SETTIMANA 01 24-02-2014 25-02-2014 26-02-2014 27-02-2014 28-02-2014 05-S:Introduzione al seq. Solanacee 18-S:Introduzione al seq. Drupacee 10-11 INTRODUZIONE GIORNATEGENOMICHE 06-S: Sequenziamento Solanacee 09-S: Sequenziamento Pomacee 12-S: Sequenziamento vite 19-S: Sequenziamento Drupacee 11-12 01-S:Sequenziamento Graminacee 07-S: Sequenziamento Solanacee 10-S: Sequenziamento Pomacee 13-S: Sequenziamento vite 20-S: Sequenziamento Drupacee 12-13 02-S:Sequenziamento Graminacee 08-S: Sequenziamento Solanacee 11-S: Sequenziamento Pomacee 14-S: Sequenziamento vite 21-S: Sequenziamento Drupacee 22-Conclusioni sul seq. genomi veg, 14-15 03-S:Sequenziamento Graminacee 15- S: Sequenziamento olivo 15-16 04-S:Sequenziamento Graminacee 16- S: Sequenziamento olivo 16-17 17- S: Sequenziamento olivo SETTIMANA 02 3-03-2014 4-03-2014 5-03-2014 6-03-2014 7-03-2014 10-11 VACANZE CARNEVALE VACANZE CARNEVALE VACANZE CARNEVALE 01-Introduzione NGS 07-Introduzione NGS 11-12 02-Introduzione NGS 08-Introduzione NGS 12-13 03-Introduzione NGS 09-Introduzione NGS 14-15 04-Introduzione NGS 10-Introduzione NGS 15-16 05-Introduzione NGS 11-Introduzione NGS 16-17 06-Introduzione NGS 12-Introduzione NGS SETTIMANA 03 10-03-2014 11-03-2014 12-03-2014 13-03-2014 14-03-2014 10-11 01-Genome Sequencer Illumina 07-Genome Sequencer Illumina 01-Tecnologie SOLID 07-Tecnologie SOLID 11-12 02-Genome Sequencer Illumina 08-Genome Sequencer Illumina 02-Tecnologie SOLID 08-Tecnologie SOLID 12-13 03-Genome Sequencer Illumina 09-Genome Sequencer Illumina 03-Tecnologie SOLID 09-Tecnologie SOLID 14-15 04-Genome Sequencer Illumina 10-Genome Sequencer Illumina 04-Tecnologie SOLID 10-Tecnologie SOLID 15-16 05-Genome Sequencer Illumina 11-Genome Sequencer Illumina 05-Tecnologie SOLID 11-Tecnologie SOLID 16-17 06-Genome Sequencer Illumina 12-Genome Sequencer Illumina 06-Tecnologie SOLID 12-Tecnologie SOLID SETTIMANA 04 17-03-2014 18-03-2014 19-03-2014 20-03-2014 21-03-2014 10-11 01-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 04-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 07-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 10-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 13-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 11-12 02-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 05-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 08-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 11-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 14-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 12-13 03-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 06-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 09-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 12-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 14-15 01-Fondamenti assemblaggio seq, 04-Fondamenti assemblaggio seq, 07-Fondamenti assemblaggio seq, 10-Fondamenti assemblaggio seq, 15-16 02-Fondamenti assemblaggio seq, 05-Fondamenti assemblaggio seq, 08-Fondamenti assemblaggio seq, 11-Fondamenti assemblaggio seq, 16-17 03-Fondamenti assemblaggio seq, 06-Fondamenti assemblaggio seq, 09-Fondamenti assemblaggio seq, 12-Fondamenti assemblaggio seq, SETTIMANA 05 24-03-2014 25-03-2014 26-03-2014 27-03-2014 28-03-2014
