Requisiti minimi autorizzativi delle attività di laboratorio di genetica medica

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1 22 dicembre 2017 Requisiti minimi autorizzativi delle attività di laboratorio di genetica medica Con la dgr n del 04/12/2017 sono stati definiti i requisiti minimi autorizzativi delle attività di laboratorio di genetica medica e sono state stabilite anche le tempistiche di adeguamento per le strutture già autorizzate/accreditate. Con nota della DG Welfare saranno definite, a breve, le procedure e le modalità delle istanze di autorizzazione/accreditamento delle nuove strutture e di riclassificazione di quelle già in attività, nelle more della predisposizione delle procedure informatiche. La Segreteria del Centro CRR QUALITA SMEL c/o ASST GOM Niguarda Piazza Ospedale Maggiore 3 Milano tel Fax mail: qualita.smel@ospedaleniguarda.it ISO 9001:2015

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10 ALLEGATO 1) REQUISITI MINIMI AUTORIZZATIVI PER LE ATTIVITÀ DI LABORATORIO DI GENETICA MOLECOLARE E DI CITOGENETICA In questo documento la dizione Laboratorio non definisce in alcun modo la tipologia di struttura/unità organizzativa o la sua collocazione gerarchica (complessa o semplice, dipartimentale) in cui si svolge l attività di Genetica Molecolare e/o di Citogenetica, ma unicamente la modalità organizzativa per garantire la qualità delle prestazioni. Pertanto con la definizione LGM si indicano sia Laboratori specializzati sia Sezioni specializzate. Quindi i requisiti sottoriportati devono essere posseduti sia si tratti di un laboratorio sia di una sezione specializzata. 1) I Laboratori di Genetica Medica (LGM) si configurano come strutture specialistiche, riconosciuti a livello legislativo (D.P.R 14/1/97 e normativa regionale), competenti a svolgere indagini specifiche ad elevato contenuto tecnologico e professionale per l identificazione delle malattie su base genetica. 2) Questo documento si applica alle prestazioni di Citogenetica e Genetica Molecolare. Si ritiene utile concentrare risorse umane altamente competenti e le necessarie piattaforme tecnologiche di nuova generazione in Laboratori specialistici che permettano lo sfruttamento delle attrezzature e la sinergia delle competenze. 3) Le suddette prestazioni devono essere contestualizzate in un percorso clinico, come da normativa regionale (DGR n. IX/4716/ 2013) e precedute da consulenza genetica come previsto dalle Linee-guida per le attività di Genetica Medica elaborate dalla Conferenza Stato- Regioni del 15 luglio 2004 (GU n.224 del ) e dalla Attuazione delle linee guida per le attività di Genetica Medica [Conferenza Stato-Regioni del 26 novembre 2009 (Repertorio Atti n. 241/CSR). Pertanto i LGM devono garantire direttamente o indirettamente la consulenza collegata al test, in linea, meramente esemplificativa, con le modalità definite dall allegato 1 alla d.g.r. n. X/5119/2016 Ulteriori determinazioni in merito alla rete regionale lombarda dei Centri di Senologia Breast Units Network. 4) I LGM devono essere in grado di garantire il completamento dell iter diagnostico. I LGM devono eseguire i test utilizzando le tecniche ed i campioni biologici più appropriati e, se effettuano diagnosi prenatale, devono essere in grado di effettuare i test sia nel I sia nel II trimestre di gravidanza. 5) I LGM devono soddisfare requisiti di qualità, riconosciuti a livello nazionale e internazionale, per garantire l'appropriatezza e l uniformità sul territorio regionale. Per questo, i laboratori devono attivare controlli di qualità interni (CQI) e devono partecipare a programmi di valutazione esterna di qualità (VEQ) organizzati a livello regionale, se presenti, o in caso contrario a programmi nazionali o internazionali. La partecipazione a VEQ deve riguardare diverse patologie analizzate o perlomeno le tecniche utilizzate. 1

