QS-RGQ: Caratteristiche delle prestazioni

Documenti analoghi
artus EBV QS-RGQ Kit Prestazioni caratteristiche Maggio 2012 Sample & Assay Technologies Sensibilità analitica plasma

RGQ: Caratteristiche delle prestazioni

Kit artus HBV QS-RGQ. Caratteristiche delle prestazioni. Maggio Sample & Assay Technologies. Sensibilità analitica plasma

Questo documento descrive le caratteristiche delle prestazioni del kit artus HCV QS-RGQ, versione 1, R3.

artus HI Virus-1 QS-RGQ Kit

September 2015 artus CMV QS-RGQ Kit: Performance characteristics

Caratteristiche prestazionali

Kit QIAsymphony DSP DNA

artus CT/NG QS-RGQ Kit

Manuale del kit artus CMV QS-RGQ

Kit EZ1 DSP Virus. Prestazioni caratteristiche. Sample & Assay Technologies. Siero e plasma. Intervallo lineare

Manuale kit artus HSV-1/2 RG PCR

Scheda di Applicazione QIAsymphony RGQ

Scheda del protocollo QIAsymphony SP

Scheda di Applicazione QIAsymphony RGQ

Manuale del kit artus HCV RG RT- PCR

Manuale del kit artus WNV LC RT-PCR

Manuale del kit artus HBV RG PCR

artus EBV LC PCR Kit Manuale

Manuale del kit artus

Sample & Assay Technologies. artus HSV-1/2 LC PCR Kit Manuale. Febbraio Diagnostica quantitativa in vitro

CIRCUITO INTER-LABORATORIO RT-PCR BLUETONGUE

COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HCV Quantitative Test, Version 2.0 Nuove opportunità nel monitoraggio di HCV RNA

Sviluppo e convalida di un metodo analitico

USABILITÀ INTERFERENTI EMATOCRITO LABELLING

Prestazioni di accuratezza e precisione del sistema Accu-Chek Compact e Accu-Chek Compact Plus. Introduzione. Metodo

Plug-in BRAF Pyro Guida rapida

Scheda del protocollo QIAsymphony SP

PROGRAMMA DI VEQ PER RETICOLOCITI. A. Organizzazione del Programma

Tissue_LC_200_V7_DSP e Tissue_HC_200_V7_DSP (convalidato dall'utente per il kit QIAsymphony DSP DNA Mini)

Esperienze con Sistema Cobas 4800

Corso Di CHIMICA ANALITICA II

Scienze tecniche di Medicina di Laboratorio

Validazione dei metodi analitici per il rilevamento di OGM

Elenco del materiale da laboratorio Kit QIAsymphony DSP DNA

Scheda del protocollo QIAsymphony SP

Permette di monitorare in tempo reale l andamento della reazione ed effettuare una quantizzazione del frammento amplificato

ISTITUTO ZOOPROFILATTICO SPERIMENTALE DELLE REGIONI LAZIO E TOSCANA (D.L.vo n. 270)

COMMENTO DEI RISULTATI DEL PROGRAMMA VEQ IN BIOLOGIA MOLECOLARE VIROLOGICA 2016

S = f(c) c x = f -1 (s x )

QMS QUINIDINE. Immunoassay. Legenda dei simboli. Microgenics GmbH. D Passau. Tel: +49 (0) Fax: +49 (0)

Emissione 6 25/11/2011 Approvazione DCRB Pag. 1 di 7

CALCOLO DELL ERRORE E VALUTAZIONE DI UN METODO ANALITICO

CHEMIOMETRIA. CONFRONTO CON VALORE ATTESO (test d ipotesi) CONFRONTO DI VALORI MISURATI (test d ipotesi) CONFRONTO DI RIPRODUCIBILITA (test d ipotesi)

GU n. 250 del

STATISTICA. Esercitazione 5

2- OBIETTIVI DEL TEST INTERLABORATORIO

QUALITA DEL DATO ANALITICO

Prestazioni di accuratezza e precisione del sistema Accu-Chek Active. Introduzione. Metodo

Manuale del kit artus BK Virus QS-RGQ

La validazione dei metodi di analisi per i Prodotti Fitosanitari e loro impurezze secondo la linea guida SANCO 3030

Plug-in EGFR Pyro Guida rapida

Organizzazione e ottimizzazione dell attività nel laboratorio di virologia: l esempio del CMV a Torino

STATISTICA CORSO BASE. Prova scritta del Tempo: 2 ore Cognome e Nome:... Matricola:...

