MICROBIOLOGIA CLINICA E BIOLOGIA DEI PROTOZOI E METAZOI PARASSITI
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- Ferdinando Basile
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1 DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOLOGICHE, GEOLOGICHE E AMBIENTALI Corso di laurea magistrale in Biologia sanitaria e cellularemolecolare Anno accademico 2016/ anno - Curriculum Biologia sanitaria E BIOLOGIA DEI PROTOZOI E METAZOI PARASSITI 10 CFU - 1 semestre Docenti titolari dell'insegnamento MARIA LINA MEZZATESTA - Modulo mezzate@unict.it Edificio / Indirizzo: Dip.to Scienze Biomediche e Biotecnologiche - Sezione Microbiologia. Torre Est piano 3. Via Santa Sofia n.97. Catania Telefono: Orario ricevimento: Martedì e giovedì dalle alle Si consiglia di chiedere conferma sulla presenza del docente per GUIDO SCALIA - Modulo lido@unict.it Edificio / Indirizzo: P.O. G. Rodolico, Via S. Sofia, 78 Catania; edifico 5, laboratorio virologia clinica Telefono: Orario ricevimento: Da concordare via BIANCA MARIA LOMBARDO - Modulo bm.lombardo@unict.it Edificio / Indirizzo: Sez. Biologia Animale - Via Androne CATANIA Telefono: Orario ricevimento: lunedì 13:00-14:00; mercoledì 13:00-14:00; in altri giorni previo appuntamento OBIETTIVI FORMATIVI Fornire agli studenti conoscenze approfondite sulle infezioni batteriche e virali di interesse medico. Fare acquisire le competenze metodologiche e tecniche fenotipiche e molecolari per la diagnosi di laboratorio di malattie ad eziologia virale e batterica di interesse medico. Perfezionare il lessico disciplinare, indispensabile per la corretta comunicazione, scritta e orale, in lingua italiana e inglese. Fornire conoscenze specifiche dei Protozoi e Metazoi parassiti dell uomo e dei loro cicli biologici, comprensione degli adattamenti che consentono il mantenimento di tale rapporto e dell azione che esplicano sugli ospiti.
2 Sviluppare le capacità di applicare tali conoscenze nelle strategie di prevenzione e lotta ai parassiti oggetto di studio. Perfezionare il lessico disciplinare, indispensabile per la corretta comunicazione, scritta e orale, in lingua italiana e inglese,. PREREQUISITI RICHIESTI Conoscenza di microbiologia generale. Conscenza di virologia generale e virologia speciale. Conoscenze di base dei Protozoi e Metazoi. FREQUENZA LEZIONI La frequenza dei corsi è obbligatoria. La frequenza si intende acquisita se lo studente ha frequentato almeno il 60% delle ore curriculari previste dalla disciplina. Il Consiglio del CdS delibera sulle modalità organizzative e didattiche riservate agli studenti nelle situazioni descritte nell art. 27 c. 1, 2 e 3 (studenti lavoratori, studenti atleti, studenti in situazione di difficoltà) del Regolamento Didattico di Ateneo. La frequenza dei corsi è obbligatoria. La frequenza si intende acquisita se lo studente ha frequentato almeno il 60% delle ore curriculari previste dal modulo. Il Consiglio del CdS delibera sulle modalità organizzative e didattiche riservate agli studenti nelle situazioni descritte nell art. 27 c. 1, 2 e 3 (studenti lavoratori, studenti atleti, studenti in situazione di difficoltà) del Regolamento Didattico di Ateneo. CONTENUTI DEL CORSO L esame batteriologico: la fase pre-analitica (richiesta del medico, scelta degli esami, preparazione del paziente, raccolta e trasporto del campione); la fase analitica ( esame colturale, Identificazione dei microrganismi, antibiogramma e referto). Classificazione dei batteri: Il concetto di specie in batteriologia. Tassonomia fenotipica e genotipica. Batteri di interesse medico: morfologia, identificazione, struttura antigenica, patogenesi, esami di laboratorio, terapia, epidemiologia, prevenzione e controllo di: Stafilococchi, Streptococchi, Enterococchi, Corinebatteri, Listeria, Enterobatteri, Pseudomonas, Burkolderia, Acinetobacter e
