Il progetto MIRRI: ruolo delle collezioni di microorganismi nello sviluppo delle biotecnologie italiane. Mycotheca Universitatis Taurinensis Dept. Life Science and Systems Biology www.mut.unito.it Info.mut@unito.it
Il progetto MIRRI è stato ideato nell ambito dell ESFRI Ed è entrato nella Road Map europea nel 2010 European Strategy Forum on Research Infrastructures (ESFRI) ESFRI è uno strumento EU per: sviluppare l'integrazione scientifica in Europa; rafforzare la sua proiezione internazionale.
European Strategy Forum on Research Infrastructures Construzione di nuove Infrastrutture di Ricerca (RI) Fase preparatoria (3 anni) Fase esecutiva (3 anni) Struttura legale della RI European Research Infrastructure Consortium - ERIC Attraverso la costituzione di un ERIC si passa alla fase operativa Almeno 3 Stati della EU Ogni governo paga per la sua struttura (90%)
Costruire una Infrastruttura di Ricerca Pan Europea Fornire servizi per facilitare l'accesso a microrganismi di alta qualità, loro derivati e dati associati per favorire la ricerca, lo sviluppo e la bioeconomia; Connettere le Collezioni microbiche, i ricercatori e i politici per fornire le risorse e i servizi in modo più efficace ed efficiente per soddisfare le esigenze di innovazione nel settore delle biotecnologie.
Il network deve essere: Semplice Efficiente, veloce Multiuso, multi-utenti Economicamente sostenibile > per conservare e rendere disponibile in materiale biologico evitando inutili sovrapposizioni; > per gestire e sfruttare le informazioni; > condividere e diffondere la conoscenza. Condividere non sono il materiale biologico, ma anche l esperienza dei differenti centri implementando gli strumenti a disposizione della comunità scientifica e delle aziende.
Partners Core group (16) Collaborating parties (including ECCO members)
Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen - DSMZ CAB International Institut Pasteur Belgian Science Policy Office Koninklijke Nederlandse Akademie voor wetenschappen KNAW-CBS Goeteborgs Universitet Universitat de Valencia Universiteit Gent Institut National de la Recherche Agronomique Jacobs University Bremen Universidade do Minho Universita Degli Studi di Torino Consejo Superior de Investigaciones Cientificas Institute of Biochemistry and Physiology of Microorganisms - VKM Instytut Biotechnologi Przemyslu Rolno Spozywczego Azienda Ospedaliera Universitaria San Martino- Instituto Nazionale per la Ricerca sul Cancro USMI Germany UK France Belgium Netherlands Sweden Spain Belgium France Germany Portugal Italy Spain Russian Federation Poland Italy
Lo scopo della MUT è l acquisizione, l identificazione, la caratterizzazione, la conservazione e la distribuzione di colture di funghi per supportare la ricerca e la bioeconomia. Attualmente preserva circa 5300 isolati appartenenti a 1100 specie Certificazione ISO 9001 dal 2006 Dal 2008 la MUT è membro del: European Culture Collections' Organisation (ECCO); World Federation Culture Collections (WFCC).
La MUT è una collezione di servizio che offre servizi di: isolamento e identificazione (con tecniche convenzionali e molecolari) di funghi da differenti substrati; distribuzione di colture fungine a scopo di ricerca o per applicazioni commerciali; Deposito di colture fungine di pubblico accesso o garantite; screening e caratterizzazione di colture per proprietà utili; liofilizzazione di microorganismi; corsi di formazione; consulenza.
Strategie delle CC per affrontare i vincoli socioeconomici e diventare BRCs Culture Collections Biological Resources Centers Operare in conformità con le leggi Gestione delle Risorse biologiche Fornire informazioni e servizi affidabili Gestione dei dati & Comunicazione Assicurare la sostenibilità finanziaria
Bacteria Yeasts Archaea Fungi Plasmids, DNA, RNA Protozoa Animal/human viruses Microscopic Algae Plant viruses Dedifferentiated Plant Cells Bacterial viruses Immortalised Animal and Human Cells Fig. 1 Spectrum of Holdings of Microbial Resource Centres
WP1 gestione del progetto MIRRI nella fase preparatoria WP2 progettazione dell'infrastruttura di ricerca e delle risorse distribuite WP3 Struttura di governance del network, status giuridico e operativo WP4 Piano finanziario WP5 Comunicazione, diffusione e sensibilizzazione WP6 Organizzazione e sviluppo dei servizi, creazione di programmi interdisciplinari WP7 Organizzazione delle strutture, istruzione e formazione WP8 Gestione dei dati WP9 Inquadramento giuridico per l'accesso alle risorse microbiche WP10 Approcci innovativi
1. Definire la forma di governance e lo status legale di questa struttura; 2. Identificare e coinvolgere i centri di ricerca, le aziende con vocazione biotech e i politici; Steering Committee WP1: Management and Coordination WP3: Governance structure, legal status, operational practice WP2: Organisa - tional structure, defining services WP4: Financial and business plans Building the Research Infrastructure Expert Expert Expert Group Group Group Research Infrastructure Outputs WP5: Outreach and commu - nication WP8: Information resource and data base WP6: Developing WP7: Capacity services and building, education programmes and training WP9: Legal ope- WP10: Implerational framework menting for access innovation Advisory Board 3. Definire lo scopo, i programmi di lavoro e il piano finanziario per il funzionamento sostenibile del network; 4. Definire gli standard minimi per i centri affiliati a MIRRI; 5. Sviluppare pacchetti didattici per garantire una formazione adeguata dei ricercatori e del personale BRC; 6. Connessione con paesi extra-europei; 7. Garantire l'interoperabilità dei dati sistemi informativi innovativi.
