Ricerche Microbiologiche Standard del Regno Unito Test della Termonucleasi Emesso da Standards Unit, Microbiology Services, PHE Batteriologia Procedure -Test I TP 34. I Emissione no: 3 I Data emissione: 08.01.15 I. Pagina 1 di 13 Crown copyright 2015
Ringraziamenti Le Procedure Standard del Regno Unito per le Ricerche Microbiologiche (SMI - Standards for Microbiology Investigations) sono sviluppate sotto l'egida della Public Health England (PHE) in collaborazione con il Servizio Sanitario Nazionale (NHS - National Health Service), la Sanità Pubblica del Galles e con le organizzazioni professionali i cui loghi sono di seguito elencati sul sito web https://www.gov.uk/uk-standards-for-microbiology-investigations-smi-quality-and-consistencyin-clinical-laboratories. Le SMI sono sviluppate, revisionate e controllate da diversi gruppi di lavoro che sono supervisionati da un comitato direttivo (consultare https://www.gov.uk/government/groups/standards-for-microbiology-investigations-steeringcommittee). Si ringraziano per contributi forniti i numerosi operatori dei laboratori clinici, gli specialisti e i laboratori di riferimento che hanno fornito informazioni e commenti durante lo sviluppo di questo documento. Si ringraziano i Revisori Medici per le modifiche apportate ai contenuti clinici. Per ulteriori informazioni contattare: Standards Unit Microbiology Services Public Health England 61 Colindale Avenue London NW9 5EQ E-mail: standards@phe.gov.uk Website: https://www.gov.uk/uk-standards-for-microbiology-investigations-smi-quality-andconsistency-in-clinical-laboratories Le Procedure Standard del Regno Unito per le Ricerche Microbiologiche sono sviluppate con la collaborazione di: I loghi sono aggiornati al momento della pubblicazione Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 2 di 13
Contenuti RINGRAZIAMENTI... 2 CONTENUTI... 3 TABELLA MODIFICHE... 4 RICERCHE MICROBIOLOGICHE STANDARD DEL REGNO UNITO: SCOPO E OBIETTIVO... 5 SCOPO DEL DOCUMENTO... 8 INTRODUZIONE... 8 INFORMAZIONE TECNICA/LIMITAZIONI... 8 1 CONSIDERAZIONI SULLA SICUREZZA... 9 2 REAGENTI E STRUMENTAZIONE... 9 3 MICRORGANISMI PER CONTROLLO DI QUALITA'... 9 4 PROCEDURA E RISULTATI... 9 APPENDICE: TEST DELLA TERMONUCLEASI... 11 BIBLIOGRAFIA..... 12 NICE ha accreditato la procedura usata dalla Public Health England per elaborare gli Standards for Microbiology Investigations. L accreditamento è valido per 5 anni dal Luglio 2011. Informazioni più dettagliate sull accreditamento possono essere consultate: www.nice.org.uk/accreditation. Per ulteriori informazioni sul nostro accreditamento consultare: : www.nice.org.uk/accreditation Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 3 di 13
Tabella delle Modifiche Ciascun metodo SMI possiede una registrazione separata delle correzioni. Quelle attuali sono specificate in questa pagina. Le precedenti modifiche sono disponibili presso la standards@phe.gov.uk. I documenti nuovi o revisionati devono essere controllati in ciascun laboratorio in accordo con il sistema locale di gestione della qualità. Modifica No/Data. 5/08.01.15 Emissione eliminata. no 2.2 Emissione inserita no. 3 Sezione(i) interessate Documento intero. Pagina 2 Scopo del documento Considerazioni sulla Sicurezza Microrganismi Controllo di Qualità Procedure e Risultati Diagramma di flusso Bibliografia Modifica Collegamenti ipertestuali aggiornati a gov uk. Loghi aggiornati e aggiunti. Lo scopo è stato aggiornato e aggiunta bibliografia Bibliografia aggiornate. Il controllo negativo per il test termonucleasi è stato modificato; Staphylococcus haemolyticus NCTC 4276 è stato sostituito da Staphylococcus haemolyticus NCTC 11042.I microrganismi di controllo di qualità sono stati validati dalla NCTC. Informazioni e bibliografia aggiornate. Questo diagramma di flusso è stato modificato per facilitare la consultazione. Bibliografia in parte aggiornata. Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 4 di 13
