CALICIVIRUS ENTERICI UMANI

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1 CALICIVIRUS ENTERICI UMANI SAPOVIRUS NOROVIRUS Maggior parte (90%) delle forme gastro-enteriche non batteriche nell uomo in soggetti di ogni eta (green et al., 2000) IMPORTANTI PATOGENI ENTERICI DEI BAMBINI (15-40% CASI DI ENTERITE SPORADICA) (Ramirez et al., 2006) IN USA NoV CAUSA 23 MILIONI DI CASI L ANNO

2 CALICIVIRUS ENTERICI UMANI SAPOVIRUS NOROVIRUS TRASMISSIBILI CON ALIMENTI MOLTO VARIABILI NETWORK EUROPEO PER MONITORAGGIO (DIVINE-NET)

3 CALICIVIRUS ENTERICI UMANI SAPOVIRUS NOROVIRUS NOTEVOLE ETEROGENEITA GENETICA CLASSIFICAZIONE CONTROVERSA (Vinje et al., 2003, Wang et al., 2005; Zheng et al., 2006; Farkas, 2004)

4 NOROVIRUS Famiglia: CALICIVIRIDAE Genere: Lagovirus, Norovirus, Sapovirus e Vesivirus Virus a simmetria icosaedrica Privi di envelope Piccoli ( nm) RNA Virus a singolo filamento a polarità positiva

5 ORGANIZZAZIONE GENOMICA Genoma organizzato in 3 ORF, poliadenilato all estremità 3 5 ORF-1(5400nt) RdRp ORF-2 (1600nt) ORF-3 (700nt) 3 ORF 1 ORF 2 ORF 3 Poliproteina non strutturale Proteina capsidica maggiore VP1 Proteina capsidica minore VP2

6 NOROVIRUS (NoV) 5 GENOGRUPPI (GGI-GGV) 32 GENOTIPI GGI GGII NoVs UMANI GGIII NoVs BOVINI GGIV D GGII.18 GGII.19 D NoVs SUINI GGV NoVs TOPO GGII.11

7 NOROVIRUS (NoV) MOLTI CEPPI CIRCOLANO O CO- CIRCOLANO NELLA POPOLAZIONE UMANA SOLO POCHI CEPPI SONO DOMINANTI SU SCALA GLOBALE GGII.4 cluster, Lordsdale-like GGII variant, Farmington Hills GGIIb/Hilversum GGII a GGII variant, Hunter GGII b

8 NOROVIRUS (NoV) CEPPI GII RAPPRESENTANO IL 90% DEI NoV IDENTIFICATI NoV GII.4 HANNO AFFINITA PER AMPIO SPETTRO DI RECETTORI (ABO, H, Lewis) QUESTO SPIEGHEREBBE LA LORO DIFFUSIONE

9 NOROVIRUS (NoV) ALCUNI CEPPI SONO IDENTIFICATI IN MODO SPORADICO GGIV, Alphatron/98-2/98/NL GGIV, Fort Lauderdale/560/98/US GGIV, Saint Cloude/624/98/US

10 IDENTIFICAZIONE DI NoV NEI CARNIVORI SIMILI A NoV UMANI NoV POSSONO INFETTARE SPECIE ETEROLOGHE CONTATTO CON CARNIVORI DOMESTICI ASSOCIATO CON AUMENTO PREVALENZA ANTICORPI PER NoV FENOMENO RICOMBINAZIONE GENETICA E MOLTO FREQUENTE NEI CALICIVIRUS E DETERMINA COMPARSA NUOVI CEPPI

11 IDENTIFICAZIONE DI NoV NEI CARNIVORI SIMILI A NoV UMANI PROSPETTIVE MESSA A PUNTO DI SISTEMI DIAGNOSTICI SPECIFICI STUDI SIERO-EPIDEMIOLOGICI IN CARNIVORI SELVATICI E DOMESTICI STUDI SIERO-EPIDEMIOLOGICI IN UOMO INCLUSIONE TEST DIRETTI SPECIFICI IN ALGORITMI DIAGNOSTICI FORME ENTERICHE UMANE AD EZIOLOGIA NON NOTA

12 MODALITA DI TRASMISSIONE Molluschi Molluschi Contatto Contatto diretto diretto Alimenti preparati Contaminazione ambientale Frutta, insalate, etc Acqua

13 SINTOMATOLOGIA Periodo d incubazione: 12/48h Sintomatologia gastroenterica acuta; si esaurisce entro le 60h. Nausea Vomito Diarrea acquosa Crampi addominali Lieve rialzo febbrile Eliminazione del virus con le feci per almeno 72h dopo la guarigione L immunità post contagio dura solo alcuni mesi Lo stesso individuo può infettarsi più volte nel corso della vita

14 SAPOVIRUS (SaVs) CALICIVIRUS 5 GENOGRUPPI (GGI-GGV) GGII GGI GGV GGIV HUMAN SaVs 10 GENOTIPI GGIII (Cowden) PORCINE SaVs GGVI? J681/00/US) GGVII? (K7/JP & K10/JP ) GGVIII? (43/06-18p3/It)

15 EVOLUZIONE DEI CALICIVIRUS CALICIVIRUS MUTAZIONI PUNTIFORMI IMPRESSIONANTE ETEROGENEITA GENETICA RICOMBINAZIONE ANALISI DI POLIMERASI & REGIONI CAPSIDICHE CLASSIFICAZIONE INCERTA

