QUANTIFICAZIONE DEI CAMPIONI

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ε 340 nm A 260 nm A 260nm = 1.36 A 340 nm = A 340nm A = c [NADH] = : 6.22 x 10 3 = x 10-6 M

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IMMUNOCHIMICA

QUANTIFICAZIONE DEI CAMPIONI Metodi colorimetrici vs Determinazione spettrofotometrica diretta Metodi immunichimici

TECNICHE IMMUNOCHIMICHE Si basano tutte sull uso di anticorpi (Ab). Anticorpo: glicoproteine solubili, della classe delle immunoglobuline (Ig), prodotte e secrete dai linfociti B. Antigene: Qualsiasi sostanza estranea che induca risposta immunitaria (polisaccaridi, proteine, acidi nucleici). Sostanza riconosciuta e legata da un anticorpo.

Keith Wilson School of Life Sciences University of Hertfordshire, UK Il biochimico, tuttavia, più che alle complesse interazioni che si verificano nella risposta immunitaria in vivo, è interessato all uso delle tecniche immunochimiche in vitro. Occorre infatti sottolineare che non è necessario essere cultori di immunologia per poter impiegare e capire, la maggior parte delle tecniche immunochimiche.

TECNICHE IMMUNOCHIMICHE Si basano tutte sull uso di anticorpi (Ab). Anticorpo: glicoproteine solubili, della classe delle immunoglobuline (Ig), prodotte e secrete dai linfociti B. Antigene: Qualsiasi sostanza estranea che induca risposta immunitaria (polisaccaridi, proteine, acidi nucleici). Sostanza riconosciuta e legata da un anticorpo. PM = ~ 150 kda

SCHEMATIZZAZIONE DI UN IgG Porzioni variabili Legame con l antigene Porzione costante Mantiene la struttura 3D dell Ab,fissa il complemento,interagisce con recettori cellulari...

BASI MOLECOLARI DELL IMMUNOCOMPLESSO Forces Involved in Antigen-binding The binding of an antigen to an antibody takes place by the formation of multiple noncovalent bonds between theantigen and the amino acids of the binding site. The strength of a single antigen antibody bond is the antibody affinity. It is produced by summation of the attractive and repulsive forces (van der Waals interactions, hydrogen bonds, salt bridges and hydrophobic force). The interaction of the antibody-combining site with antigen can be investigated thermodynamically and kinetically by using monovalent antibody fragments (fragments of variable regions or Fab). http://immuneweb.xxmu.edu.cn/reading/adative/12.pdf

SIGNIFICATO PRATICO DEL TIPO DI LEGAME ph ESTREMI ALTA TEMPERATURA ALTA CONCENTRAZIONE SALINA

CARATTERISTICHE DI UN ANTICORPO Monovalenti Multivalenti Anticorpi Specifici Sensibili Monoclonali Policlonali Proteina + Ab policlonale

CARATTERISTICHE DI UN ANTICORPO Monovalenti Multivalenti Anticorpi Specifici Sensibili Monoclonali Policlonali Cross reattività Capacità di un singolo Ab di legarsi a più epitopi o di una popolazione di Ab di reagire con più antigeni. Cause: - Epitopi in comune (1) - Epitopi strutturalmente simili (2)

CROSS REATTIVITA Ab Anti-A Ab Anti-A Ab Anti-A Ag A Riconoscimento corretto Ab-Ag A Ag B Epitopi condivisi (1) Ag C Epitopi simili (2) Effetto: falso segnale positivo

ESEMPIO REALE DI CROSS REATTIVITA Albumina bovina (BSA) vs Albumina umana (HSA) HSA 10 ug HSA 20 ug HSA 40 ug BSA 5 ug Riconoscimento con anti-bsa

AFFINITA - Forza della reazione fra un singolo epitopo dell Ag e un singolo sito di legame sull Ab (affinità). - Equilibrio fra forze di attrazione e di repulsione. - Legami non covalenti multipli. - Reversibilità del legame. - Matematicamente è rappresenta dalla costante di associazione all equilibrio (Ka o dalla Kd).

AVIDITA Misura la forza di legame totale di un Ab con un Ag con molti determinanti antigenici. Avidità Kd = 10-10 M Affinità Kd = 10-4 M Y Avidità Kd = 10-6 M Y L avidità è > della somma delle singole affinità. Forza Ionica - ph Temperatura contano sempre!

IMMUNOPRECIPITAZIONE Molti Ab divalenti (IgG) e multivalenti (IgM) hanno la capacità di far precipitare antigeni in soluzione, per formazione di un grande reticolo macromolecolare. Eccesso di Ab Equivalenza Eccesso di Ag Non può avvenire con Ab monoclonali che riconoscano un solo epitopo sull antigene (Ag monovalenti).

