Segment CMR Istruzioni per l uso - Italiano

Segment CMR Istruzioni per l uso - Italiano 13 luglio 2015 Software platform v2.0 R4531

MEDVISO AB http://www.medviso.com Griffelvägen 3 SE-224 67 Lund Sweden Tel: +46-76-183 6442 ii

Indice 1 Termini e condizioni 1 1.1 Conformità normativa...................... 1 1.2 Condizioni per l uso....................... 1 1.3 Indications for use........................ 1 2 Convenzioni e Abbreviazioni 3 2.1 Convenzioni tipografiche..................... 3 2.2 Marchi registrati......................... 3 2.3 Abbreviazioni.......................... 3 3 Guida introduttiva 5 3.1 Requisiti di sistema....................... 5 3.2 Installazione........................... 5 3.2.1 Installare Matlab Compiler Runtime......... 5 3.2.2 Installare Segment CMR................ 7 3.3 Avviare Segment CMR..................... 7 3.4 Disinstallazione.......................... 7 3.5 Panoramica software....................... 7 3.6 Primo avvio di Segment CMR................. 9 3.6.1 Impostare preferenze.................. 9 3.6.2 Impostazioni posizioni della finestra.......... 9 3.6.3 Database pazienti.................... 9 3.6.4 Connessione PACS................... 9 4 Caricare e salvare i Dati - Passo passo 11 4.1 Caricare i dati.......................... 11 4.1.1 Caricare i dati dal database.............. 11 4.1.2 Caricare i dati dal PACS................ 12 iii

INDICE 4.1.3 Caricare i dati dal disco di rete............ 13 4.2 Salvare i dati........................... 13 5 Strumenti di visualizzazione immagine 15 5.1 Opzioni di visualizzazione.................... 15 5.2 Ritagliare stacking dell immagine................ 15 5.3 Zoomare............................. 15 5.4 Regolare il contrasto....................... 15 5.5 Misurare una distanza...................... 16 6 Impostazioni immagini 17 6.1 Imposta manualmente descrizione Immagine.......... 17 6.2 Descrizione dell immagine al momento del caricamento.... 17 6.3 Dettagli pazienti......................... 17 7 Segmentazione LV - Passo passo 19 7.1 Segmentazione automatica LV [1]................ 19 7.2 Segmentazione LV manuale................... 20 7.3 Cancellare segmentazione LV.................. 20 7.4 Copiare la segmentazione LV.................. 21 7.5 Validazione di segmentazione LV................ 21 8 Segmentazione RV - Passo passo 23 8.1 Analisi automatica RV [1].................... 23 8.2 Segmentazione RV manuale................... 23 8.3 Cancellare segmentazione RV.................. 23 8.4 Validazione di segmentazione RV................ 23 9 Analisi ROI - Passo passo 25 9.1 Analisi ROI manuale....................... 25 9.2 Cancellare segmentazione ROI................. 25 10 Analisi di flusso - Passo passo 27 10.1 Analisi automatica di flusso [1]................. 27 10.2 Analisi Qp/Qs [2]........................ 28 10.3 Analisi derivazione e valvola [3]................. 28 10.4 Cancellare segmentazione di flusso............... 29 10.5 Compensazione di correnti parassite.............. 29 10.6 Unwrapping di fase....................... 30 iv

INDICE 10.7 Analisi velocita onda di polso [4]................ 31 10.8 Validazione di analisi di flusso................. 32 11 Analisi bullseye - Passo passo 35 12 Generazione report - Passo passo 37 13 Analisi T2* - Passo passo 39 13.1 Analisi automatica T2* [1]................... 39 13.2 Validazione di analisi T2*.................... 40 14 Analisi sollecitazione - Passo passo 41 14.1 Analisi sollecitazione in immagini codificate in velocità.... 41 14.1.1 Analisi automatica sollecitazione [1].......... 41 14.1.2 Cancellare dati di sollecitazione............ 42 14.1.3 Validazione di analisi sollecitazione.......... 42 15 Analisi Scar - Passo passo 43 15.1 Analisi automatica scar [1]................... 43 15.2 Analisi Grayzone......................... 44 15.3 Cancellare segmentazione scar................. 44 15.4 Validazione di analisi scar.................... 44 16 Analisi Miocardo a Rischio (MaR) - Passo passo 45 16.1 Analisi automatica MaR [1]................... 45 16.2 Cancellare segmentazione MaR................. 46 16.3 Validazione di analisi MaR................... 46 17 Analisi Perfusione - Passo passo 47 17.1 Analisi automatica perfusione [1]................ 47 17.2 Validazione di analisi perfusione................ 49 18 Analisi ECV - Passo passo 51 18.1 Analisi automatica ECV..................... 51 v

