Genomica Servizio Sequenziamento DNA

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1 Genomica Servizio Sequenziamento DNA Listino prezzi 1 maggio 2005 Value Read Codice Descrizione Prezzo / Lettura Tubi 13, Tubi con etichetta codice a barre 12, Etichette codice a barre prepagate value reads (solo in set da 50) Non ci sono pagamenti per il setup, nel caso di value read prepagate 11, Piastre min. 48 campioni 11,00 Per ordini > 480 campioni in un batchvedi il servizio High Throughput Il servizio di sequenziamento Plate-4-Plate A richiesta Il servizio è per > 10 piastre in 6-12 mesi Il Servizio VALUE Read Per plasmidi e frammenti di PCR con un tempo di risposta di ore Sistema di ordini online usando le etichette con i codici a barre di MWG Dati monitorati per single strand con PHRED Validazione di 4 controlli di qualità standard per piastra E possibile ordinare primers specifici o includere i propri Primers per vettori standard disponibili senza costi aggiuntivi Si chiede cortesemente di usare tubi da 1,5ml per i templati di DNA E vivamente consigliato mandare plasmidi purificati, asciugati ad aria (1ug DNA), o in alternativa, è possibile mandare 2 µg DNA in 20 µl 5 mm Tris- HCL, ph 8-9 E vivamente consigliato mandare frammenti di PCR purificati, asciugati ad aria (20 ng DNA/100bases),o in alternativa, è possibile mandare 30 ng DNA /100 bases in 20 µl 5 mm Tris-HCL, ph 8 9 Nel caso in cui i primer siano da Voi inclusi, devono essere spediti ad una concentrazione di 10pMol/µl (10ul, per il servizio su piastra raccomandiamo 5ul per reazione di sequenza) Ulteriori servizi "Value" Codice Descrizione Prezzo / Piastra Preparazione del templato in micropiastre 96-well (min. 48 campioni) 230, Purificazione di prodotti di PCR in micropiastre 96-well (min. 48 tcampioni) 180,00 Codice. Descrizione Prezzo Sintesi di un primer specifico non marcato 10,00 *I risultati di sequenziamento dipendono dalla qualità e dalla specificità del DNA, come dalla qualità dei primers inclusi. Se < 100 basi (PHRED20) sono ottenuti, il costo di processamento di 7 Euro per campione sarà imputato per ogni Value Read. Nota che il Value Read può essere ordinato solo con il nostro website: I prezzi sono esclusi di IVA. Gli ordini sono soggetti alle condizioni e ai termini standard di M-Medical srl che sono disponibili a richiesta.

2 Comfort Read Codice Descrizione Prezzo /Lettura Tubi 23, Tubi con etichetta codice a barre 21, Piastre minimo 48 campioni 20,00 Il Servizio Comfort Read : Per plasmidi e frammenti di PCR con un tempo di risposta di 2-5 giorni lavorativi Sistema di ordini online usando i codici a barre di MWG Dati monitorati per single strand con PHRED Una ripetizione in caso di fallimento Conservazione di templati e di primers per un mese, per ogni ordine E'possibile ordinare primers specifici o includere i propri Primers per vettori standard disponibili senza costi aggiuntivi Supporto telefonico specialistico Si chiede cortesemente di usare tubi da 1,5ml per i templati di DNA E'vivamente consigliato mandare plasmidi purificati, asciugati ad aria (> 5 µg DNA) o, in alternativa, è possibile mandare >5 µg DNA in 20 µl 5 mm Tris-HCL, ph 8-9 E'vivamente consigliato mandareframmenti di PCR purificati, asciugati ad aria (30 ng DNA/100bases),o in alternativa, è possibile mandare 30 ng DNA /100 bases in 20 µl 5 mm Tris-HCL, ph 8 9 Nel caso in cui i primer siano da Voi inclusi, devono essere spediti ad una concentrazione di 10pMol/µl (min 10µl; 5 µl per reazione raccomandati) Ulteriori Servizi Comfort Codice. Descrizione prezzo / piastra Preparazione del templato in micropiastre 96-well (min. 48 campioni) 230, Purificazione di prodotti di PCR in micropiastre 96-well (min. 48 campioni) 180,00 Codice. Descrizione Prezzo Preparazione del templato plasmidico in tubo singolo 18, Purificazione di prodotti di PCR in tubo singolo 12, Sintesi di un primer specifico non marcato 10,00 *I risultati del sequenziamento dipendono sia dalla qualità e dalla specificità del DNA, sia dalla qualità del primer incluso. Se sono ottenute < 100 basi (PHRED20), costi di processamento di 7 Euro per campione saranno imputati per ogni Comfort Read. Prezzi esclusi di IVA e spedizione.

3 Sequenziamento di BAC/PAC/Cosmid end Codice Specifiche Prezzo / Clone Sequenziamento di PAC/BAC/Cosmid End letture, una per ogni lato - preparazione del DNA inclusa - Editing manuale in ASCII dei dati del single strand - Lunghezza delle letture: si raggiungono di solito basi - Inclusa una ripetizione in caso di fallimento Prezzi esclusi di IVA e spese di trasporto. - Basta solo spedire uno stock in glicerolo del Vostro clone! Primer Walking (sequenziamento di single strand per inserti o frammenti di PCR di kb ) Codice Specifiche Prezzo / Base kb - Progettazione e design di primers specifici Primer Walking Editing manuale in ASCII dei dati del single strand - Allineamento delle sequenze incluso 0,13 - Conservazione di templati e primers per un mese - Accuratezza finale garantita: >99% Prezzi esclusi di IVA e spese di spedizione. Nel caso in cui ci fosse un gap nella sequenza che non potesse essere completato, rimarebbe comunque imputato il costo a base per la lettura completa Publication Quality (sequenziamento double strand di un inserto o frammento di PCR di kb) Codici Specifiche Prezzo / Base Publication Quality kb - Sequenziamento de novo di frammenti di DNA (es. inserti e frammenti tdi PCR) -Entrambi gli strands sono sequenziati, redatti ed allineati - Accuratezza garantita: >99.995% - Annotazioni su richiesta kb: kb: kb: 0.23 Prezzi esclusi di IVA e spese di spedizione.

