LEZIONI DI STATISTICA MEDICA



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Transcript:

LEZIONI DI STATISTICA MEDICA A.A. 2010/2011 - Screening - Test diagnostici Sezione di Epidemiologia & Statistica Medica Università degli Studi di Verona

Storia naturale della malattia (Rothman( Rothman,, 1981) Inizio esposizione Inizio processo patologico Comparsa segni precoci Comparsa segni e sintomi clinici Esito (morte, guarigione, invalidità permanente) Fase di induzione (esposizione) Fase di latenza (incubazione) Decorso Pre-clinico Decorso clinico tempo Prevenzione primaria Prevenzione secondaria Prevenzione terziaria Indagine sui fattori di rischio nella popolazione (fumo, alcool, colesterolo) Screening di popolazione (Pap test, sangue occulto nelle feci) Indagine ospedaliera Educazione sanitaria Diagnosi precoce, cura Diagnosi conclamata, riabilitazione

PREVENZIONE PRIMARIA Prima che si instauri la malattia (promozione e mantenimento della salute nella popolazione sana): Rimozione dei fattori di rischio (campagne contro il fumo, contro l alcoolismo, ) Riduzione degli effetti dell esposizione (vaccinazioni)

PREVENZIONE SECONDARIA La malattia si è instaurata, ma non è ancora evidente dal punto di vista clinico: Individuazione precoce dei casi tramite uno screening Pap test per il tumore dell utero Mammografia per il tumore del seno Sangue occulto nelle feci per il tumore del colon

PREVENZIONE TERZIARIA La malattia si è manifestata clinicamente: Prevenzione delle complicanze di una malattia già in atto ed irreversibile (es.: assistenza agli infartuati e riabilitazione)

Screening Test diagnostico poco costoso e poco invasivo somministrato: per identificare gli individui ammalati prima che la malattia si riveli dal punto di vista clinico a larghi settori della popolazione a rischio per una determinata patologia Lo scopo dello screening è diagnosticare precocemente la malattia, quando è ancora curabile.

Obiettivo del test: Classificazione dei soggetti in POSITIVI (alta probabilità di essere malati) NEGATIVI (alta probabilità di essere sani) Screening utili agli individui: Screening per il tumore al collo dell utero (PAP test) via esame citologico Screening per il tumore della mammella via mammografia in donne di età >50 Screening utili alla collettività: Test cutaneo con tubercolina Screening per l infezione streptococcica per prevenire la febbre reumatica

QUANDO EFFETTUARE UNO SCREENING Periodo di latenza della malattia sufficientemente lungo (devono essere possibili diagnosi e trattamento precoci) Intervento tempestivo prognosi migliore in termini di morbilità, mortalità e/o qualità della vita (il trattamento deve avere un efficacia superiore se effettuato prima della fase clinica) La malattia è un serio problema di salute in termini di morbilità e/o mortalità o è diffusa nella popolazione (alta prevalenza)

CARATTERISTICHE DI UNO SCREENING Efficacia riduzione di morbilità e/o mortalità dovuta al trattamento nelle fasi precoci Accettabilità veloce, facile, sicuro (poco invasivo e scarsi effetti collaterali) Costi diretti ed indiretti bassi - costi associati all impiego di risorse e personale - costi associati all esito del test (psicologici, fisici)

CARATTERISTICHE DI UNO SCREENING Affidabilità consistenza (capacità di riferire lo stesso risultato in situazioni analoghe) Validità sensibilità e specificità Performance valore predittivo positivo valore predittivo negativo

TIPOLOGIE DI SCREENING DI MASSA effettuato su tutti gli individui della popolazione bersaglio SELETTIVO effettuato su sottogruppi della popolazione ad elevato rischio di malattia

test diagnostici

Biopsie Esami endoscopici Esami radiologici con mezzi di contrasto test di grande validità, ma pericolosi, costosi, invasivi (utili come gold standard) DIAGNOSI Segni e sintomi clinici Test di laboratorio (sangue, urine) Esame clinico test economici, semplici, innocui per il paziente ma imprecisi (per interpretarli è necessario conoscerne la validità)

diagnosi della SINDROME di DOWN 1) amniocentesi ed esame dei cromosomi fetali Rischio di aborto elevato 2) misura della concentrazione della Gonadotropina Corionica Umana (HCG) nel sangue materno