Ricerche Microbiologiche Standard del Regno Unito # : Scopo e Obiettivo Utilizzatori delle SMI Nel Regno Unito le SMI sono principalmente destinate come risorsa generale ai professionisti che operano nel campo della medicina di laboratorio e delle malattie infettive. Le SMI forniscono ai clinici informazioni in merito allo standard dei servizi di laboratorio riferibili alle ricerche per la diagnosi delle infezioni nei loro pazienti e le documentazioni forniscono indicazioni che facilitano la prenotazione elettronica di tests appropriati. Le SMI forniscono gli standard per le ricerche microbiologiche anche ai responsabili della sanità pubblica che devono considerarle come parte delle procedure da adottare per la salute (sia clinica che pubblica) per la propria popolazione. Informazioni di Base per le SMI Le SMI comprendono algoritmi e procedure raccomandate che riguardano tutte le componenti del processo diagnostico dalla fase pre-analitica (sindrome clinica) alle diverse fasi analitiche (prove di laboratorio) e post-analitiche (interpretazione e comunicazione dei risultati). Gli algoritmi delle sindromi sono corredati da informazioni più dettagliate contenenti consigli sulle indagini per specifiche malattie e infezioni. Note orientative riguardano il contesto clinico, la diagnosi differenziale e indagini appropriate per particolari condizioni cliniche. Le note orientative descrivono metodologie di laboratorio essenziali che sono alla base della qualità, ad esempio la validazione della prova. La Standardizzazione del processo diagnostico conseguente all'adozione delle SMI consente di garantire in tutto il Regno Unito strategie d indagine equivalenti nei diversi laboratori ed è una condizione essenziale per interventi nel campo della sanità pubblica, della sorveglianza, e per le attività di ricerca e di sviluppo. Collaborazione Paritaria La preparazione e stesura delle SMI è effettuata mediante collaborazione paritaria fra PHE, NHS, Royal College of Pathologists e le organizzazioni professionali. L'elenco delle organizzazioni partecipanti può essere trovato su sito https://www.gov.uk/ukstandards-for-microbiology-investigations-smi-quality-and-consistency-in-clinical-laboratories. L'inclusione del logo di una organizzazione in una SMI implica il sostegno degli obiettivi e del processo di preparazione del documento. I rappresentanti delle organizzazioni professionali fanno parte del comitato direttivo e dei Gruppi di Lavoro che sviluppano le SMI. Le opinioni dei rappresentanti possono non essere rigorosamente conformi a quelle dei membri delle organizzazioni a cui appartengono né a quelle delle loro organizzazioni. I rappresentanti prescelti rappresentano uno strumento bidirezionale per la consultazione e dialogo. Le opinioni espresse sono ricercate con un processo di consultazione. Le SMI sono sviluppate, revisionate ed aggiornate con un ampio processo di consultazione # Microbiologia è usato come termine generico per includere le due specialità di Microbiologia Medica riconosciute dal GMC (General Medical Council), (che comprende Batteriologia, Micologia e Parassitologia) e la Virologia Medica. Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 5 di 13
Assicurazione di Qualità Il NICE (National Institute for Health and Care Excellence) ha accreditato la procedura utilizzata dai Gruppi di Lavoro per produrre le SMI L accreditamento è applicabile a tutte le linee guida prodotte dall Ottobre del 2009. La procedura per lo sviluppo delle SMI è certificata dalla ISO 9001:2008. Le SMI rappresentano una procedura standard di buona qualità pratica alla quale si devono attenere per la propria attività tutti i laboratori di microbiologia clinica e di sanità pubblica del Regno Unito. Le SMI sono accreditate dal NICE e non rappresentano gli standard minimi di attività, e neppure il più alto livello di complesse indagini di laboratorio disponibili nel Regno Unito. Utilizzando le SMI, i laboratori dovranno tenere conto delle esigenze locali e intraprendere ricerche addizionali qualora