10-11 01-Genomica comparativa 07-Genomica comparativa 13-Genomica comparativa 01-Genome Sequencer 454/Roche 11-12 02-Genomica comparativa 08-Genomica comparativa 14-Genomica comparativa 02-Genome Sequencer 454/Roche 12-13 03-Genomica comparativa 09-Genomica comparativa 15-Genomica comparativa 03-Genome Sequencer 454/Roche 14-15 04-Genomica comparativa 10-Genomica comparativa 16-Genomica comparativa 04-Genome Sequencer 454/Roche 15-16 05-Genomica comparativa 11-Genomica comparativa 17-Genomica comparativa 05-Genome Sequencer 454/Roche 16-17 06-Genomica comparativa 12-Genomica comparativa 18-Genomica comparativa 06-Genome Sequencer 454/Roche SETTIMANA 06 31-03-2014 1-04-2014 2-04-2014 3-04-2014 4-04-2014 31-Genomica comparativa 34-Genomica comparativa 10-11 19-Genomica comparativa 25-Genomica comparativa 32-Genomica comparativa 35-Genomica comparativa 11-12 20-Genomica comparativa 26-Genomica comparativa 33-Genomica comparativa 36-Genomica comparativa 12-13 21-Genomica comparativa 27-Genomica comparativa 01-Fondamenti mappaggio reads 05-Fondamenti mappaggio reads 14-15 22-Genomica comparativa 28-Genomica comparativa 02-Fondamenti mappaggio reads 06-Fondamenti mappaggio reads 15-16 23-Genomica comparativa 29-Genomica comparativa 03-Fondamenti mappaggio reads 07-Fondamenti mappaggio reads 16-17 24-Genomica comparativa 30-Genomica comparativa 04-Fondamenti mappaggio reads 08-Fondamenti mappaggio reads SETTIMANA 07 7-04-2014 8-04-2014 9-04-2014 10-04-2014 11-04-2014 10-11 01-Annotazione sequenze 11-Annotazione sequenze 11-12 02-Annotazione sequenze 12-Annotazione sequenze 12-13 03-Annotazione sequenze 13-Annotazione sequenze 09-Fondamenti mappaggio reads 12-Fondamenti mappaggio reads 07-Annotazione sequenze 14-Annotazione sequenze 14-15 10-Fondamenti mappaggio reads 13-Fondamenti mappaggio reads 04-Annotazione sequenze 08-Annotazione sequenze 15-16 11-Fondamenti mappaggio reads 14-Fondamenti mappaggio reads 05-Annotazione sequenze 09-Annotazione sequenze 16-17 06-Annotazione sequenze 10-Annotazione sequenze SETTIMANA 08 14-04-2014 15-04-2014 16-04-2014 17-04-2014 18-04-2014 INIZIO VACANZE PASQUA 10-11 01-RNA-Seq 11-12 02-RNA-Seq 12-13 03-RNA-Seq 14-15 04-RNA-Seq 15-16 05-RNA-Seq 16-17 06-RNA-Seq SETTIMANA 09 21-04-2014 22-04-2014 23-04-2014 24-04-2014 25-04-2014 FINE VACANZE PASQUA 10-11