NB: Non esiste una concentrazione di HCG al di sopra della quale tutti i nuovi nati sono affetti da mongolismo! cut-off 20 UI/ml bambino affetto da sindrome di Down HCG > 20 UI/ml nel 64,7% dei casi bambino non affetto da sindrome di Down HCG 20 UI/ml nel 98,6% dei casi

Validità di un test di test + popolazione malati screening veri negativi popolazione veri positivi falsi positivi falsi negativi

Validità di un test di screening Gold Standard Test + Test malati a c sani b d

Situazione ideale in un test di screening malati sani Test + a Test ----- ----- d Test + Test Nella cruda realtà malati Veri positivi Falsi negativi sani Falsi positivi Veri negativi

Test + Test malati Veri positivi Falsi negativi sani Falsi positivi Veri negativi VERI POSITIVI VERI NEGATIVI FALSI POSITIVI FALSI NEGATIVI soggetti malati, correttamente classificati come malati soggetti NON malati, correttamente classificati come NON malati soggetti NON malati, erroneamente classificati come malati soggetti malati, erroneamente classificati come NON malati

Sensibilità: probabilit nei malati probabilità che un test sia positivo Sen = P(T+ M+) = P(T+ M+) / P(M+) = (a / n) / [(a+c) / n] Test + Test - malati a c a+c sani b d b+d Sen = a /(a+c a+c) capacità del test di screening di identificare correttamente (= classificare positivamente) i soggetti malati

Specificità: probabilit nei sani probabilità che un test sia negativo Spe = P(T- M-) = P(T- M-) / P(M-) = (d / n) / [(b+d) / n] Test + Test - malati a c a+c sani b d b+d Spe = d /(b+d b+d) capacità del test di screening di identificare correttamente (= classificare negativamente) i soggetti sani

Valore predittivo nei positivi (V+ ( V+): che chi ha il test positivo sia malato ): probabilità Test + Test malati a c a+c sani b d b+d a + b c + d V(+) = a / (a+b ( a+b) proporzione di soggetti POSITIVI al test di screening che hanno la malattia

Valore predittivo nei negativi (V-): che chi ha il test negativo sia sano ): probabilità Test + Test malati a c a+c sani b d b+d a + b c + d V( ) ) = d / (c+d ( c+d) proporzione di soggetti NEGATIVI al test di screening che non hanno la malattia

N.B. Il valore predittivo positivo predittivo negativo dipendono da: e il valore - prevalenza della malattia nella popolazione (= proporzione di soggetti malati) - sensibilità e specificità dello strumento di screening

Esercizio: Si consideri una popolazione costituita da 100000 individui asintomatici, di cui 10000 affetti da una certa malattia (M+). Per diagnosticare la malattia è stato utilizzato un test con sensibilità del 90% e con specificità del 90%. M+ M- T+ 9000 9000 18000 T- 1000 81000 82000 10000 90000 100000

M+ M- T+ 9000 9000 18000 T- 1000 81000 82000 10000 90000 100000 A. Calcolare il numero di veri positivi, di falsi positivi e il valore predittivo che ci si aspetta in questa popolazione di 100000 individui Veri Positivi = Sen * 10000 = 0.90 * 10000 = 9000 Veri Negativi = Spe * 90000 = 0.90 * 90000 = 81000 Falsi Positivi = 90000 81000 = 9000

M+ M- T+ 9000 9000 18000 T- 1000 81000 82000 10000 90000 100000 A. Calcolare il numero di veri positivi, di falsi positivi e il valore predittivo che ci si aspetta in questa popolazione di 100000 individui V(+) = P(M+ T+) = P(M+ T+)/P(T+) = = (9000/n) / (18000/n) = 9000/18000 = 50%

M+ M- T+ 9000 9000 18000 T- 1000 81000 82000 10000 90000 100000 B. Qual è la prevalenza della malattia? Prevalenza di malattia = P(M+) = malati / n = = 10000 / 100000 = 0.1 = 10%

M+ M- T+ 9000 9000 18000 T- 1000 81000 82000 10000 90000 100000 C. Qual è la prevalenza della malattia misurata da questo test di screening? Prevalenza di malattia misurata = P(T+) = positivi al test / n = = 18000 / 100000 = 0.18 = 18%

Per valutare la bontà di un test sensibilità e specificità Per valutare un paziente valore predittivo positivo, se positivo al test valore predittivo negativo, se negativo al test Il test di screening ideale è quello che prevede Sen = 1 e Spe = 1... nella realtà NON ESISTE!

