Banche dati / motori di ricerca: che differenza c è?

2. Le banche dati e 3. I siti web Richiedono: strategie di ricerca particolari sufficiente conoscenza dell inglese scritto consapevolezza dell esistenza di fonti diverse, appropriate a quesiti di diverso genere e tipo capacità (almeno embrionale) di valutare criticamente il materiale reperito Banche dati / motori di ricerca: che differenza c è? BANCHE DATI MOTORI DI RICERCA I contenuti sono indicizzati da specialisti del settore e sono stati precedentemente sottoposti alla peer reviewing L informazione contenuta è organizzata e stabile Consentono la ricerca tramite molteplici campi Permettono la ricerca tramite voci di soggetto Consentono di visualizzare la cronologia delle ricerche effettuate, di combinare le ricerche tra loro, di salvare le ricerche, di impostare degli avvisi sulle novità concernenti le ricerche effettuate E possibile raffinare la ricerca tramite filtri e limiti dettagliati e peculiari I contenuti non devono adeguarsi ad alcuno standard qualitativo L informazione non è né organizzata né stabile Gli esiti recuperati sono il prodotto di crawlers automatici, non di ricerche condotte in modo ponderato Non consentono le ricerche tramite voci di soggetto Hanno poche possibilità di applicare limiti e/o filtri Sono semplici da utilizzare 1

Devo leggere tutto? Come orientarsi nella giungla Gli articoli scientifici differiscono profondamente tra loro: per la qualità metodologica dello studio stesso per la tipologia di disegno clinico alla base della loro stesura La qualità metodologica... 2

da non dimenticare Greenhalgh T. How to read a paper. Getting your bearings (deciding what the paper is about). BMJ. 1997 Lug 26;315(7102):243-246. Le tipologie di disegno clinico: La suddivisione della letteratura Letteratura secondaria > ha come oggetto altra letteratura Letteratura primaria > ha come oggetto pazienti o gruppi di pazienti Linee guida Revisioni sistematiche Metanalisi Studi osservazionali (studi di casi/serie di casi, studi di coorte, studi caso-controllo ) Studi di trattamento (studi randomizzati e controllati in cieco, doppio cieco etc.-, trial non randomizzati) 3

La piramide delle pubblicazioni Meta analisi Revisioni sistematiche Trial randomizzati controllati Studi di coorte Studi di casi/serie di casi Metodologia più rigorosa Minore bias Maggiori controlli e confronti Gli studi in cima alla piramide sono supportati da maggiore forza e peso a livello di prove scientifiche. Sono tutti esempi di Gli studi di questo tipo sono contraddistinti da una ricerca rigorosa della letteratura disponibile, dall essere quindi una combinazione di studi sulla medesima tipologia di intervento sanitario e sulla stessa categoria di pazienti. La conseguente maggiore numerosità dei campioni esaminati garantisce un maggior numero di prove. La per quanto fornita da fonti autorevoli non garantisce prove inconfutabili 4

Devo quindi trovare una risposta ad un preciso quesito clinico approccio molto più focalizzato, che implica la necessità di conoscere le risorse disponibili e sapere come utilizzarle: Banche dati ad accesso libero e/o pagamento Siti ad accesso libero e/o pagamento Per entrambe le tipologie di risorse devo prima... formulare un quesito in termini chiari In ogni quesito, è necessario individuare le parole chiave necessarie per svolgere la ricerca. Il modello utilizzato per individuare le parole chiave deve essere: Centrato sul paziente e sul problema identificato Costruito in modo tale da garantire una ricerca ben strutturata, mirata ad ottenere risposte precise e coerenti con il quesito di partenza 5