3 batteri gram negativi rari, Micobatteri, Vibrio, Campylobacter, Helicobacter, Haemophilus, Bordetella, Brucella, Yersinia, Neisseriae, Clostridi, Bacillus, Legionella, Micoplasmi, Rickettsiae, Chlamidiae e Spirochete. Contenuti del corso di virologia clinica Risposta immune alle infezioni virali Principi di diagnostica virologica Infezioni virali di: Alte vie respiratorie; Basse vie respiratorie; Apparato Gastroenterico; Apparato Ematopoietico; Sistema nervoso centrale; Malattie sessualmente trasmissibili; Apparato Urogenitale; Occhio; Cute e mucose; Infezioni nosocomiali; TORCH; Infezioni virali nel soggetto immunocompromesso; diagnostica e prevenzione delle infezioni da HPV. Sarà inoltre realizzata, con la partecipazione attiva degli studenti, un'attività trasversale che coinvolge sia i docenti dell'altro modulo del corso integrato che di Lingua inglese. Le modalità saranno definite e condivise durante le prime lezioni. Rapporti tra specie: simbiosi, parassitismo, coevoluzione. Biologia dei parassiti: adattamenti alla vita parassitaria; azione dei parassiti sugli ospiti. Parassitologia e mobilità umana. Protozoi: generalità; caratteristiche, cicli biologici, con cenni di epidemiologia, lotta e prevenzione, dei seguenti parassiti: Leishmania spp., Trypanosoma cruzi, Tripanosoma brucei gambiense e T.b. rhodesiense; Giardia spp., Trichomonas spp.; Ameba spp.; Balantidium coli; Toxoplasma gondii, Plasmodium spp. Platelminti: generalità; caratteristiche, cicli biologici, cenni di epidemiologia, lotta e prevenzione, di: Schistosoma spp., Fasciola hepatica, Opistorchis felineus, Paragonimus westermanii (Trematodi); Taenia spp., Echinococcus granulosus, Dyphillobotrium latum, Dypilidium caninum, Hymenolepis nana (Cestodi). Nematodi: generalità; caratteristiche, cicli biologici, cenni di epidemiologia, lotta e prevenzione, dei seguenti parassiti: Ancylostoma duodenalis, Necator americanus, Trichiuris trichura, Ascaris lumbricoides (geoelminti); Strongyloides stercoralis, Enterobius vermicularis, Dracunculus medinensis, Trichinella spp.; Wuchereria bancroftii, Loa loa, Onchocerca volvolus (filarie). Artropodi: generalità; caratteristiche, cicli biologici, con cenni di epidemiologia, lotta e prevenzione, di Acari e Insetti parassiti (Anoplura, Siphonaptera). Sarà inoltre realizzata, con la partecipazione attiva degli studenti, un'attività trasversale che coinvolge sia i docenti dell'altro modulo del corso integrato che di Lingua inglese. Le modalità saranno definite e condivise durante le prime lezioni.
4 TESTI DI RIFERIMENTO Antonelli, Clementi, Pozzi, Rossolini : Principi di Microbiologia medica Ed. Ambrosiana La Placa : Principi di Microbiologia Medica Ed. Esculapio Jawetz, Melnick, Adelberg s: Microbiologia medica Ed. Piccin I - De Carneri - Parassitologia generale e umana Casa Editrice Ambrosiana, Milano a cura di Claudio Genchi ed Edoardo Pozio II - De Carneri Parassitologia medica e diagnostica parassitologica Casa Editrice Ambrosiana, Milano a cura di Olga Brandonisio, Fabrizio Bruschi, Claudio Genchi ed Edoardo Pozio III - Schmidt G.D., Roberts L.S. Foundations of Parasitology Mc Graw Hill Higher Education (per la consultazione e per le attività in lingua inglese) PROGRAMMAZIONE DEL CORSO * Argomenti Riferimenti testi 1 Presentazione del programma 2015/2016. La fase pre-analitica: richiesta del medico, scelta degli esami, preparazione del paziente, raccolta, trasporto e conservazione dei campioni. 2 La fase analitica: esame colturale dei campioni microbiologici Identificazione dei microrganismi: tecniche tradizionali, molecolari e immunologiche. Sistemi manuali e automatizzati. 3 Prove di sensibilità agli antibiotici: - metodo della diffusione in agar (antibiogramma e E-test). Determinazione della Minima Concentrazione Inibente (MIC) Tassonomia batterica e classificazione dei batteri di interesse medico. 4 Stafilococchi e streptococchi: morfologia, identificazione, struttura antigenica, patogenesi, esami di laboratorio, terapia, epidemiologia, prevenzione e controllo. 5 Enterococchi, Corinebatteri, Listeria monocytogenes Enterobatteri, Salmonella,Shigella, Yersinia pestis: morfologia, identificazione, struttura antigenica, patogenesi, esami di laboratorio, terapia, epidemiologia, prevenzione e controllo. Cap.8 - Antonelli Cap. 9 - Antonelli CLSI 2014 cap.13 - Antonelli Cap. 15, 16 - Antonelli 6 Esercitazioni
