La genetica dei caratteri quantitativi

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Studia l ereditarietà nelle popolazioni dei caratteri quantitativi Molti caratteri sono quantitativi, cioè hanno molte classi fenotipiche

Il modo in cui si esprimono e vengono trasmessi i caratteri quantitativi è stato spiegato in termini mendeliani perché questi caratteri sono controllati da molti geni e sono anche influenzati dall ambiente Studi sperimentali e statistici dopo la riscoperta di Mendel

Il modo in cui si esprimono e vengono trasmessi i caratteri quantitativi è stata spiegata in termini mendeliani perché questi caratteri sono controllati da molti geni e sono anche influenzati dall ambiente aa Aa AA Maa MAA MAa Grande effetto dell ambiente su un singolo locus Tanti fenotipi (e 3 L genotipi) se ci sono molti geni che controllano il carattere. Semplice esempio con effetti additivi

La genetica dei caratteri quantitativi cerca di capire come molti geni controllano un carattere come geni e ambiente agiscono sul carattere quanti e quali sono questi geni per ogni carattere come l evoluzione modifica la distribuzione di frequenza di questi caratteri

Bisogna studiare prima di tutto statisticamente la distribuzione di frequenza dei caratteri, e i concetti chiave sono la varianza e le sue componenti (quella ereditabile e quella non ereditabile) e l ereditabilità Quanta parte della variabilità fenotipica è dovuta a differenze genetiche tra individui? Quanto parte è invece dovuta a diversi effetti ambientali sugli individui? Cos è l ereditabilità di un tratto e come questo indice influenza la sua evoluzione?

V P = Varianza fenotipica. Misura la variabilità totale di un tratto V G = Varianza genetica. Variabilità tra individui dovuta alle differenze genetiche tra individui V E = Varianza ambientale. Variabilità tra individui dovuta a differenze ambientali V P = V G + V E

Stima delle componenti della varianza attraverso l incrocio di linee pure: esempio con l altezza della corolla nel tabacco Individui F 1 hanno tutti lo stesso genotipo eterozigote. Quindi, la varianza in F 1 (ma anche nei parentali, che sono linee pure) = V E Individui F 2 hanno genotipi diversi. Quindi, la varianza in F 2 = V G + V E V G = varianza in F 2 varianza in F 1

Ci sono anche altre componenti

L ereditabilità in senso lato (broad-sense heritability) h B 2 = V G / V P = V G / (V G + V E ) E la frazione di variabilità totale dovuta a differenze genetiche. Individualmente, è la proporzione della distanza di un fenotipo dalla media attribuibile ai geni Varia tra 0 (tutti gli individui sono identici geneticamente) e 1 (l ambiente non ha effetto sul carattere) Attenzione: -se h B 2 è pari a 0, non significa che il carattere non sia controllato geneticamente - se h B 2 è maggiore di 0, e ci sono differenze tra gruppi, non significa che i gruppi siano geneticamente diversi

La variabilità di origine genetica può essere scomposta: V G = V A + V D + V I V A è la variabilità genetica dovuta agli effetti additivi degli alleli. Gli effetti degli alleli sono additivi quando non dipendono dal contesto (allele omologo o alleli ad altri loci) V D è la variabilità genetica dovuta a effetti di dominanza V I è la variabilità genetica dovuta a interazioni (epistasi) tra loci V A è fondamentale perché è la sola parte della variabilità genetica che determina la somiglianza tra parenti, ovvero la frazione di variabilità genetica che viene ereditata. E quindi la base per l azione della selezione (naturale o artificiale).

L ereditabilità in senso stretto (narrow-sense heritability) h N 2 = V A / V P

Un modo per stimare l ereditabilità in senso stretto è lo studio delle somiglianze tra genitori (media dei due) e figli. La pendenza della regressione è pari a h 2 N Attenzione, la correlazione non è 1 anche se H 2 =1 (segregazione casuale alleli) Attenzione alle somiglianze genitori-figli non dovute ai geni: questo tipo di analisi assumono che la somiglianza tra parenti sia dovuta solo a geni condivisi

Assunzione spesso valida (per esempio, verificabile con esperimenti di uova adottate, ma non sempre (soprattutto nell uomo per caratteri che dipendono da aspetti culturali)

Conoscere l ereditabilità in ss permette di capire cosa succede quando la selezione agisce su un carattere quantitativo Prima vediamo i tipi di selezione che possono agire sui caratteri quantitativi

Diversi tipi di selezione e loro effetti

La risposta alla selezione direzionale (R, è la differenza tra fenotipo medio dopo una generazione di selezione) dipende dall ereditabilità ss e dal differenziale di selezione (S, è la differenza tra fenotipo medio dei riproduttori e fenotipo medio nella popolazione)

R = h N2 S (Breeder s equation, logica pensando alla regressione genitori-figli) Permette di prevedere la risposta alla selezione per caratteri quantitativi in una generazione (molto più complessa la questione a lungo termine) (Selezione può essere molto rapida!) (ovviamente non c e evoluzione se h N 2 è pari a 0, e h N 2 dipende da V A ) Permette anche di stimare h 2 N da esperimenti di selezione artificiale!

Anche per i caratteri quantitativi la deriva genetica è importante! In assenza di selezione, per esempio, l equilibrio deriva-mutazione porta mediamente a: V A = 2Ne * V m Dove Vm è la varianza mutazionale, ovvero la varianza additiva introdotta per mutazione ogni generazione La varianza mutazionale Vm è piuttosto alta, circa un millesimo della varianza ambientale: per i caratteri fenotipici (sono controllati da molti loci) si può generare variabilità rapidamente La deriva può portare a divergenza tra popolazioni anche per caratteri fenotipici (spesso però la selezione stabilizzante rallenta la divergenza tra gruppi o di un gruppo nel tempo)

La selezione ripetuta verso un fenotipo porta alla fissazione di alleli che ad ogni locus contribuiscono a quel fenotipo? Anche dopo enormi cambiamenti fenotipici in esperimenti di selezione artificiale, permane un certo livello di variabilità (interviene la selezione naturale contro i fenotipi estremi, e c e variabilità non additiva). Questa variabilità, insieme all accumulo per mutazione, e in natura ad altri fenomeni come la migrazione tra popolazioni distinte o diverse forme di selezione bilanciante (per esempio, fluttuazione nel fenotipo ottimale), fanno sì che la variabilità additiva a caratteri quantitativi tenda a restare elevata (tranne che in popolazioni molto piccole!),

Esempio di selezione direzionale

Esempio di selezione diversificante

Esempi di selezione stabilizzante Difficoltà durante il parto Nascite premature

Come identificare i loci che controllano i caratteri quantitativi (QTL)? - QTL mapping - Loci candidati