16 EVOLUZIONE DEI CALICIVIRUS CALICIVIRUS MUTAZIONI PUNTIFORMI IMPRESSIONANTE ETEROGENEITA GENETICA E ANTIGENICA

17 EVOLUZIONE DI CALICIVIRUS CALICIVIRUS RICOMBINAZIONE PCR DIAGNOSTICA ANALISI SEQUENZA 1 nt 7708 nt 5 (A)n 3 1 nt 7708 nt 5 (A)n 3 1 nt 7708 nt 5 (A)n 3 JUNCTION REGION

18 RICOMBINAZIONE RICOMBINAZIONE E STATA DESCRITTA FREQUENTEMENTE TRA VIRUS CORRELATI GENETICAMENTE, DELLO STESSO GENOGRUPPO O GENOTIPO NoV UMANO GGIIb/HILVERSUM E FATTO DA UNA VARIETA DI GENOTIPI CAPSIDICI GGII (Reuter al., 2005; 2006) 5 1 nt (A)n 3 Mexico/1989 (GGII.3) 5 1 nt (A)n 3 Snow Montain/1976 (GGII.2) 5 1 nt (A)n 3 Hawaii/1971 (GGII.1) 5 1 nt (A)n 3 Lordsdale/1993 (GGII.4) 5 1 nt GGIIb/HILVERSUM (A)n 3 ORIGINE NON NOTA

19 RICOMBINAZIONE RICOMBINAZIONE DESCRITTA ANCHE TRA VIRUS NON CORRELATI GENETICAMENTE SaV UMANI DI GENOGRUPPO GGIV SONO IL RISULTATO DI RICOMBINAZIONE TRA VIRUS DI GENOGRUPPO GGII E VIRUS GGIV ANIMALI (Hansman et al., 2005) 5 (A)n 3 GGII SaV umani 5 (A)n 3 GGIV SaV animale? 5 (A)n GGIV SaV umani

20 INFEZIONI ETEROLOGHE NoV POSSONO INFETTARE SPECIE ETEROLOGHE CEPPO UMANO GGII PUO INFETTARE SUINI IN MODO ASINTOMATICO O CAUSARE SINTOMATOLOGIA LIEVE (Cheetham et al., 2006) CEPPO UMANO GGII.4 IDENTIFICATO IN SUINI (Mattison et al., 2007)

21 INFEZIONI UMANE UOMO SI INFETTA CON NoV E SaV MEDIANTE: CONTATTO DIRETTO ACQUA CONTAMINATA VERDURE CONTAMINATE CONSUMO DI MOLLUSCHI CRUDI INFEZIONI PEDIATRICHE DA NoV SONO MOLTO PIU FREQUENTI IN PUGLIA E SICILIA CHE IN EMILIA ABITUDINI ALIMENTARI INFLUENZANO EPIDEMIOLOGIA MALATTIE A CICLO ORO-FECALE?

22 INFEZIONI UMANE VIRUS ALTAMENTE DIFFUSIVI: NAVI MALEDETTE RESISTENTI IN AMBIENTE VENGONO CONCENTRATI DA MOLLUSCHI AZIONE FILTRAZIONE BIOLOGICA NoV SONO ORA MENZIONATI DA NORMATIVE EUROPEE SU MOLLUSCHI INCLUSI IN ELENCO B - ALL. 1 - DIRETTIVA 2003/99/CE RICERCA DI NoV IN ALIMENTI E IMPORTANTE PER PREVENIRE FORME GASTROENTERICHE

23 TUTTAVIA RECENTEMENTE, UNA NUOVA LEGISLAZIONE E STATA EMANATA A LIVELLO COMUNITARIO PER SUPPORTARE LA SORVEGLIANZA DELLE ZOONOSI E DEGLI AGENTI ZOONOSICI IN TUTTI GLI ANIMALI NELLA COMUNITA EUROPEA AL FINE DI RECEPIRE LA DIRETTIVA EU SULLE ZOONOSI 2003/99/EC IN TALE DIRETTIVA I CALICIVIRUS SONO INCLUSI NELL ELENCO B DEGLI AGENTI ZOONOSICI

24 ECOLOGIA CALICIVIRUS EPIDEMIOLOGIA MOLECOLARE CALICIVIRUS ANIMALI NON NOTA COMPRENSIONE ECOLOGIA NoVs E SaV E LIMITATA IL RUOLO DI ANIMALI COME SERBATOIO DI INFEZIONE NON E CHIARO NoV O SaV ANIMALI POSSONO ESSERE PASSATI ALL UOMO NEL TEMPO MEDIANTE TRASMISSIONE DIRETTA O SCAMBIO DI MATERIALE GENETICO MEDIANTE RICOMBINAZIONE INTRA- O INTER-GENOGRUPPO CON VIRUS UMANI

25 NOROVIRUS RICOMBINANTE DEL CANE GVI.2/BARI/91/07 SEQUENZE NOROVIRUS SIMILI IDENTIFICATE IN OSTRICHE IN GIAPPONE RITENUTI DAI RICERCATORI DEI NUOVI CEPPI UMANI VIRUS DI ORIGINE ANIMALE?

26 STUDI FUTURI STUDIARE L EPIDEMIOLOGIA DEI CALICIVIRUS IN ANIMALI DOMESTICI E NON INTERAZIONI TRA STIPITI CV ANIMALI E UMANI? POSSONO CV ANIMALI AGIRE COME SERBATOIO DI MATERIALE GENETICO PER LA DIVERSIFICAZIONE DEI CV UMANI?