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1 All. E al bando di ammissione del 8 settembre I gruppo Art. 1 - Tipologia L Università degli studi di Pavia attiva, per l a.a. 2011/2012, presso il Dipartimento di Scienze Sanitarie Applicate e Psicocomportamentali, Facoltà di Medicina e Chirurgia, il Master Universitario di II livello in Epidemiologia Genetica e Molecolare. Art. 2 - Obiettivi formativi e funzioni del corso Il Master Universitario ha lo scopo di : fornire a giovani laureati una formazione post-laurea specialistica e altamente qualificata nel settore dell epidemiologia genetica e molecolare e statistica genetica; rispondere alle esigenze di profili professionali richiesti da Centri di Ricerca, e Aziende che si occupano di consulenza di statistica genetica e genomica, di genotipizzazione, sequenziamento e microarrays; fornire profili professionali adeguati a rispondere ad una esigenza emergente determinata dalla recente e rapidissima evoluzione tecnologica in campo genetico e genomico e dall aumentata diffusione della medicina molecolare sia in ambito accademico che ospedaliero. Il Master ha la funzione di coniugare conoscenze teoriche ed esperienze pratiche, nell ambito delle più attuali discipline che caratterizzano la medicina molecolare: genetica, genomica, statistica, bioinformatica ed epidemiologia. La formazione specialistica, derivante dal conseguimento del Master, potrà accelerare e rendere più favorevole l inserimento dei laureati nel mondo del lavoro, data la diffusione di tecniche di genetica molecolare in ambito diagnostico e di studi genetici sia in ambito ospedaliero che accademico. Sbocchi professionali La figura professionale formata nel Master può trovare sbocco in: Industrie Farmaceutiche, che si occupano di farmacogenomica Centri di Ricerca, I.R.C.C.S, C.N.R, e Laboratori Universitari Aziende che sviluppano biomarcatori per la individuazione precoce dello stato di malattia, per il monitoraggio dell effetto dei farmaci e per la predizione della progressione della malattia. Art. - Ordinamento didattico Il Master Universitario ha durata annuale e prevede un monte ore di 1500, con l acquisizione di 60 crediti formativi universitari (CFU), di cui 18 CFU teorico/pratici e 42 CFU sperimentali. I crediti teorico/pratici sono articolati in lezioni frontali nell ambito di corsi integrati, suddivisi in moduli. Ad integrazione delle lezioni sono previste attività didattiche complementari consistenti in seminari su argomenti specifici, esercitazioni in aula, visite presso Enti e Aziende che generano i dati genetici e genomici che devono essere sottoposti poi all analisi statistica. I seminari possono svolgersi direttamente in sede, oppure in video-conferenza. I crediti sperimentali devono essere conseguiti mediante la realizzazione di un progetto di ricerca specifico, attraverso un tirocinio pratico o stage, sotto la guida di un docente del Collegio Docenti. Gli studenti possono svolgere il tirocinio pratico/stage nell ambito delle discipline del Corso presso: Sezione di Epidemiologia e Statistica Medica del Dipartimento di Scienze Sanitarie Applicate e Psicocomportamentali dell Università di Pavia; Dipartimento di Genetica e Microbiologia dell Università di Pavia; 1

