Emoglobina e mioglobina

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Transcript:

Emoglobina e mioglobina

Per poter parlare in modo comprensibile dell emoglobina (Hb), è utile occuparsi prima della mioglobina (Mb) che è molto simile all emoglobina ma è molto più semplice. Tra emoglobina e mioglobina ci sono stringenti relazioni di parentela: entrambe sono proteine coniugate ed il loro gruppo prostetico (parte non proteica) è il gruppo eme. La mioglobina è una proteina globulare costituita da una singola catena di circa centocinquanta amminoacidi (dipende dall organismo) ed il suo peso molecolare è di circa 18 Kd. E dotata di un gruppo eme che è inserito in una porzione idrofobica (o lipofila) della proteina, costituita da ripiegamenti riconducibili alle strutture α- elica delle proteine fibrose. La mioglobina, ma anche l emoglobina, è composta principalmente da segmenti di α-eliche, presenti in numero di otto e consiste, quasi esclusivamente, di residui non polari (leucina, valina, metionina e fenilalanina) mentre sono praticamente assenti i residui polari (acido aspartico, acido glutammico, lisina e arginina); gli unici residui polari sono due istidine, che svolgono un ruolo fondamentale per l attacco dell ossigeno al gruppo eme. Il gruppo eme è un gruppo cromoforo (assorbe nel visibile) ed è il gruppo funzionale della mioglobina.

La mioglobina è una proteina tipica dei muscoli (ma non si trova solo nei muscoli). La mioglobina si estrae dal capodoglio in cui è presente in gran quantità e poi viene purificata. La mioglobina lega in maniera reversibile l ossigeno ed è presente nei tessuti periferici in percentuale tanto maggiore quanto più quel tessuto è abituato a lavorare con approvigionamenti di ossigeno distanti nel tempo.

L emoglobina ha molte analogie strutturali con la mioglobina ed è in grado di legare l ossigeno molecolare in modo reversibile; ma, mentre la mioglobina è confinata nei muscoli e nei tessuti periferici in generale, l emoglobina si trova negli eritrociti o globuli rossi (sono pseudo cellule cioè non sono cellule vere e proprie) che costituiscono il 40 % del sangue. Contrariamente alla mioglobina il lavoro dell emoglobina è quello di prelevare ossigeno nei polmoni, rilasciarlo nelle cellule ove ce ne sia bisogno, prelevare parte dell anidride carbonica e rilasciarla nel polmoni, dove il ciclo ricomincia.

Un po di chimica L'eme è un anello tetrapirrolico (protoporfirina) presenta: - quattro anelli pirrolici tenuti insieme da gruppi metilenici (-CH=); - due gruppi vinilici (CH2=CH), - quattro gruppi metilici (-CH3) e - due propionici (-CH2-CH2-COO-). Il legame tra protoporfirina e ferro è un legame tipico dei composti detti di coordinazione che sono composti chimici in cui un atomo (o ione) centrale, forma dei legami con altre specie chimiche in numero superiore al suo numero di ossidazione (carica elettrica). Nel caso dell eme, tali legami sono reversibili e deboli. Il numero di coordinazione (numero di legami di coordinazione) del ferro è sei: ci possono essere sei molecole attorno al ferro che mettono in condivisione gli elettroni di legame. Per formare un composto di coordinazione, ci vogliono due orbitali con orientamento corretto: uno in grado di "acquistare" elettroni e l altro in grado di donarli

2 1 3 4

propionici metilici vinilici

1 2 4 3

Nell eme, il ferro forma: Il ferro nell eme - quattro legami planari con i quattro atomi di azoto che si trovano al centro dell anello della proto-porfirina ed - un quinto legame con un azoto dell istidina prossimale; il ferro ha il sesto legame di coordinazione libero e può legarsi all ossigeno. Quando il ferro è sottoforma di ione libero, i suoi orbitali di tipo d hanno tutti la stessa energia; nell eme, lo ione ferro è legato alla protoporfirina e all istidina: tali specie perturbano magneticamente gli orbitali d del ferro; l entità della perturbazione sarà diversa per i vari orbitali d a seconda del loro orientamento spaziale e di quella delle specie perturbanti. Dato che l energia totale degli orbitali deve rimanere costante, la perturbazione causa una separazione energetica tra i vari orbitali: l energia acquisita da alcuni orbitali, equivale all energia persa dagli altri. A rendere più o meno rossa la carne è il contenuto di emoproteine (è l eme che rende rossa la carne).