Prima di partire...decido la strada (= formulo il problema) Il MODELLO PICO : i 4 elementi di un quesito ben formulato Population : come definiresti il tuo paziente? Quali caratteristiche ha? Età, genere, gruppo etnico, stadio della malattia, potenziale esposizione a fattori nocivi (lavoro, abitazione, attività abituali...?) Intervention : Quale intervento fondamentale stai per prendere in considerazione? Prescrizione di un farmaco? di un test diagnostico? di un intervento chirurgico? Comparison : Quali sono le alternative principali all intervento preso in esame? Outcome : Che cosa vuoi ottenere, misurare, migliorare o modificare? In casi specifici, è bene coinvolgere il paziente nelle scelte e quindi nella definizione dell outcome: a quali risutati volete giungere? Quesito: Angela è una donna in buona salute di 50 anni con artrosi precoce alle ginocchia, anche e piedi. Ha assunto ibuprofene con un certo sollievo, ma è riluttante a seguire questa terapia a lungo termine. Ti chiede di provare l'agopuntura per ridurre il dolore provocato dalla sua artrite, qual è la tua raccomandazione? Elementi del PICO PICO in pratica Traduzione del PICO in inglese Popolazione: come definiresti il tuo paziente? Quali caratteristiche ha? Età, genere, gruppo etnico, stadio della malattia, potenziale esposizione a fattori nocivi (lavoro, abitazione, attività abituali...?) Angela è una donna in buona salute di 50 anni con artrosi precoce alle ginocchia, anche e piedi. healthy 50 year old woman with early osteoarthritis in her knees, hips, and feet Intervention: Quale intervento fondamentale stai per prendere in considerazione? Prescrizione di un farmaco? di un test diagnostico? di un intervento chirurgico? Ha assunto ibuprofene con un certo sollievo, ma è riluttante a seguire questa terapia a lungo termine. She has been taking ibuprofen Comparison : Quali sono le alternative principali all intervento preso in esame? Outcome: Che cosa vuoi ottenere, misurare, migliorare o modificare? In casi specifici, è bene coinvolgere il paziente nelle scelte e quindi nella definizione dell outcome: a quali risultati volete giungere? Ti chiede di provare l'agopuntura per ridurre il dolore provocato dalla sua artrite, trying acupuncture To reduce the pain caused by her osteoarthritis 6

I pezzi del puzzle gli operatori booleani Le parole individuate verranno combinate tra loro per formare la stringa di ricerca tramite... le parentesi GLI OPERATORI BOOLEANI AND produrrà risultati che includeranno TUTTE le parole ricercate OR produrrà risultati che includeranno almeno UNA delle parole ricercate NOT esclude il reperimento di uno o più termini di ricerca. 7

Gli operatori nascosti di Google LE PARENTESI osteoarthritis AND (ibuprofen ORacupuncture) AND pain stringa di ricerca Le parentesi sono indispensabili per modulare l ordine in cui i termini di ricerca sono analizzati dal sistema : quelli tra parentesi sono analizzati per primi Senza le parentesi: il primo operatore booleano a sinistra viene processato per primo AND viene processato prima di OR Una ricerca con "influenza AND vaccine OR vaccination" avrà come esito articoli che hanno sia il termine "influenza" che il termine "vaccine", ma fornirà anche tutti gli articoli su "vaccination" Per cambiare il risultato si possono utilizzare le parentesi in questo modo: "influenza AND (vaccine OR vaccination)" 8

Come interrogare una banca dati I singoli concetti possono essere utilizzati o come parole libere oppure riconducendole a un termine di tesauro. La nostra ricerca può, ad esempio, essere ricondotta a questa stringa di ricerca (effettuata con soli termini MeSH): "Osteoarthritis"[Mesh] AND ("Ibuprofen"[Mesh] OR "Acupuncture Therapy"[Mesh]) AND "Pain Management"[Mesh] Oppure, si può elaborare una stringa di ricerca «mista», realizzata cioè con parole libere e termini MeSH: "Osteoarthritis"[Mesh] AND ("Ibuprofen"[Mesh] OR "Acupuncture Therapy"[Mesh]) AND pain 9

ALTRI «TRUCCHI DEL MESTIERE» Le (virgolette) Permettono di ricercare due o più termini nell ordine preciso con il quale vengono scritte ES: Air Pollution Il motore cercherà nei vari campi testuali esattamente le due parole AND e nel preciso ordine in cui sono state scritte. Se non fossero presenti le virgolette l ordine non sarebbe considerato, sarebbe calcolata la sola presenza delle 2 parole nel testo. L asterisco* Permette di ricercare all interno dei campi tutte le parole con una stessa radice. ES. Pollut* Il motore cercherà nei vari campi testuali tutte quelle parole che cominciano con pollut come pollution, pollutions, pollutant, polluttants, La struttura di un articolo La maggior parte degli articoli scientifici seguono il formato IMRAD: Introduction = perché gli autori hanno deciso di affrontare quel particolare quesito di ricerca Methods = Come è stata svolta la ricerca e in che modo hanno analizzato i risultati Results = Cosa è stato provato/scoperto (Author s) Discussion = Cosa gli autori pensano possano significare i risultati ottenuti Di queste parti, quella da considerare con maggior attenzione al momento della valutazione di un articolo è la sezione Methods 10