2 Istituto di Genetica Molecolare del CNR di Pavia e Bologna; Core di Proteomica e Genomica dell Ospedale San Raffaele; Biodiversity Spa, Brescia; Statistical Laboratory, Centre of Mathematical Sciences, University of Cambridge, London School of Hygiene and Tropical Medicine, Londra; Centro per lo Studio delle Amiloidosi Sistemiche, Policlinico Universitario San Matteo, Pavia; Laboratorio Neurobiologia Sperimentale, IRCCS "Casimiro Mondino"; Laboratorio di Biotecnologia, Università di Brescia; SharDNA Spa, Cagliari ( Laboratorio di Diagnostica Ematologica Avanzata ed Integrata Clinica Ematologica, Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo; Kos Genetic s.r.l., Milano; Laboratorio di Immunologia mucosale - Clinica Medica I IRCCS Policlinico S. Matteo; Genetica Medica,Dipartimento di Scienze della Riproduzione, dello Sviluppo e di Salute Pubblica IRCCS-Burlo Garofolo, Università degli Studi di Trieste; Dipartimento di Genetica, Biologia e Biochimica & Human Genetics Foundation (HuGeF); Laboratorio di diagnostica Molecolare, Istituto Scientifico di Pavia - Via S. Maugeri È possibile un tirocinio esterno all Università di Pavia o presso altri enti o istituti, previa autorizzazione del Collegio dei docenti del Master. Il Collegio dei docenti provvederà a designare un co-tutore membro del collegio, e ad approvare una apposita Convenzione con l ente esterno. È previsto un eventuale riconoscimento di CFU precedentemente acquisiti in percorsi di formazione post lauream. La frequenza da parte degli iscritti alle varie attività formative e' obbligatoria per almeno il 75% del monte ore complessivamente previsto. Il periodo di formazione non può essere sospeso. Non sono ammessi trasferimenti in Master analoghi presso altre sedi Universitarie. Moduli di insegnamento INSEGNAMENTO (corso integrato) MODULI Temi trattati Ore didattica frontale Ore Esercita zioni Ore studio individua le 1) Introduzione alla A) Elementi di probabilità e probabilità 2) Informatica 1: il epidemiologia package R ) Disegno studi sperimentali ) Disegno studi osservazionali 1) Principi di inferenza B) Statistica statistica 2) Modelli lineari generalizzati ) Informatica 2: il package stata 4) Analisi di studi casocontrollo Totale ore CFU 2

3 C) Genetica 1) Genoma umano BIO/18, MED/0, MED/14 2) Malattie mendeliane e malattie complesse BIO/18, MED/0 MED/14 ) Variabilità genetica nell uomo BIO/18, MED/0 4) Principi di bionformatica BIO/ ) Genetica di D) Epidemiologia popolazione genetica 2) Disegno ed analisi di studi di linkage MED/0 ) Disegno ed analisi di studi di associazione familiare 4) Disegno ed analisi di studi di associazione di popolazione, MED/ Totale ) Disegno ed analisi di E) Statistica genetica studi di associazione e molecolare genome wide: SNP e CNV 2) Metodi di imputazione di dati mancanti negli studi genetici ) Analisi integrata di dati genetici e dati di espressione ) Metodi di screening del genoma ) Modelli (con) equazioni F) Modelli multivariati strutturali in epidemiologia 2) Modelli (con) genetica variabili/classi latenti ) Analisi dell interazione gene-ambiente e genegene 4) Analisi di tratti quantitativi complessi Totale ore parziale Tirocinio-Stage Totale ore