QMS TOBRAMYCIN. Immunoassay CALIBRATORI PER LA TOBRAMICINA Legenda dei simboli

ESERCIZI TRATTAMENTO DEI DATI ANALITICI

Corso di Tecniche biomolecolari applicate Modulo Analisi di Macromolecole

Emissione 5 25/11/2011 Approvazione DCRB Pagina 1 di 8

Validazione di un metodo di analisi. Dott. Lorenzo Catani

Studio pilota per la creazione e l utilizzo di un database contenente i profili genetici di una popolazione controllata di cani

SPECIFICHE TECNICHE COMUNI (CTS) PER I DISPOSITIVI MEDICO-DIAGNOSTICI IN VITRO

Emissione 6 25/11/2011 Approvazione DCRB Pagina 1 di 7

Ogni misura è composta di almeno tre dati: un numero, un'unità di misura, un'incertezza.

Prof. Anna Paola Ercolani (Università di Roma) Lez Indicatori di dispersione

SCHEMA DI VEQ PER EMATOLOGIA. Emissione 8 01/09/2015 Approvazione DCRB Page 1 of 5

BLAND-ALTMAN PLOT. + X 2i 2 la differenza ( d ) tra le due misure per ognuno degli n campioni; d i. X i. = X 1i. X 2i

RISOLUZIONE N. RIS-1/93-IV/05 SCOPERTA DEGLI IDROCARBURI POLICICLICI AROMATICI NEGLI OLI DI OLIVA E NEGLI OLI DI SANSA DI OLIVA COMMESTIBILI

1.1 Obiettivi della statistica Struttura del testo 2

Ogni misura è composta di almeno tre dati: un numero, un'unità di misura, un'incertezza.

Cognome e Nome:... Matricola e corso di laurea:...

Misure di dispersione (o di variabilità)

ORARIO LEZIONI del MASTER in Molecular Diagnostics A.A. 2016/2017 APRILE

Esercizio pilota per la titolazione di anti-a e anti-b 16/17ABO T1 distribuito il 14 Giugno 2016

ready to use - caratteristiche principali

Giulio Pisani, Biologo Istituto Superiore di Sanità

SCANNER SPETTRALE: VERIFICA DELL ATTENDIBILITÀ DELLE MISURE

3) In una distribuzione di frequenza si può ottenere più di una moda Vero Falso

GENETICA QUANTITATIVA

FACOLTÀ DI SOCIOLOGIA CdL in SCIENZE DELL ORGANIZZAZIONE ESAME di STATISTICA 21/09/2011

Manuale del kit artus HCV QS-RGQ

Indice. centrale, dispersione e forma Introduzione alla Statistica Statistica descrittiva per variabili quantitative: tendenza

Progetto. Report tecnico di fine progetto

STATISTICA CORSO BASE. Prova scritta del Tempo: 2 ore Cognome e Nome:... Matricola:...

SCHEMA DI VEQ PER I MARCATORI BIOCHIMICI DI LESIONE MIOCARDICA. Emissione 07 01/09/2015 Approvazione DCRB Pag. 1 di 5

Statistica Corso Base (Serale) Dott.ssa Cristina Mollica

standardizzazione dei punteggi di un test

University of Messina, Italy

Regressione Lineare Semplice e Correlazione

Limit of Detection (LOD) Limit of Quantification (LOQ) e valutazione della calibrazione con Chromeleon Hubaux-Vos

Comprendere i fenomeni vuol dire studiare le relazioni tra 2 o più variabili. Esiste un legame tra le variabili?

SCHEMA DI VEQ PER VES FOTOMETRIA CAPILLARE QUANTITATIVA. Emissione 2 25/11/2011 Approvazione DCRB Pagina 1 di 6

LA REALTA DEL LABORATORIO HPV

Statistica di base per l analisi socio-economica

Lab Developed Testing Solutions FLOW. Caratteristiche del sistema

Quanti soggetti devono essere selezionati?

STATISTICA. Esercitazione 6

STATISTICA CORSO BASE. Prova scritta del Tempo: 2 ore Cognome e Nome:... Matricola:...

