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1 UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI BARI Nota: per le modalità concorsuali si prega cortesemente di fare sempre riferimento al Bando di Concorso A. A Parte A Informazioni generali Proposta d istituzione di Master universitario dal titolo Master Interuniversitario di Bioinformatica Livello Primo X Secondo Durata X Annuale Biennale Rinnovo* Nuova Proposta x * (art. 5 comma 5) Facoltà proponente Scienze MM.FF.NN. - Università di Bari Dipartimenti o Centri Interdipartimentali interessati (art.5, comma 1) (Allegare Delibere) Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare

2 Sede/Sedi di svolgimento delle attività (art.5, comma 2 m) Università del Sannio, Facoltà di Scienze MM.FF.NN.,Università di Bari, Facoltà di Scienze MM.FF.NN., Università di Napoli Federico II, Facoltà di Biotecnologie Eventuali Università consociate (art.6, comma 1) Università del Sannio Università di Napoli Federico II Eventuali Enti e soggetti pubblici e/o privati Sezione di Bioinformatica e Genomica - ITB, CNR Bari, IBM Italia Sede di Bari Struttura/e cui è affidata la gestione amministrativa e finanziaria(art. 8, comma 1) Università del Sannio, Facoltà di Scienze MM.FF.NN. Elenco Professori e Ricercatori proponenti. Docenti Universitari Proponenti-Garanti 1 Cognome Saccone Nome Cecilia Settore disciplinare BIO11 Qualifica Prof. Ordinario Facoltà Scienze MM.FF.NN. Dipartimento Biochimica e Biologia Molecolare Impegno didattico*: 3 CFU 2 Cognome Attimonelli Nome Marcella Settore disciplinare BIO11 Qualifica Prof. Associato Facoltà Scienze MM.FF.NN. Dipartimento Biochimica e Biologia Molecolare Impegno didattico*: 7 CFU 3 Cognome D'Erchia Nome Annamaria Settore disciplinare BIO11 Qualifica Ricercatore

3 Facoltà Scienze MM.FF.NN. Impegno didattico*: 5 CFU Dipartimento Biochimica e Biologia Molecolare 4 Cognome Malerba Nome Donato Settore disciplinare INF05 Qualifica Prof. Associato Facoltà Scienze Dipartimento Informatica MM.FF.NN. Impegno didattico*: 2 CFU 5 Cognome De Giorgi Nome Carla Settore disciplinare BIO11 Qualifica Prof. Associato Facoltà Scienze MM.FF.NN Dipartimento Biochimica e Biologia Molecolare Impegno didattico*: 3 CFU Docenti delle altre Università consorziate 1 Cognome Ceccarelli Nome Michele Settore disciplinare BIO11 Qualifica Professore Associato Università del Sannio Impegno didattico*: 7 CFU 2 Cognome Paolella Nome Giovanni Settore disciplinare BIO10 Qualifica Professore Ordinario Università di Napoli Federico II Impegno didattico*: 7 CFU 3 Cognome Colantuoni Nome Vittorio Settore disciplinare BIO11 Qualifica Professore Ordinario Università del Sannio Impegno didattico*: 3 CFU 4 Cognome Rampone Nome Salvatore Settore disciplinare ING-INF05 Qualifica Professore Associato Impegno didattico*: 7 CFU 5 Cognome Graziano Nome Giuseppe Settore disciplinare CHIM02 Qualifica Professore Associato Università del Sannio Impegno didattico*: 5 CFU Docenti non Universitari 1 Cognome Santamaria Nome Monica Qualifica Contrattista Impegno didattico*: tutor Allegato:Curriculum e contributi scientifici relativi agli obiettivi formativi propri del Master