MIRRI garantirà una copertura più ampia delle risorse biologiche e dei servizi forniti attraverso un approccio coordinato che garantisca una migliore utilizzazione delle competenze e un programma di sviluppo delle risorse umane. Accesso facilitato alle infrastrutture di ricerca, ai dati e alle infrastrutture. Verrà istituita una piattaforma di esperti nei differenti settori. Verranno istituite procedure operative comuni che permettano di lavorare in accordo con le normative vigenti a livello internazionale. Favorirà un dialogo per gestire le esigenze scientifiche e le politiche governative (consulenze per la classe dirigente a livello nazionale ed euroeo). Maggiore efficienza del sistema e più facile accesso ai dati legati al materiale microbico in accordo con le normative internazionali. Una maggiore trasparenza e tracciabilità del flusso di materiale microbico (Nagoya Protocol). Trasferimento tecnologico al tessuto industriale
Questionario x aziende
agriculture, environment energy, climate health, hygiene
Microbial Resource Research Infrastructure (MIRRI) Enhanced research in academia and industry, e.g. agriculture biotech energy & climate environment health innovation increase food production industrial products new sources for biofuels clearing of ecological desaster antagonists against pathogens academia fighting crop failure R&D fighting climate change biodiversity functional food industry health & wellbeing sustainable agriculture, food security secure, clean & efficient energy smart & green transport Horizon 2020 climate action, resource efficiency & raw material inclusive, innovative & secure societies
Nel 2030 circa 1/3 della produzione industriale deriverà dalle biotecnologie e dalle bioenergie (OECD Report, 2012). 1. Identificare il ruolo dei microrganismi nella gestione sostenibile del territorio; 2. Aumentare l'offerta alimentare e ridurre la fame nel mondo attraverso una riduzione delle perdite dovute a parassiti e malattie; 3. Fornire le risorse per migliorare le procedure sanitarie e fitosanitarie in ottemperanza alla richiesta WTO; 4. Supportare i processi di formazione di microbiologi, biotecnologi e sistematici; 5. Supportare i progetti sanitari e in particolare la scoperta di nuovi farmaci; Fig. 8 Examples for Uses and Applications of Microorganisms Genomics Food and Taxonomic food references Systems Biology additives Agriculture Antibiotics Biochemicals / Kits Enzymes Food and Bioremediation Pharmaceutical Beverage Industry Biocontrol Drugs Fuel/Energy Industry Cosmetics Biotechnology MIRRI Microorganism holdings: uses and properties Diagnostics Basic Reseach POTENTIAL FOR COOPERATION AND OUTPUT: COORDINATED SCREENING 6. Identificare nuovi prodotti microbici da inserire nel mercato come ed esempio probiotici; 7. Fornire nuovi strumenti per la produzione di energia e biocombustibil.