GRANDE OSPEDALE METROPOLITANO Bianchi Melacrino Morelli Reggio Calabria REGIONE CALABRIA

SCHEMA DI VEQ PER VES METODO WESTERGREN. Emissione 2 25/11/2011 Approvazione DCRB Pagina 1 di 7

Transcript:

Settembre 2015 Kit artus HSV-1/2 QS-RGQ: Caratteristiche delle prestazioni Kit artus HSV-1/2 QS-RGQ, versione 1 4500363 Prima di eseguire il test verificare la disponibilità di nuove revisioni delle etichette elettroniche nel sito www.qiagen.com/products/artushsv- 12pcrkitce.aspx. Lo stato della revisione è indicato dalla data di rilascio (formato: mese/anno). Sample to Insight

Sensibilità analitica FCS Il limite di rilevabilità analitica, tenendo conto della purificazione (limite di sensibilità), è stato calcolato per il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ utilizzando campioni clinici HSV-positivi in combinazione con l estrazione sul QIAsymphony SP. La sensibilità analitica del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ, tenendo conto della purificazione, è stata stabilita utilizzando una serie di diluizioni di materiale ATCC per il virus dell herpes simplex 1 e 2 (codice ATCC VR-260 /VR-734 ) da 450 copie al valore nominale di 1,42 copie/ml, aggiunte a campioni clinici di FCS. I campioni sono stati sottoposti ad estrazione del DNA con il kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Mini in combinazione con il protocollo Cellfree200_DSP (volume di estrazione: 0,2 ml, volume di eluizione: 60 µl). Ciascuna delle 8 diluizioni è stata analizzata con il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ in 3 giorni diversi nell ambito di 3 sedute con 11 replicati ciascuna. I risultati sono stati determinati mediante un analisi probit. Il limite di rilevabilità analitica del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ in combinazione con il Rotor-Gene Q è di 57,27 copie/ml (p = 0,05) per HSV-1. Ciò significa che esiste una probabilità del 95% che vengano rilevate 57,27 copie/ml di DNA di HSV ;1. La Figura 1 illustra graficamente l analisi probit per HSV-1. Il limite di rilevabilità analitica del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ in combinazione con il Rotor-Gene Q è di 65,74 copie/ml (p = 0,05) per HSV 2. Ciò significa che esiste una probabilità del 95% che vengano rilevate 65,74 copie/ml di DNA di HSV-;2. La Figura 2 illustra graficamente l analisi probit per HSV-2. 1.0 95% Proportions Proporzioni 0.8 0.6 0.4 1.75794 1,75794 ~ 57.27 ~ copies/ml 57,27 copie/ml (95%) (39.86 95.69 copies/ml) (intervallo di confidenza al 95%: 39,86-95.69 copie/ml) 0.2 0.0-1 0 1 2 3 log (dose) Log (dose) Figura 1. Analisi probit: FCS, HSV-1 (Rotor-Gene Q). Sensibilità analitica, tenendo conto della purificazione (kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Mini), del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ sul Rotor-Gene Q. artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 2

1.0 95% Proportions Proporzioni 0.8 0.6 0.4 1,81784 ~ 65,74 copie/ml 1.81784 ~ 65.74 copies/ml (95%) (intervallo di confidenza al 95%: 47,62-104.12 copie/ml) (47.62 104.12 copies/ml) 0.2 0.0-1 0 1 2 3 4 Log log (dose) (dose) Figura 2. Analisi probit: FCS, HSV-2 (Rotor-Gene Q). Sensibilità analitica, tenendo conto della purificazione (kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Mini), del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ sul Rotor-Gene Q. Specificità FCS La specificità del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ è garantita in primo luogo dalla selezione dei primer e delle sonde, e poi dalla selezione di condizioni di reazione stringenti. I primer e le sonde sono stati controllati per accertare eventuali omologie con tutte le sequenze pubblicate nelle banche genetiche mediante analisi comparativa delle sequenze. La rilevabilità di tutti i genotipi pertinenti è stata così assicurata da un allineamento del database e da sessioni PCR eseguite su strumenti Rotor-Gene con i genotipi riportati nella Tabella 1. Inoltre, la specificità è stata convalidata con 30 diversi campioni di FCS HSV-1 e HSV-2-negativi. Tali campioni non hanno generato segnali con i primer e le sonde specifici per HSV;-1 e HSV-2, inclusi nell HSV;-1/2 RG Master. È stata rilevata una potenziale cross-reattività del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ utilizzando il gruppo di controllo elencato nella Tabella 2. Nessuno dei patogeni testati è risultato reattivo. Non sono state riscontrate cross-reattività con le infezioni miste. artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 3

