La cellula batterica: la motilità
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- Damiano Perini
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1 La cellula batterica: la motilità
2 BACTERIAL MOTILITY Swimming motility Swarming motility } FLAGELLO Chemotaxis Gliding motility: mysterious process known Twitching motility: type IV pili
3 FLAGELLA Some bacteria are motile Locomotory organelles- flagella Taste environment Respond to food/poison chemotaxis
4 Dislocazione dei flagelli nelle cellule batteriche
5 Dislocazione dei flagelli nelle cellule batteriche Flagellar distribution is occasionally used to differentiate between morphologically related bacteria. For example, among the Gram-negative motile rod-shaped bacteria, the enterics have peritrichous flagella while the pseudomonas have polar flagella.
6 Flagellar stains of three bacteria a. Bacillus cereus b. Vibrio cholerae c. Bacillus brevis Since the bacterial flagellum is below the resolving power of the light microscope, although bacteria can be seen swimming in a microscope field, the organelles of movenent cannot be detected. Staining techniques such as Leifson's method utilize dyes and other components that precipitate along the protein filament and hence increase its effective diameter.
7 Vibrio cholerae. Liefson's flagellar stain Bacterial flagella are below the resolving power of the light microscope. In order to be visualized, the bacteria must be reacted with a stain that precipitates along the flagellar filaments, which increases their effective diameter to the point of resolution. Vibrio cholerae is motile by means of a single polar flagellum inserted into one pole of the cell.
8 Salmonella enteritidis TEM about 10,000X Salmonella is an enteric bacterium related to E. coli. The enterics are motile by means of peritriochous flagella.
9 Flagella embedded in cell membrane project as strand Flagellin (protein) subunits move cell by propeller like action Nei flagelli un lungo filamento (da 3 a 12mm) a forma di spirale aperta sporge dalla superficie della cellula: costituito da molecole di una proteina globulare aggregate in una stretta catena elicoidale (tubi con uno stretto canale centrale vuoto). Sono troppo sottili per l osservazione al MO (10-20nm)
10 The ultrastructure of a bacterial flagellum ME MI Il flagello è composto da tre parti: il filamento, l uncino ed il corpo basale. Il corpo basale inserito nell involucro cellulare è molto complesso. Nei Gram+ si trovano due anelli inseriti nella membrana interna attorno ad un perno (cilindro), mentre i Gram- hanno un paio di anelli supplementari nella membrana esterna.
11 Struttura dei flagelli nei Gram e nei Gram+ Nei batteri Gram-negativi la coppia esterna di anelli è ancorata al LPS (anello L) ed al peptidoglicano (anello P), mentre la coppia interna è localizzata all interno della membrana citoplasmatica (anello MS). Nei Gram-positivi è presente solo la coppia più interna.
12 Struttura e funzione del flagello Ancorate alla membrana citoplasmatica sono localizzate le proteine Mot che controllano il motore, il quale con una torsione fa ruotare il filamento. Un altro gruppo di proteine, dette Fli, funge da invertitore ribaltando la rotazione del flagello in risposta a segnali intracellulari. Un modello a turbina protonica è proposto per spiegare la rotazione del flagello. I protoni scorrendo attraverso le proteine Mot, possono esercitare forza elettrostatica sugli anelli MS, provocando la rotazione del rotore.
13 Ultrastruttura dei flagelli batterici Flagelli di E. coli colorati negativamente
14 The E. coli Flagellar Motor- a true rotary motor reconstruction of electron micrographs of purified hook-basal bodies In E. coli circa 40 geni influenzano la struttura e l assemblaggio dei flagelli. I filamenti crescono per aggiunta di molecole di flagellina sulla punta, le molecole si spostano verso l esterno attraverso il canale vuoto e si aggregano spontaneamente.
15 Crescita dei filamenti flagellari La sintesi inizia con l assemblaggio dell anello MS alla membrana, seguita dalla formazione degli altri anelli, dell uncino e del cappuccio (cap). A questo punto, le molecole di flagellina scivolano nel canale centrale, guidate nella corretta posizione dalle proteine cap che assicurano una accrescimento ordinato del filamento.