11-12 12-13 14-15 15-16 16-17 SETTIMANA 10 28-04-2014 29-04-2014 30-04-2014 1-05-2014 2-05-2014 FESTA DEL LAVORO 10-11 01-Impiego microarray 04-Impiego microarray 07-Impiego microarray 11-12 02-Impiego microarray 05-Impiego microarray 08-Impiego microarray 12-13 03-Impiego microarray 06-Impiego microarray 09-Impiego microarray 14-15 07-RNA-Seq 10-RNA-Seq 13-RNA-Seq 15-16 08-RNA-Seq 11-RNA-Seq 14-RNA-Seq 16-17 09-RNA-Seq 12-RNA-Seq 15-RNA-Seq SETTIMANA 11 5-05-2014 6-05-2014 7-05-2014 8-05-2014 9-05-2014 10-11 10-Impiego microarray 13-Impiego microarray 16-Impiego microarray 19-Impiego microarray 22-Impiego microarray 11-12 11-Impiego microarray 14-Impiego microarray 17-Impiego microarray 20-Impiego microarray 23-Impiego microarray 12-13 12-Impiego microarray 15-Impiego microarray 18-Impiego microarray 21-Impiego microarray 24-Impiego microarray 14-15 16-RNA-Seq 19-RNA-Seq 22-RNA-Seq 25-RNA-Seq 28-RNA-Seq 15-16 17-RNA-Seq 20-RNA-Seq 23-RNA-Seq 26-RNA-Seq 29-RNA-Seq 16-17 18-RNA-Seq 21-RNA-Seq 24-RNA-Seq 27-RNA-Seq 30-RNA-Seq SETTIMANA 12 12-05-2014 13-05-2014 14-05-2014 15-05-2014 16-05-2014 10-11 46-RNA-Seq 11-12 47-RNA-Seq 12-13 48-RNA-Seq 31-RNA-Seq 35-RNA-Seq 39-RNA-Seq 14-15 32-RNA-Seq 36-RNA-Seq 40-RNA-Seq 43-RNA-Seq 15-16 33-RNA-Seq 37-RNA-Seq 41-RNA-Seq 44-RNA-Seq 16-17 34-RNA-Seq 38-RNA-Seq 42-RNA-Seq 45-RNA-Seq SETTIMANA 13 19-05-2014 20-05-2014 21-05-2014 22-05-2014 23-05-2014 01-Sequenziamento NGS si srna 08-Sequenziamento NGS si srna 10-11 02-Sequenziamento NGS si srna 09-Sequenziamento NGS si srna 15-Sequenziamento NGS si srna 11-12 03-Sequenziamento NGS si srna 10-Sequenziamento NGS si srna 16-Sequenziamento NGS si srna 12-13 04-Sequenziamento NGS si srna 11-Sequenziamento NGS si srna 17-Sequenziamento NGS si srna
14-15 05-Sequenziamento NGS si srna 12-Sequenziamento NGS si srna 18-Sequenziamento NGS si srna 15-16 06-Sequenziamento NGS si srna 13-Sequenziamento NGS si srna 19-Sequenziamento NGS si srna 16-17 07-Sequenziamento NGS si srna 14-Sequenziamento NGS si srna 20-Sequenziamento NGS si srna SETTIMANA 14 26-05-2014 27-05-2014 28-05-2014 29-05-2014 30-05-2014 10-11 01-ChiP-Seq per regol. trascriz. 07-ChiP-Seq per regol. trascriz. 13-ChiP-Seq per regol. trascriz. 18-ChiP-Seq per regol. trascriz. 11-12 02-ChiP-Seq per regol. trascriz. 08-ChiP-Seq per regol. trascriz. 14-ChiP-Seq per regol. trascriz. 19-ChiP-Seq per regol. trascriz. 12-13 03-ChiP-Seq per regol. trascriz. 09-ChiP-Seq per regol. trascriz. 15-ChiP-Seq per regol. trascriz. 20-ChiP-Seq per regol. trascriz. 14-15 04-ChiP-Seq per regol. trascriz. 10-ChiP-Seq per regol. trascriz. 16-ChiP-Seq per regol. trascriz. 15-16 05-ChiP-Seq per regol. trascriz. 11-ChiP-Seq per regol. trascriz. 17-ChiP-Seq per regol. trascriz. 16-17 06-ChiP-Seq per regol. trascriz. 12-ChiP-Seq per regol. trascriz. SETTIMANA 15 2-06-2014 3-06-2014 4-06-2014 5-06-2014 6-06-2014 FESTA DELLA REPUBBLICA 10-11 01-Risequenziamento genomi 05-Risequenziamento genomi 09-Risequenziamento genomi 13-Risequenziamento genomi 11-12 02-Risequenziamento genomi 06-Risequenziamento genomi 10-Risequenziamento genomi 14-Risequenziamento genomi 12-13 03-Risequenziamento genomi 07-Risequenziamento genomi 11-Risequenziamento genomi 15-Risequenziamento genomi 04-Risequenziamento genomi 08-Risequenziamento genomi 12-Risequenziamento genomi 16-Risequenziamento genomi 14-15 15-16 16-17 SETTIMANA 16 9-06-2014 10-06-2014 11-06-2014 12-06-2014 13-06-2014 10-11 01-Ricerca