1 Termini e condizioni Questo manuale contiene le Istruzioni per l uso per un utilizzo sicuro di Segment CMR. 1.1 Conformità normativa Segment CMR ha il marchio di conformità CE ed è certificato secondo lo standard ISO 13485. Segment CMR è sviluppato quasi interamente sulla base di Segment approvato da FDA con decreto FDA 510(k) numero K090833. Alcune caratteristiche non sono incluse nell approvazione FDA. Queste funzioni sono segnalate nelle Istruzioni per l uso e nel Manuale di riferimento, e sono solo a scopo sperimentale. Segment CMR è in attesa di approvazione da parte di FDA. Gli utenti sono tenuti a conoscere le norme di conformità in vigore nel paese di riferimento prima di utilizzare Segment CMR. È responsabilità degli utenti rispettare le norme e i regolamenti del paese di riferimento. 1.2 Condizioni per l uso Il software può essere utilizzato solo da specialisti di MRI Cardiaca. Il software è uno strumento di analisi di dati clinici importanti. Il medico specialista è il solo responsabile dell interpretazione dei dati e l unico in grado di prendere le decisioni necessarie per la cura del paziente. Il software è utilizzato per leggere le immagini di apparecchi per risonanza a marchio Philips, Siemens e General Electric. Le immagini sono fornite su CD, tramite lo standard DICOM per trasferire i file direttamente dall apparecchio per risonanza, o infine con sistemi PACS. 1.3 Indications for use Segment CMR is a software that display and analyzes DICOM-compliant cardiovascular images acquired from magnetic resonance (MR) scanners. Segment CMR is designed for review, quantification and reporting of cardio- 1

CAPITOLO 1. TERMINI E CONDIZIONI vascular structures using multi-slice, multi-frame and velocity encoded MR images. Segment CMR provides validated and reproducible data for supporting the evaluation of cardiac function. The ventricular analysis is provided for usage in both pediatric (from newborn) and adult population. Images and associated data analysis can be stored, communicated, rendered, and displayed within the system and across PACS system. The data produced by Segment CMR is intended to be used to support qualified cardiologist, radiologist or other licensed professional healthcare practitioners for clinical decision making. It is a support tool that provides relevant clinical data as a resource to the clinician and is not intended to be a source of medical advice or to determine or recommend a course of action or treatment for a patient. 2

2 Convenzioni e Abbreviazioni Questo capitolo descrive le convenzioni tipografiche presenti in questo manuale e nel programma. 2.1 Convenzioni tipografiche A Tasto A della tastiera. Ctrl-A Tasto CTRL. Tenere premuto contemporaneamente Ctrl e A. Icona nella barra degli strumenti. *.mat Estensione file. C:/Program Cartella. File Menu, ad es. menu File. File Save As Sottomenu, ad es. nel menu File si trova la voce Save As. Close Tasto Comando/Attiva-Disattiva nell interfaccia grafica utente. Endocardium Pulsante di opzione nell interfaccia grafica Single frame Casella di controllo nell interfaccia grafica. 2.2 Marchi registrati Qui sotto una lista dei marchi registrati presenti in questo manuale. Segment CMR è un marchio registrato di Medviso AB. Segment DICOM Server è un marchio registrato di Medviso AB. Sectra PACS è un marchio registrato di Sectra Imtec AB, (http://www.sectra.se). Matlab è un marchio registrato di Mathworks Inc, (http://www.mathworks.com)). 2.3 Abbreviazioni CMR Risonanza Magnetica Cardiaca LV Ventricolo Sinistro MaR Miocardio a Rischio PWV Velocita onda di polso RV Ventricolo Destro 3