16 Crescita dei filamenti flagellari L accrescimento del flagello in vivo avviene a livello apicale (non dalla base ma dalla punta), ed il trasporto della flagellina (ne servono circa copie per formare un filamento) si effettua attraverso la cavità centrale.
17 ROTAZIONE FLAGELLARE Il flagello ruota come un motore propulsore. L energia viene fornita dalla forza protonmotrice: il flusso verso il basso dei protoni attraverso la membrana citoplasmatica applica una forza elettrostatica all anello interno del corpo basale. Gli altri anelli servono probabilmente come guaine isolanti. Insieme al corpo basale codificato da diversi geni, il motore dei flagelli è costituito da due tipi di proteine di membrana (MotA e MotB), codificate dai geni mot, le cui mutazioni paralizzano i flagelli. La dissipazione del gradiente protonico attraverso la membrana, mediata dal complesso Mot, fa ruotare il flagello, ed è stato calcolato che devono essere traslocati circa 1000 protoni affinché possa avvenire un singolo movimento rotatorio. La rotazione flagellare può far avanzare un batterio in un terreno liquido alla velocità di 60 lunghezze cellulari/secondo.
18 Modello della probabile disposizione elicoidale delle subunità proteiche di un flagello e di un pilus
19 Flagella vs Fimbrae Transmission electron micrograph of Aquaspirillum hydrophila showing flagella (thick, long structures) and pili (thinner fibers)
20 Flagelli e pili in Proteus vulgaris Fimbrie Flagelli
21 Three bacteria showing the flagella filaments. Each filament forms an extended helix several cell lengths long.
22 Chemotaxis Tumble Smooth Swimming or Run Il movimento batterico può avvenire a caso, con cambiamenti continui di direzione (tumbling) o direttamente in una sola direzione (swimming or run) ed è determinato dalla direzione della rotazione del flagello (oraria e antioraria)
23 Chemotaxis Nei batteri peritrichi il movimento in avanti è dato dalla rotazione di tutti i flagelli, che vanno a costituire un unico fascio, in senso antiorario. La rotazione in senso orario induce la cellula a capovolgersi, e successivamente il ritorno alla rotazione antioraria guida le cellule in una nuova direzione. I batteri polari cambiano direzione invertendo la rotazione flagellare (quindi tirando la cellula invece di spingerla). I microrganismi con flagelli unidirezionali (Rhodobacter sphaeroides possiede un flagello che gira solo in senso orario) cambiano direzione fermandosi periodicamente per ri-orientarsi in modo casuale mediante movimento browniano.
24 Chemiotassi In assenza di un gradiente chimico i batteri si muovono a caso, cambiando continuamente la propria direzione. Chemiotassi: movimento verso sostanze che attraggono (attrattive: nutrienti) o l allontanamento da sostanze che respingono (repellenti: cataboliti, sostanze tossiche). I batteri rispondono anche a diversi stimoli ambientali come i campi magnetici e la luce.
25 Chemotactic Behavior of Free Swimming Bacteria No Gradient Increasing attractant Increasing repellent
26 ASSAYS: A Soft Agar Chemotaxis Plate La chemiotassi positiva o negativa può essere studiata mediante colture su piastre Petri. Ponendo i batteri al centro di un disco di agar contenente una sostanza attrattiva, prima esauriscono le sostanze in loco, quindi si spostano verso l esterno seguendo il gradiente di attrazione; ciò porta alla formazione di un anello che si espande in direzione centrifuga. In presenza di repellenti i batteri si allontanano creando un alone chiaro intorno al disco.
27 ASSAYS: A Soft Agar Chemotaxis Plate A mixture of growth media and a low concentration of agar are mixed in a Petri plate. The agar forms a mesh like network making water filled channels that the bacteria can swim through.