opportune. Le SMI aiutano i laboratori a soddisfare i requisiti dell accreditamento con la promozione di procedure d elevata qualità che possono essere verificate. Le SMI forniscono inoltre un punto di riferimento per lo sviluppo del metodo. Le prestazioni della SMI dipendono dal personale ben addestrato e dalla qualità dei reagenti e delle attrezzature utilizzate. I laboratori dovrebbero assicurare che tutti i reagenti di tipo commerciale e quelli messi a punto in laboratorio siano stati validati e risultati idonei allo scopo. I laboratori devono partecipare a programmi di valutazione di qualità esterni ed eseguire le relative procedure del controllo di qualità interno. Coinvolgimento del Paziente e della Comunità Nello sviluppo delle SMI i rispettivi Gruppi di Lavoro sono impegnati per favorire il coinvolgimento dei pazienti e dell opinione pubblica. Grazie al coinvolgendo pubblico, di operatori sanitari, ricercatori e organizzazioni di volontariato la SMI risultante sarà strutturalmente valida e atta a soddisfare le esigenze dell'utente. L opportunità di partecipazione per contribuire alla consultazione è estesa al pubblico con l accesso libero al nostro sito web Informazione della Gestione e dei Dati Sensibili La PHE è un organizzazione che condivide le direttive Caldicott. Ciò significa prendere ogni possibile precauzione per prevenire la diffusione non autorizzata di informazioni sui pazienti e di garantire che le informazioni relative agli stessi siano mantenute in condizioni di sicurezza. Lo sviluppo di metodi SMI è assoggetto agli obiettivi PHE di Uguaglianza https://www.gov.uk/government/organisations/public-health-england/about/equality-and-diversity. I Gruppi di Lavoro SMI sono impegnati a raggiungere gli obiettivi di parità di consultazione efficace con gli appartenenti al pubblico, i partner, le parti interessate ed i gruppi specialistici coinvolti. Dichiarazione Legale Mentre ogni cura è stata intrapresa per la preparazione delle SMI, PHE e ogni altra organizzazione di sostegno, deve, per quanto possibile in base a qualunque legge vigente, escludere la responsabilità per tutte le perdite, costi, reclami, danni o spese derivanti da o connessi all'uso di una SMI o con qualsiasi informazione ivi contenuta. Se si apportano modifiche a una SMI, si deve porre in evidenza dove e da chi sono state effettuate tali modifiche. Le conoscenze di base e la tassonomia microbica per la SMI sono le più complete possibili, al momento della pubblicazione. Eventuali omissioni e nuove informazioni saranno considerate nel corso della prossima revisione. Queste procedure standard (SMI) possono essere sostituite solo da revisioni dello standard, azione legislativa, o in seguito ad indicazioni da parte dell ente accreditato NICE. I diritti d autore delle SMI sono della Crown e questi dovrebbero essere riconosciuti quando appropriato. Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 6 di 13
Citazione Suggerita per questo Documento Public Health England. (2015). Thermonuclease Test. UK Standards for Microbiology Investigations. TP 34 Emissione 3. https://www.gov.uk/uk-standards-for-microbiologyinvestigations-smi-quality-and-consistency-in-clinical-laboratories Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 7 di 13
Scopo del Documento Test della Termonucleasi Questo è anche noto come test di stabilità al calore della nucleasi. Si tratta di una prova di 4 ore che evidenzia la produzione di DNAsi stabile al calore (termonucleasi) da parte di Staphylococcus aureus. E 'utilizzato anche per la differenziazione e e la conferma della presenza di DNAsi di S. aureus subsp aureus da quella prodotta da S. epidermidis o altri micrococchi 1. Si usa di preferenza per rilevare la presenza di S. aureus nei flaconi di emocoltura positivi 2. Questa SMI deve essere usata congiuntamente con le altre SMI Introduzione A differenza di altri stafilococchi, la maggior parte dei ceppi di S. aureus e Staphylococcus intermedius produce termonucleasi, una DNAsi