Gestione ed analisi di base dati nell epidemiologia. delle malattie infettive

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1 Università degli Studi di Torino - Facoltà di Medicina Veterinaria Laboratorio di epidemiologia delle malattie infettive Scuola Specializzazione in Sanità Animale, Allevamento e Produzioni Zootecniche Gestione ed analisi di base dati nell epidemiologia delle malattie infettive Luigi Bertolotti :: Premessa Outline :: introduzione ai db, descrizione della sua struttura, terminologia, tipi di database e di database management system :: introduzione all impiego dei diversi software Microsoft Excel :: introduzione all impiego dei diversi software Microsoft Access :: Applicazioni del db a diversi campi dell epidemiologia: l analisi spaziale e l epidemiologia molecolare :: Prova in itinere 1

2 :: I software Le basi dati sono gestite dai Database Management System ovvero software che si interfacciano tra i dati e l utente Tra i più comuni e i più utilizzati appartengono al pacchetto Microsoft Office: :: MS Excel non è un vero DBMS ma è il più accessibile e utilizzato nella gestione dei dati :: MS Access DBMS in grado di gestire anche db di medie dimensioni Introduzione Microsoft Excel è un foglio di calcolo, ma può essere utilizzato come DBMS Barra della formula Barre strumenti Colonne Righe Fogli di lavoro 2

3 Introduzione E in grado di gestire db di piccole dimensioni Spesso utilizzato per creare db semplici, ma è in grado di gestire db relazionali mediante cartelle di lavoro Utilizzato per elaborazioni di base, di tipo descrittivo Ha la possibilità di creare report grafici Introduzione Cose importanti da sapere Ogni file di Excel possiede di default 3 fogli, creando così una cartella di lavoro E possibile creare collegamenti i diversi fogli 3

4 Introduzione Cose importanti da sapere il tipo di dato inserito ha un formato preciso e definibile i dati inseriti in formati errati possono portare a errate interpretazioni Introduzione Cose importanti da sapere Possibili formati: Generale Numero Valuta / Contabilità Data / Ora Percentuale / Frazione / Scientifico Testo Speciale Personalizzato! 4

5 Introduzione Cose importanti da sapere Particolare attenzione al formato delle date! Excel ha la possibilità di trasformare le date in formato numerico: Introduzione Cose utili da sapere Lo zoom permette di visualizzare meglio i dati contenuti nei fogli 5

6 Introduzione Cose utili da sapere Bloccando i riquadri le intestazioni di righe e colonne possono essere mantenute anche scorrendo i dati Introduzione Cose utili da sapere per copiare i dati nelle celle adiacenti si può usare il quadratino di selezione 6

7 Introduzione Cose utili da sapere Con lo stesso metodo si possono creare diversi tipi di sequenze Introduzione Cose utili da sapere 7

8 Introduzione Cose utili da sapere Le formule Rappresentano uno strumento molto potente Permettono un alto livello di personalizzazione dei fogli di lavoro 8

9 Le formule devono cominciare sempre con = possono essere semplici formule matematiche possono contenere riferimenti a diverse celle possono contenere formule complesse, contenute in Ms Excel Le formule Semplici dopo l invio il risultato è visualizzato nella cella deve cominciare con = può essere compilato sia nella cella sia nella barra della formula 9

10 Le formule Semplici Cella di riferimento il risultato si aggiorna automaticamente se il valore in D3 cambia Le formule Semplici Celle di riferimento il risultato si aggiorna automaticamente se il valore in B4, B7 e B5 cambia 10

11 Le formule Semplici come i dati, le formule possono essere copiate in diverse celle ma! Obiettivo: ottenere i valori di y per diversi valori di x [0:10] Step 01: creare la sequenza di valori di x Le formule Step 02: creare la sequenza di valori di y, copiando la cella relativa alla formula Copiando la formula in celle diverse, la formula mantiene un collegamento relativo alle celle di riferimento 11

12 Le formule Soluzione 01: ricopiare i valori di a e b nelle celle in corrispondenza dei valori di x Soluzione poco raffinata e spesso non realizzabile! Le formule Soluzione 02: bloccare i riferimenti alle celle costanti durante la scrittura della formula $ La formula in B9: =B4*B7+B5 diventa =$B$4*B7+$B$5 Riferimento assoluto 12

