Curriculum Vitae INFORMAZIONI PERSONALI Rossano Atzeni Via Picciau 29, 09028 Sestu - CAGLIARI (Italia) 3382245334 rossano.atzeni@gmail.com Sesso Maschile Data di nascita 1 FEB. 74 Nazionalità Italiana ESPERIENZA PROFESSIONALE 01 giugno 2013 31 gennaio 2014 Programmatore - Senior Back End Developper Jobyourlife srl Via Nazario Sauro, Cagliari (Italia) https://www.jobyourlife.com Attività o settore Risorse Umane & Recruiting 15 GEN. 11 13 GEN. 13 Programmatore Senior CRS4 SRL Polaris Edificio 1 Località Piscina Manna IT-09010 Pula (Italia) SVILUPPATORE PER APPLICAZIONI E TRATTAMENTO DATI DI GENOMICA PRESSO IL PROGRAMMA ADVANCED GENOMICS COMPUTING TECHNOLOGY Attività o settore BIOINFORMATICA 1 APR. 10 30 NOV. 10 Programmatore Senior (Developer/System integrator) Consorzio Cybersar c/o Complesso Universitario di Monserrato - Dipartimento di Fisica - SP Monserrato- Sestu km 0,700 09042 Monserrato (Italy) Realizzazione dell'applicazione web di front-end per l'accesso a un sistema di Document Repository mediante attività di configurazione e sviluppo di codice su CMS/Framework Drupal (php) e LMS Moodle (php). Configurazione e adattamento della piattaforma Fedora Repository (www.fedoracommons.org) per accogliere specifiche collezioni di oggetti digitali e relativi metadati. Sviluppo moduli Drupal di integrazione applicativa basati sull'invocazione di web service REST/SOAP. Attività o settore Cyberinfrastructure per la ricerca scientifica e tecnologica in Sardegna 13 OTT. 08 31 MAR. 10 Programmatore Senior Hosteras spa Via Nazario Sauro, 8/10 Italy-09123 Cagliari (undefined) Sviluppo portale per booking online, gestione db, sviluppo applicazioni php/ajax, sviluppo Server Rest/Soap Attività o settore Tour Operator online 1 GIU. 07 10 OTT. 08 Programmatore - Software Developer SharDNA spa c/o PARCO SCIENTIFICO & TECNOLOGICO DELLA SARDEGNA Edificio 3, località Piscinamanna IT-09010 Pula (Italia) Sviluppo software e applicazioni web-based per la gestione del DataBase e l analisi dei dati. Sviluppo del portale LOTO per l elaborazione dei dati derivanti dall uso degli SNPs (50k e 500k chip dell Affimetrix): codifica secondo il formato HAPMAP (.hap), filtraggio informazioni in base a range di 13/2/14 Unione europea, 2002-2013 http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 1 / 6
posizioni, di SNPs e di campioni, selezione dei dati significativi, secondo soglie minime definite dall'utente: soglia minima di genotipizzazione, livello minimo di MAF, SNPs "omozigoti", conversione dal formato HAPMAP al formato pre-makehap (.ped), calcolo di frequenze alleliche in un file.hap. Restyling e ampliamento del framework Workbench per la gestione (inserimento, modifica, cancellazione, ricerca & visualizzazione) di - Dati anagrafici e genealogici; - Prelievi del sangue, sierologiche ed emocromi; - Visite mediche generali (abitudini di vita, anamnesi patologica e farmacologica, ipertensione, calvizie) e specialistiche (cardiologiche,cefalea, obesità, oculistica, allergologiche) - Estrazione di Pedigree Attività o settore SVILUPPO & BIOINFORMATICA 1 NOV. 06 31 MAG. 07 Programmatore - Software Developer SharDNA spa c/o PARCO SCIENTIFICO & TECNOLOGICO DELLA SARDEGNA Edificio 3, località Piscinamanna 09010 Pula (SharDNA spa,c/o PARCO SCIENTIFICO & TECNOLOGICO DELLA SARDEGNAEdificio 3, località Piscinamanna09010 Pula (Cagliari), Italytel. +39 070 4606100fax +39 070 4606151) Sviluppo di un'interfaccia user-friendly per il framework di gestione del DataBase Attività o settore SVILUPPO & BIOINFORMATICA 01 novembre 2005 31 maggio 2006 HW & SW Developer XENTAS SYSTEM srl c/o PARCO SCIENTIFICO & TECNOLOGICO DELLA SARDEGNA Edificio 2, località Piscinamanna IT-09010 Pula (Cagliari) (Italia) Sviluppo di applicazioni HW & SW per sistemi basati su tecnologia RFID: 1. Rivelazione e Identificazione di condotte interrate 2. Sistema di sicurezza e controllo accessi 3. Identificazione e tracciamento ovini Attività o settore Sviluppo, elettronica digitale, sistemi embedded 1 GEN. 05 31 OTT. 05 Progettazione circuiti digitali & applicazioni software INFN c/o Università di Cagliari - Dipartimento di Fisica S.P. Monserrato-Sestu Km 0,700 IT-09042 Monserrato (Italia) Sviluppo di applicazioni in logica FPGA e software di test/controllo per progetti: 1. Migrazione scheda di acquisizione PCI dalla modalità Slave alla modalità Master. 