Tabella 1. Analisi della specificità di genotipi rilevanti (FCS) Virus Ceppo Origine HSV-1 (Cycling Green, ciclo verde) HSV-2 (Cycling Orange, ciclo arancione) (Cycling Yellow, ciclo giallo)) HSV-1 HF ATCC* + + HSV-1 KOS INSTAND + + HSV-1 MacIntyre QCMD + + HSV-2 HG-52 NCPV + + HSV-2 G ATCC* + + HSV-2 MS QCMD + + * American Type Culture Collection. Society for Promotion of Quality Assurance in Medical Laboratories (Società per la promozione del controllo qualità nei laboratori medici). Quality Control for Molecular Diagnostics (Controllo qualità per la diagnostica molecolare). National Collection of Pathogenic Viruses (Raccolta nazionale di virus patogeni). Tabella 2. Analisi della specificità del kit con patogeni potenzialmente cross-reattivi (FCS) Gruppo di controllo Virus dell herpes umano 3 (virus della varicella-zoster) Virus dell herpes umano 4 (virus di Epstein-Barr) HSV-1 (Cycling Green, ciclo verde) HSV-2 (Cycling Orange, ciclo arancione) (Cycling Yellow) + + Virus dell herpes umano 5 (citomegalovirus) + Virus dell herpes umano 2 (virus herpes simplex 2) + Virus dell herpes umano 6A + Virus dell herpes umano 6B + Virus dell herpes umano 7 + Virus dell herpes umano 8 (virus dell herpes associato al sarcoma di Kaposi) + Virus dell epatite A + Virus dell epatite B + Virus dell epatite C + Virus dell immunodeficienza umana (HIV) + Virus umano di tipo 1 della leucemia dei linfociti T Virus umano di tipo 2 della leucemia dei linfociti T + + Enterovirus + Parvovirus B19 + Virus del Nilo occidentale + artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 4

artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 5

Robustezza FCS La verifica della robustezza consente la determinazione del tasso globale d errore del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ. Per verificare la robustezza, 32 campioni di FCS HSV-negativi sono stati arricchiti con 172 copie/ml di HSV-1 e 30 campioni di FCS HSV-negativi sono stati arricchiti con 200 copie/ml di HSV-2 (concentrazione pari all incirca a tre volte il limite di sensibilità analitica). In seguito ad estrazione del DNA con il kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Mini in combinazione con il protocollo Cellfree200_DSP (volume di estrazione: 0,2 ml, volume di eluizione: 60 µl), i campioni sono stati analizzati con il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ. Inoltre, la robustezza del controllo interno è stata calcolata mediante purificazione e analisi di tutti i campioni di FCS arricchiti di questo studio. Non sono state riscontrate inibizioni di alcun genere. Ne consegue che la robustezza del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ era pari al 99%. Sostanze interferenti FCS Le sostanze potenzialmente interferenti analizzate non hanno mostrato nessuna interferenza con il kit artus HSV-1/2 RG PCR, vedere Tabelle 3 e 4. Tabella 3. Risultati relativi allo studio delle sostanze interferenti per HSV-1 Concentrazione di HSV-1 (copie/ml) 572,7 Sostanza interferente C T (HSV-1) C T (HSV-1) IS C T (HSV-1) controllo Concentrazione Elemento (copie/ml) C T medio DS CV (%) Assoluto Eritrociti 31,68 0,37 1,17 0,01 gdna 10.000 31,60 0,26 0,82 0,06 gdna 100.000 31,95 0,29 0,90 0,29 Controllo 572,7 31,67 0,23 0,72 CV: coefficiente di variazione; IS: sostanza interferente; DS: deviazione standard artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 6

