un Cancer Atlas
8 Disease mapping in Trentino Popolazione: abitanti in 223 comuni, di cui: 211 comuni sotto i sotto i 1000 La scarsa casistica (numerosità dei casi) nei comuni meno popolati può portare a risultati inaffidabili e fuorvianti (rischi relativi eccessivamente grandi) no popolazione < > 5000 Gli indicatori stimati in questi domini possono assumere valori anomali con altissima variabilità Lugano febbraio 2010, FOSS4G-IT Dolci et al., WebGIS Open Source per un Cancer Atlas
9 Esempio numerico Comune di Valda Popolazione residente femmine = 117 Casi di tumore alla mammella = 3 Rischio PAT = 1429/ = 0,58% (Casi tumore mammella PAT/Popolazione femmine PAT) Comune di Trento Popolazione residente femmine = Casi di tumore alla mammella = 329 Rischio PAT = 1429/ = 0,58% (Casi tumore mammella PAT/Popolazione femmine PAT) Casi attesi = 117*0,58% = 0,68 (Pop. femmine Valda* Rischio PAT) 4,42 Casi attesi = 54836*0,58% = 318 (Pop. femmine Trento* Rischio PAT) 1.03 NOTA: Nel Comune di Valdail rischio per una donna di contrarre un tumore alla mammella è 4,42 volte il rischio rispetto al valore PAT. NOTA: Nel Comune di Trento il rischio per una donna di contrarre un tumore alla mammella è 1.03 volte il rischio rispetto al valore PAT. Indice epidemiologico: Rischio Relativo (RR) Sede: Mammella, Gruppo: Femmine
10 Correzione per piccole aree Protocolli statistici di correzione automatica per indicatori epidemiologici per piccole aree (Small Area Estimation, SAE) L applicazione di un modello di correzione SAE è necessario al fine di regolarizzare un indicatore di rischio in un comune o in una zona in modo da ottenere valori coerenti con i fattori di rischio locali Metodo implementato: Stima Bayesiana Poisson Software: R, Winbugs 1.4
11 Correzione SAE su mappa Indice base Indice SAE Comune RR RR SAE Valda 4,42 1,10 Trento 1,03 1,02 Rischio Relativo (RR) Sede: Mammella Gruppo: Femmine
12 I Dati: Ambito ed Indicatori (comprensorio) (comuni) REGISTRO TUMORI Osservatorio Epidemiologico APSS
13 Struttura logica della piattaforma Modulo Geografico Dati/Indicatori epidemiologici OssEpi Catalogo dati, indicatori Visualizzazione mappe Visualizzazione grafici JpStradario Modulo conversione indirizzi Dati pazienti Lugano febbraio 2010, FOSS4G-IT Dolci et al., WebGIS Open Source per un Cancer Atlas
14 Tecnologie utilizzate Lugano febbraio 2010, FOSS4G-IT Dolci et al., WebGIS Open Source per un Cancer Atlas
15 SLD Creator Modulo generatore SLD Indicatori Ambito geografico Sesso Classe di età Standard WMS Request
16 Interfaccia Operativa Analisi di Sopravvivenza CancerAtlas: Sezioni principali Guida Utente Livello Indicatori Livello Ambito geografico Sedi Sedi Sesso Sesso Classi di età Classi di età Indicatori base Casi incidenti Tasso di incidenza Rischio relativo Indicatori SAE Casi incidenti SAE Tasso di incidenza SAE Rischio relativo SAE Comprensori Comuni Toolbar principale Polmone Mammella Retto Colon Pelle, melanomi Totale Maschi Femmine Totale Livello Informazioni Mappa Titolo mappa Livello Mappa Informazioni di sintesi Seleziona comune LivelloLegenda Grafico Informazioni di sintesi Tabella dati Sezione mappa Ante-Post
17 Risultati : Mappatura digitale del Registro Tumori : Strumento di mascheramento della localizzazione 1. Piattaforma interamente sviluppata con tecnologia Open source 2. Interfaccia utente WebGIS x GeoStat (GeoBI per epidemiologia)
18 Sviluppifuturi Grafici run time(v. Java-R per analisi di sopravvivenza) Georeferenziazione automatica anonima del db clinico A. Costruire uno strumento di sorveglianza e pianificazione per la Sanità Pubblica B. Migliorare la capacità di rispondere Alle richieste da parte della popolazione e delle amministrazioni sulla percezione di rischio localizzato Alla preoccupazione crescente circa la qualità dell'ambiente e dei suoi possibili effetti sulla salute
19 DEmo
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