Quantità di precipitato (ppt) ZONA DI EQUIVALENZA Non si raggiunge MAI ad un vero plateau. Eccesso di Ab Equivalenza Eccesso di Ag 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 [Ag]

IMMUNOPRECIPITAZIONE IN SOLUZIONE PER ANALISI QUALITATIVE Per determinare la PRESENZA di un Ag in un campione. Soluzione con l Ab Campione con l Ag (4 C-16h) Surnatante ppt Ab-Ag PROBLEMI: tecnica lenta e presenza di falsi negativi

IMMUNOPRECIPITAZIONE IN SOLUZIONE - OGGI AUMENTO DELLA EFFICIENZA Lisato cellulare o mistura di proteine Aggiunta Ab-biglia di Sefaroso Centrifugazione Ab già coniugato ad una biglia, facile da separare dalla soluzione. http://www.piercenet.com/method/co-immunoprecipitation-co-ip

IMMUNOPRECIPITAZIONE IN SOLUZIONE AUMENTO DELLA EFFICIENZA - Aggiungere una molecola che forma con l ab un complesso insolubile (es. proteina A). - Centrifugazione e rimozione del surnatante. Biglie magnetiche

INDAGINI QUANTITATIVE: IMMUNOPRECIPITAZIONE SU GEL IMMUNODIFFUSIONE (ID) Concetto : antigeni solubili diffondono in gel di agarosio creando un gradiente di concentrazione. Max [Ag]: in corrispondenza del punto di deposizione dell Ag. Min [Ag]: alla massima distanza dal punto di deposizione dell Ag.

IMMUNODIFFUSIONE RADIALE SEMPLICE (SRID) Gel Agaroso + Ab = Concentrazione massima

IMMUNODIFFUSIONE RADIALE SEMPLICE (SRID) Gel Agaroso + Ab = Concentrazione massima = Zona di equivalenza

IMMUNODIFFUSIONE RADIALE SEMPLICE (SRID) = Concentrazione massima = Zona di equivalenza

PIASTRE PER LA SRID Liofilchem IMMUNOLOGY Contengono coloranti per evidenziare gli immunocomplessi.

IMMUNODIFFUSIONE RADIALE SEMPLICE (SRID) - Ab incorporato in un gel di agarosio a 56 C. - Ag aggiunto in pozzetti diffusione formazione di un gradiente anelli di ppt al punto di equivalenza. Curva di taratura - Possibile realizzazione di una curva standard test quantitativo. Metodo di Mancini - degli anelli proporzionale alla [Ag].

ESEMPIO DI SRID Usata per misurare la concentrazione totale di IgG e IgM in alcune patologie. L Ag cercato può esser un Ab! Curva di taratura

IMMUNOELETTROFORESI 1. Miscela di Ag, separati per elettroforesi su agarosio. 2. Deposizione e diffusione di un Ab. 3. Formazione di archi di precipitazione (zona di equivalenza). Misura qualitativa. Possibile stima quantitativa (spessore delle bande di precipitazione). Es. analisi: le componenti seriche. NB Risparmio di Ab!

IMMUNOELETTROFORESI Usata su campioni di siero, urina, e liquido spinale.

IMMUNOELETTROFORESI ROCKET [Ab] costante nel gel + (Anodo) Concentrazione crescente di Ag Modificazione della SRID Pozzetti per l Ag - (Catodo) Bande di precipitazione a forma di razzo, la cui AREA (o h) è proporzionale alla [Ag]. Tecnica quantitativa.

IMMUNOELETTROFORESI ROCKET Valida solo per Ag con pi bassi. Gel di agaroso + Curva di taratura? Campioni Ag: pi basso per garantire una carica negativa al ph del gel. Ab: preferibilmente con carica nulla o positiva, come normalmente avviene a ph 8.6. -

CONFRONTO FRA TECNICHE SRID IMMUNOELETTROFORESI ROCKET IMMUNOELETTROFORESI Diffusione e precipitazione Elettroforesi, poi diffusione e precipitazione Elettroforesi e precipitazione

Diameter 2 (mm 2 ) ESERCIZIO SULLA SRID 8 y = 0,1243x - 0,0714 R 2 = 0,9989 4 0 0 30 60 Ag concentration (ng) Y = 4.2 mm 2 X = 34.4 ng

DILUIZIONI Soluzione A 50 ml Soluzione B 50 ml Concentrazione iniziale (Ci o C1) = 100 mm Concentrazione finale (Cf o C2)? Quanto sono V1 e V2?

Conti di laboratorio più frequenti Molarità (M) = n moli soluto/litro di soluzione n moli = massa/pm % p/p: 10% p/p di KCl 10 g di soluto in 100 g di soluzione, ovvero 10 g di KCl + 90 g di solvente (es. H 2 O). % p/v: 10% p/v di KCl 10 g di soluto in 100 ml di soluzione, cioè 10 g di sale portati a volume sino a 100 ml, con H 2 O % p/v = % p/p. d (densità) d = Massa/Volume DILUIZIONI : C1.V1 = C2.V2

Soluzione A Soluzione B X ml C1.V1=C2.V2 X ml C1 = 4X V1 = ml C2 = 1X V2 = 200 ml

Condizioni sperimentali GEL di PAA 8% (15 ml) TBE 5X 1X 3.00 ml Acril/bisAcril 40% 8% 3.00 ml APS 0.66% 100 L TEMED 10 µm 10 nm 15 L H 2 O A volume 15 ml m µ n