2. Implementazione in logica FPGA dell algoritmo di ricostruzione degli hit raccolti dal Muon Arm dell esperimento Alice, all interno del progetto HLT (Trigger di alto livello) 1 FEB. 05 31 MAG. 05 Tutor di Fisica per corso di laurea in Biologia Università di Cagliari Via Università 40 IT-09124 Cagliari (Italia) Attività o settore Insegnamento & Formazione 1 MAG. 05 31 LUG. 05 Docento corso di programmazione in C GIOCUR Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4-09125 Cagliari GIOCUR Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4-09125 Cagliari GIOCUR Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4-09125 Cagliari-GIOCUR Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4-09125 Cagliari GIOCUR Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4-09125 13/2/14 Unione europea, 2002-2013 http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 2 / 6
Cagliari (undefined) Attività o settore Insegnamento & Formazione 10 LUG. 04 11 SET. 04 Undergraduated Work European Organization for Nuclear Research CERN CH-1211 Genève 23 Switzerland CH-1211 Genève 23 Ginevra (Svizzera) Nell'ambito del lavoro di tesi: Sviluppo del sistema di readout di un rivelatore a pixel per l esperimento NA60 presso il CERN di Ginevra Test sotto fascio del sistema di acquisizione sviluppato, per l installazione del rivelatore in zona sperimentale, e per gestire l avvio della fase di presa dati. 1 OTT. 97 30 SET. 98 Programmatore Comune di Monserrato (CA) Piazza San Lorenzo IT-09042 Monserrato (Italia) Programmatore e videoterminalista c/o Uff. Elettorale e Leva. Sviluppo di applicazioni in Access 1 NOV. 96 31 MAG. 97 Videoterminalista Comune di Selargius (CA) Piazza Istria, 1 IT-09047 Selargius (Italia) Videoterminalista c/o Ufficio Tecnico 1 SET. 93 31 AGO. 96 "Giornalista" free-lance "Sogni" viale Trento 090100 Cagliari Articoli e lavoro di redazione per un piccola rivista mensile locale ISTRUZIONE E FORMAZIONE 1 NOV. 98 15 DIC. 04 Laurea in Fisica (110/110 LODE) UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI CAGLIARI, Fisica delle particelle elementari TESI: Sviluppo del sistema di readout di un rivelatore a pixel per l esperimento NA60 presso il CERN di Ginevra 93 Diploma di Perito Informatico 55/60 I.T.I. Dionigi Scano (Cagliari) Via Cesare Cabras IT-09042 Monserrato (Italia) 5 SET. 11 9 SET. 11 NGS and GWAS for Complex and Monogenic Disorders Istituto di Ricerca Genetica e Biomedica (CNR-IRGB) and the Centro di Ricerca, Sviluppo e Studi Superiori in Sardegna, Summer School on Next Generation Sequencing and Genome Wide Association Studies. 24 SET. 12 28 SET. 12 2nd Sardinian Summer School 13/2/14 Unione europea, 2002-2013 http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 3 / 6
Genomic Analysis of Complex and Monogenic Disorders COMPETENZE PERSONALI Lingua madre italiano Altre lingue COMPRENSIONE PARLATO PRODUZIONE SCRITTA Ascolto Lettura Interazione Produzione orale inglese B1 B2 B2 B2 B1 Livelli: A1/A2: Livello base - B1/B2: Livello intermedio - C1/C2: Livello avanzato Quadro Comune Europeo di Riferimento delle Lingue Competenze professionali Programmazione Logiche FPGA: 1. Quartus (Altera Corporation) 2. Verilog HDL (Hardware Description Language) Programmazione Chip Rabbit Semiconductor Competenze informatiche Sistemi Operativi (Amministratore) 1) Windows 2) LINUX Programmazione: 1. JAVA 2. JSP 3. HTML 4. JAVASCRIPT -JQUERY 5. PHP - AJAX 6. PERL 7. CSS 8. XML 9. Script di Shell (Bash,Korn) 10. C/C++ 11. Dynamic C 12. GLADE/GTK++ 13. CVI 14. Python, Pascal, Assembler, Visual Basic 15. C# DataBase 1. ORACLE 2. MYSQL 3. MSSQL Content Management System: 1. JOOMLA 2. MAMBO 3. CMSIMPLE 4. PLONE 5. MODX 6. DRUPAL 13/2/14 Unione europea, 2002-2013 http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 4 / 6