3 Guida introduttiva 3.1 Requisiti di sistema Sistema operativo: Windows 2000, Windows XP (32 bit e 64 bit), Windows Vista (32 bit), Windows 7 (32 bit e 64 bit), Windows 8. Computer con 4 Giga di memoria o superiori. Hard disk con almeno 500 MB di spazio disponibile. La scheda video supporta DirectX e OpenGL. 3.2 Installazione Prima installazione: installare Matlab Compiler Runtime (Sezione 3.2.1), quindi installare Segment CMR (Sezione 3.2.2). Aggiornamenti: installare solo Segment CMR (Sezione 3.2.2). Sono necessari i privilegi di amministratore per eseguire l installazione. 3.2.1 Installare Matlab Compiler Runtime 1. Scaricare il file MCR file e aprirlo con doppio click. Il file è scaricabile dalla homepage di Medviso AB. (http://medviso.com/download2/). 2. Seguire le istruzioni nelle Figure 1-4. Figura 1: Cliccare Run. 5

CAPITOLO 3. GUIDA INTRODUTTIVA Figura 2: Cliccare OK. Figura 3: Cliccare Install. Figura 4: Cliccare Next. 6

3.3. AVVIARE SEGMENT CMR 3. Riavviare il computer. 3.2.2 Installare Segment CMR 1. L ultima versione di Segment CMR è scaricabile dalla homepage di Medviso AB (http://medviso.com/download2/). Scaricare il file ( il cui nome è pressappoco install Segment CMR 2px Ryyyy.exe), cliccare col tasto destro e seguire le istruzioni. Per scaricare il file è necessario essere in possesso della password ricevuta al momento dell acquisto. Se la password dovesse essere stata smarrita, contattare sales@medviso.com. 2. Copiare il file di licenza nella cartella di installazione di Segment CMR. Ìl file di licenza è nominato vostronome.key o licenza.key. Se non si ha il file di licenza, contattare support@medviso.com. 3.3 Avviare Segment CMR Per avviare il programma fare doppio click sul file C:/Program Files/Segment CMR/Segment CMR.exe, o sul suo collegamento. All avvio del programma dovrebbe essere visualizzata l immagine mostrata nella Figura 5. Se non si visualizza l immagine, il software non è correttamente installato. 3.4 Disinstallazione Per disinstallare Segment CMR, eliminare tutti i file nella cartella C:/Program/Segment CMR o nella cartellac:/program Files/Segment CMR. Le preferenze utente sono salvate in Application Data e nella sottocartella Segment CMR sotto l account di ciascun utente. Per disinstallare Matlab Compiler Runtime, utilizzare la funzione Install or Remove Programs nel pannello di controllo di Windows. 3.5 Panoramica software La panoramica di Segment CMR è mostrata nella Figura 6. In questo documento saranno utilizzate come riferimento le lettere (a-o). Per maggiori informazioni sull utilizzo di questo strumento, puntare il mouse sull icona del software per aprire la guida. 7

CAPITOLO 3. GUIDA INTRODUTTIVA Figura 5: Finestra di avvio per Segment CMR. Figura 6: Interfaccia utente grafica principale. In questo documento saranno utilizzate come riferimento le lettere (a-o). 8

3.6. PRIMO AVVIO DI SEGMENT CMR 3.6 Primo avvio di Segment CMR Al primo avvio di Segment CMR attendere che termini il processo di installazione. Per completare l installazione, impostare le preferenze e le posizioni della finestra come descritto nelle Sezioni 3.6.1 e 3.6.2. 3.6.1 Impostare preferenze Si consiglia di scegliere una cartella specifica dove salvare o caricare i file. Richiamare la cartella dal menu Preferences (a). Impostare le cartelle Data, Export e CD. 3.6.2 Impostazioni posizioni della finestra Si può impostare la posizione della finestra principale di Segment CMR trascinando la finestra nella posizione e nella dimensione desiderate. La posizioni e le dimensioni vengono salvate e mantenute anche ai successivi avvii di Segment CMR. Se si passa alla visualizzazione su un altro monitor, le impostazioni di visualizzazione di Segment CMR potrebbero essere perse. Premere Shift-Ctrl-R per resettare le posizioni dell interfaccia grafica. Questa funzione è disponibile anche nel menu File (a). 3.6.3 Database pazienti Iniziare utilizzando il nostro esempio di database pazienti. Scaricare il file Patientdatabase.zip dalla homepage di Medviso AB (http://medviso.com/download2/). Il file è piuttosto grande (1,4 GB). Decomprimere il file e salvare il contenuto in una cartella. Salvare nella sottocartella dove è installato Segment CMR. Impostare il percorso del database pazienti in Segment CMR. Cliccare Preferences e Advanced System and DICOM Settings. Appare la nuova interfaccia grafica utente; cliccare Database Folder, selezionare la cartella dove è stato salvato il file patientdatabase.mat. 3.6.4 Connessione PACS Per impostare la connessione PACS e il Segment Server di solito è necessario chiedere l aiuto dello staff di supporto PACS della zona di riferimento. Vi verrà chiesta la disponibilità ad una telefonata/videochiamata web per facilitare il procedimento. Il Database, il manuale istruzioni per la connessione PACS e il manuale del plugin Sectra PACS sono visualizzabili sulla homepage di Medviso AB 9

