Il software Epi Info

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1 Il software Epi Info Descrizione e analisi dei dati dello studio sulla compliance: Modulo Analizza i dati I tipi di variabili (aleatorie) (1) Variabile: fenomeno misurato Aleatorio: il risultato di questa misura è sottoposto al caso, non deterministico, non costante (es: dado) Quantitative: una variabile è detta quantitativa se ha un senso dire che un risultato è più grande di un altro e se è possibile fare la somma di 2 risultati (es: la numerazione dei globuli rossi, l età) Quantitative discrete: numero basso di risultati possibili (la misura manuale della tensione arteriosa diastolica varia tra 4 e 10 cm di mercurio, essendo la precisione delle misure approssimata +/- 0.5, si osserva generalmente una decina di valori) Quantitative continue: se non sono discrete (es: l altezza, la numerazione globulare) 1

2 I tipi di variabili (aleatorie) (2) Se una variabile non è quantitativa è qualitativa: Nominale/categorica: ha delle categorie independenti (es: istologia, sede del tumore). Binaria/dicotomica: se solo 2 risultati sono possibili (es: sesso) Ordinale: ha delle categorie ordinate (la proteinuria sulle strisce (0, +, ++, +++), uno score)! una variabile qualitativa puo esprimersi sotto forma numerica nella codifica (es: 1 e 2 per il sesso), senza che ci sia nessuna idea di ordine o di classifica!!! Lanciare il modulo di analisi Col tasto «Analizza i dati» dopo aver aperto Epi Info con l icona o Start tutti programmi Epi info Analysis Si aprono le finestre Analysis Risultati dell analisi Program editor-nuovo programma 2

3 Tutti i comandi disponibili sono nella finestra Analysis (anche il comando «Esci») Il primo comando da utilizzare è quello per aprire un progetto: Dati Apri (importa), «cambia progetto» se il progetto selezionato non è il vostro, e scegliere una maschera: appare il numero di soggetti inseriti finora Aprire un progetto Statistiche Lista (1) Appena si clicca su un comando, si apre una finestra di dialogo: per es, Statistiche Lista, scegliere Grid (Tabella) e esce la tabella di tutti dati inseriti Appare la tabella nella finestra «Risultati dell analisi» e il programma del comando in linguaggio Epi Info nella finestra «Program Editor» 3

4 Statistiche Lista (2) Ci sono 3 possibilità per visualizzare la lista dei dati: Web (HTML) Grid Allow updates (come Grid ma con la possibilità di cambiare i dati della tabella: non utilizzarlo perchè i controlli/checks non si effettuano! Passare per «Registra i dati» della prima pagina di Epi Info) L asterisco rappresenta tutte le variabili del database Si puo selezionare «Tutte (*) eccetto» e scegliere quelle che non interessano O ancora solo alcune (per deselezionare le variabili, cliccare sopra) UN ALTRO MODO DI VISUALIZZARE LA LISTA DEI CAMPI CREATI Variabili Mostra informazioni ci da la lista delle variabili col loro nome nel database Access, il loro tipo, il loro formato e la loro intestazione Ordinare le liste All inizio, le liste sono ordinate secondo l inserimento dei soggetti Seleziona/Condizioni/Ordina Ordina per ordinare secondo una variabile, doppio clic su questa variabile: scegliere tra Ascending (++) (crescente) Descending (decrescente) Per cancellare la variabile secondo la quale ordinare «Remove from Sort» Per visuallizzare il risultato rifare una lista dei dati 4

5 Distribuzione di una variabile qualitativa Es: sesso (binaria) Il comando «Frequenze» ci dà la ripartizione del sesso e delle altre variabili qualitative nel nostro database Abbiamo altre variabili qualitative nel database? Descrizione stato civile (1) 5

6 Creazione di variabili categoriche Anche se non avevamo nessuna variabile qualitativa (nominale/categorica o ordinale) possiamo generare un tipo di variabile a categorie da una variabile quantitativa, una variabile quantitativa in classe di valori (dopo aver scelto l ampiezza dalle classe): ETAC che definisce 3 classi di età 1 = età<61 2 = età = età>65 DEGENZAC che sono le categorie di durata di ricovero 0 = 0-1 giorno 1 = 2-5 giorni 2 = 5-10 giorni 3 = più di 10 giorni Creazione ETAC Variabili Definisci la variabile ETAC tipo numerico o testo e Ricodifica Eta in ETAC LOVALUE e HIVALUE sono dei comandi interni a Epi Info per identificare il valore minimo e il valore massimo. Se l info è mancante, anche ETAC è mancante 6

7 Descrizione ETA e ETAC La variabile quantitativa ETA si descrive grazie agli indicatori media, mediana, min-max, etc. Statistiche Medie Invece, la variabile ETAC si descrive grazie a Statistiche Frequenze come per le variabili qualitative Rappresentazioni grafiche (1) Statistiche Grafici Barre/poligone di frequenza: spazio tra le barre (variabili qualitative: sesso, istologia, etc., nessun ordinamento logico) Barre ruotate (barre col l ascissa a sinistra) Istogramma: barre contigue (dati continui, variabili ordinali, variabile in classe, es: età) Punti Torta Barre sovrapposte (inizia a 0 in ordinata) 7

