DNA E PROTEINE IL DNA E RACCHIUSO NEL NUCLEO, MENTRE LA SINTESI PROTEICA SI SVOLGE NEL CITOPLASMA: COME VIENE TRASPORTATA L INFORMAZIONE?

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Annabella Locatelli
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1 DNA E PROTEINE NUMEROSI DATI SUGGERISCONO CHE IL DNA SVOLGA IL SUO RUOLO GENETICO CONTROLLANDO LA SINTESI DELLE PROTEINE, IN PARTICOLARE DETERMINANDONE LA SEQUENZA IN AMINOACIDI E NECESSARIO RISPONDERE AD ALCUNI PROBLEMI, TRA CUI: IL DNA E COMPOSTO DA QUATTRO TIPI DI NUCLEOTIDI, MENTRE LE PROTEINE CONTENGONO 20 TIPI DI AMINOCIDI: COME PUO ESSERCI CORRISPONDENZA? IL DNA E RACCHIUSO NEL NUCLEO, MENTRE LA SINTESI PROTEICA SI SVOLGE NEL CITOPLASMA: COME VIENE TRASPORTATA L INFORMAZIONE? L RNA messaggero (mrna) Per la sintesi delle proteine un gene, cioè la sequenza nucleotidica del DNA che codifica per una certa proteina, viene copiato (trascritto) producendo un RNA che è copia complementare del gene. Questo RNA esce dal nucleo trasportando nel citoplasma il messaggio contenuto nel gene.

2 QUANTI SONO GLI AMINOACIDI? IN NATURA ESISTONO MOLTI TIPI DIVERSI DI AMMINOACIDI, MA QUELLI PRESENTI NELLE PROTEINE SONO POCO PIÙ DI 20 LE PROTEINE VENGONO SINTETIZZATE UTILIZZANDO SOLTANTO 20 AMINOACIDI, ALCUNI DI QUESTI POSSONO PERÒ ESSERE MODIFICATI DOPO LA SINTESI DELLA CATENA POLIPEPTIDICA IL CODICE GENETICO UN CODICE DI 4 BASI AZOTATE PER CODIFICARE 20 AMINOACIDI: QUANTE PAROLE SI POSSONO COMPORRE CON UN ALFABETO DI 4 LETTERE? 4 PAROLE DI UNA LETTERA (A, T, C, G) = PAROLE DI DUE LETTERE (AA, AT, AC,AG, TA.) = PAROLE DI TRE LETTERE (AAA, AAT.) = PAROLE DI TRE NUCLEOTIDI (TRIPLETTE) SONO PIÙ CHE SUFFICIENTI PER CODIFICARE I 20 AMINOACIDI

LA TRIPLETTA UUU CODIFICA QUINDI LA FENILANANINA (Phe) CON STRATEGIE SIMILI SI ARRIVO

3 IN ESPERIMENTI DI SINTESI PROTEICA IN VITRO, UTILIZZANDO UN mrna ARTIFICIALE FORMATO DA SOLI NUCLEOTIDI DI URACILE (POLI-U) SI OTTENNE UN PEPTIDE FORMATO DA SOLE FENILALANINE LA TRIPLETTA UUU CODIFICA QUINDI LA FENILANANINA (Phe) CON STRATEGIE SIMILI SI ARRIVO ALLA COMPLETA DECIFRAZIONE DEL CODICE GENETICO NOTA: si riportano i codoni del messaggero UAU

4 IL CODICE RISULTO ESSERE A TRIPLETTE, SENZA VIRGOLE, RIDONDANTE (DEGENERE), NON AMBIGUO, 61 TRIPLETTE (CODONI) CODIFICANO PER I 20 AMINOACIDI LE TRIPLETTE SINONIMO SPESSO DIFFERISCONO SOLO PER IL TERZO NUCLEOTIDE TRE CODONI : UAA UAG UGA SEGNALANO IL TERMINE DELLA TRADUZIONE IL CODICE E UNIVERSALE: I CODONI HANNO LO STESSO SIGNIFICATO IN TUTTI GLI ESSERI VIVENTI (QUASI VERO) mrna AUGUUUCUUAAAGGUACAGAA Met Phe Leu Lys Gly Thr Glu.. Mutazioni Risultati di una sostituzione di un nucleotide AUGAUUCUUAAAGGUACAGAA Met Ile Leu Lys Gly Thr Glu..