stabile al calore. Le sottospecie di Staphylococcus schleiferi sono DNAsi positive e producono nucleasi stabili al calore. Il test della termonucleasi rileva la presenza di questo enzima. Il microrganismo è sottoposto al calore per distruggere le termonucleasi labili. Poi è inoculato in un terreno contenente DNA e blu di toluidina. Il DNA è degradato dal calore e le nucleasi stabili determinando cambiamento di colore del blu di toluidina che assume colore rosa o rosso. Informazioni Tecniche/Limitazioni L agar DNA blu di toluidina è soggetto a modificazioni e si deve controllare ogni lotto. Le sottospecie di Staphylococcus schleiferi e alcuni ceppi di Staphylococcus hyicus sono termonucleasi positive. Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 8 di 13
1 Considerazioni sulla Sicurezza 3-19 Fare riferimento alle attuali linee guida sulla manipolazione sicura di tutti i microrganismi descritti in questa SMI. Tutte le procedure che possono generare aerosol devono essere eseguite in cabina microbiologica di sicurezza. Le linee guida precedentemente esplicitate devono essere supplementate con la COSHH locale e con la valutazione del rischio. E essenziale la conformità alle normative postali e dei trasporti. 2 Reagenti e Strumentazione Colonie batteriche isolate che crescono su terreno solido O Emocoltura positiva contenente microrganismi con morfologia tipica degli stafilococchi alla colorazione Gram 2. Agar DNAsi preparato secondo il metodo di Lachica e al 1971 20. Ansa batteriologica con filo metallico diritto/ansa o, in alternativa, ansa monouso. Pipette Pasteur sterili Brodo Brain Heart Infusion Bagno termostatico 3 Microrganismi per Controllo di Qualità 20 Controllo Positivo Staphylococcus aureus NCTC 6571. Controllo Negativo Staphylococcus haemolyticus NCTC 11042. Nota: I ceppi non sono validati dal NCTC per dare questo risultato 4 Procedura e Risultati 4.1 Emocoltura e Metodo di Prova 2,21,22 Dispensare 2-3 ml di brodo sangue da emocoltura positiva in una provetta 13x100mm tappo sterile Riscaldare a 100 C per 15 min e raffreddare a temperatura ambiente. Centrifugare a 1000 x g per 10 min e raccogliere il liquido supernatante. Ricavare pozzetti di 6 mm di diametro nella piastre contenenti terreno DNA blu di toluidina (massimo 12 pozzetti per piastra) e riempire ciascuno di loro con il supernatante da emocolture diverse o con i controlli. In alternativa, possono essere inserite nei pozzetti emocolture bollite (non supernatante). Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 9 di 13
I pozzetti di controllo Positivo e Negativo devono essere saggiati in ogni piastra contemporaneamente ai campioni Incubare a 35-37 C ed esaminare ogni ora per un massimo di 4 ore. Esaminate la piastra a 1 ora, 2 ore, 4 ore dopo incubazione notturna se negativo dopo 4 ore 4.2 Metodo di Prova con Colonia Inoculare alcune colonie in 1 ml di brodo Brain Heart Infusion. Incubare a 35-37 C per 2 ore Riscaldare la sospensione a 100 C per 15 min. Lasciare raffreddare a temperatura ambiente Ricavare pozzetti di 6 mm di diametro (utilizzando l estremità smussata di una pipetta sterile) nelle piastre contenenti terreno DNA blu di toluidina (massimo 12 pozzetti per piastra). Riempire ogni pozzetto con la sospensione di brodo raffreddato. Incubare a 35-37 C ed esaminare ogni ora per un massimo di 4 ore. Interpretazione Risultato positivo Area rosa e chiarificazione al bordo del pozzo con anello blu scuro alla periferia esterna di questa zona; indica attività termonucleasi e che il microorganismo è uno Staphylococcus aureus. Risultato negativo Nessun area modificata o di ridotte dimensioni per chiarificazione attorno al pozzetto. O. Nessun cambiamento di colore Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 10 di 13
Appendice: Test della Termonucleasi Il diagramma di flusso è solo indicativo Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 11 di 13
