Marta Blangiardo Curriculum Vitæ

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1 Marta Blangiardo Curriculum Vitæ Imperial College, Department of Epidemiology and Public Health School of Medicine St. Mary s Campus, Norfolk Place London W2 1PG, UK website: Tel. +44 (0) Fax +44 (0) Nata a Milano il 15 Settembre Completa il Liceo Classico P. D Anghiera ad Arona (Novara) nel Si laurea in Scienze Statistiche, Demografiche e Sociali all università di Milano-Bicocca nel 2001 con una tesi dal titolo: Approcci parametrici e semiparametrici alla meta-analisi di studi osservazionali in epidemiologia, relatore Prof. Giovanni Corrao. Ottiene una votazione di 110 cum laude Dal Gennaio 2002 al Dicembre 2004 svolge il dottorato in Statistica Applicata con una borsa di studio all Università di Firenze, ottenendo il titolo di dottore di ricerca con una tesi è intitolata: Modelling variability of gene expression data, relatore prof. Annibale Biggeri. Nel 2003 è visiting scholar al Center for Genomic Research, Harvard University, Cambridge, Massachusetts (USA). Da Gennaio 2005 è Research Fellow in Biostatistics and Genomics al Department of Epidemiology and Public Health, Imperial College, London, UK. Membro dell Unità di Ricerca di Firenze nell ambito del PRIN-COFIN Statistical contributions to the analysis of gene expression data ( ) Membro dell Unità di Ricerca di Firenze nell ambito del PRIN-COFIN Statistical tools in system biology ( )

2 Interessi di ricerca Marta Blangiardo lavora allo sviluppo di nuovi modelli e alle applicazioni di metodologie esistenti all interno di vari progetti che riguardano l analisi di dati di espressione genica ed epidemiologici. In particolare, il suo interesse si concentra sui seguenti aspetti: confronto di liste di geni provenienti da diversi esperimenti, al fine di integrarne le informazioni sviluppo di modelli di errore della misura in dati di espressione genica modelli gerarchici in epidemiologia. Al momento sta collaborando all interno del progetto HEIMTSA, allo sviluppo di modelli Bayesiani che permettano di incorporare incertezza ad ogni step della catena del processo inquinante, con particolare riguardo agli effetti degli inquinanti sulla salute pubblica. Al momento Marta Blangiardo sta anche lavorando all applicazione di modelli Bayesiani per la stima del livello di integrazione degli stranieri in Italia. Progetti di ricerca passati Marta Blangiardo ha fornito consulenza statistica per un indagine sui cittadini provenienti dai Paesi al di fuori della comunità europea all interno dell Osservatorio Statistico per la presenza straniera in Lombardia, progetto curato dalla Fondazione I.S.MU. per la regione Lombardia, iniziato nel 2000 e ora alla sua settima edizione. Ogni anno i risultati dell indagine sono organizzati in un report pubblicato dalla casa editrice Franco Angeli, Milano. Dal 2003 al 2005 Marta ha collaborato con il Dipartimento dell area critica dell Ospedale di Careggi (Firenze), all interno di un progetto intitolato Calibration experiments in Microarray analysis e con l Unità Operativa di Farmacologia e Servizio di Chemioterapia Clinica dell ospedale di Careggi (Firenze), all interno di un progetto per la valutazione dell effetto di onde elettromagnetiche a bassa frequenza nell uomo e nel lievito, parte del progetto europeo Nutrigenomics (NuGo, una rete per integrare le competenze di ricercatori nel campo della genomica nutrizionale). Dal 2003 al 2005 Marta è stata la consulente statistica per l Istituto Regionale Di Ricerca in Lombardia (IReR) lavorando su due progetti: Una valutazione dei pazienti anziani e disabili in Lombardia and Migrazione interna in Lombardia. Nel 2004 Marta ha collaborato con l Azienda Regionale della Sanità in Toscana (ARST) per l analisi statistica degli incidenti stradali. Nel 2005 Marta ha contribuito all organizzazione e all insegnamento del corso residenziale Statistics for Functional Genomicists and Functional Genomics for Statisticians tenutosi a S. Domenico (Firenze) dal 9 al 13 Maggio 2005.

3 Nel 2006 Marta ha iniziato a lavorare su un modello Bayesiano a classi latenti per valutare il livello di integrazione degli immigrati presenti in Lombardia (in collaborazione con il dipartimento di statistica di University College London e I.S.MU.)