CAPITOLO 3. GUIDA INTRODUTTIVA (http://medviso.com/products/cmr/resources/). Il plugin di Sectra PACS può richiedere dei componenti aggiuntivi di Microsoft Visual C++ scaricabili dalla homepage di Medviso AB (http://medviso.com/download2/). 10

4 Caricare e salvare i Dati - Passo passo 4.1 Caricare i dati Per caricare i dati del paziente dal database, seguire la Sezione 4.1.1. Per caricare i dati del paziente dal PACS, seguire la Sezione 4.1.2. Per caricare i dati del paziente dal disco di rete, seguire la Sezione 4.1.3. 4.1.1 Caricare i dati dal database 1. Cliccare lo strumento (a), Figura 7 è visualizzato. Figura 7: Selezione grafica paziente. 2. Selezionare paziente. 3. I dati dei pazienti possono essere salvati in due formati: DICOM o formato Segment CMR. Per immagini in formato DICOM, cliccare Select & Load, viene mostrata la Figura 8. Per immagini in formato Segment CMR cliccare Load all. 11

CAPITOLO 4. CARICARE E SALVARE I DATI - PASSO PASSO 4. Selezionare la serie immagini da caricare nella Figura 8. Figura 8: Selezione grafica serie di immagini. 5. Cliccare Load. 4.1.2 Caricare i dati dal PACS 1. Selezionare Import from PACS nel menu File, Figura 9 è visualizzato. Figura 9: Interfaccia per importare pile di immagini da PACS. 12

4.2. SALVARE I DATI 2. Inserisci il paziente o studiare le informazioni e la conduzione di ricerca. 3. Selezionare studio e la serie per caricare. 4. Caricare lo studio in Segment CMR per selezionare Open files. 4.1.3 Caricare i dati dal disco di rete 1. Selezionare Open from Disc in the File menu, Figura 10 è visualizzato. Figura 10: Selezione caricamento stacking dell immagine. 2. Selezionare stacking dell immagine da caricare. 3. Per i file DICOM, selezionare le dimensioni delle colture per la pila di immagini e ritagliare l immagine. 4. Cliccare Load Selected File(s) or Folder(s). 4.2 Salvare i dati 1. Per salvare le immagini includendo il delineamento su Database Pazienti cliccare lo strumento (b). 2. Per salvare le immagini includendo il delineamento su disco di rete, selezionare Save As... nel menu File (a). 13

CAPITOLO 4. CARICARE E SALVARE I DATI - PASSO PASSO 3. Per salvare le immagini includendo il delineamento su PACS cliccare lo strumento (b). 14

5 Strumenti di visualizzazione immagine 5.1 Opzioni di visualizzazione Scegliere opzione di visualizzazione pannello tramite,,,,,, (c). Per visualizzare un video degli stacking dell immagine utilizzare gli strumenti, (d). 5.2 Ritagliare stacking dell immagine 1. Cliccare Misc modalità (h). 2. Selezionare lo strumento (i). 3. Ritagliare uno stacking dell immagine selezionando un area all interno dello stacking dell immagine. 5.3 Zoomare 1. Selezionare stacking dell immagine. 2. Utilizzare gli strumenti e (e) per zoomare avanti e indietro nello stacking dell immagine. 5.4 Regolare il contrasto 1. Selezionare stacking dell immagine. 2. Selezionare lo strumento (e). 3. Regolare contrasto e luminosità cliccando tasto destro del mouse e trascinando il puntatore all interno dello stacking dell immagine (sinistradestra per il contrasto, su-giù per la luminosità). 15

