Urinocoltura : dal prelievo all antibiogramma antibiogramma Dott.ssa Franca Benini U.O.Microbiologia Centro Sevizi Laboratorio Unico Pievesestina Forlì 17 maggio 2011
Il campione microbiologico: il percorso analitico
Il campione microbiologico: il percorso analitico Isolamento e identificazione dei germi patogeni sempre e solo attraverso un percorso a fasi diverse: Fase pre-analitica Fase analitica Fase post-analitica - richiesta - prelievo - raccolta campione - accettazione - conservazione e trasporto - esecuzione dell esame - validazione - refertazione - turn around times - elaborazione statistica
L'appropriatezza della fase pre-analitica condiziona fortemente la qualità della risposta microbiologica: un campione non idoneo può determinare il mancato isolamento dei microrganismi veri responsabili a fronte del riscontro di batteri contaminanti o della normale popolazione residente. La parte preanalitica è il momento più critico di tutto il percorso
Quali sono gli strumenti che possono aiutare a gestire la qualità della fase preanalitica? richiesta mirata al quesito diagnostico campione appropriato alla richiesta (informazione e preparazione del paziente, prelievo idoneo e contenitore corretto) identificazione corretta del campione conformità del campione ai protocolli in uso (istruzioni sugli esami effettuati, modalità di prelievo, trasporto e conservazione del campione)
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Urinocolture
Fase analitica scelta di terreni idonei di coltura e corrette modalità di incubazione identificazione del germe patogeno tipizzazione (biotipo, antibiotipo, sierotipo, genotipo) prova di sensibilità agli antibiotici con un metodo standardizzato preferibilmente quantitativo e soggetto alla valutazione del controllo di qualità
Gli strumenti per la qualità della fase analitica Livello tecnologico del laboratorio e relativo aggiornamento strumentale Standardizzazione dei metodi analitici Controllo della qualità (CQI,VEQ) Qualificazione professionale e aggiornamento continuo del personale
Fase post-analitica Refertazione: interpretazione dei dati colturali (identificazioni ed antibiogrammi), commenti al referto, contatti con il clinico Trasmissione dati Conservazione ceppi batterici particolari Elaborazione statistica dei dati (segnalazione tempestiva di isolamenti critici germi sentinella, analisi dei dati storici per la sorveglianza e la diffusione delle resistenze batteriche).
Fase post-analitica: il referto Nessuna crescita di batteri e lieviti Carica batterica approssimativa: 100.000 CFU/ml.. Popolazione microbica mista presente in concentrazione non significativa Popolazione microbica mista presente in alta carica da probabile contaminazione durante la raccolta del campione
I commenti al referto Il microrganismo è un GERME SENTINELLA: potrebbero insorgere problemi di diffusione e terapia, in tal caso fare riferimento alle procedure aziendali. Acinetobacter MDR: verificare se si tratta di colonizzazione o di infezione; prima del trattamento consultare gli infettivologi. Stafilococco aureo meticillino-resistente (MRSA) resistente a beta-lattamici, cefemi e carbapenemi. I ceppi ESBL+ ad eccezione dei carbapenemi la terapia con beta-lattamici potrebbe risultare scarsamente efficace od inefficace indipendentemente dalla sensibilità in vitro. Nel caso di infezioni sistemiche si racciomanda consulenza infettivologica.