4 Esperienza di insegnamento Esercitazioni per il corso Statistica per le Scienze Sociali (Facoltà di Psicologia, Università di Milano-Bicocca) nel Docente assistente per il corso di Database Management using the package SAS (Facoltà di Economia, Università di Firenze) nel 2003 Esercitazioni per il corso Stratified analysis and regression modelling in epidemiology nel 2005, 2006, 2007 e Introduction to multilevel modelling nel 2007 al Department of Epidemiology and Public Health, Imperial College. Docente per il corso Introduzione ai modelli multilivello, (Scuola di Dottorato della Facoltà di Scienze, Università di Milano-Bicocca) nel 2007 Conoscenze tecniche Software e programmazione Ottima capacità di programmazione in software statistici come R, S- Plus, Bugs e SPSS. Buona conoscenza e capacità di programmazione in SAS. Conoscenza di base di linguaggi object oriented (JAVA). Ottima conoscenza di Office e dei compilatori latex. Lingue Italiano: madrelingua Inglese: ottima conoscenza parlata e scritta Spagnolo: conoscenza di base Presentazioni Design of experiments for cdna microarray experiments, Meeting of the International Biometric Society (IBS), Regione Italiana, Marina di Massa, 7-9 Settembre A Bayesian approach to model the variability of gene expression data, Workshop on Statistical for Functional Genomics, Ascona (CH), 27 Giugno - 1 Luglio Investigating gene-specific variance via Bayesian hierarchical modelling, 19th Workshop on Statistical Modelling, Firenze, 4-8 Luglio Using a calibration experiment to assess gene specific information: Full Bayesian and Empirical Bayesian models for two channels microarray data, Seminar at the Institut National Agronomique Paris-Grignon, 15 Marzo 2005.

5 Measures of the integration of foreign migrants in Lombardia: some new experiences, BSPS Annual Conference, Canterbury, 13 Settembre (Poster) A test of the maximal intersection between lists of differentially expressed genes, Workshop on Data Fusion in Genomics, Imperial College, 7-9 Settembre A Bayesian Latent Class Analysis to assess the integration of immigrant people in Lombardia (Seminar), Departament d Economia, Universitat de Girona, Spagna, 11 Novembre Comparison of lists of differentially expressed genes, (Seminar), Dipartimento di Farmacologia, Università di Firenze, 6 Febbraio 2006 (Poster) Statistical tools for synthesizing lists of differentially expressed features in microarray experiments, LARS workshop, Leeds, UK, 4-6 July (Poster) A Bayesian measurement error model for combining different pre-processing methods in Affymetrix chips, Statistics for Biomolecular Data Integration and Modeling Workshop, Ascona, (CH) Giugno Pubblicazioni Statistica Applicata Bagnardi V., Blangiardo M., La Vecchia C., Corrao G. A metaanalysis of alcohol drinking and cancer risk British Journal of Cancer, 2001, 11(85), Bagnardi V., Blangiardo M., La Vecchia C., Corrao G. Alcohol consumption and the risk of cancer: a meta-analysis Alcohol Research, 2001, 25(4), Blangiardo M., Baio G. Bayesian latent class model to measure social integration of immigrants in Italy, 2007, Technical Report, Department of Epidemiology and Public Health, Imperial College, London, UK. Blangiardo M. Application of a latent class model to measure the integration of foreign migrants, accepted for publication in Statistica, Microarray Blangiardo M., Biggeri, A., Toti, S., Lagazio, C., Giusti, B. Investigating gene-specific variance via Bayesian hierarchical modelling, in Proceedings of the 19th Workshop on Statistical Modelling, Florence, 4-8 July 2004.

6 Altro Biggeri A., Blangiardo M. Pooling microarray data for assessing treatment/exposure effects: a Bayesian model, in Atti della XLII riunione scientifica S.I.S., Bari 9-11 Giugno 2004, Cleup, Padova, 2004, Luceri C., De Filippo C., Giovannelli L., Blangiardo M., Cavalieri D., Aglietti F., Pampaloni M., Andreuccetti D., Pieri L., Bambi F., Biggeri A., Dolara P. Effect of extremely low frequency electromagnetic fields (ELF-EMF) on DNA damage and gene expression of human lymphocytes and Saccharomyces cerevisiae, in Research in Radiations, 2005, 164, Blangiardo M., Toti S., Giusti B., Abbate R., Magi A., Poggi F., Rossi L., Torricelli F., Biggeri A. Using a calibration experiment to assess gene-specific information: Full Bayesian and Empirical Bayesian models for microarray data in Bioinformatics, 2006, 22, Blangiardo M., Richardson S. Statistical tools for synthesizing lists of differentially expressed features in microarray experiments in Genome Biology, 2007, R54, 8(4). Blangiardo M., Richardson S. A Bayesian calibration model to combine several pre-processing methods in Affymetrix chips submitted. L immigrazione straniera in Lombardia. La prima/seconda/terza/quarta/quinta indagine regionale (editor G.C. Blangiardo), Fondazione Ismu, Milano, 2002,2003,2004,2005,2006. Capitoli di libri Baio G., Blangiardo M. Introduction to Bayesian Modeling for Social Sciences in Best Practices in Quantitative Methods (editor J.W. Osborne), SAGE in press

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