Struttura a 8 segmenti alfa dalla A alla H Con raccordi non alfa: gomiti e della emoglobina

Fe +2 +O 2 Fe +3 Il Fe è protetto dalla gabbia globinica e solo un e - viene trasferito all O

Tasca idrofobica per l eme

Emoglobina - L Hb contenuta nei globuli rossi incrementa da 5 ml a 250 ml (50 volte) la capacità di trasporto dell O 2 in un litro di sangue. - In presenza di O 2 si estrae 18 volte più Energia che in sua assenza. - La mioglobina serve da riserva di O 2 permette il movimento dell O 2 dalla superficie della cellula al mitocondrio. - Se l O 2 fosse trasportato alle cellule per semplice diffusione, la dimensione massima di un organismo aerobio sarebbe di 1 mm.

EMOGLOBINA E La 1^ proteina di cui è stato determinato il PM con accuratezza; - è un tetramero, 4 sub. 2-alfa e 2- beta (141 e 146 aa rispettivamente). - in cui è stata identificata una patologia molecolare; - la 1^ in cui è stata definita la struttura utilizzando la diffrazione ai raggi X. La cooperatività del suo legame all O 2 ha fornito un modello per la comprensione di molte regolazioni enzimatiche

Emoglobina umana alfa2(rosso) beta2 (giallo)

Legame cooperativo Quando una proteina è funzionalmente attiva, può mutare la sua forma senza indurre cambi conformazionali nelle proteine vicine; (mioglobina ossigenata non influenza le mioglobine vicine). Invece in proteine associate come l emoglobina: quando una catena si ossigena e cambia la sua forma tale modificazione si ripercuote sulle altre catene del tetrametro. le altre catene del tetrametro assumono un "atteggiamento meno ostile" nei riguardi dell ossigeno: la difficoltà con cui una catena si ossigena diminuisce man mano che le catene ad essa vicine si ossigenano a loro volta. Lo stesso discorso è valido per la deossigenazione.

La struttura quaternaria della deossiemoglobina prende il nome di : forma T (tesa) mentre quella della ossiemoglobina viene chiamata forma R (rilasciata); nello stato teso vi sono una serie di interazioni elettrostatiche piuttosto forti tra amminoacidi acidi e amminoacidi basici che portano ad una struttura rigida della deossiemoglobina (ecco il perché del "forma tesa"), mentre quando si lega l ossigeno, l entità di queste interazioni diminuisce (ecco il perché del "forma rilasciata"). Inoltre, in assenza di ossigeno, la carica dell istidina (vedi struttura) viene stabilizzata dalla carica opposta dell acido aspartico mentre, in presenza di ossigeno, c è la tendenza da parte della proteina, a perdere un protone; tutto ciò comporta che l emoglobina ossigenata sia un acido più forte dell emoglobia deossigenata: effetto bohr

Deossiemoglobina (forma T) ph 6,0 Tessutale Asp94 His146

EFFETTO Bohr CO 2 +H 2 O HCO -3 +H + HB + O 2 Hb-4O 2 Hb-nH + +4O 2 Hb-4O 2 + nh+ L Hb trasporta l O 2, ma anche H + e CO 2, i siti di legame sono diversi e rispettivamente: L eme per l O 2, l istidina 146 della sub.β per l H + (quando protonate formano un ponte con le Asp 94) e gli NH 3+ terminali per la CO 2

Effetto Bohr: ph le Istidine-146 C terminali delle catene β, nella deossi- Hb formano un ponte salino con le Asp-94, se l anello dell Istidina è protonato stabilizzando la forma deossi; il ponte salino non si forma nell Hb- 4O 2 perché l Ist-146 non è protonata. Si intensifica l effetto Bohr per aumento di H + si producono cariche negative che permettono la formazione di altri ponti salini, stabilizzando la forma deossi.