ULTERIORI INFORMAZIONI Pubblicazioni The silicon vertex tracker of NA60 Banicz, K.; Atzeni, R.; David, A.; Floris, M.; Heuser, J.; Keil, M.; Lourenco, C.; Ohnishi, H.; Radermacher, E.; Shahoyan, R.; Usai, G.; CERN, Geneva, Switzerland Nuclear Science Symposium Conference Record, 2005 IEEE High differentiation among eight villages in a secluded area of Sardinia revealed by genome-wide high density SNPs analysis. Pistis G, Piras I, Pirastu N, Persico I, Sassu A, Picciau A, Prodi D, Fraumene C, Mocci E, Manias MT, Atzeni R, Cosso M, Pirastu M, Angius A. Istituto di Genetica delle Popolazioni, CNR, Alghero, Sassari, Italy. PLoS One. 2009;4(2):e4654. Epub 2009 Feb 27. Scaling with the flow: advantages of a MapReduce-based scalable and high-throughput sequencing workflow [Download PDF version] Luca Pireddu, Simone Leo, Frederic Reinier, Riccardo Berutti, Rossano Atzeni, Gianluigi Zanetti poster - International Conference on Human Genetics (ICHG) 2012, Montreal, Canada - october 2011 Genetic factors regulating the levels of immune system cells in health and disease Valeria Orrú, Edoardo Fiorillo, Maristella Steri, Sole Gabriella, Francesca Virdis, Mariano Dei, Sandra Lai, Antonella Mulas, Piras M., Lobina M., mara Marongiu, Mauro Congia, Firinu D., Michael B Whalen, Sidore Carlo, Maria Francesca Urru, Fabio Busonero, Frederic Reinier, Marco Marcelli, Rossano Atzeni, Andrea Angius, Christopher M. S. Jones, David Schlessinger, Gonçalo R. Abecasis, Serena Sanna, Francesco Cucca European Network of Immunology Institutes (ENII) - april 2012 Title: Sequencing-based and multiplatform Genome-Wide Association Study for Multiple Sclerosis and Type 1 Diabetes in Sardinians.(157) (12:00NOON-12:15PM on Thu) (Platform) Author(s): I. Zara, E. Porcu, M. Zoledziewska, M. Pitzalis, M. Valentini, A. Mulas, F. Busonero, R. Atzeni, M. Oppo, F. Reinier, R. Berutti, R. Pilu, F. Deidda, C. Sidore, R. Piras, A. Loi, Sonia. Sanna, E. Cocco, F. Poddie, G. Farina, G. Rosati, L. Lianas, G. Cuccuru, G. Zanetti, A. Angius, M. G. Marrosu, C. M. Jones, G. R. Abecasis, Serena. Sanna, F. Cucca ASHG Meeting - san Francisco 2012 Title: Whole Genome Sequencing of 2100 Individuals in the founder Sardinian Population.(177) (06:30PM-06:45PM on Thu) (Platform) Author(s): C. Sidore, S. Sanna, A. Kwong, H. M. Kang, R. Cusano, M. Pitzalis, M. Zoledziewska, A. Maschio, F. Busonero, M. Lobina, A. Angius, R. Lyons, B. Terrier, C. Brennan, R. Atzeni, A. Mulas, M. Dei, M. Piras, S. Lai, F. Reinier, R. Berutti, C. Jones, M. Marcelli, M. Urru, M. Oppo, D. Schlessinger, G. Abecasis, F. Cucca ASHG Meeting - san Francisco 2012 Title: Genetic factors associated with levels of immune cell types.(1516f) (3:15PM-4:15PM on Fri) (Poster) Author(s): M. Steri, V. Orrù, E. Fiorillo, G. Sole, C. Sidore, F. Virdis, M. Dei, S. Lai, A. Mulas, M. G. Piras, M. Lobina, M. Marongiu, M. Zoledziewska, M. Congia, F. Busonero, A. Maschio, M. F. Urru, M. Marcelli, R. Atzeni, D. Firinu, M. Valentini, W. Mentzen, S. Naitza, M. B. Whalen, A. Angius, C. M. Jones, D. Schlessinger, G. Abecasis, S. Sanna, F. Cucca ASHG Meeting - san Francisco 2012 Pubblicazioni Low-Pass DNA Sequencing of 1200 Sardinians Reconstructs European Y-Chromosome Phylogeny; Science2 August 2013: Vol. 341no. 6145pp. 565-569DOI:10.1126/science.1237947 13/2/14 Unione europea, 2002-2013 http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 5 / 6
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