Regolato da un complesso network di geni
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- Alfredo Bellucci
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1 I INDUZIONE FIORALE
2 La transizione fiorale è uno dei più drastici cambiamenti che si hanno nel ciclo vitale di una pianta MAV dalla produzione di foglie passa alla formazione del fiore Cambiamento brusco e irreversibile Regolato da un complesso network di geni Il momento in cui si determina la transizione è determinato da una serie di fattori: AMBIENTALI ed ENDOGENI
3 Induzione fiorale: insieme degli eventi che avvengono nel MAV e portano alla produzione di fiori Fattori interni: regolazione autonoma p. es età della pianta Stimoli esterni: fotoperiodismo vernalizzazione Regolazione del tempo di fiorirura
4 induzione FPI FMI ABCDE
5 GENI DI INDUZIONE FIORALE (vie fotoperiodo vernalizzazione, autonoma ormonale) GENI INTEGRATORI DEI PATHWAYS DI INDUZIONE FIORALE (FPI) GENI DI IDENTITA MERISTEMATICA (FMI) GENI DI IDENTITA DEGLI ORGANI DEL FIORE (ABCDE)
6 MERISTEMA DELL APICE VEGETATIVO: TRE STADI DI SVILUPPO Fase giovanile Fase adulta vegetativa Fase adulta riproduttiva Da fase giovanile ad adulta vegetativa cambiamenti nella morfologia, fillotassi, più evidenti nelle specie arboree perenni
7 Hedera helix Acacia heterophylla
8 I cambiamenti di fase sono influenzati da segnali trasmissibili: rifornimento di carboidrati (saccarosio), ormoni (gibberelline).
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10 INDUZIONE FIORALE: COMPETENZA DETERMINAZIONE Competente: in grado di rispondere allo stimolo Determinato : in grado di eseguire il programma di sviluppo anche se rimosso dal contesto fisiologico normale
11 ESPERIMENTI CON INNESTI La gemma fiorisce anche se innestata su una pianta in stato vegetativo che non produce stimolo fiorale
12 Acquisita la competenza il meristema aumenta la tendenza alla fioritura con l età (numero di foglie)
13 Tra i fattori induttivi della fioritura : DURATA DEL GIORNO le piante percepiscono la durata del giorno gli organismi misurano il tempo OROLOGIO BIOLOGICO I ritmi circadiani sono un esempio di orologio biologico
14 I RITMI CIRCADIANI ritmi fisiologici endogeni di piante e animali associati alla durata del giorno negli animali: ciclo veglia/sonno piante: posizione delle foglie, apertura/chiusura stomi, petali, fotosintesi
15 RITMO CIRCADIANO NEI MOVIMENTI DIURNI DELLE FOGLIE DI Albizzia
16 I ritmi endogeni assumono la forma di onde sinusoidali descrivibili in termini matematici da grandezze come periodo, fase, ampiezza
17 Se trasferiti in luce o buio continui molti di questi ritmi permangono per un certo tempo ma tendono a sfasarsi rispetto al periodo di 24 h RITMI ENDOGENI e durano circa 24 ore CIRCA DIEM
18 In condizioni naturali questi ritmi sono sincronizzati ad un periodo di 24 ore mediante segnali ambientali: Il segnale ambientale più importante è la luce Transizioni: luce /buio (tramonto) buio/luce (alba)
19 Lo scorrimento di fase sincronizza il ritmo circadiano con differenti cicli giorno/notte
20 impulsi di luce nel periodo di buio inducono cambiamenti nella fase del ritmo Un impulso dato nelle prime ore della notte soggettiva RITARDA il ritmo Impulso interpretato come fine del giorno precedente Un impulso dato nelle ultime ore della notte soggettiva AVANZA la fase del ritmo Impulso interpretato come inizio del giorno successivo gli spostamenti di fase sincronizzano il ritmo endogeno con diversi cicli giorno/notte.
