La traduzione. Prof. Savino; dispense di Biologia Molecolare, Corso di Laurea in Biotecnologie
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- Sabina Gioia
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1 La traduzione
2 Il ribosoma Il ribosoma ha due siti per legare i trna.
3 L amminoacil-trna entra nel sito A Il flusso dei trna Le 3 fasi della sintesi delle proteine Inizio elongazione terminazione
4 L inizio della traduzione L inizio della traduzione nei batteri richiede 3 fattori di inizio, chiamati IF-1, IF-2 e IF-3. La subunità 30S ha bisogno di IF-3 per legarsi al mrna al sito di inizio della traduzione. IF-2 lega il trna iniziatore e controlla il suo legame alla subunità 30S. IF-1 si lega all emisito A ed impedisce agli amminoacil-trna di entrarvi. IF-1
5 Il trna iniziatore Appaiate in tutti i trna
6 L inizio della traduzione
7 L inizio della traduzione nei procarioti e negli eucarioti Ogni regione codificante è preceduta da una sequenza Shine-Dalgarno. Se due regioni codificanti sono particolarmente vicine, il ribosoma passa da una all altra senza dissociarsi.
8 L inizio negli eucarioti eif-2b permette il legame di una molecola di GTP a eif-2 Questo aumenta l affinità di eif-2 per il Met-tRNA i il Met-tRNA i viene legato, formando un complesso ternario. Il tutto viene caricato sulla subunità 40S (generando il cpomplesso d inizio 43S), che il fattore eif3 provvede a tenere separata dalla subunità maggiore 60S.
9 L inizio negli eucarioti Separatamente, un gruppo di fattori, chiamato eif4f si lega all estremità 5 del messaggero eif4e: lega il cappuccio; eif4a: elicasi, denatura ogni struttura secondaria ci sia tra i primi 15 nucleotidi la denaturazione oltre i primi 15 nucleotidi è compiuta da eif4a e da eif4b eifg: proteina strutturale, lega la PABP (polya Binding Protein) i messaggeri poliadenilati sono tradotti più efficientemente perchè è maggiore l efficienza di inizio della traduzione. Il complesso d inizio 43S (subunità 40S, eif3, eif-2 e Met-tRNA i ) lega il 5 del messaggero.
10 L inizio negli eucarioti L aggiunta di eif1 e di eif1a permette lo inizio della scansione. Raggiunto l AUG di inizio, il complesso si ferma.
11 L elongazione L ingresso di un aminoacil-trna nel sito A è mediato da un fattore di elongazione (EF-Tu nei batteri). EF-Tu legato a GTP si associa ad un trna caricato con un amminoacido. Il complesso ternario (EF-Tu. GTP. trna) lega il sito A. Se l appaiamento codoneanticodone è corretto, esso induce un cambiamento conformazionale nel ribosoma, che, a sua volta causa l idrolisi del GTP in EF-Tu. Il complesso binario EF-Tu. GDP non è più in grado di legare il ribosoma e si stacca. Un altra proteina, EF-Ts, spiazza il GDP da EF-Tu. Una molecola di GTP spiazza EF- Ts e il ciclo ricomincia. La Kirromicina è un antibiotico perchè agisce su EF-Tu dei batteri: quando la Kirromicina lega EF-Tu, il fattore è in grado di portare l amminoacil-trna nel sito A, ma poi resta bloccato sul ribosoma e la sintesi proteica si arresta.
12 L elongazione
13 La traslocazione La controparte eucariotica di EF-G è la proteina eef-2, che funziona in maniera simile da traslocasi. eef-2 è il bersaglio della tossina difterica. La tossina trasferisce un ADP su eef-2, e questa modificazione rende la proteina inattiva nella sintesi delle proteine. Una singola molecola di tossina può modificare abbastanza eef-2 da uccidere una cellula.
14 La terminazione Fattore di distacco
15 La terminazione
16 Il ribosoma complem. Shine- Dalgarno
Traduzione del codice genetico La sintesi proteica
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