Cos'è Linux. Un sistema operativo : un insieme di programmi necessari per il funzionamento del computer e per il funzionamento di altri programmi.

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1 Cos'è Linux Un sistema operativo : un insieme di programmi necessari per il funzionamento del computer e per il funzionamento di altri programmi. Unix gratuito : una implementazione gratuita di Unix per Personal Computer sviluppata nel 1994 da Linus Torvalds File: linux_introduzione_files.sxi Riccardo Percudani 02/03/04

2 Perché Linux? Stabile e potente Gratuito e open source Molte applicazioni generali gratuite Molti programmi di bioinformatica basati su linux File: linux_introduzione_files.sxi Riccardo Percudani 02/03/04

3 Linux: componenti Tre componenti: Kernel il fulcro del sistema. Comunica con l hardware (processore, memoria, disco fisso) Shell interfaccia tra l utente e il kernel Applicazioni programmi che estendono le funzioni del sistema operativo Kernel Shell Applicazioni File: linux_introduzione_files.sxi Riccardo Percudani 02/03/04

4 Oggetti: files e processi In Linux si hanno solamente files o processi. Processi Applicazioni attive in memoria. Sono associate ad un PID (process identifier) Files Sono collezioni di dati conservati in una memoria permanente. Esempi di files: documenti o programmi in formato di testo dati o programmi in formato binario directories

5 Struttura delle directories I file sono raggruppati in directories. Il sistema (filesystem) ha una struttura gerarchica. Il primo elemento della gerarchia è chiamato radice

6 Logica dei comandi Una frase in linguaggio naturale del tipo portami velocemente una penna per favore In Unix dovrebbe essere formulata come: portami -velocemente -perfavore penna comando opzioni parametro Oppure, dal momento che Unix è un linguaggio sintetico: prtm -v -p penna Opzioni + parametri sono chiamati argomenti. Nb. Lo spazio è sempre il separatore tra comando e argomenti e tra i vari argomenti Nb. Per eseguire un comando occorre usare il tasto [invio]

7 Convenzioni tipografiche Useremo le seguenti convenzioni: Caratteri scritti in rosso e grassetto devono essere introdotte nel computer così come sono scritte Caratteri scritti in rosso e corsivo rappresentano nomi generici di file o directories NB. Unix fa distinzione tra maiuscole e minuscole In Unix miofile.txt, MioFile.txt e MIOFILE.txt sono tre file diversi, ma se vengono trasferiti in Windows diventano lo stesso file! Windows non distingue tra maiuscole e minuscole.

8 Comandi: lista dei files e directories Dopo il login ci si trova alla directory di partenza chiamata home Per vedere il contenuto della directory (list) % ls Ci sono due directory speciali che non vengono listate:. directory corrente.. directory precedente Per listare tutti i file e le directories bisogna aggiungere un opzione % ls -a

9 Comandi: operazioni sulle directories Per creare una sub directory nella directory corrente (make directory) % mkdir nomedirectory Per entrare nella directory (change directory) % cd nomedirectory Si possono usare anche le directories speciali % cd.. (va alla directory precedente) % cd. (rimane dov è)

10 Pathnames Il pathname è il nome completo dei files e delle directories nel file-system Per vedere il pathname della directory corrente (print working directory): % pwd Nella vostra directory dovreste avere un risultato del tipo: /home/vostro_nome Significa che la directory corrente vostro_nome è figlia della directory chiamata home, che a sua volta è figlia della radice / Le operazioni files e directories possono essere effettuate con i pathnames: % ls /home/biocomp % cd /home/biocomp

11 Comandi: copiare, muovere, cancellare files copiare file o directory (copy) % cp file1 file2 % cp file1 subdir/file1 % cp file1../file1 muovere file e directory (move) % mv file1 file2 % mv file1 subdir/file2 % mv file1../file2 cancellare file (remove) e directory (remove directory) % rm file % rmdir directory (solo se vuota)

12 Comandi: leggere i files visualizzare il contenuto di files (concatenate) % cat file % cat file1 file2 visualizzare 1 pagina alla volta (less) % less file visualizzare le prime righe (head) e le ultime (tail) righe % head file % tail file

13 Sommario comandi su files e directories ls ls -a mkdir cd directory cd.. pwd lista files e directories lista tutti i files e directories crea una directory va alla directory va alla directory precedente mostra il percorso della directory cp file1 file2 mv file1 file2 rm file rmdir directory cat file less file head file tail file copia il file1 in file2 rinomina file1 in file2 cancella un file cancella una directory mostra un file mostra una pagina per volta mostra le prime righe di un file mostra le ultime righe di un file