28 A Soft Agar Chemotaxis Plate Bacteria are added to the center of the plate and allowed to grow.
29 A Soft Agar Chemotaxis Plate The bacteria swim up the gradients of attractants to form chemotactic rings.
30 A Soft Agar Chemotaxis Plate Serine ring Aspartate ring Each ring consists of millions of cells.
31 Chemiotassi batterica Chemiotassi positiva di E. coli L anello più esterno formato da batteri che si nutrono di serina; il secondo anello da batteri che utilizzano l acido aspartico, una sostanza con potere di attrazione minore. La colonia in alto a destra è formata da mutanti dotati di motilità, ma privi di chemiotassi. Quella in basso da mutanti immobili Chemiotassi negativa di E. coli I dischi chiari sono tamponi di agar concentrato contenente acetato, posti in agar diluito inoculato con E. coli. La concentrazione di acetato aumenta da 0 (il disco in alto a destra) fino a 3M (il disco in alto a sinistra). All aumentare della concentrazione di acetato aumenta anche la grandezza dell area priva di batteri intorno al disco.
32 Misurare la chemiotassi A) Immersione di un capillare nella sospensione batterica; formazione del gradiente di concentrazione. B) Accumulo di batteri in un capillare contenente una sostanza attraente. C) Capillare di controllo contenente una soluzione salina, priva di potere attraente o repellente. La concentrazione di cellule all interno e all esterno di esso è la stessa. D) Repulsione dei batteri da parte di un repellente. E) cinetica del numero di cellule in capillari contenenti varie sostanze chimiche.
33 The Molecular Machinery of Chemotaxis TWO-COMPONENT SYSTEM Information transfer through covalent modification of proteins: phosphorylation and methylation (also acetylation in motor proteins) INPUT Attractant concentration Signal Transduction OUTPUT Direction of rotation
34 The Molecular Machinery of Chemotaxis TWO-COMPONENT SYSTEM La chemiotassi è un meccanismo alquanto complesso e coinvolge numerosi tipi di proteine. Nella membrana cellulare sono presenti diverse proteine sensore, i chemiorecettori, in grado di rilevare la presenza di attraenti e repellenti, permettendo alla cellula in movimento di percepire, nel tempo, se la concentrazione di una sostanza aumenta o diminuisce. La cellula dunque risponde a cambiamenti della concentrazione piuttosto che alla concentrazione assoluta dello stimolo chimico.
35 Le proteine sensore sono chiamate proteine metil-accettrici per la chemiotassi (MCP), o proteine recettore-trasduttore o semplicemente trasduttori. In E. coli sono state identificate 5 differenti MCP. Sono proteine transmembranarie, ognuna delle quali può rilevare una varietà di composti. Per esempio, il trasduttore Tar di E. coli può percepire come attraenti sia l aspartato che il maltosio e come repellenti metalli pesanti come cobalto e nichel.
36 The Molecular Machinery of Chemotaxis Tsr (serina) Tar (ac.aspartico) Trg (glucosio) Tap AER INPUT Attractants bind receptors at the cell surface changing their state. (methylated chemoreceptors MCP S ). Signal Transduction Le MCP si legano ai composti direttamente o indirettamente, tramite proteine di legame periplasmatiche, attivando una serie di interazioni con particolari proteine citoplasmatiche capaci di alterare la rotazione del flagello. OUTPUT Direction of rotation
37 The Molecular Machinery of Chemotaxis Tsr Tar Tap Trg CheA (CheW) INPUT P~ The MCPs regulate the activity of a histidine kinase - autophosphorylates on a histidine residue. Diversi geni che sono coinvolti nella trasmissione del segnale basata sulla fosforilazione mediante ATP e defosforilazione OUTPUT Direction of rotation
38 The Molecular Machinery of Chemotaxis Tsr Tar Tap Trg CheA (CheW) CheY (CheB) INPUT P~ P~ CheA transfers its phosphate to a signaling protein CheY to form CheY~P. Binding attractant: CheA inhibited; CheY increases: motor turns CCW= smooth swimming Binding repellent: CheA activated; CheY-P increases; motor turns CW=tumble Il trasduttore forma un complesso con la chinasi sensore CheA e con una proteina ad essa associata, CheW. In risposta alla formazione di questo complesso CheA si autofosforila in CheA-P.Gli attraenti diminuiscono la frequenza di autofosforilazione, mentre i repellenti l aumentano. CheA-P può poi fosforilare CheY e CheB, che sono regolatori della risposta. OUTPUT Direction of rotation