Tabella 4. Risultati relativi allo studio delle sostanze interferenti per HSV-2 Concentrazione di HSV-2 (copie/ml) 657,4 Sostanza interferente C T (HSV-2) C T (HSV-2) IS C T (HSV-2) controllo Concentrazione Elemento (copie/ml) C T medio DS CV (%) Assoluto Eritrociti 31,59 0,22 0,69 0,13 gdna 10.000 31,34 0,39 1,25 0,38 gdna 100.000 31,48 0,37 1,17 0,24 Controllo 572,7 31,72 0,37 1,16 CV: coefficiente di variazione; IS: sostanza interferente; DS: deviazione standard Valutazione clinica FCS Le prestazioni cliniche del test artus HSV-1/2 QS-RGQ sono state inoltre valutate utilizzando campioni artificiali di FCS e analizzando i relativi riscontri rispetto ai risultati ottenuti applicando un metodo CE-IVD confrontabile. Sono stati preparati in totale 524 campioni di FCS umano (HSV-1/2 positivi: n = 404; HSV- 1/2 negativi: n = 120), poi analizzati con il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ e con un metodo di confronto presso un laboratorio clinico-diagnostico esterno. I risultati sono stati analizzati per determinarne la sensibilità e la specificità analitiche, quindi riferiti per entrambi i test per dimostrarne le prestazioni equivalenti. Tabella 5. Intervallo di confidenza bilaterale al 95% asintotico: Metodo del punteggio di Newcombe per campioni negativi (FCS) Tipo di test per frequenze di chiamata Negativo Positivo Totale Kit artus HSV-1/2 QS-RGQ 60 0 60 Kit di confronto 59 1 60 Totale 119 1 120 Tabella 6. Intervallo di confidenza bilaterale al 95% asintotico: Metodo del punteggio di Newcombe per campioni positivi (FCS) Tipo di test per frequenze di chiamata Negativo Positivo Totale Kit artus HSV-1/2 QS-RGQ 14 188 202 Kit di confronto 29 173 202 Totale 43 361 404 artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 7

Tabella 7. Proporzione di chiamate corrette per ogni test (FCS) Serie di campioni Tipo di campione Kit artus HSV- 1/2 QS-RGQ: proporzione di chiamate corrette Kit di confronto: proporzione di chiamate corrette Differenza proporzioni (kit artus HSV-1/2 QS-RGQ kit di confronto) Intervallo inferiore di confidenza al 95% Intervallo superiore di confidenza al 95% Tutto Negativo 1,000 0,983 0,017-0,045 0,089 Tutto Positivo 0,931 0,856 0,074 0,014 0,136 I valori della sensibilità e della specificità analitiche per il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ sono stati rispettivamente del 93,1% e del 100%. I valori della sensibilità e della specificità analitiche per il kit di confronto sono stati rispettivamente del 85,6% e del 98,3%. La differenza di specificità analitica per il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ e il kit di confronto è stata dell 1,7% (intervallo di confidenza al 95%: 4,5-8,9%). La differenza di sensibilità analitica per il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ e il kit di confronto è stata del 7,4% (intervallo di confidenza al 95%: 1,4-13,6%). In generale i dati indicano una differenza inferiore al 2% in termini di specificità analitica tra il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ e il kit di confronto. Per quanto riguarda la sensibilità analitica, esiste invece una differenza pari a circa l 8% tra i kit, dove il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ presenta una migliore sensibilità rispetto al kit di confronto. Sensibilità analitica plasma Per il plasma, la sensibilità analitica del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ, tenendo conto della purificazione, è stata calcolata utilizzando una serie di diluizioni del materiale virale ATCC aggiunte al plasma umano, precisamente da 1.000 a 3,16 copie/ml per HSV-1 e da 316 a 1,00 copie/ml per HSV-2. I campioni sono stati sottoposti ad estrazione del DNA con il kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi in combinazione con il protocollo Cellfree1000_DSP (volume di estrazione: 1 ml, volume di eluizione: 60 µl). Ciascuna delle 8 diluizioni (9 per HSV-1; 8 per HSV-2) è stata analizzata con il kit artus HSV-1/2 QS- RGQ in 4 giorni diversi nell ambito di 4 sedute con 11 replicati ciascuna. I risultati sono stati determinati mediante un analisi probit. La Figura 3 illustra graficamente l analisi probit per HSV-1. Il limite di rilevabilità analitica per HSV-1 del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ, tenendo conto della purificazione in combinazione con il Rotor-Gene Q, è di artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 8

