LA BIOLOGIA MOLECOLARE E UNA BRANCA DELLA BIOLOGIA CHE STUDIA LE BASI MOLECOLARI DELLE FUNZIONI BIOLOGICHE, PONENDO UNA PARTICOLARE ATTENZIONE A QUEI
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- Gaetana Coco
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1 CONCETTI DI BASE
2 LA BIOLOGIA MOLECOLARE E UNA BRANCA DELLA BIOLOGIA CHE STUDIA LE BASI MOLECOLARI DELLE FUNZIONI BIOLOGICHE, PONENDO UNA PARTICOLARE ATTENZIONE A QUEI PROCESSI CHE COINVOLGONO GLI ACIDI NUCLEICI.
3 ARGOMENTI CENTRALI DELLA BIOLOGIA MOLECOLARE SONO AD ESEMPIO: 1. LO STUDIO DELLA STRUTTURA TRIDIMENSIONALE DELLE MACROMOLECOLE BIOLOGICHE (DNA, RNA E PROTEINE) 2. L ANALISI DELLE RELAZIONI ESISTENTI TRA LA STRUTTURA TRIDIMENSIONALE DI PROTEINE ED ACIDI NUCLEICI E LE FUNZIONI BIOLOGICHE DA ESSI SVOLTE
4 3. LE INTERAZIONI MOLECOLARI 4. LO STUDIO DEI GENOMI E DEI LORO MECCANISMI DI REPLICAZIONE 5. I PROCESSI DI TRASCRIZIONE E TRADUZIONE DELL INFORMAZIONE GENICA
5 VA INOLTRE EVIDENZIATO CHE IN SENO ALLA BIOLOGIA MOLECOLARE SI SONO SVILUPPATE NUMEROSE IMPORTANTI METODICHE, COMPLESSIVAMENTE NOTE COME METODICHE DEL DNA RICOMBINANTE O TECNOLOGIE RICOMBINANTI, CHE CONSENTONO LA RIVELAZIONE, L ANALISI E LA MANIPOLAZIONE DEGLI ACIDI NUCLEICI. QUESTE METODICHE HANNO MOLTEPLICI POTENZIALITA APPLICATIVE E PER QUESTO SONO STATE ESPORTATE IN MOLTI ALTRI CAMPI DELLA BIOLOGIA E DELLA
6 MEDICINA, CONTRIBUENDO TRA L ALTRO ALLA NASCITA DELLE BIOTECNOLOGIE.
7 PRINCIPALI APPLICAZIONI DELLE METODICHE DEL DNA RICOMBINANTE: FARMACI E VACCINI RICOMBINANTI DIAGNOSTICA CLINICA (MALATTIE INFETTIVE, MALATTIE EREDITARIE) ANALISI MEDICO-FORENSI TERAPIA GENICA TIPIZZAZIONE DI SPECIE ANIMALI E VEGETALI
8 ENZIMI STABILIZZATI PER APPLICAZIONI INDUSTRIALI GENOMICA FUNZIONALE MIGLIORAMENTO GENETICO DI SPECIE ANIMALI E VEGETALI
9 LA NASCITA DELLA BIOLOGIA MOLECOLARE SI PUO FARE RISALIRE AL 1953, QUANDO JAMES WATSON E FRANCIS CRICK DEFINIRONO LA STRUTTURA TRIDIMENSIONALE DEL DNA.
10
11 PROGRAMMA DEL CORSO
12 GLI ACIDI NUCLEICI SONO MOLECOLE POLIMERICHE LINEARI FORMATE DA NUCLEOTIDI. ESSI COMPRENDONO: ACIDO RIBONUCLEICO O RNA ACIDO DEOSSIRIBONUCLEICO O DNA
13 FIGURA 3.2A GENOMI II
14 FIGURA 2.1 GENOMI II
15 FIGURA 1.1 GENOMI II: LOCALIZZAZIONE DEL DNA NELLA CELLULA EUCARIOTICA
16 I MITOCONDRI SONO ORGANULI SEMIAUTONOMI, DOTATI DI UN PROPRIO GENOMA, PROPRI RIBOSOMI E PROPRI RNA DI TRASPOSTO PER OPERARE LA SINTESI PROTEICA.