39 The Molecular Machinery of Chemotaxis Tsr Tar Tap Trg CheA (CheW) CheY (CheB) INPUT P~ P~ CheA transfers its phosphate to a signaling protein CheY to form CheY~P. Binding attractant: CheA inhibited; CheY increases: motor turns CCW= smooth swimming Binding repellent: CheA activated; CheY-P increases; motor turns CW=tumble CheY è la proteina centrale di questo sistema, in quanto serve come regolatore della risposta per la chemiotassi dirigendo la direzione di rotazione del flagello. CheY-P interagisce con il motore del flagello inducendolo a ruotare in senso orario e di conseguenza ad effettuare una capriola ( l interruttore del motore è costituito da alcune proteine codificate dai geni fli). CheY defosforilato non può legarsi ed il motore continua a girare in senso antiorario consentendo il moto rettilineo della cellula. OUTPUT Direction of rotation
40 Tsr Tar Tap Trg CheA (CheW) CheY CheZ The Molecular Machinery of Chemotaxis INPUT P~ CheY~P binds to the switch and causes the motor to reverse direction. The signal is also modulated by CheZ which dephosphorylates CheY. P~ Un altra proteina CheZ può defosforilare CheY permettendo alla cellula di muoversi linearrmente invece di capovolgersi. I repellenti aumentano il livello di CheY-P e quindi il susseguirsi di capriole, invece, gli attraenti riducono il livello di CheY-P permettendo l avanzamento regolare. OUTPUT Direction of rotation
41 The Molecular Machinery of Chemotaxis
42 La regolazione della chemiotassi Il grado di metilazione delle proteine MCP controlla la loro capacità di rispondere ad una sostanza chimica e determina il processo dell ADATTAMENTO: fase del circuito di regolazione necessaria per poter azzerare e far ripartire il sistema.
43 Swarming Bacterial swarming is an organized form of multicellular translocation across solid surfaces It has been suggested that swarming is a strategy developed by flagellated microorganisms to ensure their rapid expansion and colonization in the natural environment. Swarming motility has been shown to play a role in the colonization of host mucosal surfaces by some infectious agents. In addition, some bacteria, such as uropathogenic Proteus mirabilis, produce higher levels of virulence factors during their swarm-cell state.
44 Swarming Microfotografia elettronica di una cellula multiflagellata, Proteus mirabilis
45 Swarming di Proteus mirabilis in infuso cuore-cervello agarizzato
46 Gliding motility Molti procarioti sono mobili anche in assenza di flagelli, muovendosi attraverso una superficie solida mediante un processo di scivolamento. La motilità per scivolamento è considerevolmente più lenta di quella a propulsione mediata dal flagello, ma permette al microrganismo un certo movimento nel suo habitat. La morfologia delle colonie dei batteri che si muovono per scivolamento è del tutto caratteristica con cellule che si spostano fuori dal centro della colonia stessa. Possiamo ricordare i cianobatteri filamentosi, i mixobatteri ed alcune specie di Flavobacterium. Nei cianobatteri il movimento per scivolamento è accompagnato dalla secrezione di una sostanza mucosa (slime) di natura polisaccaridica che si distribuisce tra la superficie cellulare e la superficie solida su cui il microrganismo si muove.
47 Gliding motility Flavobacterium johnsoniae è indotto invece da un movimento delle Lo scivolamento di proteine della superficie cellulare. In questo modello, le proteine specifiche per la motilità sono ancorate alla membrana citoplasmatica ed alla membrana esterna e si ipotizza sospingano la cellula avanti e indietro con un meccanismo a ruota dentata, grazie alla presenza di punti di contatto nel peptidoglicano tra i due gruppi di proteine. L energia rilasciata dalla forza protonmotrice dirige il movimento delle proteine della membrana citoplasmatica, le quali la trasmettono alle proteine della membrana esterna, collocate in una specie di corsia sulla superficie cellulare, il cui movimento è direttamente responsabile dello scivolamento cellulare.