Nell ambito delle scienze biomediche la principale banca dati è Pubmed Parte dal 1948/50 Prodotto dalla National Library of Medicine Indicizza solo articoli di riviste (80% del contenuto in lingua inglese) Settori: Medicine, Biology,Environmental science, Marine biology, Plant and animal science, Biophysics, Chemistry, Nursing, Dentistry, Veterinary medicine, Allied health, Preclinical sciences Tesauro:MESH (Medical Subject Headings della NLM) GRATUITO da www.pubmed.gov ma: per PC Unito collegarsi dai siti delle Biblioteche Unito oppure da casa tramite proxy: http://proxy-medicina.unito.it inserendo le proprie credenziali di posta Unito Questo per avere i vantaggi di: 11

RISORSE A PAGAMENTO ACCESSO DA CASA Mi dice se è disponibile il full text elettronico Nel caso in cui non sia disponibile, mi collega al catalogo Unito per verificare il posseduto del cartaceo da parte di qualche biblioteca Unito 12

Pubmed Ricerca avanzata tutorial e FAQ strumenti risorse utili La ricerca avanzata di Pubmed avviene tramite il PubMed Advanced Search Builder. Dal menu a tendina si sceglie un campo specifico da associare al termine (Author, MeSH terms ecc.). Con il link Show index list vengono visualizzati e suggeriti i termini corrispondenti nell indice di PubMed (Index List) e il numero di record associati ad ognuno di questi. E possibile scegliere più termini in campi diversi, associandoli con gli operatori booleani opportuni. Per la ricerca tramite i termini MeSH, meglio utilizzare il MeSH Database. 13

inserendo le parole della ricerca, Pubmed procede con la funzione di completamento automatico, suggerendo i termini Sulla sinistra della schermata trovo gli esiti della ricerca: Posso ottenere diverse visualizzazioni del formato della citazione all interno della pagina selezionando gli articoli posso: mandare le citazioni in un file, mandarle in una collection virtuale all interno di MY NCBI, mandarle nel clipboard =parcheggio temporaneo (max 8 ore) di citazioni inviarle via mail importarle in un gestore di bibliografia 14

Sulla destra della schermata trovo*: La possibilità di visionare la distribuzione delle pubblicazioni nel tempo, utilizzando le frecce per selezionare i risultati (strumento disponibile solo con 10.000 o più citazioni) La possibilità di visionare un minimo di 4 immagini pertinenti alla ricerca effettuata (alle seguenti condizioni: in presenza di un minimo 250 citazioni, filtri non impostati, ricerca effettuata senza l aiuto degli operatori booleani) La possibilità di ripetere la ricerca all interno di altre banche dati NCBI La possibilità di capire come il sistema ha interpretato la mia ricerca La possibilità di visualizzare le ultime ricerche effettuate Sulla sinistra della schermata trovo: La possibilità di scegliere tra i limiti/filtri proposti oppure, cliccando su Choose additional filters, di aggiungerne altri da selezionare Tramite Clear all posso eliminare tutti i limiti/filtri impostati precedentemente (o deseleziono quelli già scelti) 15

Come Pubmed ha interpretato la ricerca tramite parole libere - di patient satisfaction : "patient satisfaction"[mesh Terms] OR ("patient"[all Fields] AND "satisfaction"[all Fields]) OR "patient satisfaction"[all Fields] Accesso all eventuale testo pieno elettronico o all indicazione su dove trovare la copia cartacea Questa citazione era stata selezionata per l invio in clipboard, resta segnalato anche nel corso di ulteriori ricerche 16

In Advanced Search trovo: la search history cliccando sui numero di esiti di ogni ricerca, ritorno all elenco complessivo cliccando sul numero progressivo di ogni ricerca, posso: combinare le ricerche con gli operatori, cancellarle, rilanciarle, vedere come il sistema ha interpretato la ricerca, salvarla in MY NCBI ESERCITAZIONE : La ricerca per parole libere Provare ad inserire i seguenti gruppi di parole dalla schermata iniziale di Pubmed: Depression in medical students Community gardens nutrition il tutto in 10 17