Esercitazioni Capitolo 8 I composti inorganici covalenti (Scaricare ArgusLab e seguire le istruzioni)

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1 Esercitazioni Capitolo 8 I composti inorganici covalenti (Scaricare ArgusLab e seguire le istruzioni) Esercizio 1 la molecola di anidride solforosa 3. Dalla barra delle applicazioni scegliete, si apre una finestra cliccate su S assicutandovi che in basso compaia la scritta tetraedral (cliccandoci sopra) 4. Cliccando su un punto qualsiasi dello scermo col tato destro del mouse verrà inserito l atomo scelto 5. Dalla barra delle appicazioni scelgo 6. Cliccando col tasto destro sull atomo scegliete S[sp3] e selezionate l opzione S_3 +4 tetrahedral 7. Ora cliccate su O assicutandovi che in basso compaia la scritta trigonal planar cliccandoci sopra col tasto sinistro del mouse 8. Mi sposto di circa 1,3 e clicco col tasto destro 9. Tenendo premuto il tasto spostatevi sull atomo di zolfo e cliccate col tasto destro 10. Ora, sempre tenendo premuto il tasto spostatevi di 1,3 e cliccate col tasto destro 11. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 12. Andate sui legami, cliccateci col tasto sinistro e scegliete duble 13. Cliccando Alt e tasto sinistro e spostando in verticale il mouse mettete in evidenza i doppi legani (se non sono visibili) 14. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione UFF 15. Il programma vi chiederà di salvare il file, scegliete il nome anidride solforosa 16. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 17. Salvare la molecola col nome anidride solforosa UFF 18. Inserite i nomi degli atomi dal menu label e selezionando all atom 19. Tenendo premuto il tasto Ctrl andate in sequenza sulla scritta O2, S, O3 e col tasto sinistro del mouse selezionateli (appariranno di colore giallo, a volte è complicato perché occorre mettere la molecola in modo che tutti gli atomi risultino evidenti) 20. Nella barra delle applicazioni apparirà, cliccate sul simbolo colorato e verrà inserito il valore dell angolo 21. Se seleziono solo a atomi (andando sempre sulla scritta) nella barra delle applicazioni apparirà cliccateci sopra e vedrete le varie distanze fra gli atomi 22. Savate col nome anidride solforosa valori 23. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione AM1 24. È una funzione più precisa della precedente che utilizzerà i valori da noi inseriti per dare una forma più corretta della molecola

2 25. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 26. Scegliete il menu e l opzione remove all monitor 27. Slavate col nome anidride solforosa AM1

3 Esercizio 2 la molecola di anidride solforica 3. Dalla barra delle applicazioni scegliete, si apre una finestra cliccate su S assicutandovi che in basso compaia la scritta trigonal planar (cliccandoci sopra) 4. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 5. Dopo aver cliccato col tasto destro sull atomo di zolfo (si colora di giallo), cliccate su O assicutandovi che in basso compaia la scritta trigonal planar cliccandoci sopra col tasto sinistro del mouse e poi spostatevi di 1,5, tenendo schicciato il tasto shift e cliccate col tasto destro 6. Ripetere l operazione altre due volte 7. Il legame che si è formato e singolo, cliccateci sopra col tasto destro e scegliete duble 8. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione UFF 9. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 10. Salvare la molecola col nome anidride solforica UFF 11. Inserite i nomi degli atomi dal menu label e selezionando all atom 12. Selezionando tutti gli atomi nella barra delle applicazioni si evidenzierà il seguente tasto premetelo e apparirà un nuovo valore utile al programma per stabilire la corretta geometria della molecola 13. Potete inserire nuovi angoli e nuove distanze che coinvolgono il nuovo atomo selezionandolo insieme ad altri atomo tenendo premuto Ctrl e tasto sinistro e cliccando sugli atomi presenti fino a che i simboli non si colorano 14. Salvare il file col nome anidride solforica valori 15. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione AM1 16. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 17. Scegliete il menu e l opzione remove all monitor 18. Slavate col nome anidride solforica AM1