21 La sensibilità del ritmo ai segnali ambientali è variabile: a seconda del momento nella notte soggettiva o del giorno soggettivo uno stimolo può provocare un avanzamento o un ritardo della fase oppure essere inefficace La capacità dell ambiente di resettare l orologio circadiano è sotto il controllo dell orologio stesso
22 I ritmi endogeni sono molto diffusi in natura: perché? sono un meccanismo adattativo che consente agli organismi di rispondere al tempo opportuno al cambiamento delle condizioni ambientali Le piante crescono meglio quando il loro ritmo endogeno coincide con quello ambientale
23 Un sistema circadiano nella sua formulazione più semplificata, si può considerare composto da un oscillatore endogeno (central clock) che genera il ritmo e produce delle risposte (outputs) attraverso specifiche vie di trasduzione (signaling pathways) L oscillatore può essere resettato da segnali ambientali come luce o temperatura risposte
24 NEGLI ULTIMI ANNI STUDI DI BIOLOGIA MOLECOLARE E DI GENETICA (mutanti) SULLA PIANTA MODELLO ARABIDOPSIS HANNO PORTATO ALL INDIVIDUAZIONE DI ALCUNI DEI COMPONENTI MOLECOLARI DELL OSCILLATORE ENDOGENO
25 TOC1 Piantine trasformate con il gene della luciferasi sotto il controllo del promotore del gene LHCB (CAB) sistema gene reporter Il gene LHCB esibisce un ritmo giornaliero di espressione la luciferasi in presenza di luciferina genera bioluminescenza IDENTIFICATI mutanti toc (timing of LHCB (CAB) expression) In questi mutanti si ha perdita del ritmo giornaliero di espressione del gene toc1 componente dell oscillatore centrale
26 Pianta di tabacco trasformata con PHYB:LUC, con le foglie sincronizzate su ritmi opposti di 12 ore luce: 12 ore buio
27 Inoltre isolati i mutanti : CCA1 (CIRCADIAN CLOCK-ASSOCIATED1) LHY (LATE ELONGATED HYPOCOYLS) Sono fattori di trascrizione MYB Mutazioni recessive o espressione costitutiva determinano la perdita del ritmo giornaliero della espressione di diversi geni CCA1 e LHY componenti dell oscillatore
28 I meccanismi molecolari di base dell oscillatore endogeno sono conservati nei diversi organismi (piante, animali) Si basano sull esistenza a di loops trascrizionali con regolatori positivi e negativi in cui un componente controlla la sua espressione regolando quella degli altri componenti
29 modello dell oscillatore centrale in arabidopsis morning genes (LHCB) + - evening genes luce + +
30 modello dell oscillatore centrale in arabidopsis
31 Pathways di input sincronizzazione con alternanza giorno/notte Circadian clock system Oscillatore centrale genera ritmi di circa 24 ore Pathways di output effetti biochimici, fisiologici, sviluppo: p es Fioritura
32 Per funzionare correttamente l oscillatore deve essere sincronizzato con i cicli giornalieri giorno/notte dell ambiente FOTORECETTORI (fitocromi, criptocromi ELF3, TIC) Piante mutanti phya in luce rossa debole: ritmo rallentato Piante mutanti phyb in luce rossa continua: ritmo alterato CRY1 CRY2 coinvolti nella sincronizzazione mediata da luce blu
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34 Alcuni adattamenti fisiologici delle piante avvengono su una dimensione temporale stagionale piuttosto che giornaliera; un esempio tipico è la fioritura
35 La fioritura e un fenomeno fotoperiodico il cambiamento della lunghezza del giorno può determinare l inizio di un determinato processo fioritura riproduzione asessuale formazione organi di riserva dormienza