4 Attività didattica complementare Possono essere proposti seminari su argomenti specifici tenuti da docenti italiani e stranieri, quali: La suscettibilità genetica alla Sclerosi Multipla La suscettibilità genetica all infarto al miocardio, ipertensione e ictus cerebri La suscettibilità genetica al Morbo di Chron, Colite Ulcerosa e Celiachia La suscettibilità genetica alla malattia di Alzheimer e Demenza Frontotemporale La suscettibilità genetica al cancro del colon e della mammella Metodi statistici per l analisi di dati di sequenza in studi caso controllo a livello del genoma Modelli causali nell analisi di dati genetici Modelli predittivi dell insorgenza e progressione di malattie multifattoriali attraverso dati genetici (genetic risk scores), clinici e di espressione Randomizzazione mendeliana: uso dei geni come variabili strumentali La ricerca bibliografica fra qualità, sintesi e pratica quotidiana Marketing per piattaforme di genetica e genomica Analisi della sopravvivenza Art. 4 - Valutazione La valutazione verrà effettuata sulla base di verifiche di profitto e di una prova finale: ad ogni verifica di profitto, da svolgersi alla fine dei primi insegnamenti (corsi integrati A- B-C), e alla fine dei secondi insegnamenti (corsi integrati D-E-F), verrà attribuito un punteggio massimo di 5. Le prove consisteranno in un esame scritto o orale e in alcuni casi comporteranno l utilizzo di software. La prova scritta/orale verrà effettuata dopo almeno 15 giorni dalla fine di ciascun corso integrato. la prova finale consisterà nella discussione di una tesi sperimentale o trattazione di un tema di rilevante interesse e di un esame scritto le cui domande verteranno sui 6 (A-F) corsi integrati. A tale prova verranno riconosciuti: fino a 0 punti per la qualità della ricerca svolta, fino a 10 punti per l approfondimento bibliografico sul tema argomento della tesi, fino a 10 punti per la redazione e l esposizione della tesi stessa e fino a 20 punti per l esame scritto finale. Per il conseguimento del diploma di Master universitario di II livello lo studente dovrà ottenere un minimo di 42 punti: almeno 20 punti per la qualità della ricerca svolta, almeno 5 punti per l approfondimento bibliografico sul tema argomento della tesi, almeno 5 punti per la redazione e l esposizione della tesi stessa e almeno12 punti l esame scritto finale. Art. 5 - Conseguimento del Titolo A conclusione del Master, agli studenti che hanno svolto tutte le attività ed ottemperato agli obblighi previsti, previo il superamento dell esame finale, verrà rilasciato il Diploma di Master universitario di II livello in Epidemiologia Genetica e Molecolare. Art. 6 - Docenti Gli insegnamenti del Master Universitario saranno tenuti da Docenti dell Università di Pavia, da Docenti di altri Atenei, nonché da esperti esterni altamente qualificati. Il Master si caratterizza per una rilevante componente di Docenti da Enti di ricerca e da qualificate Università italiane e straniere. Art. 7 - Requisiti di ammissione Il Master è rivolto a chi abbia conseguito: 4

5 1. diploma di laurea specialistica, ai sensi del D.M. n. 509/1999, in una delle seguenti classi: Biotecnologie Mediche, Veterinarie e Farmaceutiche (9/S) Farmacia e farmacia industriale 14/S Biotecnologie agrarie 7/S Biologia 6/S Fisica 20/S Ingegneria biomedica 26/S Matematica 45/S Medicina e chirurgia 46/S Medicina veterinaria 47/S Modellistica matematico-fisica per l'ingegneria 50/S Metodi per l'analisi valutativa dei sistemi complessi 48/S Statistica demografica e sociale 90/S Statistica per la ricerca sperimentale 92/S Statistica economica, finanziaria ed attuariale 91/S Scienze biologiche (6/S) Informatica 2S Biotecnologie Industriali 8S Scienze e Tecnologia per l'ambiente e il Territorio (82S) Scienze e Tecnologie Agroalimentari (78S) 2. diploma di laurea magistrale, ai sensi del D.M. n. 270/2004, in una delle seguenti classi: Biologia (LM-6) Biologie agrarie (LM-7) Farmacia e farmacia industriale LM-1 Fisica LM-17 Ingegneria biomedica LM-21 Matematica LM-40 Medicina e chirurgia LM-41 Medicina veterinaria LM-42 Modellistica matematico-fisica per l'ingegneria LM-44 Scienze statistiche LM-82 Scienze statistiche attuariali e finanziarie LM-8 Biostatistica e statistica sperimentale LM-82 Biotecnologie Mediche, Veterinarie e Farmaceutiche (LM-9) Biotecnologie Industriali LM8 Scienze e Tecnologia per l'ambiente e il Territorio (LM75) Scienze e Tecnologie Alimentari (LM70) Informatica LM18. diploma di laurea secondo il previgente ordinamento in: Chimica e Tecnologia Farmaceutiche Farmacia Scienze Biologiche Matematica Statistica Altri titoli di studio saranno valutati dal Collegio dei Docenti ai soli fini dell ammissione. Il numero massimo degli iscritti è previsto in 25 unità Il numero minimo per attivare il corso è di 10 iscritti 5