5 Molti aminoacidi sono codificati da più di una tripletta, quindi non tutte le mutazioni per sostituzione di un nucleotide fanno cambiare la proteina AUGUUUCUUAAAGGUACAGAA Met Phe Leu Lys Gly Thr Glu.. Alcune mutazioni saranno prive di effetto Risultati di una sostituzione di un nucleotide AUGUUCCUUAAAGGUACAGAA Met Phe Leu Lys Gly Thr Glu.. AUGUUUCUUAAAGGUACAGAA Met Phe Leu Lys Gly Thr Glu.. Mutazioni Risultati di una inserzione di un nucleotide AUGCUUUCUUAAAGGUACAGAA Met Leu Ser Stop SLITTAMENTO DELLA CORNICE DI LETTURA Una delezione avrà effetti analoghi

6 Mutazioni: errori nel DNA introdotti durante la replicazione La DNA polimerasi, enzima che catalizza la replicazione del DNA è estremamente veloce e accurato: inserisce nucleotidi al secondo e compie soltanto un errore ogni nucleotidi. Nessun dattilografo è altrettanto bravo! Questo però vuol dire che ogni volta che il DNA si replica si compiono tra e 6 milioni di errori, cioè mutazioni! (quindi ogni gene muterebbe a ogni generazione cellulare) Nelle nostre cellule la correttezza della replicazione viene enormemente migliora da da una serie di sistemi di riparazione, che controlla continuamente il DNA replicato e corregge eventuali errori. I sistemi di riparazione riescono a ridurre il tasso di errori a livelli bassissimi: un gene muta una volta ogni milione di generazioni

7 Sintesi delle proteine DNA Nucleo Il messaggero esce dal nucleo TRASCRIZIONE Citoplasma LA TRADUZIONE IN CHE MODO LA SEQUENZA DI CODONI DEL mrna CONTROLLA LA SEQUENZA DEGLI AMINOACIDI? IL RUOLO DEL trna

8 AUGUUUCUUAAAGGUACAGAA Met Phe Leu Lys Gly Thr Glu.. Dal momento che i codoni (triplette dell RNA Messaggero) non sono capaci di richiamare direttamente gli amminoacidi, come avviene la sintesi della proteina? Una famiglia di RNA, i trna, funziona da intermediario: ogni trna è capace di riconoscere un codone mediante una tripletta complementare (anticodone) e di trasportare il corrispondente amminoacido: esiste un trna per ogni amminoacido AUG UUU CUU AAA mrna UAC AAA GAA UUU trna Met Phe Leu Lys.. Proteina UNA FAMIGLIA DI PICCOLI RNA, GLI RNA DI TRASPORTO (RNA TRANSFER O trna) SVOLGE IL RUOLO DI ADATTATORE TRA LA TRIPLETTA (CODON) DEL mrna E L AMINOACIDO CORRISPONDENTE I trna SONO FORMATI DA POCHE DECINE DI NUCLEOTIDI

I tratti appaiati si avvolgono a doppia elica Il ripiegamento

sequenze complementari UNA MOLECOLA DI trna LEGA AD UNA SUA

. mrna E SI UNISCE AD UNA TRIPLETTA (CODON) DEL mrna CHE

9 I tratti appaiati si avvolgono a doppia elica Il ripiegamento a trifoglio deriva da legami idrogeno che si formano tra sequenze complementari UNA MOLECOLA DI trna LEGA AD UNA SUA ESTREMITA UNO SPECIFICO AMINOACIDO..CUU.. mrna E SI UNISCE AD UNA TRIPLETTA (CODON) DEL mrna CHE RICONOSCE TRAMITE IL PROPRIO ANTICODON, UN GRUPPO DI TRE NUCLEOTIDI COMPLEMENTARE AL CODON CODON

UN ERRORE DI RICONOSCIMENTO, QUINDI DI APPAIAMENTO AMINOACIDOtRNA-CODONE,

10 IN CHE MODO OGNI trna PUO RICONOSCERE E LEGARE L AMINOACIDO CORRETTO (QUELLO CORRISPONDENTE AL CODON CHE RICONOSCE) SENZA COMPIERE ERRORI? UN ERRORE DI RICONOSCIMENTO, QUINDI DI APPAIAMENTO AMINOACIDOtRNA-CODONE, PRODURREBBE UN ERRORE NELLA SINTESI DELLA PROTEINA GLI ENZIMI AMINOACIL-tRNA-SINTETASI Enzima

11 NELLA SINTESI PROTEICA QUESTO LEGAME SI STACCHERA DAL trna E UNIRA L AMINOACIDO AL GRUPPO AMINICO DELL AMINOACIDO VICINO

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