36 FOTOPERIODISMO: capacità di misurare la lunghezza del giorno per produrre una risposta fisiologica in un determinato momento dell anno I ritmi circadiani e il fotoperiodismo hanno la proprietà comune di rispondere a cicli giorno/notte
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38 La risposta fotoperiodica è influenzata dalla latitudine alla quale la pianta cresce Effetto della latitudine sulla durata del giorno
39 Le piante possono essere classificate secondo la loro risposta fotoperiodica rispetto alla fioritura
40 E CRITICA LA DURATA DEL PERIODO DI BUIO
41 Fioritura ritmica in risposta a interruzioni del buio nella SOIA (SPD) (8h luce; 64buio) Int 26 h= massima fioritura Int 40 h= fioritura nulla
42 DURANTE IL PERIODO DI BUIO SI ALTERNANO FASI DI SENSIBILITA E DI INSENSIBILITA ALLA LUCE Nelle SPD la fioritura è indotta se l interruzione del buio (alba) avviene dopo il completamento della fase sensibile alla luce Nelle LPD si ha fioritura se l interruzione della notte coincide con la fase sensibile alla luce
43 La fioritura è un fenomeno fotoperiodico ed è fondamentale la misura del trascorrere del tempo durante il periodo di buio Ipotesi dell orologio (Bunning 1936) La misura del tempo fotoperiodico si basa su di un ritmo circadiano in cui si alternano fasi di sensibilità e fasi di insensibilità alla luce La capacità del segnale luminoso di indurre la fioritura dipende dalla fase del ritmo endogeno in cui il segnale viene recepito
44 Quando il segnale luminoso è percepito durante la fase sensibile del ritmo si può avere induzione della fioritura (LDP) inibizione della fioritura (SDP) SDP: fioritura se l impulso è recepito DOPO il completamento della fase sensibile LDP: fioritura se l impulso è recepito DURANTE la fase sensibile
45 MODELLO DELLA COINCIDENZA ESTERNA LPD: L ESPOSIZIONE ALLA LUCE DEVE ESSERE COINCIDENTE CON LA FASE SENSIBILE DEL RITMO ENDOGENO
46 COINCIDENZA ESTERNA L orologio circadiano genera una fase inducibile dalla luce durante il ciclo giorno/notte La fioritura si ha quando una particolare durata del giorno espone le piante alla luce durante la fase inducibile L interazione tra il ritmo circadiano e la luce avviene a livello della trascrizione del gene CONSTANS (CO) e della stabilità della proteina espressa CONSTANTS determina direttamente la trascrizione del gene FLOWERING LOCUS T (FT) che è un potente induttore della FIORITURA
47
48 Nel normale ciclo giorno/notte il mrna di CO mostra un ritmo giornaliero In condizioni di SD si hanno elevati livelli di CO mrna solo di notte In condizioni di LD elevati livelli di CO mrna si raggiungono alla fine del periodo di luce I livelli di CO mrna determinano la FASE INDUCIBILE dalla luce
49 Modello della COINCIDENZA ESTERNA La luce ha due funzioni: resetta l orologio circadiano in modo da generare oscillazioni giornaliere di un regolatore chiave della fioritura con picco nel tardo pomeriggio regola l attività di questo componente chiave
50 Deve esserci COINCIDENZA tra l accumulo di mrna del gene CO e la luce del giorno In modo da consentire l accumulo della proteina CO
51 Fioritura di Arabidopsis in condizioni di LD
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54 Come viene generato il ritmo giornaliero dei livelli della proteina CO? PhyB promuove la riduzione dei livelli di CO al mattino PhyA e criptocromi stabilizzano la proteina CO alla fine del giorno Durante la notte CO è degradato secondo un meccanismo indipendente
55 Induzione della fioriura in LPD e SPD Hd1: ortologo di CO ma è un inibitore della fioritura Hd3a ortologo di FT
56 .