13 Le formule L unico riferimento relativo resta il valore di x I valori di a e b restano costanti Le formule I riferimenti possono essere usati per collegare Fogli diversi Cartelle di lavoro (file) diverse 13

14 Le formule Ms Excel possiede una vasta libreria si formule, divise in categorie Le formule Tutte le formule vengono richiamate usando la stessa sintassi: = [nome della formula] ( [parametri] ) i parametri possono essere sia valori numerici, che riferimenti a celle 14

15 Le formule Carrellata sulle formule più usate Matematiche somma() somma ass() valore assoluto exp() esponenziale log10() logaritmo base 10 pi.greco() valore di π arrotonda() arrotonda.difetto() arrotonda.eccesso() tronca() elimina la parte decimale Le formule Carrellata sulle formule più usate Data e ora adesso() anno() giorno() ora() Logiche se() e() o() vero() falso() 15

16 Le formule Carrellata sulle formule più usate Statistica dalle formule più semplici come media() e dev.st() ai test statistici più comuni. Le formule identificazione dei Positivi (rif. assoluto) media di ogni Ag (rif. relativo) 16

17 Le formule media di un intervallo di valori =media(f2:f12) SE() effettua un test: restituisce due valori, a seconda se il test è VERO o FALSO =SE(test ; vero ; falso) Le formule =CONTA.SE(I2:M12;"POS") =CONTA.SE(I2:M12; "neg") =J14/CONTA.VALORI(I2:M12)*100 =J16/CONTA.VALORI(I2:M12)*100 17

18 Esercitazione 02 Ms Excel Step #01 Un veterinario vi chiede di ricostruire i movimenti di animali dell allevamento Bertatti, fornendovi uno schema grafico delle entrate e delle uscite. :: I primi dati risalgono al :: Il numero di animali presenti prima del 1985 non è conosciuto. :: La ricerca è ancora in corso, e ci si aspetta una grossa mole di dati. Per questo motivo, il vostro compito è di: 1) disegnare una tabella (db piatto) in cui organizzare i dati ricevuti, sulla base di quelli già ottenuti, utilizzando tutti i dati riportati nel grafo. 2) estrapolare, usando le formule, le seguenti informazioni: quanti animali sono entrati in allevamento quanti animali sono usciti dall allevamento qual è la media di capre macellate all anno quante capre sono state macellate Esercitazione 2 Ms Excel Centro Allevamento Caprino capre - riproduzione becchi - riproduzione becco - riproduzione capre becchi + 10 capre agnelli Centro di Macellazione Allevamento Rossi Allevamento Bertatti capre - riproduzione 1 becco - riproduzione Allevamento Verdi agnelli - allevamento becco - riproduzione 2 capre - riproduzione Allevamento Rossi 18

19 Esercitazione 2 Ms Excel Dalla scorsa lezione chiedersi sempre qual è l obiettivo qual è il soggetto Esercitazione 2 Ms Excel Soluzione 19

20 Esercitazione 2 Ms Excel Soluzione Compito 01 Esercitazione 2 Ms Excel Soluzione Compito 02 20

21 Esercitazione 2 Ms Excel? a questo punto, dove siamo?? Tabelle Pivot Permettono una rapida visualizzazione Riepilogano i dati creando nuove tabelle 21

22 Le tabelle pivot nuovo foglio nella cartella Le tabelle pivot Le tabelle pivot permettono di riepilogare i dati contenuti in una tabella, rendendo più agevole l elaborazione dei dati 22

23 Le tabelle pivot campo di riepilogo generale campi Colonna campi disponibili = campi della tabella conteggi campi Riga Le tabelle pivot Alcuni esempi 23

24 Le tabelle pivot Alcuni esempi Grafici 24

25 i grafici i grafici 25

26 i grafici i grafici 26

27 i grafici i grafici 27

28 Esercitazione 02 Ms Excel Step #02 Utilizzate il db creato da voi per descrivere i movimenti degli animali di Bertatti per creare un report che descriva: gli ingressi e le uscite di capre/becchi/agnelli divisi per motivo 1) sia mediante tabella pivot 2) sia mediante un grafico a barre orizzontali 28