6 Il Collegio docenti potrà altresì valutare se sussistano le condizioni per ampliare il suddetto contingente di posti. Nel caso in cui il numero degli aspiranti sia superiore a quello massimo previsto, verrà effettuata, da parte di una Commissione composta dal Coordinatore del Master e da due membri del Collegio dei docenti, una selezione e formulata una graduatoria di merito, espressa in centesimi, determinata sulla base dei seguenti criteri di valutazione: 1. Fino ad un massimo di punti 40 punti per il voto di laurea, così determinato: (voto di laurea 40)/ Fino ad un massimo di 40 punti per i seguenti esami sostenuti nel corso della carriera universitaria: - 8 punti per l esame di STATISTICA o MATEMATICA o affini - 8 punti per l esame di GENETICA o affini - 8 punti per l esame di INFORMATICA/BIOINFORMATICA o affini - 8 punti per l esame di BIOINGEGNERIA o affini - 8 punti per l esame di BIOTECNOLOGIE o FARMACOLOGIA o affini. fino ad un massimo di 20 punti per ogni altro eventuale titolo pertinente, così ripartiti: - Tesi pertinente fino a 7 punti - Scuola di specializzazione pertinente 2 punti - Master pertinente 2 punti per ciascun master - Dottorato di ricerca pertinente fino a 6 punti - Borsa o assegno di ricerca pertinenti fino a punti (1 punto per anno) - Attività di ricerca pertinente fino a punti (1 punto per anno) In caso di ex aequo all ultimo posto disponibile in graduatoria sarà ammesso il candidato più giovane di età. In caso di rinuncia di uno o più candidati, i posti resisi disponibili saranno messi a disposizione dei candidati che compaiono nella graduatoria finale, fino ad esaurimento dei posti stessi, secondo la graduatoria di merito. Art. 8 - Termine di presentazione delle domande di ammissione I candidati devono inviare la domanda di ammissione, secondo le modalità stabilite dal bando, a decorrere dal 15 settembre 2011 ed entro il termine del 02 novembre Art. 9 - Allegati alla domanda di partecipazione I candidati devono allegare alla domanda di partecipazione al master la dichiarazione 1 sostitutiva di certificazione relativa ai requisiti richiesti per l ammissione e per l eventuale selezione: esami sostenuti nel corso della carriera universitaria e relativi ai seguenti insegnamenti: - STATISTICA o MATEMATICA o affini - GENETICA o affini - INFORMATICA/BIOINFORMATICA o affini - BIOINGEGNERIA o affini - BIOTECNOLOGIE o FARMACOLOGIA o affini titoli pertinenti alle tematiche del master (vedasi art.7) curriculum vitae 1 la modulistica è scaricabile dal sito 6

7 Tali requisiti devono essere posseduti entro il termine previsto per la presentazione della domanda di ammissione. Art Contributo di ammissione L iscritto al Master dovrà versare per l a.a. 2011/2012 la somma di.500,00 comprensiva di: 14,62 quale imposta di bollo, 6,90 quale quota integrativa per Assicurazione infortuni, 127,00 quale rimborso spese per servizi agli studenti, 2,00 quale Fondo cooperazione e conoscenza Tale importo si versa in un unica rata all atto dell immatricolazione. Qualora Enti o Soggetti esterni contribuiscano al funzionamento del Master mediante l'erogazione di un contribuito finalizzato a coprire l'iscrizione di candidati, lo stesso sarà assegnato sulla base di un colloquio tendente a valutare le conoscenze specifiche in statistica e genetica. Gli aspiranti dovranno presentare domanda su apposito modulo, corredata da curriculum vitae. I vincitori dovranno svolgere, a titolo gratuito, l'attività di tirocinio diretto alla preparazione della tesi del Master, nei laboratori di tali Enti o Soggetti esterni finanziatori per un totale di 42 CFU (=42x25=1050 ore). Art. 11 Sito web della segreteria organizzativa di cui all art. 7 del bando di ammissione Qualsiasi comunicazione ai candidati verrà resa nota mediante pubblicazione al seguente sito web del dipartimento di Scienze Sanitarie Applicate e Psicocomportamentali: Per informazioni relative all organizzazione del corso: Segreteria organizzativa Università degli Studi di Pavia Dipartimento di Scienze Sanitarie Applicate Via Bassi 21, Pavia Sig. Alessandra Bianchi - statgen@unipv.it 7

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