4 2 Cognome Accetturo Nome Matteo Qualifica Contrattista Impegno didattico*: tutor Allegato:Curriculum e contributi scientifici relativi agli obiettivi formativi propri del Master Titolo/i di studio richiesto/i per l ammissione (art. 5, comma 2 j) Diploma di laurea specialistica o magistrale o diploma di laurea conseguito secondo il vecchio ordinamento nelle seguenti discipline tecnico-scientifiche: Biologia, Chimica, Farmacia, Medicina, Agraria, Veterinaria, Informatica, Fisica, Ingegneria e Matematica. Numero massimo di ammissibili (art. 5, comma 2 h) 20 Numero minimo (in caso di mancato raggiungimento del numero minimo, il corso non può essere attivato: art. 5, comma 2 h) 12 Modalità di ammissione (art. 5, comma 2 i) Saranno ammessi al master fra tutti i partecipanti alla selezione i primi 20 valutati secondo i seguenti criteri: 10 punti massimo per il voto di laurea, punteggio stabilito secondo la seguente formula [(voto di laurea-66)/44]*10 10 punti massimo per la valutazione del Curriculum 5 punti per il colloquio. A parità di merito saranno preferiti i laureati in discipline biologiche e informatiche e i più giovani. Criteri e procedure per l eventuale riconoscimento crediti pregressi (art. 4) Verifica del possesso di solide basi teoriche e metodologiche relative a matematica e fisica, e/o chimica e biologia. Per quanto riguarda i crediti pregressi, oltre il voto di laurea magistrale o specialistica, verranno anche valutate eventuali borse di studio precedentemente ottenute. Modalità di rilevamento e recupero di debiti formativi (art. 5, comma 2 j)

5 Sviluppo di curricula paralleli nel primo periodo del corso che consentiranno a tutti di recuperare i debiti formativi rilevati dalla documentazione presentata e dalla prova di esame di ammissione sostenuta. Obblighi e modalità di frequenza (art. 2, comma 3 e art. 5, comma 2 l) La frequenza alle lezioni frontali e di laboratorio sarà obbligatoria avendo lo studente l'obbligo di acquisire nell'arco di 1 anno 60 CFU. Saranno comunque ammessi coloro che abbiano seguito i 2/3 delle lezioni frontali e i 3/4 di laboratorio. Lo stage finale sarà obbligatorio come pure l'esame finale. Eventuali Borse di Studio (art. 5, comma 2 k e art.6, comma 2 b) Le tre Università consorziate si stanno attivando per reperire borse di studio da enti locali (Comuni e Regioni) e PMI. Stage (art. 2, comma 1 e art. 5, comma 2 g) Gli stage verranno svolti presso strutture formative sia interne alle Università consorziate che esterne ad esse. In itinere si definiranno le convenzioni per gli stage. Allegato riportiamo un elenco di strutture che hanno ospitato gli stagisti del master tenutosi presso l Università del Sannio nell A.A. 2003/04. Parte B - Motivazioni del master e valutazione della qualità. Domanda formativa espressa dal territorio (art. 5, comma 2 a)

6 La Bioinformatica è una disciplina di base che associata alla genomica e alla proteomica consente lo svolgimento di ricerche avanzate nel campo sanitario e agroalimentare. Da ciò deriva la implicita esigenza nel territorio di una copertura formativa in tale contesto. Il documento allegato Contributo al soddisfacimento dei fabbisogni espressi dalle istituzioni scientifiche e dal sistema economico meridionale risponde a tale punto in modo molteplice. Obiettivi formativi qualificanti, anche in relazione agli sbocchi professionali e alla spendibilità a livello internazionale (art. 5, comma 2 b) La creazione della figura professionale del Bioinformatico consentirà a giovani laureati nel settore bio-medico e tecnologico una maggiore apertura sul mercato del lavoro nazionale e internazionale. Sistemi di valutazione ed autovalutazione (art. 11) Attivazione sistema valutazione Somministrazione apposito questionario ai fruitori del Master Alla conclusione del Master, il Presidente provvede a far pervenire ai competenti Organi di Governo dell Università il consuntivo delle attività scientifiche e didattiche svolte, i risultati conseguiti e la relativa rendicontazione. Parte C - Prospetto generale delle attività formative.

