La trascrizione del DNA
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- Giorgina Sacchi
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1 La trascrizione del DNA
2 I prodotti iniziali dei geni consistono in molecole di Acido Ribonucleico
3 Dogma centrale DNA RNA polipeptide
4 RNA/DNA
5 Proprieta dell RNA - Prodotto a partire dal DNA stampo (trascrizione) - Sequenza complementare a quella del DNA che ne dirige la sintesi - Molecola a singolo filamento con ossatura zucchero-fosfato - Presenza del ribosio al posto del desossiribosio - Presenza dell Uracile al posto della Timina - RNA informazionali che vengono tradotti in polipeptidi (mrna) - RNA funzionali, non vengono tradotti in polipeptidi ma svolgono la loro funzione come RNA (trna, rrna, snrna, snrnp, scrna, sirna, mirna)
6 I diversi RNA
7 I componenti dell RNA : i ribonucleotidi A G C U
8 L RNA passa dal nucleo al citoplasma Esperimento di pulsechase Si somministrano ribonucleotidi marcati con radioattivo a cellule eucariotiche. La radioattivita e inizialmente presente nel nucleo e poi passa nel citoplasma
9 L RNA puo essere sintetizzato anche in vitro -DNA stampo -RNA polimerasi Fonte del DNA FagoT2 A+T/ G+C (DNA) 1.84 A+U/ G+C (RNA) NTP Bovini Batterio RNA
10 La trascrizione dell RNA e un processo asimmetrico
11 La trascrizione dell RNA e basata sull appaiamento complementare delle basi 3 5
12 Trascrizione di procarioti ed eucarioti
13 RNA Polimerasi procariotica Permette il riconoscimento delle sequenze consenso sul promotore
14 La trascrizione dell RNA inizia a partire da un promotore PROMOTORE: regione di DNA formata da sequenze specifiche dette consenso a cui si lega la RNA polimerasi per iniziare la trascrizione Sequenze consenso
15 Inizio della trascrizione Rilascio del fattore σ Complesso del promotore aperto Complesso del promotore chiuso
16 Allungamento dell RNA
17 Terminazione dell RNA Sequenza segnale di terminazione ricca di GC che permette di formare legami complementari intracatena
18 Meccanismi di terminazione dell RNA 1. Ansa a forcina Segnali di distacco della RNA polimerasi
19 Proteine Rho 2. La proteina Rho si posiziona sull RNA su siti specifici
20 RNA eucariotico Trascritto primario Trascritto maturo
21 RNA polimerasi eucariotiche RNA polimerasi I per gli rrna RNA polimerasi II per gli mrna RNA polimerasi III per i trna, snrna, mirna etc
22 Inizio della trascrizione eucariotica Le RNA polimerasi eucariotiche iniziano a trascrivere solo se presenti fattori di trascrizione proteici
23 Il promotore eucariotico
24 Modificazioni del trascritto primario -CAP o cappuccio al 5 (7-metilguanosina) - coda di poly-a lunga residui Contribuiscono a rendere stabile l RNA
25 I geni eucariotici sono interrotti Rimozione di sequenze interne di RNA dal trascritto primario
26 Il gene interrotto dell ovalbumina Gene (esoni ed introni) Trascritto primario Rimozione degli introni Trascritto maturo
27 I geni eucariotici sono interrotti
28 UN GENE DIVERSE PROTEINE
29 Splicing alternativi del pre-mrna del gene dell α-tropomiosina
30 Sequenze consenso nei siti di splicing 5 e 3 degli mrna
31 Il complesso dello spliceosoma
32 Reazione di transesterificazione dello SPLICING cappio
33 RNA autocatalitici: RIBOZIMI
34 RIBOZIMI - E.Coli, Tetrahymena (tipo I) - t-rna, mitocondri, cloroplasti (tipo II)
35 Determinazione cromosomica del sesso in Drosophila e nell uomo Cromosomi sessuali Specie XX XY XXY XO Drosophila Homo Sapiens Aneuploidi
36 La specificazione del sesso in Drosophila
37 Sex-lethal acceso Sex-lethal spento
38 Geni sull X-> producono prodotti proteici detti NUMERATORI Geni sugli Autosomi-> producono prodotti proteici detti DENOMINATORI
39 Cosa sono numeratori e denominatori? Proteine b-helix-loop-helix (fattori di trascrizione) che funzionano come dimeri
40 Inizio e antenimento dello switch molecolare sex-lethal Sex-lethal si attiva dal promotore precoce PE ad opera dei fattori di trascrizione prodotti dal cromosoma sessuale X
41 SPLICING ALTERNATIVO determinazione del sesso in Drosophila : gene Sex-lethal Esone incluso roteina funzionale per lo sviluppo femminile Esone rimosso Proteina non funzionale
42 Sex-lethal Transformer Double-sex Attiva geni femminili e reprime i geni maschili
43 UN GENE DIVERSE PROTEINE DIVERSE PROTEINE
44 Enhancer trascrizionali
45 Enhancer: sequenze cis-agenti a cui si legano fattori di trascrizione speciali, che a loro volta interagiscono con i fattori di trascrizione posti sul promotore e con la RNA polimerasi -agiscono a distanze molto ampie -agiscono in entrambi gli orientamenti -effetti indipendenti dalla posizione (a monte o a valle del gene)
46 ENHANCER
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