- Costituzione di gruppi di esperti - Dalle BRCs e da centri di ricerca esterni e dal mondo industriale su argomenti diversi (alimenti, agricoltura,ibioindustria,medicina) - Con competenza in tassonomia, controllo di qualità, questioni legali e di sostenibilità. - Gli esperti saranno disponibili attraverso un One-Stop-Consultation Platform Saràorganizzato un help desk per tutte le BRCs affiliate a MIRRI
- Offrire specifici corsi di formazione per Microbial Resource Centre (MRC), Culture Collection (CC) staff, ricercatori e personale tecnico - Argomenti sia scientifici che legali e di gestione - training will be offered in a distributed curriculum, depending on collection strength to broaden the scope of offered courses - development of a Master Curriculum to attract students Prevenire la perdita di competenze nella sistematica die microorganismi e nella gestione delle collezioni degli stessi. 22
- Possibilità di depositare ceppi di collezioni non pubbliche in collezioni pubbliche. Importante soprattuto per orphan collections o in pericolo. - Accesso facilitato alle risorse genetiche di MIRRI - Conservazione ex situ del materiale in modo adeguadato - Programmi coordinati per l isolamento di nuovo materile biologico - Sviluppo di strategie per obbligare il deposito del materiale pubblicato in collezioni pubbliche (< 1%) aumento della credibilitàdella scienza e delle nuove opportunità di sfruttamento (Trusted collections concept according to EU)
- l'accesso fisico alle strutture all'interno di MIRRI per promuovere la collaborazione e formazione tra i partner MRC e gli utenti - possibilità di utilizzare strumentazioni/ metodi che sono attualmente finanziariamente fuori portata nelle proprie strutture. opportunitàdi collaborare utilizzando una crescente gamma di apparecchiature che porterà ad aumento del numero di pubblicazioni e/o ricadute industriali
- supporto nel raggiungimento della conformitàcon il protocollo di Nagoya - Access and Benefit Sharing Policy (ABS) - Prior Informed Consent (PIC) - sostegno per l'attuazione del codice di condotta sulla biosicurezza per BRCs - Supporto per incrementare l utilizzo del MTA (core ECCO) - questioni giuridiche import / export The ABS Regulation has now been approved by both the European Parliament and the Council. A press release can be found here: http://www.consilium.europa.eu/uedocs/cms_data/docs/pressdata/en/envir/142185.pdf) Maggior rispetto delle regolamentazioni da parte dei curatori e degli scienziati
- Opportunità di integrare i tuoi dati in un pan-european database - integration into a given infrastructure - supported by MIRRI experts - Garantire open access ai vostri dati - Armonizzare la condivisione dei dati facilitare la visibilità dei propri dati pubblicati Incrementare l accesso a dati affidabili
Structure of MIRRI in the Implementation Phase Nella fase di attuazione MIRRI sarà aperto a nuovi partners, purchè abbiamo gli standard minimi richiesti.
- definition of criteria for membership is under development (WP2.2) - criteria should reflect at least the requirements already established for BRCs and for RIs, concerning - open access of microbial material - management - quality - data provision - science component - ( )
This preparatory phase project will have a catalytic and stimulating effect in many different ways. Governments should develop national road maps for BRCs ensuring the pan-european strategy can be implemented. The Italian Situation is not optimal. Great opportunity to develop an national network in Italy; To create, from the experience of already existing BRCs, new centres able to handle different kind of organisms; To support the academic research; To support the bio-based economy and the transfer-technology in different regions.
What do Italy needs to join MIRRI in the executive phase? 1. To convince the government to accede to MIRRI and found the Italian participation (Italian Road Map) 2. List all collections of microorganisms present in Italy and check the quality of the material and of the relative dataset; 3. Staff training on technical and legal aspects for the establishment of common operational procedures within a legal framework; 4. Ensuring funding management of the collections; 5. Development of National website for easy access to material and information.
MIRRI è cominciato nel Novembre 2012: i partner chiave sono stati identificati nei principali paesi europei. Questa fase preparatori sicuramente avrà un effetto catalizzatore e stimolante per tutte le collezioni di microorganismi. I singoli governi dovranno sviluppare delle strategie nazionali per le BRCs del loro paese per assicurare lo sviluppo del network Pan- Europeo. (SITUAZIONE ITALIANA DISASTROSA). La maggioranza delle collezioni sono di laboratorio ; Non sono collezioni di servizio con staff permanente Nella maggior parte dei casi non ottemperano alle normative internazionali relative alla biodiversità, nonché allo scambio di microorganismi; Non hanno un Quality Managment System e non sono certificate. Non sappiamo esattamente quali e quante sono che materiale conservano e in quali condizioni
MIRRI deve diventare lo stimolo per cominciare a lavorare ad un sistema di collezioni a livello nazionale che sicuramente raggrupperà collezioni diverse. Cominciare a lavorare in modo collaborativo e senza campanilismi (finanziamenti per depositi sui progetti finanziati ) Grande opportunità per sviluppare un network di collezioni italiano; Creare nuove BRCs in grado di gestire differenti tipi di organismi; Sostenere la ricerca accademica; Sostenere lo sviluppo della bioeconomia in diverse aree creando sinergia tra università e SMEs.
Cosa dobbiamo fare perché l Italia entri nella fase esecutiva di MIRRI? MUT 1. Adattare le nuove strutture acquisite per erogare servizi secondo gli standard più elevati; 2. Garantire l assunzione a tempo indeterminato di personale esperto; 3. Garantire il finanziamento a lungo termine della collezione. ITALY 1. Mappare le collezioni esistenti, il materiale conservato e le procedure utilizzate; 2. Formare il personale delle CC sugli aspetti legali e tecnici; 3. Garantire il finanziamento delle collezioni che vogliono diventare BCR. 4. Website nazionale per reperire materiale e informazioni.
Le collezioni microbiche piemontesi: creazione di un network e valorizzazione delle risorse biologiche - MICRONEP MIRRI Europe Operational Unit National Node Hub National Node Hub National Node Hub National Node Hub MUT IZS-PLV PLAVIT DISAF A MICRONEP CRA- ENO DISAF A
Thank you!!!! Info.mut@unito.it