5 7 Pseudomonas, Burkolderia, Stenotrophomonas, Acinetobacter baumannii Micobatteri, Vibrio, morfologia, identificazione, struttura antigenica, patogenesi, esami di laboratorio, terapia, epidemiologia, prevenzione e controllo. 8 Helicobacter pylori, Bordetella, Brucella, Bacillus, Clostridium morfologia, identificazione, struttura antigenica, patogenesi, esami di laboratorio, terapia, epidemiologia, prevenzione e controllo. Cap.17,18 - Antonelli Cap. 19,20,21 - Antonelli 9 Esercitazioni 10 Haemophilus,Neisseria, Legionella,Spirochete, Micoplasmi, Rickettsie e Chlamidiae: morfologia, identificazione, struttura antigenica, patogenesi, esami di laboratorio, terapia, epidemiologia, prevenzione e controllo. Cap. 20, 23, 25, 30 - Antonelli 11 Esercitazioni 12 Risposta immune alle infezioni virali. Principi di diagnostica virologica 13 Infezioni virali delle alte e basse vie respiratorie. 14 Infezioni virali dell'apparato gastroenterico e Apparato Ematopoietico. 15 Infezioni virali del Sistema nervoso centrale; Malattie sessualmente trasmissibili; Apparato Urogenitale. 16 Infezioni virali dell'occhio; Cute e mucose; Infezioni nosocomiali; TORCH 17 Infezioni virali nel soggetto immunocompromesso. 18 Esercitazione 19 Diagnostica e prevenzione delle infezioni da HPV. 20 Esercitazioni * Argomenti Riferimenti testi 1 Rapporti tra specie: simbiosi. IV, I (cap.2) 2 * Adattamenti alla vita parassitaria IV, I (cap.2) 3 * Azione dei parassiti sugli ospiti IV, I (cap.2) 4 Zoonosi. Parassitologia e mobilità umana. IV, I (cap.8) 5 Protozoi: generalità. IV, I (cap.9) 6 * Leishmania spp. Tripanosoma cruzi. Tripanosoma brucei gambiense. Tripanosoma brucei rhodesiense. IV, I (cap.10)
6 7 Giardia duodenalis. Trichomonas vaginalis. Amebe intestinali. Amebe free-living. IV, I (capp. 10 e 11) 8 * Toxoplasma gondi IV, I (cap. 12) 9 * Malaria IV, I (cap.13) 10 Platelminti: generalità IV, I (cap. 15) 11 * Trematodi: Schistosoma spp. IV, I (cap. 15) 12 * Trematodi: Fasciola epatica, Opistorchis sp., Paragonimus sp.. IV, I (cap. 15) 13 * Cestodi: tenie. IV, I (cap. 15) 14 * Cestodi: Echinococcus granulosus. IV, I (cap. 15) 15 Nematodi: generalità IV, I (cap. 16) 16 * Geoelminti: Ancylostoma, Necator, Trichuris, Ascaris. IV, I (cap. 16) 17 * Dracunculus medinensis IV, I (cap. 16) 18 * Filarie: Wuchereria, Onchocerca, Loa. IV, I (cap. 16) 19 * Trichinella spp. IV, I (cap. 16) 20 Artropodi: generalità. IV, I (cap. 18) 21 * Artropodi parassiti dell'uomo. IV, I (cap. 18) * Conoscenze minime irrinunciabili per il superamento dell'esame. N.B. La conoscenza degli argomenti contrassegnati con l'asterisco è condizione necessaria ma non sufficiente per il superamento dell'esame. Rispondere in maniera sufficiente o anche più che sufficiente alle domande su tali argomenti non assicura, pertanto, il superamento dell'esame. MATERIALE DIDATTICO Materiale pubblicato sulla piattaforma Studium Il materiale didattico sarà disponibile sulla piattaforma STUDIUM PROVA D'ESAME MODALITÀ D'ESAME
7 Colloquio orale Criteri di assegnazione del voto: La votazione massima nel modulo è assegnata allo studente che abbia dimostrato padronanza degli argomenti, capacità di mettere in relazione le conoscenze acquisite, capacità espositive e padronanza del lessico disciplinare. Sarà valutata anche l'attività realizzata in lingua inglese. Descrizione: L'esame del modulo di prevede una prova scritta, costituita da 1 domanda a risposta aperta e da 5 domande a risposta multipla. L'esame è superato se si ottiene almeno 18/30 nella valutazione della risposta aperta e se si risponde correttamente a 3 su 5 dei quesiti a risposta multipla. Criteri di assegnazione del voto: La votazione massima nel modulo è assegnata allo studente che abbia dimostrato padronanza degli argomenti, capacità di mettere in relazione le conoscenze acquisite, capacità espositive e padronanza del lessico disciplinare. Sarà valutata anche l'attività realizzata in lingua inglese. DATE D'ESAME Il calendario degli esami è consultabile al seguente link: Il calendario degli esami è consultabile al seguente link: PROVE IN ITINERE Non previste PROVE DI FINE CORSO E prevista la possibiltà di svolgere una prova di fine modulo, facoltativa, con le stesse modalità previste per gli appelli regolarii. La data di svolgimento sarà concordata in aula, in base alle esigenze (programmazione di prove di esame e di studio) manifestate dagli studenti.
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