8 Rappresentazioni grafiche (2) Variabili quantitative: istogramma Quantitative discrete: contare il numero di realizzazioni di ogni risultato Quantitative continue: raggruppare i risultati in classe, il numero di classe dipendente dalla taglia del campione studiato (es: età, peso). Infatti, come si fa con 1 o 2 persone per età a identificare una tendenza o struttura dei dati «a colpo d occhio» in una situazione simile? Rappresentazioni grafiche (3) Variabili qualitative: diagrammi a barre per visuallizzare la frequenza di realizzazione di ogni risultato barre separate per richiamare che la continguità dei risultati non ha lo stesso senso che in un istogramma pertanto sono anche molto utilizzati formaggi/torte Variabili ordinali: istogramma o diagramma a barre ma in senso ordinato 8

9 Tabelle crociate tra 2 variabili Per ottenere la ripartizione di una variabile in funzione di un altra: comando «Tabelle» Per es, la distribuzione delle modalità di dimmissione per tipo di ricovero: tabella 6x2, la distribuzione dei tipi di ricoveri per stato civile: tabella 2x2 Analizzare un sotto-gruppo Per selezionare una parte dei soggetti, comando Seleziona/Condizioni/Ordina Seleziona Si ritorna a tutti soggetti con «Annulla selezione» Quando si effettua una nuova! selezione pensare a cancellare la selezione precedente altrimenti la nuova selezione sarà un sottogruppo della precedente Se si utilizza il segno (diverso da) cioè «<>» nel linguaggio Epi Info, i valori mancanti non sono selezionati 9

10 Gestire i dati mancanti (1) I dati possono essere mancanti per 2 motivi: Puo capitare che i soggetti che hanno risposto ad un questionario non hanno risposto a tutte le domande per vari motivi (nell esempio di una raccolta dati su archivi informatici di un reparto alcuni dati possono mancare: sede del tumore, istologia, etc.) Le domande sono senza oggetto per alcuni soggetti e risultano mancanti (o vuote) per un sistema di gestione dei dati ed è normale Gestire i dati mancanti (2) Opzioni Configurazione parametri permette di includere o no i dati mancanti nei calcoli con il campo «Includi valori mancanti» 10

11 Descrizione stato civile (2) Gestire i dati mancanti (3) Analisi di una variabile qualitativa con o senza includere i dati mancanti Analisi di una variabile quantitativa con o senza includere i dati mancanti 11

12 Altre opzioni d analisi Opzioni Configurazione parametri Statistiche: attiva o disattiva la produzione dei test statistici Elaborazione record Non cancellati: tutti i soggetti non cancellati sono inclusi nell analisi Elaborazione record Cancellati: solo i soggetti cancellati sono inclusi nell analisi Elaborazione record Entrambi: tutti i soggetti cancellati o no sono inclusi Salvare i risultati dell analisi (1) In Parametri Scelta della cartella di lavoro si definisce la cartella dove saranno registrati i risultati dell analisi 12

13 Salvare i risultati dell analisi (2) Sono salvati in un documento in formato HTML, leggibili dai navigatori Internet con un nome del tipo «Out + numero» Per attribuire un nome diverso al documento, Risultati Invia i risultati ad un file cliccando su «Replace any existing file» Ad ogni comando si crea un file di risultati Si puo dare un nome alla pagina dei risultati: Risultati Titolo Con Risultati Chiudi invio si ferma il registro dei risultati Si consiglia di cancellare regolarmente i file di risultati che non servono Salvare i comandi di un analisi «Salva» nella finestra Program Editor, si apre la finestra «Salva programma» dove si puo cambiare la cartella con «cambia progetto» Ogni volta che si deve continuare l analisi, «Apri» e cercare il file E consigliato scrivere più programmi piccoli piuttosto che uno grande perchè il software si perde 13

14 Salvare le variabili nuove Salva Esporta, selezionare «All» e «Replace», in Nome file inserire il nome del progetto o andare a cercarlo con il browser, in Data table dare un nome alla nuova tabella Access che conterra le nuove variabili! Attenti a non dare lo stesso nome della maschera perchè altrimenti la cancella Si consiglia si salvare soprattutto il programma di definizione delle nuove variabili Esportare i dati verso un altro software Sempre Salva Esporta ma invece del formato Epi 2000 scegliere Excel 4.0 o Text, «All» se volete esportare tutte le variabili, sempre «Replace» e in File Name introdurre un nome per questo nuovo file Excel I valori mancanti saranno caselle vuote in Excel Sempre verificare che il file Excel ha lo stesso numero di linee e colonne che il file Epi Info, puo capitare un problema di conversione (con i caratteri speciali soprattutto) 14

15 Analisi di un database ACCESS creato fuori Epi Info La creazione retrospettiva di una maschera non è possibile ma l analisi si Apri Importa: cercare il progetto ACCESS da analizzare usando la riga «Origine dati». Scegliere il formato dei dati tra Access 2000 e Access 97. Cliccare Mostra Tutto, appaiono tutte le tabelle del file. Cliccare sulla tabella da aprire Non riuscira ad aprire le tabelle con un nome con spazio!!!! Ci chiede «Creazione di un collegamento temporaneo nel progetto attuale» e un nome per il link con Epi Info Sempre verificare che l importazione sia stata effettuata corretamente (Variabili Mostra informazioni o Statistiche Lista) Analisi di un database EXCEL creato fuori Epi Info Sempre Apri Importa, «formato dei dati» Excel 8.0, tramite la riga «Origine dati» cercare il file Excel che si vuole analizzare. Cliccare sul foglio che si vuole analizzare Cliccare su «First rows contain fields name» se la prima linea su Excel contiene il nome delle variabili Verificare l importazione Se tutto Ok, si puo iniziare ad analizzare i dati 15