37,16 copie/ml (p = 0,05). Ciò significa che esiste una probabilità del 95% che vengano rilevate 37,16 copie/ml. La Figura 4 illustra graficamente l analisi probit per HSV-2. Il limite di rilevabilità analitica per HSV-2 del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ, tenendo conto della purificazione in combinazione con il Rotor-Gene Q, è di 43,24 copie/ml (p = 0,05). Ciò significa che esiste una probabilità del 95% che vengano rilevate 43,24 copie/ml. Proporzioni 37,16 copie/ml (intervallo di confidenza al 95%: 27,31-57.52 copie/ml) Figura 3. Analisi probit: plasma, HSV-1 (Rotor-Gene Q). Sensibilità analitica, tenendo conto della purificazione (urina, utilizzando il kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi), del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ sul Rotor-Gene Q. Log (dose) artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 9

43,24 copie/ml (intervallo di confidenza al 95%: 31,02-68.11 copie/ml) Proporzioni Figura 4. Analisi probit: plasma, HSV-2 (Rotor-Gene Q). Sensibilità analitica, tenendo conto della purificazione (urina, utilizzando il kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi), del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ sul Rotor-Gene Q. Log (dose) Range lineare plasma Il range lineare del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ, tenendo conto della purificazione, è stato calcolato analizzando una serie di diluizioni di materiale virale nel plasma da 2,89 x 10 7 copie/ml a 2,97 x 10 1 copie/ml per HSV-1, e da 1,51 x 10 7 copie/ml a 3,45 x 10 1 copie/ml per HSV-2. La purificazione è stata eseguita in replicati (n = 4 per concentrazioni 1,00 x 10 6 copie/ml; n = 8 per concentrazioni <1,00 x 10 6 copie/ml) utilizzando il kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi in combinazione con il protocollo Cellfree1000_DSP (volume di estrazione: 1 ml, volume di eluizione: 60 µl). Ogni campione è stato analizzato con il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ. Nel plasma, il range lineare del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ per HSV-1, tenendo conto della purificazione, è stato determinato per coprire le concentrazioni da 37,3 copie/ml a 2,89 x 10 7 copie/ml (Figura 5). Nel plasma, il range lineare del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ per HSV-2, tenendo conto della purificazione, è stato determinato per coprire le concentrazioni da 43,2 copie/ml a 1,51 x 10 7 copie/ml (Figura 6). artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 10

Log10 concentrazione stimata [log10 (copie/ml)] Intervallo lineare: 1,57 7,46 log10 (copie/ml) Log10 concentrazione nominale [log10 (copie/ml)] Figura 5. Range lineare del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ (HSV-1, plasma). Calcolo del range lineare. La linea retta è stata determinata mediante una regressione lineare del log10 delle concentrazioni calcolate con il log10 delle concentrazioni nominali. Log10 concentrazione stimata [log10 (copie/ml)] Intervallo lineare: 1,64 7,18 log10 (copie/ml) Log10 concentrazione nominale [log10 (copie/ml)] Figura 6. Range lineare del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ (HSV-2, plasma). Calcolo del range lineare. La linea retta è stata determinata mediante una regressione lineare del log10 delle concentrazioni calcolate con il log10 delle concentrazioni nominali. artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 11