4 Esercizio 3 Acido Carbonico 3. Dalla barra delle applicazioni scegliete, si apre una finestra cliccate su C assicutandovi che in basso compaia la scritta trigonal planar (cliccandoci sopra) nero e cliccate col tasto destro poi andate sullo schermo 4. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 5. Cliccate con tasto sinistro sull atomo di carbonio (si colora di gliallo) andate, scegliete O trigonal planar, e tenento premuto il tasto shift spostatevi di 1,5 rispetto all atomo di carbonio e cliccate col tasto destro 6. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 7. Cliccate col tasto destro sul legame e scegliete duble 8. Cliccate con tasto sinistro sull atomo di carbonio (si colora di gliallo) andate, scegliete O tetrahedral, e tenento premuto il tasto shift spostatevi di 1,5 rispetto all atomo di carbonio e cliccate col tasto destro 9. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 10. Ripetete i punti 8 e Dalla barra delle applicazioni scegliete 12. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione UFF 13. Salvare la molecola col nome acido carbonico 14. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 15. Salvare la molecola col nome acido carbonico UFF 16. Inserite i nomi degli atomi dal menu label e selezionando all atom 17. Potete inserire angoli di torsione angoli e distanze selezionando 4, 3 e 2 atomi utilizzando Ctrl e tasto sinistro e cliccando sugli atomi presenti fino a che i simboli non si colorano 18. Salvare il file col nome acido carbonico valori 19. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione AM1 20. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 21. Col tasto sinistro cliccate su un legame singolo 22. Premendo contemporaneamente i tasti shift + alt schiacciando il tasto sinistro del mouse ruotate il gruppo OH di circa Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione AM1 24. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged

5 25. Scegliete il menu e l opzione remove all monitor 26. Vi accorgerete che la molecola ha due forme di stabilità 27. Slavate col nome anidride solforica AM1

6 Esercizio 4 Acido solforoso 3. Dalla barra delle applicazioni scegliere e aprire il file anidride solforosa UFF 4. Inserite i nomi degli atomi dal menu label e selezionando all atom 5. Col tasto sinistro cliccate sul legame dell atomo di O3 e scegliete single 6. Cliccate su O3 col tasto destro e scegliete change atom e selezionate O[sp3] tetrahedral 7. Col tasto sinistro selezionate l atomo di zolfo, scegliete O tetrahedral, tenendo schiacciato il tasto shift spostatevi di 1,5 e cliccate col tasto destro 8. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 9. Dalla barra delle applicazioni scegliete 10. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione UFF 11. Salvare la molecola col nome acido solforoso 12. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 13. Salvare la molecola col nome acido solforoso UFF 14. Inserite i nomi degli atomi dal menu label e selezionando all atom 15. Potete inserire angoli di torsione angoli e distanze selezionando 4, 3 e 2 atomi utilizzando Ctrl e tasto sinistro e cliccando sugli atomi presenti fino a che i simboli non si colorano 16. Salvare il file col nome acido solforoso valori 17. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione AM1 18. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 19. Scegliete il menu e l opzione remove all monitor 20. Salvare col nome acido solforoso AM1

7 Esercizio 5 Acido solfidrico 3. Dalla barra delle applicazioni scegliete (se non è già aperta), si apre una finestra cliccate su S assicutandovi che in basso compaia la scritta tetrahedral poi andate sullo schermo nero e cliccate col tasto destro 4. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 5. Dalla barra delle applicazioni scegliete 6. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione UFF 7. Salvare la molecola col nome acido solfidrico 8. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 9. Salvare la molecola col nome acido solfidrico UFF 10. Potete inserire angoli angoli e distanze selezionando 3 e 2 atomi utilizzando Ctrl e tasto sinistro e cliccando sugli atomi presenti fino a che i simboli non si colorano 11. Cliccando su dalla barra delle applicazioni potete centrare la molecola 12. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione AM1 13. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 14. Inserite i nomi degli atomi dal menu label e selezionando all atom 15. Scegliete il menu e l opzione remove all monitor 16. Salvare col nome acido solfidrico AM1