polimorfismi 07-Ricerca polimorfismi 13-Ricerca polimorfismi 19-Ricerca polimorfismi 25-Ricerca polimorfismi 11-12 02-Ricerca polimorfismi 08-Ricerca polimorfismi 14-Ricerca polimorfismi 20-Ricerca polimorfismi 26-Ricerca polimorfismi 12-13 03-Ricerca polimorfismi 09-Ricerca polimorfismi 15-Ricerca polimorfismi 21-Ricerca polimorfismi 27-Ricerca polimorfismi 28-Ricerca polimorfismi 14-15 04-Ricerca polimorfismi 10-Ricerca polimorfismi 16-Ricerca polimorfismi 22-Ricerca polimorfismi 15-16 05-Ricerca polimorfismi 11-Ricerca polimorfismi 17-Ricerca polimorfismi 23-Ricerca polimorfismi 16-17 06-Ricerca polimorfismi 12-Ricerca polimorfismi 18-Ricerca polimorfismi 24-Ricerca polimorfismi SETTIMANA 17 16-06-2014 17-06-2014 18-06-2014 19-06-2014 20-06-2014 10-11 11-12 12-13 01-Sequenziamento genoma organelli 05-Sequenziamento genoma organelli 09-Sequenziamento genoma organelli 13-Sequenziamento genoma organelli 02-Sequenziamento genoma organelli 06-Sequenziamento genoma organelli 10-Sequenziamento genoma organelli 14-Sequenziamento genoma organelli 14-15 03-Sequenziamento genoma organelli 07-Sequenziamento genoma organelli 11-Sequenziamento genoma organelli 15-Sequenziamento genoma organelli
15-16 04-Sequenziamento genoma organelli 08-Sequenziamento genoma organelli 12-Sequenziamento genoma organelli 16-Sequenziamento genoma organelli 16-17 SETTIMANA 18 23-06-2014 24-06-2014 25-06-2014 26-06-2014 10-11 17-Sequenziamento genoma organelli 01-Proteogenomica 01-Bioinf. in post-genomica 11-12 18-Sequenziamento genoma organelli 02-Proteogenomica 02 Bioinf. in post-genomica 12-13 19-Sequenziamento genoma organelli 03-Proteogenomica 03-Bioinf. in post-genomica 20-Sequenziamento genoma organelli 14-15 04-Proteogenomica 15-16 05-Proteogenomica 16-17 06-Proteogenomica SETTIMANA 19 30-06-2014 1-07-2014 2-07-2014 3-07-2014 4-07-2014 10-11 04-Bioinf. in post-genomica 07-Bioinf. in post-genomica 10-Bioinf. in post-genomica 16-Proteogenomica 11-12 05-Bioinf. in post-genomica 08-Bioinf. in post-genomica 11-Bioinf. in post-genomica 17-Proteogenomica 12-13 06-Bioinf. in post-genomica 09-Bioinf. in post-genomica 12-Bioinf. in post-genomica 18-Proteogenomica 14-15 07-Proteogenomica 10-Proteogenomica 13-Proteogenomica 19-Proteogenomica 15-16 08-Proteogenomica 11-Proteogenomica 14-Proteogenomica 20-Proteogenomica 16-17 09-Proteogenomica 12-Proteogenomica 15-Proteogenomica SETTIMANA 20 7-07-2014 8-07-2014 9-07-2014 10-07-2014 11-07-2014 10-11 13-Bioinf. in post-genomica 19-Bioinf. in post-genomica 25-Bioinf. in post-genomica 11-12 14-Bioinf. in post-genomica 20-Bioinf. in post-genomica 26-Bioinf. in post-genomica 12-13 15-Bioinf. in post-genomica 21-Bioinf. in post-genomica 27-Bioinf. in post-genomica 14-15 16-Bioinf. in post-genomica 22-Bioinf. in post-genomica 28-Bioinf. in post-genomica 15-16 17-Bioinf. in post-genomica 23-Bioinf. in post-genomica 29-Bioinf. in post-genomica 16-17 18-Bioinf. in post-genomica 24-Bioinf. in post-genomica 30-Bioinf. in post-genomica SETTIMANA 21 14-07-2014 