57 Il segnale fotoperiodico è percepito nelle foglie e trasmesso all apice meristematico IPOTESI DEL FLORIGENO
58 CO è espresso nel sistema vascolare delle foglie (cellule compagne del floema) CO promuove fioritura se espresso nelle foglie ma non se espresso nel MAV
59 FT è il FLORIGENO mrna di FT e la proteina possono migrare dalle foglie al SAM FT si lega al fattore di trascrizione FD espresso nel MAV Il complesso FT/FD attiva la trascrizione dei geni di identità meristematica (FMI) che determinano la transizione fiorale
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61 FT SOC1 LEAFY FPI FMI ABC LEAFY CAL AP1
62 Pathway ormonale GA determinano la fioritura precoce in assenza di condizioni fotoperiodiche induttive (giorno corto per Arabidopsis) In Arabidopsis la fioritura in condizioni non induttive è promossa dalla somministrazione di GA e ritardata da inibitori biosintetici pathway indipendente da quelli fotoperiodico e vernalizzazione
63 VERNALIZZAZIONE Alcune specie per fiorire o per accelerare la fioritura richiedono l esposizione ad un periodo di basse temperature
64 Studi negli anni 60 su Thlaspi arvense vernalizzazione dell apice Il sito di percezione del freddo è il meristema apicale vegetativo
65 Esistono diverse varietà di arabidopsis in quanto al tempo di fioritura a fioritura tardiva, con vernalizzazione (invernale annuale) (germinano in estate e fioriscono in primavera) a fioritura precoce (estiva annuale) (germinano e fioriscono nella stessa estate) non vernalizzata vernalizzata Fioritura precoce Fioritura tardiva Fioritura precoce
66 la differenza a livello molecolare è determinata dalla variazione allelica di FRIGIDA (FRI) FLOWERING LOCUS (FLC) annuali invernali hanno alleli dominanti di FRI e FLC varietà precoci hanno alleli fri non funzionali o flc deboli FRI e FLC agiscono sinergicamente
67 FLC è un inibitore della fioritura FRI è un modulatore positivo della espressione di FLC
68 REGOLAZIONE EPIGENETICA METILAZIONE DEGLI ISTONI FLC
69 Modificazioni covalenti della cromatina come metilazione e acetilazione di residui specifici di istoni costituiscono il codice istonico Fornisce un livello ulteriore di controllo della trascrizione genica che affianca quello esercitato dai fattori di trascrizione nucleosoma Ingombro sterico decondensazione della cromatina
70 REGOLAZIONE DELLA TRASCRIZIONE DI FLC Meccanismo epigenetico La ipermetilazione H3-K4 della cromatina di FLC è associata con il ritardo della fioritura nelle varietà invernali-annuali di arabidopsis
71 H3-K9 metilazione Repressione della trascrizione H3-K4 metilazione evolutivamente conservata e associata a geni trascritti
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73 In varietà annuali invernali di arabidopsis contenenti l allele FRI la cromatina di FLC ha elevati livelli di H3-K4 metilazione in confronto a specie precoci che hanno un allele FRI non funzionante (fri) FRI è un promotore della H3-K4 metilazione di FLC
74 Come agisce la vernalizzazione? Identificati tre geni coinvolti VERNALIZATION1 (VRN1) VERNALIZATION2 (VRN2) VERNALIZATION INSENSITIVE (VIN3)
75 Dall analisi di mutanti insensibili a vernalizzazione, cioè a fioritura tardiva anche dopo un periodo prolungato di freddo Individuati tre mutanti: Vernalization1 (vrn1) Vernalization2 (vrn2) Vernalization insensitive (vin3) In vrn1 e vrn2 FLC è represso al freddo ma la repressione non è stabile a temperature normali In vin3 FLC non è represso dalla vernalizzazione vin3 è responsabile per la repressione inizale di FLC; vrn1 e vrn2 per il mantenimento
76 Studi recenti dimostrano che la vernalizzazione determina modificazioni che convertono la cromatina di FLC in eterocromatina, inattiva nella trascrizione Durante la vernalizzazione le code degli istoni della cromatina di FLC vengono deacetilate e in seguito si ha un aumento della H3-K9 e K27 metilazione La modificazione è mantenuta con il ritorno a temperature più elevate Dall analisi dei mutanti e dalle informazioni sulla struttura dei geni vrn1, vrn2, e vin3, elaborato un modello
77 Modello per la repressione della espressione di FLC da VERNALIZZAZIONE Indotta da freddo
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