Bibliografia 1. MacFaddin JF. Deoxyribonuclease and Thermonuclease Tests. Biochemical Tests for Identification of Medical Bacteria. 3rd ed. Philadelphia: 2000. p. 137-59. 2. Madison BM, Baselski VS. Rapid identification of Staphylococcus aureus in blood cultures by thermonuclease testing. J Clin Microbiol 1983;18:722-4. 3. European Parliament. UK Standards for Microbiology Investigations (SMIs) use the term "CE marked leak proof container" to describe containers bearing the CE marking used for the collection and transport of clinical specimens. The requirements for specimen containers are given in the EU in vitro Diagnostic Medical Devices Directive (98/79/EC Annex 1 B 2.1) which states: "The design must allow easy handling and, where necessary, reduce as far as possible contamination of, and leakage from, the device during use and, in the case of specimen receptacles, the risk of contamination of the specimen. The manufacturing processes must be appropriate for these purposes". 4. Official Journal of the European Communities. Directive 98/79/EC of the European Parliament and of the Council of 27 October 1998 on in vitro diagnostic medical devices. 7-12-1998. p. 1-37. 5. Health and Safety Executive. Safe use of pneumatic air tube transport systems for pathology specimens. 9/99. 6. Department for transport. Transport of Infectious Substances, 2011 Revision 5. 2011. 7. World Health Organization. Guidance on regulations for the Transport of Infectious Substances 2013-2014. 2012. 8. Home Office. Anti-terrorism, Crime and Security Act. 2001 (as amended). 9. Advisory Committee on Dangerous Pathogens. The Approved List of Biological Agents. Health and Safety Executive. 2013. p. 1-32 10. Advisory Committee on Dangerous Pathogens. Infections at work: Controlling the risks. Her Majesty's Stationery Office. 2003. 11. Advisory Committee on Dangerous Pathogens. Biological agents: Managing the risks in laboratories and healthcare premises. Health and Safety Executive. 2005. 12. Advisory Committee on Dangerous Pathogens. Biological Agents: Managing the Risks in Laboratories and Healthcare Premises. Appendix 1.2 Transport of Infectious Substances - Revision. Health and Safety Executive. 2008. 13. Centers for Disease Control and Prevention. Guidelines for Safe Work Practices in Human and Animal Medical Diagnostic Laboratories. MMWR Surveill Summ 2012;61:1-102. 14. Health and Safety Executive. Control of Substances Hazardous to Health Regulations. The Control of Substances Hazardous to Health Regulations 2002. 5th ed. HSE Books; 2002. 15. Health and Safety Executive. Five Steps to Risk Assessment: A Step by Step Guide to a Safer and Healthier Workplace. HSE Books. 2002. 16. Health and Safety Executive. A Guide to Risk Assessment Requirements: Common Provisions in Health and Safety Law. HSE Books. 2002. 17. Health Services Advisory Committee. Safe Working and the Prevention of Infection in Clinical Laboratories and Similar Facilities. HSE Books. 2003. Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 12 di 13
18. British Standards Institution (BSI). BS EN12469 - Biotechnology - performance criteria for microbiological safety cabinets. 2000. 19. British Standards Institution (BSI). BS 5726:2005 - Microbiological safety cabinets. Information to be supplied by the purchaser and to the vendor and to the installer, and siting and use of cabinets. Recommendations and guidance. 24-3-2005. p. 1-14 20. Lachica RV, Genigeorgis C, Hoeprich PD. Metachromatic agar-diffusion methods for detecting staphylococcal nuclease activity. Appl Microbiol 1971;21:585-7. 21. D.Baird. Staphylococcus: Cluster-forming Gram-positive cocci. In: JG Collee, AG Fraser, BP Marmion, A Simmons, editors. Mackie & McCartney Practical Medical Microbiology. 14th Edition ed. New York: Churchill Livingstone; 1996. p. 245-62. 22. Kaplan NM. Use of thermonuclease testing to identify Staphylococcus aureus by direct examination of blood cultures. East Mediterr Health J 2003;9:185-90. Batteriologia Test - Procedure I TP 34.I Emissione no: 3 Data emissione 08.01.15 Pagina: 13 di 13