CAPITOLO 5. STRUMENTI DI VISUALIZZAZIONE IMMAGINE 5.5 Misurare una distanza 1. Cliccare Misc modalità (h). 2. Selezionare lo strumento (i). 3. Misurare una distanza trascinando il mouse dal punto di inizio a quello di fine dello stacking dell immagine. 16

6 Impostazioni immagini 6.1 Imposta manualmente descrizione Immagine 1. Fare clic destro sulla miniatura per la serie di immagini. 2. Selezionare Select Image Description nel menu contestuale. 6.2 Descrizione dell immagine al momento del caricamento La descrizione dell immagine é impostata automaticamente nel processo di caricamento confrontando le informazioni dai tag DICOM con le informazioni contenute nel file di testo imagedescription.txt. 1. Il file di testo si trova nella cartella in cui è installato Segment CMR. 2. Aggiornare manualmente il file di testo in base alla struttura come definito nella prima riga nel file di testo. 6.3 Dettagli pazienti Modificare i dati dei pazienti da selezionare View and Adjust Patient Details nel menu Report. 17

7 Segmentazione LV - Passo passo 7.1 Segmentazione automatica LV [1] 1. Iniziate la analisi LV per selezionare LV modalità (h) e selezionare (i). Una nuova interfaccia è aperta, come mostrato nella Figura 11. Figura 11: Interfaccia grafica analisi LV. 2. Selezionare tutte le sezioni il ventricolo sinistro tasto sinistro del mouse per selezionare sezione più basale e tasto destro per selezionare sezione apicale più epicardica. 3. Controllare le sezioni di selezione in vista asse longitudinale. 4. Assicurarsi che la croce centrale è al centro del LV. 5. Inizia la segmentazione automatica LV. 19

CAPITOLO 7. SEGMENTAZIONE LV - PASSO PASSO 6. Il risultato di segmentazione viene presentato nella finestra principale dove curva volumi può essere controllare (k) e volumi LV misurati sono presentati, secondo la Figura 12 (j). Figura 12: Risultato analisi LV. 7. Se necessario, la correzione della segmentazione LV puó essere effettuata utilizzando i seguenti strumenti:,,,,,,,, and (i). 7.2 Segmentazione LV manuale Per delineazione manuale della LV, i seguenti strumenti possono essere utilizzati:,,, (i). Se si seleziona la casella di spunta Single Frame Mode (m), la funzione viene eseguita solo sull attuale intervallo di tempo. 7.3 Cancellare segmentazione LV Per cancellare la segmentazione LV, selezionare Clear All LV Segmentation da LV menu (a). 20

7.4. COPIARE LA SEGMENTAZIONE LV 7.4 Copiare la segmentazione LV Per copiare la segmentazione LV in un altro stacking dell immagine selezionare Import Segmentation From Another Image Stack da LV menu (a). 7.5 Validazione di segmentazione LV 1. J. Tufvession, E. Hedstrom, K. Steding-Ehrenborg, M. Carlsson, H. Arheden, E. Heiberg, Validation and development of a new automatic algorithm for time resolved segmentation of the left ventricle in magnetic resonance imaging. In Press in BioMed Research International, 2015. [Available through http://www.hindawi.com/journals/bmri/aa/970357/ref/] 21

8 Segmentazione RV - Passo passo 8.1 Analisi automatica RV [1] 1. Se si seleziona la casella di spunta Single Frame Mode (m), la segmentazione viene eseguita solo sull attuale intervallo di tempo. 2. Puntare il centro dell indicatore RV (croce bianca) nel mezzo della cavità RV. 3. Selezionare le sezioni del ventricolo destro. Le sezioni selezionate sono evidenziate in giallo come nella Figura 12. 4. Cliccare RV modalità (h). 5. Cliccare (i). 6. Selezionare Clear All RV Segmentation Except Enddiastole/Endsystole da RV menu (a). 7. Vengono visualizzati i volumi RV misurati (j). 8.2 Segmentazione RV manuale è possibile utilizzare i seguenti strumenti per la definizione manuale o la correzione della segmentazione automatica:,,, (i). 8.3 Cancellare segmentazione RV Per cancellare la segmentazione RV, selezionare Clear All RV Segmentation da RV menu (a). 8.4 Validazione di segmentazione RV 1. M. A. Aneq, E. Nylander, T. Ebbers, and J. Engvall, Determination of right ventricular volume and function using multiple axially rotated MRI slices, Clin Physiol Funct Imaging 31(3) pp. 233-9, 2011. 23