15-07-2014 16-07-2014 17-07-2014 18-07-2014 10-11 31-Bioinf. in post-genomica 37-Bioinf. in post-genomica 01-S01:Prosp. genom. post-genom 07-S03:Prosp. genom. post-genom 11-12 32-Bioinf. in post-genomica 38-Bioinf. in post-genomica 02-S01:Prosp. genom. post-genom 08-S03:Prosp. genom. post-genom 12-13 33-Bioinf. in post-genomica 39-Bioinf. in post-genomica 03-S01:Prosp. genom. post-genom 09-S03:Prosp. genom. post-genom 04-S02:Prosp. genom. post-genom 10-S04:Prosp. genom. post-genom 14-15 34-Bioinf. in post-genomica 15-16 35-Bioinf. in post-genomica 05-S02:Prosp. genom. post-genom 11-S04:Prosp. genom. post-genom 16-17 36-Bioinf. in post-genomica 06-S02:Prosp. genom. post-genom 12-S04:Prosp. genom. post-genom
B.01.a Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (a) cereali ORE 21 B.09 Consultazione ed utilizzo di sequenze genomiche annotate Traini Alessandra B.01.b Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (b) solanacee B.01.c Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (d) pomacee B.01.d Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (e) drupacee 6 seminari da 3 ore ciascuno + 3 ore "miste": Luigi Cattivelli (graminacee), Giovanni Giuliano B.10, Genomica comparativa: analisi di famiglie (solanacee), Riccardo Velasco (pomacee), geniche Massimo Delledonne (vite), Simone Scalabrin (olivo), Ignazio Verde (drupacee). B.11 RNA-Seq: Assemblaggio ed annotazione de novo di trascrittomi e digital gene expression profiling B.12 Impiego dei microarray per lo studio dell' espressione genica Sanseverino Walter D'Agostino Nunzio Ferrarini Alberto B.01.e Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (f) agrumi B.13 Sequenziamento NGS di small RNA ed analisi dei dati Faccioli Primetta B.01.f Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (c) vite B.14 ChiP-Seq applicato allo studio della regolazione della trascrizione Matarazzo Maria Rosaria B.01.g Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (f) olivo B.02.a Introduzione agli approcci NGS: basi teoriche e risultati attuali, le innovazioni e le prospettive ORE 12 + 6 B.03 Genome Sequencer 454/Roche Gaetano Perrotta B.15 Risequenziamento di genomi e risequenziamento targeted di geni candidati mediante tecnologie NGS B.16. Ricerca di polimorfismi (SNPs/indels) da dati NGS Delledonne Massimo Sanseverino Walter B.04 Genome Sequencer Illumina ORE 12 Angela Cordella B.17 Sequenziamento mediante tecnologie NGS ed B.05 Tecnologia SOLiD ORE 12 Giovanna Marchese Scotti Nunzia annotazione del DNA mitocondriale e plastidico B.06 Fondamentali sull'assemblaggio delle sequenze B.18 Proteogenomica Caterino Marianna B.07 Fondamentali sul mappaggio delle reads lungo un genoma di riferimento D'Agostino Nunzio B.19 La bioinformatica nell'era post-genomica: strumenti e banche l'analisi e l' integrazione di dati 'omici' Boccia Angelo
D'Agostino Nunzio B.08 Annotazione di sequenze genomiche: dalla sequenza alla funzione B.20.a Prospettive della genomica e postgenomica nella genetica agraria