L anidride carbonica diffonde nell eritrocita passando per la membrana plasmatica; dato che gli eritrociti costituiscono circa il 40% del sangue, dovremmo aspettarci che solo il 40% dell anidride carbonica che diffonde dai tessuti entri in essi, in realtà il 90% dell anidride carbonica entra negli eritrociti perché essi contengono un enzima che converte l anidride carbonica in acido carbonico, ne risulta che la concentrazione stazionaria di anidride carbonica negli eritrociti sia bassa e perciò è elevata la velocità di ingresso. CO 2 +H 2 O HCO -3 +H +

L emoglobina in arrivo ad un tessuto si trova allo stato rilasciato (legato all ossigeno), ma in prossimità del tessuto, viene carbossilata e passa allo stato teso: la proteina in tale stato, ha minore tendenza a legarsi con l ossigeno, rispetto allo stato rilasciato, perciò l emoglobina libera ossigeno al tessuto; inoltre, per reazione fra acqua e anidride carbonica, si ha produzione di ioni H+ e quindi ulteriore ossigeno per effetto bohr.

Effetto della CO 2 : Due meccanismi per alterare l affinità della Hb per l O 2 : - Effetto Bohr (influenza della modifica del ph) - Formazione dei carbammati dei gruppi N terminali delle 4 catene proteiche dell Hb. R-NH 2 + CO 2 <-> R-N-COO - + H + H I gruppi amminoterminali sono posti alle interfacce dei dimeri alfa-beta che una volta carbossilati stabiliscono legami salini che stabilizzano la forma T.

Vi sono altri fattori che possono influire sulla capacità dell emoglobina di legarsi all ossigeno, uno di questi è la concentrazione di 2,3 bisfosfoglicerato. Il 2,3 bisfosfoglicerato è un metabolica presente negli eritrociti in concentrazione 4-5 mm (in nessun altra parte dell organismo è presente in concentrazione così elevata. A ph fisiologico, il 2,3 bisfosfoglicerato è deprotonato ed ha su di sé cinque cariche negative; si va ad incuneare tra le due catene beta dell emoglobina perché tali catene presentano un elevata concentrazione di cariche positive. Le interazioni elettrostatiche tra le catene beta ed il 2,3 bisfosfoglicerato conferiscono una certa rigidità al sistema: si ottiene una struttura tesa che ha scarsa affinità per l ossigeno; durante l ossigenazione, poi, il 2,3 bisfosfoglicerato viene espulso. Negli eritrociti c è un apparato apposito che converte l 1,3 bisfosfoglicerato (prodotto dal metabolismo) in 2,3 bisfosfoglicerato in modo che esso raggiunga una concentrazione di 4-5 mm e che quindi l emoglobina sia in grado di scambiare l ossigeno nei tessuti.

2,3-Bifosfoglicerato Effettore allosterico presente in concentrazioni variabili nella cellula (g. rosso) si lega con alta affinità in una nicchia prodotta da aa. con cariche +, il suo ruolo è quello di stabilizzare la forma deossi con conseguente maggior rilascio di ossigeno. Permette l adattamento immediato ad alte quote, e l utilizzo dell ossigeno materno dal feto Hb fetale due catene α e due catene γ al posto delle β. Le catene γ hanno Ser al posto His 143, questo elimina due cariche positivo dal sito per il BPG, riducendone l affinità, l assenza di BPG fa aumentare l affinità dell Hb fetale a scapito di quella materna

L altro fenomeno che si verifica quando un eritrocita raggiunge un tessuto è il seguente: per gradiente, l HCO3- (derivato dell anidride carbonica) esce dall eritrocita e, per bilanciare l uscita di una carica negativa, si ha l ingresso di cloruri che determina un aumento della pressione osmotica: per bilanciare questa variazione si verifica anche l ingresso di acqua che causa un rigonfiamento dell eritrocita (effetto HAMBURGER). Il fenomeno opposto si verifica quando un eritrocita raggiunge gli alveoli polmonari: si ha uno sgonfiamento degli eritrociti (effetto HALDANE). Quindi gli eritrociti venosi (diretti ai polmoni) sono più rotondi di quelli arteriosi.