9 Analisi ROI - Passo passo 9.1 Analisi ROI manuale 1. Cliccare ROI/Flow modalità (h). 2. Se si seleziona la casella di spunta Single Frame Mode (m), la segmentazione viene eseguita solo sull attuale intervallo di tempo. 3. Per posizionare una ROI, utilizzare uno degli strumenti (i) o. 4. Modificare ROI con gli strumenti (i). 5. Traduci ROI con lo strumento (i). 6. Modificare la segmentazione ROI utilizzando lo strumento di correzione (i). 7. Selezionare ROI con Shift-click con lo strumento (i). 8. Impostare l etichetta di ROI selezionati con lo strumento (i). 9. Impostare il colore di ROI selezionati con lo strumento (i). 10. Selezionare ROI Analysis da ROI menu per effettuare analisi del ROI secondo la Figura 13 (a). 9.2 Cancellare segmentazione ROI Eliminare ROI selezionati selezionando Delete Selected ROI, e tutte le ROI selezionando Clear All ROIs nel menu ROI (a). 25

Figura 13: Interfaccia grafica analisi ROI.

10 Analisi di flusso - Passo passo 10.1 Analisi automatica di flusso [1] 1. Visualizzare la grandezza dell immagine della coppia immagini a contrasto di fase come mostrato nella Figura 14. Figura 14: Stacking dell immagine di flusso. 2. Cliccare ROI/Flow modalità (h). 3. Utilizzare lo strumento (i) per posizionare un ROI al centro del vaso. 4. Modificare ROI con gli strumenti (i). 5. Traduci ROI con lo strumento (i). 6. Impostare l etichetta della ROI con lo strumento (i). 7. Impostare il colore della ROI con lo strumento (i). 27

CAPITOLO 10. ANALISI DI FLUSSO - PASSO PASSO 8. Per tracciare e sezionare il vaso cliccare (i). 9. Controllare la segmentazione. Se necessario utilizzare lo strumento di correzione (i). 10. Cliccare (g) per visualizzare la curva del flusso, come mostrato nella Figura 15. Figura 15: Interfaccia grafica report di flusso. 10.2 Analisi Qp/Qs [2] 1. Iniziare con la segmentazione del vaso dell arteria polmonare e dell aorta come descritto nella sezione precedente. Controllare che le etichette siano corrette (Pulmonary artery e Aortic ascending flow). Alternativamente impostare le etichette delle ROI tramite lo strumento (i). 2. Selezionare Qp/Qs Analysis da Flow menu (a). 3. Il rapporto Qp/Qs è presentato in una nuova finestra di messaggio. 10.3 Analisi derivazione e valvola [3] 28 1. Iniziare con la segmentazione del vaso dell arteria polmonare e/o dell aorta come descritto nella la Sezione 10.1. Controllare che le etichette

10.4. CANCELLARE SEGMENTAZIONE DI FLUSSO siano corrette (Pulmonary artery e Aortic ascending flow). Alternativamente impostare le etichette delle ROI tramite lo strumento (i). 2. Selezionare Shunt and Valve Analysis da Flow menu (a). 3. Le frazioni di rigurgito sono presentate in una nuova finestra di messaggio. 10.4 Cancellare segmentazione di flusso Eliminare ROI attuale selezionando Delete ROI, e tutte le ROI selezionando Clear All ROIs nel menu ROI (a). 10.5 Compensazione di correnti parassite L algoritmo di compensazione correnti parassite è un metodo per ridurre gli errori di fase nel background di immagini a contrasto di fase MR. Si noti che è importante che quando si compensano gli effetti di correnti parassite la pila di immagini non deve essere tagliata, poiché l algoritmo necessita dell informazione sulla fase dall intera serie di immagini. 1. Selezionare Eddy Current Compensation da Flow menu (a), per aprire l interfaccia per compensare effetti correnti parassite, come mostrato nella Figura 16. 2. Se necessario, regolare i parametri di soglia per includere solo le regioni di tessuto statiche. 3. Selezionare metodo di compensazione. 4. Cliccare Calculate. 5. Cliccare Apply per applicare la compensazione alla pila di immagini. 6. Cliccare Done per chiudere l interfaccia. 29