17 FIGURA 1.22 GENOMI II
18 NON TUTTE LE PROTEINE MITOCONDRIALI SONO SINTETIZZATE NEI MITOCONDRI. ALCUNE DI ESSE SONO CODIFICATE DAL GENOMA NUCLEARE E SONO SINTETIZZATE NEL CITOPLASMA PER POI ESSERE INDIRIZZATE AI MITOCONDRI
19 FIGURA 2.3 GENOMI II: LOCALIZZAZIONE DEL DNA NELLA CELLULA PROCARIOTICA
20 TABELLA 8.1 GENOMI III
21 TABELLA 8.3 FONDAMENTI DI BIOL. MOL.
22 FIGURA 44.2 DULBECCO-VIROLOGIA. NEI VIRUS IL GENOMA PUO ESSERE A DNA O AD RNA
23 FIGURA 1.4 GENOMI II
24 POSSIBILI DEFINIZIONI DI GENE: UN SEGMENTO DI DNA CHE CODIFICA UNA PROTEINA (SI PUO APPLICARE SOLO AI GENI CODIFICANTI) UN SEGMENTO DI DNA TRASCRITTO IN UNA MOLECOLA DI RNA FUNZIONALE (TALE DEFINIZIONE COMPRENDE ANCHE I GENI RIBOSOMALI, I GENI DEGLI RNA DI TRASPORTO, I GENI DEI MICRORNA)
25 PER INFORMAZIONE GENICA SI INTENDE L ESATTA SEQUENZA DELLE BASI DELL ACIDO NUCLEICO.
26 DOGMA CENTRALE DELLA BIOLOGIA: DNA REPLICAZIONE TRASCRIZIONE RNA TRADUZIONE PROTEINE
27 PER GENOMA SI INTENDE L INTERO CONTENUTO DI DNA DI UNA CELLULA O DI UN INDIVIDUO. IL TRASCRITTOMA RAPPRESENTA L INTERO CONTENUTO DI mrna DI UNA CELLULA CIOE L INSIEME DEI TRASCRITTI CODIFICANTI. PER PROTEOMA SI INTENDE IL CONTENUTO PROTEICO COMPLESSIVO DI UNA CELLULA.
28 FIGURA 3.1 GENOMI II
29 IN UN ORGANISMO PLURICELLULARE I DIFFERENTI TIPI CELLULARI POSSEGGONO LO STESSO GENOMA MA DIFFERENTI TRASCRITTOMI E PROTEOMI, CIASCUNO DEI QUALI DEFINISCE UN PARTICOLARE ASSETTO STRUTTURALE E METABOLICO.
30 UNITA DI MISURA DELLA LUNGHEZZA PIU UTILIZZATE IN BIOLOGIA MOLECOLARE (QUELLE IN ROSSO) m mm = 10-3 m μm = 10-6 m nm = 10-9 m Å = m
31 UNITA DI MISURA DEL PESO PIU UTILIZZATE IN BIOLOGIA MOLECOLARE g mg = 10-3 g μg = 10-6 g ng = 10-9 g
32 UNITA DI MISURA DEL VOLUME PIU UTILIZZATE IN BIOLOGIA MOLECOLARE l (litro) ml = 10-3 l = 1 cm 3 μl = 10-6 l = 1 mm 3
33 DATO CHE IL DNA E FORMATO DA DUE FILAMENTI POLINUCLEOTIDICI, LA LUNGHEZZA DELLE MOLECOLE E ESPRESSA IN TERMINI DI COPPIE DI BASI O bp (BASE PAIRS). DNA MOLTO LUNGHI SONO MEGLIO DESCRITTI INTERMINI DI kb (CHILOBASE) = bp Mb (MEGABASE) = bp Gb (GIGABASE) = bp
34 TABELLA 2.1 GENOMI II
35 NELL UOMO I GENI SONO GENERALMENTE MOLTO DISTANTI GLI UNI DAGLI ALTRI E LA PORZIONE DEL GENOMA CHE CODIFICA PROTEINE E PARI A CIRCA IL 5 %.
36 ASPETTI ORGANIZZATIVI
37 LE DIAPOSITIVE DELLE LEZIONI SI POSSONO SCARICARE DAL SITO WEB DEL DIPARTIMENTO DI SCIENZE E TECNOLOGIE AMBIENTALI, BIOLOGICHE E FARMACEUTICHE ENTRATI NELL AREA DOWNLOAD, SELEZIONARE LA CARTELLA RUSSO DA CUI POSSONO ESSERE SCARICATI GLI APPUNTI
38 MODALITA DI SVOLGIMENTO DEGLI ESAMI
39 ORARIO DELLE LEZIONI ORARIO DI RICEVIMENTO DEGLI STUDENTI
MODELLO SCHEDA INSEGNAMENTO
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