4 Sequenziamento High Throughput Genomi Batterici, ESTs, BACs, PACs, Cosmidi Codici Specifiche Price Sequenziamento di un genoma microbico di Xmega basi -Generazione di librerie shotgun. Sequenziamento fino ad un livello di ridondanza (coverage) di 10 volte 4 6 mesi; - Utilizzate solo PHRED 20 base calls % seq. accuratezza; max. 5 contigs Codice PHRAP è usato per la costruzione delle sequenze shotgun - Chiusura dei gap con diversi approcci Prezzo / Base Sequenziamento Coverage (ridondante) - Generazione di librerie shotgun di un genoma batterico di X mega basi fino - Sequenziamento fino ad un livello di ridondanza (coverage) di X volte Prezzo / Base alla ridondanza (coverage)richiesta - Utilizzate solo PHRED 20 base calls 3 MB fino a ridondanza (coverage) di 6 volte in 50 giorni lavorativi - PHRAP è usato per la costruzione delle sequenze shotgun Product-No Sequenziamento di BACs, PACs, cosmids etc. 20 giorni lavorativi per il primo assembly; % seq. accuracy - Generazione di librerie plasmidiche di inserti shotgun piccoli (1,5-3Kb) - Sequenziamento con una ridondanza (coverage) fino ad 8 volte - PHRAP è usato per la costruzione delle sequenza shotgun - Chiusura dei gap con diversi approcci Sequenziamento High throughput (>480 reads) - Trafsormazione di cellule competenti con mix di ligazione, inclusa clones - Picking di cloni incluso in 30 giorni lavorativi - Preparazione di DNA automatizzata e sequenziamento Codice Utilizzate solo PHRED 20 base calls - Setup price per letture di sequenze < 200 PHRED 20 bases

5 Costruzione di Librerie Codice. Specifiche Price Generazione di librerie shotgun di - Preparazione del DNA genomico incluso (dipende dall'organismo) genomi batterici - Grandezza dell'inserto kb Codice Inserti più grandi - Ridondanza (coverage) almeno di 8 volte 63 - Inclusi 960 cloni per ogni 96 cloni - Sequenziamento ed analisi BLAST di 96 cloni inclusi aggiuntivi (controllo qualità) - Ulteriori cloni disponibili a basso prezzo Generazione di librerie shotgun di BACs/PACs/ cosmidi/fagi Codice Richiesto solo un clone in coltura stab agar -Librerie plasmidiche shotgun con piccoli inserti (1.5-3 kb) cloni inclusi Sequenziamento ed analisi BLAST di 96 cloni incluse 63 (controllo qualità) per ogni 96 cloni - Ulteriori cloni disponibili a basso prezzo ( ) aggiuntivi Generazione di librerie di cosmidi di genomi batterici Codice Preparazione di DNA genomico inlcuso (dipende dall'organismo) - Dimensioni dell'inserto kb cloni inclusi Sequenze terminali di 24 cloni incluse 63 - Analisi di restrizione di 24 cloni inclusa per ogni 96 cloni (stima della dimensione del frammento e controllo dell'integrità) - Ulteriori cloni disponibili aggiuntivi Generazione di librerie di cdna - Preparazione dell'rna inclusa Codice Vettore: psport 1 - Dimensione media dell'inserto 1.2 kb Quantità di cloni: > 4.0 x Controllo qualità attraverso analisi di restrizione di 48 cloni cdna - Mix di Ligazione fornita - Transformazione, piastramento e picking Prezzi esclusi di IVA e trasporto.

6 Il. servizio di Bioinformatica Clustering e Assembly Codice. Prodotto: Analisi di sequenziamenti fatti da MWG Prezzo ,000-10,000 Letture (Prezzo per Lettura) 0, ,000-50,000 Letture , ,000 Letture Codice. Prodetto: Analisi di sequenziamento da Mixed Databases* Price ,000-10,000 Letture (Prezzo per Lettura) 1, ,000-50,000 Lettura , ,000 Lettura * Mixed databases sono composti da dati di sequenza forniti da clienti, da database pubblicati, da dati di sequenza MWG etc. I. Servizi di Bioinformatica InterPro/Gene Ontology Codice Prodotto Prezzo per contig/singlet Analisi InterPro/Gene Ontology di singlets o contigs originati da corse per sequenze MWG InterPro/Gene Ontology analysis of singlets or contigs originating from mixed databases* *Mixed databases sono composti da dati di sequenza forniti da clienti, da database pubblicati, da dati di sequenza MWG etc. 2,40 3,36 Prezzi validi dal 1 Maggio 2005 Per ordinare usa il nostro sistema di ordini online. Sul nostro sito ci sono anche suggerimenti per la preparazione del templato.se hai altre domande non esitare a contattarci: Website: Telefono:02/ oligo@mmedical.dgroup.it