CAPITOLO 10. ANALISI DI FLUSSO - PASSO PASSO Figura 16: Interfaccia grafica compensazione di correnti parassite. 10.6 Unwrapping di fase L algoritmo di svolgimento è un metodo per correggere i valori di fase avvolti nelle immagini a contrasto di fase MR. 30 1. Selezionare Unwrap da Flow menu (a). 2. Inserire il VENC originale per il set di dati. 3. L interfaccia per svolgimento di fase è indicato, come in grafico 17. 4. Scegliere un pixel (rappresentato da un punto rosso nell immagine). 5. Cliccare Auto-Unwrap All per applicare l algoritmo di svolgimento di fase automatico all intera serie di immagini. 6. Se necessario, utilizzare gli strumenti manuali per svolgere pixel singoli. 7. Cliccare Apply and Exit per memorizzare lo svolgimento nel file di dati e ritornare alla GUI principale.

10.7. ANALISI VELOCITA ONDA DI POLSO [4] Figura 17: Interfaccia grafica unwrapping di fase. 10.7 Analisi velocita onda di polso [4] Le funzioni descritte in questo capitolo sono fuori scheda tecnica e solo a scopo sperimentale. 1. Iniziare con una misurazione etichettata come Aortic Length e due ROI etichettate come Aortic ascending flow e Abdominal aorta. Utilizzare gli strumenti di misurazione come descritto nella sezione 5.5 e gli strumenti di flusso ROI descritti nel Capitolo 10. 2. Selezionare Pulse Wave Velocity Analysis in Analysis (a) per iniziare l analisi velocità onda di polso. 3. A sinistra la misurazione è evidenziata in giallo, le intersezioni con le immagini che mostrano il flusso sono visualizzate come linee bianche. Sulla destra è mostrato un tracciato di curve di flusso lungo le rispettive tangenti calcolate. Nel calcolo, il parametro sigma può essere rettificato utilizzando il dispositivo di scorrimento. 31

CAPITOLO 10. ANALISI DI FLUSSO - PASSO PASSO Figura 18: Interfaccia grafica analisi della velocità dell onda di Polso. 10.8 Validazione di analisi di flusso 32 1. S. Bidhult, M. Carlsson, K. Steding-Ehrenborg, H. Arheden, and E. Heiberg, A new method for vessel segmentation based on a priori input from medical expertise in cine phase-contrast Magnetic Resonance Imaging. In Proceedings of Seventeenth Annual SCMR Scientific Sessions, New Orleans, USA, 2014. 2. P. Munkhammar, M. Carlsson, H. Arheden, and E. Pesonen, Restrictive right ventricular physiology after Tetralogy of Fallot repair is associated with fibrosis of the right ventricular outflow tract visualized on cardiac magnetic resonance imaging, Eur Heart J Cardiovasc Imaging 14(10) pp. 978-85, 2013. 3. G. Barone-Rochette, S. Pierard, S. Seldrum, C. de Meester de Ravenstein, J. Melchior, F. Maes, A. C. Pouleur, D. Vancraeynest, A. Pasquet, J. L. Vanoverschelde, and B. L. Gerber, Aortic Valve Area, Stroke Volume, Left Ventricular Hypertrophy, Remodeling and Fibrosis in Aortic Stenosis Assessed by Cardiac MRI: Comparison Between High and Low Gradient, and Normal and Low Flow Aortic Stenosis, Circ Cardiovasc Imaging, 2013.