Robustezza plasma La verifica della robustezza nel plasma consente la determinazione del tasso globale d errore del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ. Per verificare la robustezza per HSV-1, 30 campioni di plasma HSV-1-negativi sono stati arricchiti con 111,5 copie/ml di HSV-1 (concentrazione pari all incirca a tre volte il limite di sensibilità analitica). Per verificare la robustezza per HSV-2, 30 campioni di plasma HSV-2-negativi sono stati arricchiti con 129,7 copie/ml di HSV-2 (concentrazione pari all incirca a tre volte il limite di sensibilità analitica). In seguito ad estrazione con il kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi in combinazione con il protocollo Cellfree1000_DSP (volume di estrazione: 1 ml, volume di eluizione: 60 µl), i campioni sono stati analizzati con il kit artus HSV-;1/2 QS-RGQ. Per quanto concerne la robustezza nelle analisi del bersaglio HSV-1 e HSV-2, tutti i campioni (30/30) sono risultati positivi per HSV-1 e HSV-2 in ciascuna analisi. Inoltre, la robustezza del controllo interno è stata valutata dopo purificazione e analisi dei 48 campioni di plasma arricchiti. Questi campioni sono risultati completamente negativi per i bersagli HSV-1 e HSV-2 e completamente positivi per il controllo interno. Non sono state riscontrate inibizioni di alcun genere. Ne consegue che la robustezza del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ è pari al 99%. Sostanze interferenti plasma Quattro sostanze endogene (bilirubina, emoglobina, trigliceridi e proteina albumina) a concentrazioni elevate sono state identificate come potenzialmente interferenti se presenti nei campioni di plasma. È stato valutato il loro effetto nel plasma contenente HSV-1 o HSV-2 a concentrazioni pari a circa 10 volte il valore del limite di rilevamento (LOD) (rispettivamente 371,65 copie/ml e 432,39 copie/ml). Come controllo sono stati inclusi campioni di plasma arricchiti con HSV-1 e HSV-2 senza l aggiunta di sostanze interferenti. Tutti i campioni, con o senza sostanze interferenti, sono stati analizzati in 4 replicati utilizzando il kit QIAsymphony DSP Virus/Pathogen Midi in combinazione con il protocollo Cellfree1000_DSP (volume di estrazione: 1 ml, volume di eluizione: 60 µl). Per i campioni contenenti livelli elevati di inibitori endogeni (bilirubina, emoglobina, trigliceridi e proteina albumina) non sono state osservate interferenze sul rilevamento di HSV-1 e HSV-2. artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 12

Valutazione clinica plasma Le prestazioni cliniche del test artus HSV-1/-2 QS-RGQ sono state valutate utilizzando campioni artificiali e analizzando i relativi riscontri rispetto ai risultati ottenuti applicando un metodo CE-IVD confrontabile. Sono stati preparati in totale 464 campioni di plasma umano trattati con EDTA (HSV-1/-2 positivi: n = 386; HSV-1/-2 negativi: n = 78), poi analizzati con il kit artus HSV-1/-2 QS-RGQ e con un metodo di confronto presso un laboratorio clinico-diagnostico esterno. I risultati sono stati analizzati per determinarne la sensibilità e la specificità analitiche, quindi riferiti per entrambi i test per dimostrarne le prestazioni equivalenti. Tabella 8. Intervallo di confidenza bilaterale al 95% asintotico: Metodo del punteggio di Newcombe per campioni negativi (plasma) Tipo di test per frequenze di chiamata Negativo Positivo Totale Kit artus HSV-1/2 QS-RGQ 39 0 39 Test di confronto 39 0 39 Totale 78 0 78 Tabella 9. Intervallo di confidenza bilaterale al 95% asintotico: Metodo del punteggio di Newcombe per campioni positivi (plasma) Tipo di test per frequenze di chiamata Negativo Positivo Totale Kit artus HSV-1/2 QS-RGQ 0 193 193 Test di confronto 0 193 193 Totale 0 386 386 Tabella 10. Proporzione di chiamate corrette per ogni test (plasma) Serie di campioni Tipo di campione Kit artus HSV- 1/2 QS-RGQ: proporzione di chiamate corrette Kit di confronto: proporzione di chiamate corrette Differenza proporzioni (kit artus HSV-1/2 QS-RGQ kit di confronto) Intervallo inferiore di confidenza al 95% Intervallo superiore di confidenza al 95% Tutto Negativo 1,000 1,000 0,000-0,090 0,090 Tutto Positivo 1,000 1,000 0,000-0,020 0,020 artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 13

artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 14

I valori della sensibilità e della specificità analitiche per il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ sono stati entrambi del 100%. I valori della sensibilità e della specificità analitiche per il kit di confronto sono stati entrambi del 100%. La differenza di specificità analitica per il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ e il kit di confronto è stata dello 0% (intervallo di confidenza al 95%: -9-9%). La differenza di sensibilità analitica per il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ e il kit di confronto è stata dello 0% (intervallo di confidenza al 95%: -2-2%). In generale i dati mostrano che la differenza stimata in termini di specificità e sensibilità analitiche tra il kit artus HSV-1/2 QS-RGQ e il kit di confronto era pari a zero. Precisione I dati sulla precisione del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ consentono la determinazione della varianza totale del test. La varianza totale è composta dalla variabilità intra-test (variabilità di risultati multipli di campioni con la stessa concentrazione in uno stesso esperimento), dalla variabilità inter-test (variabilità di risultati multipli del test generati su strumenti differenti dello stesso tipo da operatori differenti in uno stesso laboratorio) e dalla variabilità inter-lotto (variabilità di risultati multipli del test ottenuti con lotti diversi). I dati ottenuti sono stati utilizzati per determinare la deviazione standard, la varianza e il coefficiente di variazione per il patogeno specifico e il controllo interno di PCR. I dati sulla precisione analitica del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ (senza tenere conto della purificazione) sono stati raccolti mediante DNA di HSV-1 e HSV-2 alla concentrazione di 10 copie/µl. I test sono stati effettuati con 8 replicati. I dati sulla precisione sono stati calcolati in base ai valori CT delle curve di amplificazione (CT: ciclo soglia, vedi Tabelle 11 e 12). Sulla base di tali risultati, lo scarto statistico generale di un dato campione alla concentrazione menzionata è di 1,82% (CT) per HSV-1, 0,67% (CT) per HSV-2, e 1,24% (CT) e 1,58% (CT) rispettivamente per il rilevamento del controllo interno. Questi valori si basano sulla totalità di tutti i singoli valori della variabilità calcolata. artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 15

Tabella 11. Dati sulla precisione per HSV-1 sulla base dei valori C T Variabilità intra-test: HSV-1 10 copie/µl Variabilità intra-test: Variabilità inter-test: HSV-1 10 copie/µl Variabilità inter-test: Variabilità inter-lotto: HSV-1 10 copie/µl Variabilità inter-lotto: Varianza totale: HSV-1 10 copie/µl Varianza totale: Valore C T Deviazione standard Coefficiente di variazione (%) 30,46 0,25 0,81 25,29 0,08 0,30 29,69 0,69 2,05 24,97 0,31 1,25 29,95 0,40 1,35 24,90 0,30 1,20 29,91 0,55 1,82 24,99 0,31 1,24 Tabella 12. Dati sulla precisione per HSV-2 sulla base dei valori C T Variabilità intra-test: HSV-2 10 copie/µl Variabilità intra-test: Variabilità inter-test: HSV-2 10 copie/µl Variabilità inter-test: Variabilità inter-lotto: HSV-2 10 copie/µl Variabilità inter-lotto: Varianza totale: HSV-2 10 copie/µl Varianza totale: Valore C T Deviazione standard Coefficiente di variazione (%) 29,85 0,15 0,50 25,17 0,39 1,55 29,92 0,15 0,49 25,11 0,41 1,63 29,80 0,23 0,79 24,89 0,33 1,32 29,88 0,20 0,67 25,07 0,40 1,58 artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 16

Riproducibilità I dati sulla riproducibilità consentono una regolare valutazione delle prestazioni del kit artus HSV-1/2 QS- RGQ nonché un confronto di efficacia con altri prodotti. Questi dati sono ottenuti dalla partecipazione a programmi di valutazione consolidati. Cross-contaminazione L assenza di cross-contaminazione fra i campioni per l intero flusso di lavoro è stata dimostrata dal corretto rilevamento di tutti i campioni positivi e negativi in posizioni alternate (modello a scacchiera) per un sistema artus QS-RGQ rappresentativo. artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 17

I prodotti correlati e le informazioni per l ordine sono elencati nel manuale del kit artus HSV-1/2 QS-RGQ Per informazioni aggiornate sulla licenza e per i disclaimer specifici dei prodotti, consultare il manuale del kit o il manuale utente QIAGEN. I manuali dei kit e i manuali utente QIAGEN sono disponibili nel sito www.qiagen.com oppure possono essere richiesti al servizio di assistenza tecnica QIAGEN o al proprio distributore locale. Marchi commerciali: QIAGEN, Sample to Insight, QIAsymphony, artus, Rotor-Gene (Gruppo QIAGEN); ATCC, VR-260, VR-734 (American Type Culture Collection); Acrometrix (Life Technologies). I marchi, i nomi registrati ecc. utilizzati nel presente documento, anche se non contrassegnati specificamente come tali, vanno considerati protetti dalla legge. 09/2015 HB-0403-D01-001. 2012 2015 QIAGEN, tutti i diritti riservati. Ordini www.qiagen.com/contact Assistenza tecnica support.qiagen.com Sito web www.qiagen.com artus HSV-1/2 QS-RGQ Kit: Performance Characteristics 09/2015 18