1 Torr. La pressione esercitata da una colonnina di mercurio di 1 mm. in condizioni standard.

Nello sviluppo di un essere umano vi sono dei geni che vengono espressi solo per un determinato periodo di tempo; per tale motivo si hanno emoglobine diverse: fetali, embrionali, dell uomo adulto. Le catene che costituiscono queste diverse emoglobine, hanno delle strutture differenti, ma con delle similitudini, infatti la funzione che svolgono è più o meno la stessa.

Curva

La sigmoide (cooperativa) È una curva ibrida, risultato di forme a diversa affinità La forma della curva fa capire che l Hb è sensibile a piccole variazioni di concentrazione di O. L Hb è un trasportatore, la Mb un serbatoio

A livello polmonare: ph 7.6 con una pp di O 2 di 100mM di Hg A livello tissutale: ph 7.2 20 mm di Hg rilascia il 77%, senza variazione di ph Solo il 66% 7.6 ph del sangue nei polmoni 7.2 nei tessuti,

Hb-nH + +4O 2 Hb-4O 2 + nh + CO 2 + H 2 O HCO 3 +H +

Effetto Bohr: le Istidine-146 C terminali delle catene β, nella deossi- Hb formano un ponte salino con le Asp-94 l anello dell Istidina è protonato stabilizzando la forma deossi; il ponte salino non si forma nell Hb- 4O 2 perché l Ist-146 non è protonata. Si intensifica l effetto Bohr per aumento di H + si producono cariche negative che permettono la formazione di altri ponti salini, stabilizzando la forma deossi.

Effetto della CO 2 : Due meccanismi per alterare l affinità della Hb per l O 2 : - Effetto Bohr (influenza della modifica del ph) -Formazione dei carbammati dei gruppi N terminali delle 4 catene proteiche dell Hb. La CO 2 viene trasportata dai tessuti ai polmoni soprattutto come ione bicarbonato e in bassa % dal legame con l N-terminale delle globine. I gruppi amminoterminali sono posti alle interfacce dei dimeri alfa-beta che una volta carbossilati stabiliscono legami salini che stabilizzano la forma T.

po 2 nei tessuti po 2 nei polm. (4500m slm) po 2 nei polm. a l. del mare variare fa 5mM a livello del mare 8mM in alta montagna.

5mM a livello del mare 8mM in alta montagna. 0mM l Hb lega l O con alta affinità A livello del mare l Hb è saturata nei polmoni(100mmhg), nei tessuti (20mmHg), quindi trasferisce il 70% di O 2. La saturazione dell Hb scende del 30% con l altitudine, con l aumento di BPG ritorna normale.

La catena γ presenta una ser al posto di una his in posizione 143, l HbF ha quindi 2 cariche+ in meno nella sua cavità centrale, ha quindi bassa affinità per il 2,3BPG e una maggiore affinità per l ossigeno dell HbM

Hb Hammersmith [Phe(42)βSer] La Ser permette all H2O di entrare nella sacca dell EME

Hb Savannah [Gly(24)βVal] Hb A con Gly

Hb Milwaukee [His Gly] Fe 3+ Stabilizzato dalla Gly

Hb Kansas[Asn(102) βthr]:si perde un legame ad H nell interfaccia α1/β2: Asn(102) β2/ Asp(94) α1; si stabilizza lo stato T, p50=70 mm Hg

Hb Yakima [Asp(99)βHis]: si è perso un legame ad H critico tra Β2-Asp(99) e α1-tyr(42) che stabilizza lo stato T; p50 = 12 mmhg