10.8. VALIDAZIONE DI ANALISI DI FLUSSO 4. K. Dorniak, M. Hellmann, D. Rawicz-Zegrzda, M. Wesierska, A. Sabisz, E. Szurowska, M. Didziak and E. Heiberg, A novel tool for phase contrast MR-derived pulse wave velocity measurement - validation against applanation tonometry and phantom studies. Abstract at Cardiovascular Magnetic Resonace Scientific Session, Nice, France, 2015. 33

11 Analisi bullseye - Passo passo 1. Iniziare con la segmentazione LV manuale o automatica come descritto nel Capitolo 7. 2. Selezionare lo stacking dell immagine su cui eseguire l analisi bullseye. 3. Cliccare lo strumento (g) per aprire l interfaccia di analisi Bullseye, come mostrato nella Figura 19. Figura 19: Interfaccia grafica analisi Bullseye. 4. Impostare la rotazione della sezione trascinando il dispositivo di scorrimento in modo che la linea gialla si trovi al centro della cavità LV. Cliccare Update. Questa fase è necessaria per ottenere un corretto tracciato bullseye. 5. Selezionare parametro sul tracciato. 6. Impostare i parametri di visualizzazione. 35

CAPITOLO 11. ANALISI BULLSEYE - PASSO PASSO 7. Cliccare Export per esportare i dati sul foglio di lavoro. 36

12 Generazione report - Passo passo 1. Dopo aver effettuato le misurazioni, cliccare (g) per visualizzare il generatore report. Figura 20: Generatore report. 2. Selezionare le sezioni che si desidera includere nel report. Le sezioni di colore grigio non sono disponibili poiché le misurazioni o le immagini non sono presenti. 3. Selezionare le immagini che si desidera includere nel report. 4. Assicurarsi di scegliere i valori di riferimento appropriati. 5. Scrivere la diagnosi del paziente. 6. Cliccare Generate HTML report per generare un report HTML. 7. Cliccare Send to PACS per inviare il report al PACS. 37

13 Analisi T2* - Passo passo 13.1 Analisi automatica T2* [1] 1. Iniziare con la segmentazione LV manuale o automatica in tutti i fotogrammi come descritto nel Capitolo 7. 2. Posizionare un ROI in pila di immagini per definire la regione per l applicazione di T2* di calcolo, come descritto nel capitolo 9. 3. Avviare il modulo T2* selezionando T2* module in T2* menu (a). Figura 21: Interfaccia grafica analisi T2*. 4. Il valore medio regionale T2* si presenta sopra il grafico. I valori medi T2* regionali ha dimostrato di correlare strettamente alla concentrazione di ferro [2, 3]. 5. Un valore T2* a livello di pixel è fornito selezionando T2* pixel-fit, e spostare le croce rosso nell immagine acquisita a sinistra, oppure nel T2* mappa. 39

CAPITOLO 13. ANALISI T2* - PASSO PASSO 6. Parametri di visualizzazione immagine sono definite utilizzando i cursori e le caselle di controllo nella parte inferiore sinistra del pannello. 7. Cliccare Export per esportare il risultato sul foglio di lavoro. 8. Cliccare su Generate Image Stacks per aggiungere la pila di immagini T2* nella GUI principale del Segment CMR. 13.2 Validazione di analisi T2* 1. S. Bidhult, C. G. Xanthis, L. L. Liljekvist, G. Greil, E. Nagel, A. H. Aletras, E. Heiberg, E. Hedstrom, Validation of a New T2* Algorithm and Its Uncertainty Value for Cardiac and Liver Iron Load Determination from MRI Magnitude Images. In Press in Magn Reson Med, 2015. [Available through http://medviso.com/documents/segmentcmr/t2star.pdf/] 2. L. J. Andersson, S. Holden, B. Davis, E. Prescott, C. C. Charrier, N. H. Bunce, D. N. Firmin, B. Wonke, J. Porter, J. M. Walker and D. J. Pennell, Cardiovascular T2-star (T2*) magnetic resonance for the early diagnosis of myocardial iron overload. European Heart Journal 22(23) pp. 2171-2179, 2001 3. J. P. Carpenter, T. He, P. Kirk, M. Roughton, L. J. Anderson, S. V. de Noronha, M. N. Sheppard, J. B. Porter, J. M. Walker, J. C. Wood, R. Galanello, G. Forni, G. Catani, G. Matta, S. Fucharoen, A. Fleming, M. J. House, G. Black, D. N. Firmin,T. G. St Pierre, D. J. Pennell, On T2* Magnetic Resonance and Cardiac Iron. Circulation, 123(14), pp. 1519-28, 2011 40