Il data base aziendale I microrganismi isolati ed i relativi antibiogrammi sono gli elementi strutturali di un grande data base di AVR da cui si ricava la diffusione, la frequenza e la tipologia dei germi presenti nel territorio e le loro caratteristiche di resistenza (osservatorio epidemiologico)
Richieste esami batteriologici in AVR Anno 2010 Anno 2009 TOTALI Esterni Interni Altro DH Ass.domiciliari RSA/C.P. 17859 21196 5195 5158 2713 2906 2326 2643 134709 141005 108660 111279 271462 284187 0 50000 100000 150000 200000 250000 300000
Richieste esami batteriologici in AVR per tipo di campioni Anno 2009 Anno 2010 Urine Sangue App.genitale App.gastroenterico Alte vie respiratorie Pus essudati, liquidi vari Basse vie respiratorie 20249 20853 22248 24856 16464 16843 16930 16789 13652 12095 65294 72170 116409 120581 0 20000 40000 60000 80000 100000 120000 140000
Richieste esami batteriologici in AVR ANNO 2010 (per tipo reparto) Esterni 141005 Interni 111279 Altro 21196 DH Ass.domiciliari RSA/C.P. 5158 2906 2643 0 20000 40000 60000 80000 100000 120000 140000 160000
Richieste esami batteriologici - AUSL Forlì- per tipo reparto Anno 2010 Anno 2009 TOTALI 46057 45471 Esterni 22412 22885 Interni 14275 14255 Altro 7584 6666 DH Ass.domiciliari RSA/C.P. 807 799 535 506 444 360 0 5000 10000 15000 20000 25000 30000 35000 40000 45000 50000
Richieste esami batteriologici - AUSL Forlì -per tipo materiale Anno 2010 Anno 2009 Urine Sangue 8825 9766 15876 15675 App.genitale Pus essudati, liquidi vari App.gastroenterico Alte vie respiratorie Basse vie respiratorie 4923 4537 4369 3762 4158 4418 3940 4028 3746 3285 0 2000 4000 6000 8000 10000 12000 14000 16000 18000
Urine 12000 10000 8000 6000 4000 2000 0 Richieste esami batteriologici 2010 AUSL Forlì per tipo di reparto e materiale ESTERNI INTERNI RSA/CP ADI Sangue Pus essudati, liquidi vari App.gastroenterico Alte vie respiratorie App.genitale Basse vie respiratorie
% positività dei campioni inviati AUSL Forlì Anno 2010 Anno 2009 Urine Sangue App.genitale Pus essudati, liquidi vari App.gastroenterico Alte vie respiratorie Basse vie respiratorie 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45
Microrganismi da URINOCOLTURE Anno 2010 AUSL Forlì Campioni ESTERNI Campioni INTERNI Pseudomonas aeruginosa Proteus mirabilis Klebsiella pneumoniae Enterococcus faecalis Escherichia coli 0,0 10,0 20,0 30,0 40,0 50,0 60,0 70,0 80,0 90,0
% Sensibilità Escherichia coli da URINA - AUSL Forlì - Anno 2010 Campioni esterni Campioni interni Nitrofurantoina Gentamicina Cotrimoxazolo Ciprofloxacina Ceftazidima Cefotaxima Ampicillina Amoxicillina/Clavulanico 0 20 40 60 80 100 120
L'antibiogramma: ci sono novità??
L'antibiogramma: ci sono novità??
La MIC (minima concentrazione inibente)
Da Antibiogramma 2011 Documento RER Le categorie di interpretazione
Da Antibiogramma 2011 Documento RER La MIC (minima concentrazione inibente)
Tutti gli antibiotici testati sono S (Non interessa il valore numerico di MIC)
La sensibilità : è sempre uguale???
Da Antibiogramma 2011 Documento RER Combinazioni antibiotico microrganismo per cui non è prevista refertazione Enterobatteri e cefazolina Enterococchi e fluorochinoloni Combinazioni antibiotico microrganismo per cui è prevista refertazione più restrittiva Proteus mirabilis e ciprofloxacina Pseudomonas aeruginosa e amikacina
E.coli Pr.mirabilis - CIPROFLOXACINA CIPROFLOXACINA - E.coli (n.10361) 120 100 80 60 40 20 0 28,8 29,2 0,4 2,2 S % - 2,2 70,8 68,6 CLSI EUCAST R % I% S % >4 > 4 2 2 1 1 0,5 0,5 < 0,25 < 0,25 CLSI EUCAST Ciprofloxacina CIPROFLOXACINA - Pr.m irabilis (n.1116) 120 100 80 60 40 20 33,2 10,8 55,9 S % -11,1 44,1 11,1 44,8 R % I% S % 0 CLSI EUCAST
CEPPO ESBL: attenzione alla nota in calce al referto
Linea guida regionale 2010
Linea guida regionale 2010: diagnosi
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