Informazioni sul corso a.a v.1. Insegnamento di Biochimica 090SM BIO/10 6 CFU 48 ore

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1 Informazioni sul corso a.a v.1 Insegnamento di Biochimica 090SM BIO/10 6 CFU 48 ore

2 Informazioni sul corso Marco Scocchi Dip. Di Scienze della Vita - Prof. Associato Tel mscocchi@units.it Insegnamento di Biochimica 090SM BIO/10 6 CFU 48 ore Gruppo di ricerca: Peptidi di difesa dell'ospite - meccanismo d'azione e applicazioni Ambito: Biomedicina Linea: Microbiologia molecolare 2

3 Informazioni sul corso di biochimica Obiettivi Obiettivi: Far acquisire agli studenti conoscenza delle principali biomolecole includendo struttura, proprietà, funzioni, interazioni e metabolismo delle biomolecole. Giungere a comprendere le basi molecolari dei sistemi biologici e degli scambi energetici che guidano il metabolismo. 3

4 Programma del corso (I) Introduzione alle biomolecole (m1) Le caratteristiche fondamentali delle molecole biologiche: il legame covalente, i gruppi funzionali, la gerarchia molecolare. Le interazioni deboli: il legame idrogeno, legami di Van del Waals, i legami ionici e le interazioni idrofobiche. Struttura e funzione delle proteine (m2, m4) Le caratteristiche degli amminoacidi. Il legame peptidico, i quattro livelli di struttura delle proteine, l α-elica, la conformazione β, i ripiegamenti β le forze che stabilizzano la struttura. Esempi della struttura e della funzione di alcune proteine fibrose e globulari. La mioglobina l emoglobina, regolazione del legame all ossigeno. Gli enzimi e la loro regolazione (m5, m6) Proprietà degli enzimi. Classificazione. i cofattori. La catalisi. L energia di attivazione. Il sito attivo. Il modello cinetico di Michaelis-Menten. Inibizione enzimatica reversibile ed irreversibile. Esempio di meccanismo catalitico: la chimotripsina. Regolazione enzimatica: il controllo allosterico, la fosforilazione, l attivazione proteolitica. 4 Continua

5 Programma del corso (II) I carboidrati (m7) I monosaccaridi. Il legame glicosidico. I disaccaridi, i polisaccaridi. L amido, la cellulosa, il glicogeno. I glicosamminoglicani ed i glicoconiugati e loro funzioni biologiche. I lipidi (m8) Gli acidi grassi, i triacilgliceroli. I glicerofosfolipidi, gli sfingolipidi ed il colesterolo. Funzioni biologiche dei lipidi. Le membrane biologiche (m9) caratteristiche delle membrane biologiche. Fluidità di membrana. Le proteine di membrana. Meccanismi di trasporto. Trasporto passivo, trasportatori e canali ionici. IL trasporto attivo e le valutazioni energetiche. Il DNA ed il flusso dell informazione genetica (m10) Nucleosidi e nucleotidi. Il legame fosfodiestere. La struttura del DNA. Sintesi del DNA e denaturazione. Cenni sulle funzioni del DNA e dei diversi RNA. Funzioni biologiche dei nucleotidi. La biosegnalazione (m11) La trasduzione del segnale: principali sistemi di trasduzione. I Recettori di membrana. Le proteine G ed Secondi messaggeri. Recettori con attività tirosin-chinasica. 5

6 Programma del corso (III) Bioenergetica e metabolismo (m12) Visione d insieme e finalità. Principi di bioenergetica: le variazioni di energia libera, l ATP ed il trasferimento del gruppo fosforico. Il coenzima A. Le ossidoriduzioni di interesse biologico: il NADH ed il FADH 2. Catabolismo, e anabolismo. Le vie metaboliche principali Glicolisi e gluconeogenesi (m13). La glicolisi: descrizione delle tappe, bilancio. Destini del piruvato. Sistemi di regolazione. La gluconeogenesi e sua regolazione. La degradazione del glicogeno e la via del pentosio fosfato. Acetil-Coa e ciclo di Krebs (m14). Principali tappe, prodotti e regolazione. L ossidazione degli acidi grassi. Il ciclo dell acido citrico. La catena di trasporto degli elettroni e la fosforilazione ossidativa. La sintesi dell ATP. Strategie metaboliche nelle piante e nei microorganismi. Metabolismo dei lipidi (m15). Destino dei lipidi. Metabolismo degli acidi grassi. Trasporto mitocondriale e beta-ossidazione. Cenni sulla biosintesi. La fosforilazione ossidativa (m16). Il potenziale di trasferimento degli elettroni. La catena respiratoria, Formazione del gradiente protonico. Utilizzo del gradiente protonico: l ATP sintasi e la sintesi dell ATP. Resa energetica.

7 Informazioni sul corso - Materiale didattico Appunti delle lezioni Presentazione ppt: caricata in formato PDF su Moodle2 Libro di testo consigliato: Pwd: proteina Introduzione alla Biochimica di Lehninger Quinta edizione- Ed. Zanichelli Possono essere utilizzate anche edizioni precedenti. In alternativa altri testi di biochimica purché recenti (< anni) Testi Utilizzati: Berg, Tymoczko, Stryer Biochimica Sesta edizione Ed. Zanichelli Biochimica di Garrett Grisham Piccin ed 2014 Biochemical Adaptation: Mechanism and Process in Physiological Evolution (Inglese) P. W. Hochachka. G. N. Somero 2002 Brock Biology of Microorganisms, Madigan Michael

8 L esame Esame in forma scritta. 12 domande a risposta multipla (circa 1/3 del punteggio) 4 domande aperte (anche problemi) di cui almeno una sul metabolismo (circa 2/3 del punteggio). Prossimi Appelli: 30/01/2018 (sugg. per chi ha superato chim. Organica 29/01) 16/02/2018 Inizio marzo 2018 Consigliatissimo: affrontare prima l esame di chimica organica