7 Attività formative e relativi contenuti (Almeno 2 crediti (*) per insegnamento) (*) 25 ore corrispondono a 1 unità di misura del discente Settore Scientifico disciplinare CFU Ore Didattica Frontale Ore Didattica assistita / Laborato rio Ore Studio individ uale Ore Stage Livello 1 Allineamento competenze Laureati in Discipline Biologiche Laureati in Discipline Informatico-Matematiche Livello 2 I principi di base della Bioinformatica Livello 3 Argomenti avanzati ING-INF/ MAT/ BIO/ BIO/ BIO/ ING-INF/ BIO/ CHIM ING-INF/ BIO/ Tirocinio ING-INF/ e BIO11 Prova finale Presentazione tesina Totale crediti 60

8 Modalità di svolgimento delle verifiche periodiche/intermedie (art. 3, comma 3 e art. 5, comma 2 g). I CFU vengono acquisiti in seguito al superamento di prove di verifica dell'apprendimento previsti al termine di ciascuna delle tre sessioni relative ai 3 livelli. Modalità di svolgimento della/e prova/e finale/i (art.3, comma 4 e art.5, comma 2 g) Relazione di una trentina di pagine relativa al lavoro svolto nella fase di tirocinio Collaborazioni interne ed esterne (art. 5, comma 2n) Regolamento finanziario allegato. Attività formativa Strumento (incarico, supplenza, contratto) Docenza frontale Tutoraggio Docenza laboratorio Supplenza o contratto esterno Contratto esterno Contratto esterno o supplenza Indicazione delle aule, laboratori, strumentazioni : l attività didattica verrà svolta prevalentemente presso l Università del Sannio dove sono disponibili aule con 20 postazioni. I laboratori saranno esclusivamente in aule didattiche fornite di computers. Il Dipartimento di Biochimica possiede un laboratorio mobile costituito da 15 personal computer, una stampante e un rooter wireless che consentirà lo svolgimento dei laboratori. (Allegare delibera/e delle/a strutture/a coinvolte/a) (art. 5, comma 2 o) Aule Disponibilità di posti

9 UniSannio UniNapoli UniBA (Saletta corsi IBM Italia) Laboratori Disponibilità di postazioni Mobile 16 Strumentazioni Laboratorio mobile costituito da 16 PC, un rooter per la connessione wireless e una stampante.

10 Livello 1. allineamento delle competenze 8 CFU; Sede: Università del Sannio Laurati in Discipline Biologiche Insegnamento SSD CFU Informatica di Base ING-INF05 4 Elementi di Matematica e MAT05 4 Statistica Lauerati in Discipline Informatico-Matematiche Insegnamento SSD CFU Principi di Biochimica BIO10 3 Principi di Biologia cellulare e BIO11 3 molecolare Principi di Genetica BIO18 2 Livello 2. I principi di base della Bioinformatica 25 CFU Sede: Università del Sannio Insegnamento SSD CFU Programmazione in Bioinformatica: INF-ING05 5 Algoritmi E linguaggi di programmazione, Programmazione in Ambienti e Linguaggi dedicati Parte D Programma Didattico Algoritmi per la Bioinformatica: Allineamento di sequenze mediante programmazione dinamica, algoritmi euristici di allineamento, allineamenti multipli ING-INF05 5 Basi di Dati Biologiche: Modello BIO11 5 relazionale, SQL, XML. Banche dati di DNA e proteine, Banche dati specializzate, Integrazione di banche dati. Evoluzione molecolare: principi e metodi BIO11 5 Analisi di pattern, ricerca e predizione di geni: Metodologie e Applicazioni. BIO11 5 Livello 3. Argomenti avanzati 15 CFU Sede: Distribuita fra le tre sedi Insegnamento SSD CFU Analisi strutturale e predizione della BIO11, ING-INF05 4 struttura : Predizione basata sull'apprendimento, modelli ab initio, predizione per omologia Immagini biologiche : Metodologie per l elaborazione e analisi di immagini nella biologia molecolare ING-INF05 3

11 Analisi di Genomi :Annotazione di features, genomica comparata, classificazione funzionale di geni Genomica funzionale: studi di espressione genica, microarray BIO11 4 BIO11 4 Stage ed esame di master: 12 CFU o Stage presso enti e aziende operanti nell ambito della Bioinformatica (6 CFU) o Esame di Master (6 CFU)

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