IL GENOMA DELLA CELLULA VEGETALE
I GENOMI DELLE CELLULE VEGETALI Genoma nucleare Geni per il funzionamento globale della cellula vegetale Condivisi o specifici per la cellula vegetale Genoma plastidiale Set di geni specifici per il funzionamento dei plastidi Comuni a cellule batteriche Genoma mitocondriale Set di geni specifici per il funzionamento dei mitocondri Comuni a cellule batteriche
IMPACCHETTAMENTO DEL DNA NEGLI ISTONI
ULTERIORE IMPACCHETTAMENTO DEL DNA NEI CROMOSOMI METAFASICI
ASSEMBLAGGIO DI UN CROMOSOMA (ANIMAZIONE)
ACCORCIAMENTO DEL DNA TELOMERICO AD OGNI CICLO DI REPLICAZIONE
LA DNA POLIMERASI (ANIMAZIONE)
IL PROCESSO DI REPLICAZIONE DEL DNA (ANIMAZIONE)
LA REPLICAZIONE DEL DNA RICHIEDE LA PRESENZA DI ELICASI
I VARI TIPI DI RNA POLIMERASI ESISTENTI NELLE PIANTE RNA polimerasi I Produzione di RNA ribosomali grandi RNA polimerasi II Produzione di RNA messaggeri Precursori di microrna RNA polimerasi III Produzione di RNA transfer Produzione di RNA nucleare piccolo RNA ribosomale piccolo RNA polimerasi dipendente da RNA Produzione di «small Interfering RNA»
STRUTTURA DEL NUCLEOLO: SEDE DELLA SINTESI DI RNA RIBOSOMALE
I GENI SONO SUDDIVISI IN ESONI ED INTRONI (es.: gene per la subunità piccola della Rubisco) Sequenza regolatrice introne esone
I TRASPOSONI SONO UN ELEMENTO EVOLUTIVO IMPORTANTE. CLASSE I: COPIA E INCOLLA sottoclasse I: controllo dell espressione della trascrittasi inversa e integrazione di cdna nel genoma sottoclasse II: si muove passivamente
TRASPOSONI DI CLASSE II: TAGLIA E INCOLLA
I SETTORI PIGMENTATI DI ALCUNI TESSUTI SI FORMANO MEDIANTE TRASPOSIZIONE CASUALE
LA REGOLAZIONE DEI GENI AVVIENE ATTRAVERSO LA COMBINAZIONE DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE
PROTEINE LEGANTI LA REGIONE TATA (ANIMAZIONE)
IL CONTROLLO COMBINATORIO DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE PREVEDE UNA SEQUENZA DI FASI
IL CONTROLLO COMBINATORIO DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE
IL CONTROLLO COMBINATORIO DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE
LEGAME DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE A ELEMENTI CIS PER INFLUENZARE LA TRASCRIZIONE GENICA
MODO DI AZIONE DEI REPRESSORI TRASCRIZIONALI
FATTORI TRASCRIZIONALI
FATTORI TRASCRIZIONALI
ESEMPIO: INTERAZIONE DI FATTORI DI TRASCRIZIONE MULTIPLI CON ELEMENTI CIS NEL PROMOTORE CAB Fotorecettori Proteina regolatrice indotta dal ritmo circadiano gene coinvolto nella sintesi di clorofilla
LA TRASCRIZIONE GENICA (ANIMAZIONE)
LA REGOLAZIONE GENICA AVVIENE ANCHE MEDIANTE MODIFICAZIONE DEGLI ISTONI (PERMANENTE) Freddo prolungato (inverno)
MANTENIMENTO DELLA METILAZIONE DEL DNA IN PUNTI SIMMETRICI Questo promuove la ereditarietà dell espressione genica: EPIGENETICA
REGOLAZIONE DELL ESPRESSIONE GENICA A LIVELLO DI RNA: SPLICING ALTERNATIVO Proteina ribosomiale 14 dei mitocondri Succinato deidrogenasi subunità B
ALTRI FATTORI CHE CONTROLLANO L ESPRESSIONE GENICA DNA TRASCRIZIONE RNA TRADUZIONE DEGRADAZIONE DEGRADAZIONE RNA LIBERO
I MICRORNA SONO REGOLATORI DELL ESPRESSIONE GENICA. COME SI ORIGINANO?
INTERAZIONE TRA mirna E LA PROTEINA ARGONAUTA
INTERAZIONE TRA mirna E LA PROTEINA ARGONAUTA
INTERFERENZA AD RNA: UN ULTERIORE MECCANISMO PER REGOLARE L ESPRESSIONE GENICA
IL SILENZIAMENTO GENICO MEDIANTE sirna: DEGRADAZIONE DI mrna E METILAZIONE GENICA
LETTERATURA FONDAMENTALE: IL SEQUENZIAMENTO DEL GENOMA DI ARABIDOPSIS
LA STRATEGIA DI SEQUENZIAMENTO DEL GENOMA
LE FUNZIONI PREVISTE DEI GENI DI ARABIDOPSIS
CARATTERISTICHE DEL GENOMA DI ARABIDOPSIS Lunghezza: 125 milioni di coppie di basi Composto da circa 26000 geni Un gene tipico è lungo circa 4500 bp Gli esoni sono lunghi circa 250 bp, mentre gli introni hanno una lunghezza di 170 bp Metà dei geni hanno controparti in animali e funghi Circa 150 famiglie proteiche sono invece specifiche Circa 400 geni sono simili a geni dei Cianobatteri Sono presenti circa 4000 transposoni
CONFRONTO TRA GRUPPI GENICI DI ORGANISMI DIVERSI
IL GENOMA DI ARABIDOPSIS CONTIENE DIVERSE REGIONI DUPLICATE
UNA TECNOLOGIA RIVOLUZIONARIA: POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)
UNA TECNOLOGIA RIVOLUZIONARIA: POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)
ANALISI GENETICA MEDIANTE EXPRESSION ARRAY
LA POLIPLOIDIA E UN EVENTO EVOLUTIVO IMPORTANTE: IPOTESI SULL ORIGINE autopoliploidia allopoliploidia
DIVERGENZA NELLA FUNZIONE GENICA MEDIANTE MODIFICAZIONI NELLE SEQUENZE REGOLATRICI
DIVERGENZA NELLA FUNZIONE GENICA MEDIANTE MODIFICAZIONI NELLE SEQUENZE REGOLATRICI
GENI ORTOLOGHI E PARALOGHI: UN ALTRO MECCANISMO EVOLUTIVO
ALLINEAMENTO DEI GENOMI DI MAIS, SORGO, CANNA DA ZUCCHERO E RISO
DNA NEI CLOROPLASTI
IL CONTENUTO GENICO DEL DNA PLASTIDICO DI TABACCO
LA REPLICAZIONE DEL DNA PLASTIDICO DI TABACCO
INTERRELAZIONE TRA ESPRESSIONE GENICA NUCLEARE E PLASTIDIALE
ASSEMBLAGGIO COORDINATO DELLA RUBISCO
CONFRONTO TRA RNA POLIMERASI