La scelta del livello ottimale di sensibilità e specificità dipende da considerazioni sulla malattia in studio: malattie molto rare sensibilità elevata (per individuare i pochi casi) malattie ad alta letalità, che possono essere adeguatamente trattate in fasi precoci per aumentare la sopravvivenza/migliorare la prognosi sensibilità elevata intervento poco efficace specificità elevata trattamento invasivo (ad esempio, intervento chirurgico) specificità elevata

NB: Sensibilità e specificità sono caratteristiche intrinseche dello strumento di screening e, fissato uno strumento, l aumento dell una comporta una diminuzione dell altra!

La maggior parte dei test dignostici produce un risultato quantitativo Per discriminare tra sani e malati è necessario disporre di un valore soglia o cut off Situazione ideale: sani e malati restituiscono valori del test differenti Cut off immediatamente determinato Situazione reale: sovrapposizione nella distribuzione di sani e malati Sensibilità e specificità sono inversamente correlate in rapporto alla scelta del cut off L adozione di una soglia che offre un elevata Sensibilità comporta una perdita di Specificità e viceversa

Esempio: densita' di probabilita'

GRAFICO DEL LIVELLO DECISIONALE Sen+Spe-1 Indice di Youden: Sen+Spe Indice di Youden

densita' di probabilita'

Come variano sensibilità e specificità al variare del cut off? I ESEMPIO (PAZIENTI DIABETICI) II ESEMPIO (PAZIENTI DIABETICI ANZIANI) specificità 1-specificità sensibilità Cut-off specificità 1-specificità sensibilità 50.0 % 50.0 % 99.997 % 100 mg/dl 2.3 % 97.7 % 99.997 % 84.1 % 15.9 % 99.9 % 115 mg/dl 15.9 % 84.1 % 99.9 % 97.7 % 2.3 % 97.7 % 130 mg/dl 50.0 % 50.0 % 97.7 % 99.9 % 0.1 % 84.1 % 145 mg/dl 84.1 % 15.9 % 84.1 % 99.997 % 0.003 % 50.0 % 160 mg/dl 97.7 % 2.3 % 50.0 % --- --- --- 175 mg/dl 99.9 % 0.1 % 15.9 % Utilizzati per rappresentare le CURVE ROC

ESEMPIO Risultati del test ELISA (Enzyme-Linked Immuno- Sorbent Assay) per l antigene HTLV-III in pazienti con AIDS e donatori sani di sangue... Valore Pazienti con AIDS Donatori sani di sangue Totale 12.0 21 0 21 [6.0-12.0) 36 2 38 [5.0-6.0) 15 2 17 [4.0-5.0) 7 3 10 [3.0-4.0) 7 15 22 [2.0-3.0) 2 73 75 <2.0 0 202 202 Totale 88 297 385

... determinare sensibilità e specificità del test per diversi valori di cut-off Test + Test Valore Pazienti con AIDS Donatori sani di sangue Totale a 12.0 21 0 21 [6.0-12.0) 36 2 38 [5.0-6.0) 15 2 17 [4.0-5.0) 7 3 10 c [3.0-4.0) 7 15 22 [2.0-3.0) 2 73 75 <2.0 0 202 202 Totale 88 297 385 b d = 297 cut-off Cut- off Sensibilità Specificità 12.0 21 / 88 = 0.24 297 / 297 = 1.00

Valore Pazienti con AIDS Donatori sani di sangue Totale 12.0 21 0 21 [6.0-12.0) 36 2 38 [5.0-6.0) 15 2 17 [4.0-5.0) 7 3 10 [3.0-4.0) 7 15 22 [2.0-3.0) 2 73 75 <2.0 0 202 202 Totale 88 297 385 Cut-off Sensibilità Specificità 12.0 21 / 88 = 0.24 297 / 297 = 1.00 6.0 57 / 88 = 0.65 295 / 297 = 0.99 5.0 72 / 88 = 0.82 293 / 297 = 0.99 4.0 79 / 88 = 0.90 290 / 297 = 0.98 3.0 86 / 88 = 0.98 275 / 297 = 0.93 2.0 88 / 88 = 1.00 202 / 297 = 0.68