Biochimica. Prof. Alessandro Tossi Edificio Q 1 piano lab 106 Dip. Scienze della Vita

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Luigina Campo
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1 Biochimica Prof. Alessandro Tossi Edificio Q 1 piano lab 106 Dip. Scienze della Vita

2 Biochimica: Definizioni: Chimica dei sistemi viventi Chimica: studio della struttura, interazioni e reazioni delle molecole. Sistema vivente: difficile una definizione univoca sistema complesso ed altamente organizzato formato da strutture biologiche con precise funzioni che trasforma energia e ne controlla il flusso che è in grado di replicarsi e quindi di evolvere che risponde a stimoli provenienti dall ambiente sistema dotato di metabolismo e capacità di autoriproduzione 2

3 La biochimica e la biologia molecolare giocano un ruolo fondamentale nello sviluppo dei farmaci PROTEOMICA GENOMICA BIOLOGIA STRUTTURALE IDENTIFICAZIONE DI NUOVI BERSAGLI PER FARMACI MOLECOLE DERIVATE DA FONTI NATURALI LIBRERIE COMBINATORIALI PROGETTAZIONE E SINTESI DI NUOVE MOLECOLE ruolo diretto ruolo indiretto SISTEMI DI VAGLIO AD ALTA EFFICIENZA (SAGGI BIOLOGICI) EVENTUALI MODIFICHE CHIMICHE E NUOVI LEADS BREVETTAZIONE PROTEINE RICOMBINANTI PRODUZIONE SU PIU LARGA SCALA FERMENTAZIONE SISTEMI DI VEICOLAZIONE STUDI DI TOSSICITA E FASI CLINICHE DI VALUTAZIONE DI EFFETTI TERAPEUTICI DOCUMENTAZIONE PER APPROVAZIONE DA AUTHORITY CONTROLLO E CERTIFICAZION E DI QUALITA' PRODUZIONE INDUSTRIALE INFORMAZIONE AI MEDICI COMMERCIALIZZAZIONE FARMACOECONOMIA FARMACO VIGILANZA FARMACIE OSPEDALIERE O APERTE AL PUBBLICO 3

Biochimica ed evoluzione dello sviluppo del farmaco pre 80 post 80 post 2000 BANCHE DI PRODOTTI NATURALI O SINTETICI BERSAGLIO TERAPEUTICO PROGETTAZIONE KNOWLEDGE BASED GENOMICA

4 Biochimica ed evoluzione dello sviluppo del farmaco pre 80 post 80 post 2000 BANCHE DI PRODOTTI NATURALI O SINTETICI BERSAGLIO TERAPEUTICO PROGETTAZIONE KNOWLEDGE BASED GENOMICA PROTEOMICA BIOLOGIA STRUTTURALE MODIFICHE STRUTTURALI Attività Tossicità STRUTTURA MOLECOLARE Biodisponibilità BERSAGLIO/ FARMACO TRASCRITTOMICA METABOLOMICA LIBRERIE SINTETICHE COMBINATORIALI 4

5 Obbiettivi del corso: COMPRENDERE: I concetti di base sulla struttura delle macromolecole biologiche (proteine, acidi nucleici e polisaccaridi) e dei loro componenti (amminoacidi, nucleotidi e carboidrati) Isolamento, purificazione e caratterizzazione delle proteine Ripiegamento delle proteine relazione funzione/struttura Struttura e funzione degli enzimi. Nozioni di base sulla cinetica enzimatica e sulla regolazione degli enzimi. Struttura e funzione di proteine strutturali e immunitarie Le membrane biologiche, trasporto transmembrana, trasduzione del segnale Metabolismo intermedio - nozioni di base: le principali vie metaboliche, logica metabolica, organizzazione delle reazioni enzimatiche, regolazione, stechiometria Struttura del DNA e RNA, informazione genetica, enzimi che agiscono sul DNA, nozioni di base sui processi di replicazione, trascrizione e traduzione

6 Organizzazione del corso: 1a parte (ca 20 lez.) - Molecole e macromolecole biologiche - struttura delle proteine tecniche di isolamento, analisi, purificazione e caratterizzazione 2a parte (ca 20 lez.) - Struttura e funzioni delle proteine 3a parte (ca 15 lez.) - Vie metaboliche 4a parte (ca 5 lez.) - DNA - struttura, replicazione, trascrizione, traduzione Strumenti: Lezioni / dispense (PDF online) / vostri appunti siti WEB: codice primo accesso: proteina Libri di testo: a scelta fra Nelson & Cox I principi di biochimica di Lehninger (VI edizione) Zanichelli Berg,Tymoczko & Stryer Biochimica (VII edizione) Zanichelli Garrett & Grisham Biochimica (V Edizione) Piccin

7 L esame di Biochimica consisterà in una prova scritta in cinque o sei parti: 1 sezione con 10 domande a scelta multipla 1 domanda sulla struttura di biomolecole: fornire la struttura corretta di tre biolmolecole semplici a richiesta, identificare le strutture fornite di due biomolecole più complesse 2/3 domande a tema sulla struttura e/o funzione dei vari tipi di proteine, sul trasporto o signalling transmembrana, sul metabolismo, sui processi che coinvolgono il DNA. 1 esercizio di cinetica enzimatica Il voto per la prima sezione rifletterà la conoscenza globale degli argomenti trattati nel corso. Il voto per la seconda domanda la correttezza delle strutture chimiche fornite Il voto per le domande a tema rifletterà a) la congruenza e completezza della risposta e la capacità di descrivere i concetti richiesti in maniera precisa e sintetica, b) la correttezza dei concetti, della trattazione chimica (strutture/reazioni) e della terminologia, e c) la capacità di integrare l argomento con altre tematiche incontrate durante il corso. Il voto per l esercizio di cinetica enzimatica rifletterà la correttezza della risposta, come valore numerico e corrette grandezze ed unità di misura All esame sarà dedicata l ultima lezione del corso Tempo disponibile: 3 ore. Modalità di iscrizione all esame: on-line su esse tre Modalità di correzione: pubblicazione degli esiti su Moodle previa registrazione online (nelle note per lo studente saranno forniti i voti per le singole domande) 7

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