8 Esercitazione N. 6 Acido solforico 3. Aprire il file acido solforoso valori 4. Col tasto destro del mouse scegliete change atom, cliccate su periodic talble, cliccate su S e assicuratevi che appaiono selezionati sp3 e S_3+6 (se non sono presenti selezionateli col tasto sinistro) infine schiacciate OK 5. Col tasto sinistro del mouse cliccate sull atomo di zolfo 6. Dalla barra delle applicazioni scegliete (se non è già aperta), si apre una finestra cliccate su O assicutandovi che in basso compaia la scritta trigonal planar (col tasto sinistro del mouse) poi andate sullo schermo e tenendo schicciato il tasto shift cliccate col tasto destro a 1,4 di distanza dall atomo 7. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 8. Cliccate col tasto sinistro sul nuovo legame e scegliete duble 9. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione UFF 10. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 11. Salvare la molecola col nome acido solforico UFF 12. Potete inserire angoli di torsione angoli e distanze selezionando 4, 3 e 2 atomi utilizzando Ctrl e tasto sinistro coinvolgendo il nuovo atomo 13. Cliccando su dalla barra delle applicazioni potete centrare la molecola 14. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione AM1 15. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 16. Se appare la scritta not converged cliccate sul seguente tasto della barra delle applicazioni i processo riprenderà nuovamente 17. Continuate fino a che non compare la scritta converged 18. Scegliete il menu e l opzione remove all monitor 19. Salvare col nome acido solforico AM1

9 Esercizio n.7 Acido nitrico 3. Dalla barra delle applicazioni scegliete, si apre una finestra cliccate su N assicutandovi che in basso compaia la scritta trigonal planar (cliccandoci sopra) poi andate sullo schermo nero e cliccate col tasto destro 4. Andate sulla finestra aperta precedentemente e scegliete O trigonal planar, e tenento premuto il tasto shift spostatevi di 1,5 rispetto all atomo di azoto e cliccate col tasto destro 5. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 6. Col tasto sinistro cliccate sul legame e scegliete duble 7. Cliccate col tasto sinistro del mouse sull atomo di azoto e andate sulla finestra aperta precedentemente e scegliete O trigonal planar, e tenento premuto il tasto shift spostatevi di 1,5 rispetto all atomo di azoto e cliccate col tasto destro. 8. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 9. Col tasto sinistro cliccate sul legame e scegliete duble 10. Cliccate col tasto sinistro del mouse sull atomo di azoto e andate sulla finestra aperta precedentemente e scegliete O tatrahedral, e tenento premuto il tasto shift spostatevi di 1,5 rispetto all atomo di azoto e cliccate col tasto destro 11. Dalla barra delle appicazioni scegliere per porre fine agli inserimenti 12. Dalla barra delle applicazioni scegliete 13. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione UFF 14. Salvare la molecola col nome acido nitrico 15. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 16. Salvare la molecola col nome acido carbonico UFF 17. Inserite i nomi degli atomi dal menu label e selezionando all atom 18. Potete inserire angoli di torsione angoli e distanze selezionando 4, 3 e 2 atomi utilizzando Ctrl e tasto sinistro e cliccando sugli atomi presenti fino a che i simboli non si colorano 19. Salvare il file col nome acido nitrico valori 20. Adesso dal menu scegliete optimize geometry eselezionate l opzione AM1 21. In fondo apparirà la seguente scritta la scrittura converged 22. Scegliete il menu e l opzione remove all monitor 23. Vi accorgerete che la molecola ha due forme di stabilità 24. Slavate col nome acido nitrico AM1