48 Gliding motility Evolved social gliding. Wild-type Myxococcus xanthus (top, 12 o'clock position) on soft agar, whereas non-social mutants lacking extracellular pili (05 o'clock and 10 o'clock positions) do not. Two strains that descend from the pili-deficient mutants (03 o'clock and 08 o'clock positions) re-evolved the ability to social gliding, but by fundamentally different mechanisms than the wild-type. I mixobatteri sono un classico esempio di batteri con uno stile di vita sociale e cooperativo.
49 A and S motility M. xanthus, Gram-negative bacterium moves across surfaces by means of a poorly understood mechanism known as gliding motility. Gliding is controlled by two distinct genetic systems (sets of genes): the adventurous (A) and social (S) motility systems. S-motility is activated when cells are in proximity to each other, while A-motility allows cells to move independently. Mutations in the S-system genes do not interfere with A-motility, and vice-versa; a single mutation in the mgl locus, however, interferes with both types of motility. The mgl operon contains two open reading frames (ORFs) which are transcribed together. A collection of non motile mutants helped to define the downstream ORF as the mgla gene. Single mutations at the mgla locus completely abolish motility. A series of deletion mutations was constructed to determine the role of the upstream ORF (now called mglb). A strain carrying a deletion in mglb and with an intact mgla produces small colonies. The cells are motile, but their rate of swarm spreading is reduced.
50 Pictured below are the edges of colonies of M. xanthus grown on agar. The top frame shows the smooth edge of a colony which has neither A nor S motility, and therefore does not swarm at all; this is characteristic of strains with a single mutation in the mgl locus, as well as of strains with one mutation in each of the two motility systems. The left frame depicts a colony in which only A- motility is active; the right frame shows a colony in which only S-motility is active. Finally, the bottom frame shows a wild-type colony in which both A and S-motility are active.
51 Twitching motility: type IV pili Twitching motility is a flagella-independent form of bacterial translocation over moist surfaces. It occurs by the extension, tethering, and then retraction of polar type IV pili, which operate in a manner similar to a grappling hook. Twitching motility is equivalent to social gliding motility in Myxococcus xanthus and is important in host colonization by a wide range of plant and animal pathogens, as well as in the formation of biofilms and fruiting bodies.
52 Twitching motility: type IV pili Pseudomonas aeruginosa e Neisseria gonorrhoeae e Neisseria meningitidis, utilizzano i pili di tipo IV per muoversi in un processo chiamato twitching motility. Estensione attiva e contrazione dei pili di tipo IV sembrano essere coinvolti in una larga varietà di processi come il movimento cellulare (motilità contrattile), la trasformazione, la congiunzione, l infezione di batteriofagi, la formazione di biofilm, l'attivazione della risposta cellulare dell ospite, e la citotossicità.
53 Twitching motility: type IV pili Studi in P. aeruginosa hanno permesso di identificare almeno 40 geni coinvolti nella biosintesi dei pili di tipo IV e nella motilità per contrazione. Cinque di questi geni, pils pilr, fims, algr, e rpon sono coinvolti nella regolazione trascrizionale di geni richiesti per la biosintesi e la funzione dei pili. Almeno 20 geni sono coinvolti specificamente nella biosintesi del pilus. Di questi, pila codifica per la principale subunità strutturale del pilus, mentre pilb codifica per una proteina con un putativo dominio NTP-binding che si pensa sia richiesto per la polimerizzazione e l estensione del pilus A number of genes required for pili assembly are homologous to genes involved in type II protein secretion and competence for DNA uptake, suggesting that these systems share a common architecture. Twitching motility is also controlled by a range of signal transduction systems, including twocomponent sensor-regulators and a complex chemosensory system
54 Axial filaments spirochetes similar function to flagella run lengthwise along cell snake-like movement
55 Axial filaments Nella cellula delle Spirochete è presente una struttura, detta filamento assiale, formata da due o più elementi filamentosi che partono dai poli della cellula. Il filamento assiale è simile al flagello, presentando un corpo basale ed un uncino; esso tuttavia non è un appendice cellulare libera ma è localizzato tra la membrana esterna ed il peptidoglicano ed è spesso avvolto da una guaina proteica e pertanto viene anche indicato come endoflagello o flagello periplasmatico. Le Spirochete possiedono 2 filamenti assiali, Treponema 2-16 e Borrelia
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