11 6) Nei LGM deve operare personale dedicato in modo prioritario a questa attività, comprendente figure professionali differenziate in numero adeguato alla tipologia e al volume delle prestazioni erogate. Il personale sanitario dirigente deve essere specialista in Genetica Medica o possedere i requisiti equipollenti previsti dalla normativa vigente, come enunciato nelle Lineeguida per le attività di Genetica Medica elaborate dalla Conferenza Stato-Regioni del 15 luglio 2004 (GU n.224 del ), fermo restando gli effetti prodotti dalla circolare 30SAN/2001 riguardo alla salvaguardia dei diritti acquisiti del personale. 7) Presso ogni LGM devono esserci almeno un Responsabile e 2 Dirigenti sanitari, in possesso dei titoli di cui al punto precedente, a tempo pieno per garantire la continuità del servizio e la validazione dei risultati. In luogo di due dirigenti a tempo pieno possono esserci un numero maggiore di laureati, in possesso dei medesimi succitati requisiti, che garantiscano 2 Full Time Equivalent (FTE). Almeno uno dei Dirigenti sanitari (intendendo anche il Responsabile) deve aver maturato un esperienza documentata di almeno 5 anni in ambito diagnostico. L organico deve prevedere inoltre almeno 2 tecnici di laboratorio biomedico. In quelli in cui vengano utilizzate tecniche di sequenziamento di nuova generazione (NGS) a scopo diagnostico deve essere disponibile una figura dedicata alla risoluzione di problemi biologici a livello molecolare con metodi informatici (bio-informatico). 8) Volumi di attività Le attività di genetica devono essere concentrate presso strutture che garantiscano un adeguato volume di attività associato ad un costante aggiornamento delle conoscenze e delle tecnologie. I carichi di lavoro devono essere tali da garantire la qualità delle prestazioni e minimizzare il rischio di errori. a) Attività di Citogenetica L organico minimo di un Laboratorio di Citogenetica deve prevedere un Responsabile, 2 dirigenti del ruolo sanitario e 2 tecnici di laboratorio biomedico. L attività minima annuale di un laboratorio deve essere di almeno 1200 analisi; l attività minima annuale di un laboratorio che esegue esclusivamente analisi citogenetiche per la ricerca di anomalie acquisite deve essere di almeno 600 l anno. Se il laboratorio esegue anche analisi di CGH-/SNPs-array si rende necessario che il personale che opera nel laboratorio sia specificatamente qualificato ed esperto. b) Attività di Genetica Molecolare L organico minimo di un Laboratorio di Genetica Molecolare deve prevedere un Responsabile, 2 dirigenti del ruolo sanitario e 2 tecnici di laboratorio biomedico. L attività minima annuale di un laboratorio deve essere di almeno 2000 referti, fatto salvo laboratori ultra-specialistici dedicati a patologie estremamente rare, la cui attività verrà valutata dalla Direzione Regionale Welfare, sentito il parere del CReSMeL. Allo stato attuale, i risultati positivi ottenuti mediante tecnologie NGS devono essere confermati mediante altra metodica (Sanger sequencing). 9) Tempi di refertazione I LGM devono dichiarare i tempi di refertazione di tutte le analisi erogate. Nella tabella sono indicati i tempi, in giorni lavorativi, per tutte le tipologie di test/analisi entro i quali almeno il 90% per ciascuna tipologia di indagine deve essere refertato. 2

12 Tempi di refertazione indagini di citogenetica costituzionale Tempo (giorni) Cariotipo da colture di amniociti e da coltura a medio-lungo termine di trofoblasto 15 Cariotipo da colture di linfociti 20 Cariotipo da coltura a breve termine di trofoblasto (tecnica diretta) 5 Analisi urgenti su linfociti ottenuti da sangue fetale 7 Cariotipo da coltura di fibroblasti ottenuti da biopsia cutanea 20 FISH per indagini su campioni in prenatale 4 FISH per indagini su campioni in postnatale 12 FISH per indagini su campioni in postnatale per riarrangiamenti subtelomerici 20 QF-PCR 4 BoBs 4 BoBs su materiale abortivo 10 CGH/SNP array per indagini su campioni in diagnosi postnatale 40 CGH/SNP array per indagini su campioni in diagnosi prenatale 7 Tempi di refertazione indagini di citogenetica oncologica anomalie acquisite Tempo (giorni) Cariotipo da colture di sangue midollare/periferico 10 FISH per indagini su campioni oncologici 10 RSA (Region Specific Assays) 7 Tempi di refertazione indagini genetica molecolare Tempo (giorni) Diagnosi Prenatali 10 Test (STR/VNTR) per esclusione di contaminazione materna 3 SNPs di suscettibilità 10 Sequenza completa di un gene < 5 kb 45 Sequenza completa di un gene > 5 < 10 kb 65 Sequenza completa di un gene > 10 kb 120 Ricerca di mutazione specifica 10 Analisi mediante NGS * < 10 geni 45 da 10 a 50 geni 65 > 50 geni 120 * Laddove nel contesto di PDTA malattia specifico i risultati del test condizionino le scelte clinicoterapeutiche, i tempi massimi di refertazione devono essere contenuti entro 30 giorni 3

13 10) Requisiti relativi al referto Il referto deve essere scritto in conformità alle linee guida nazionali/internazionali, in modo chiaro e comprensibile anche ai non specialisti e contenere le seguenti informazioni: ü identificazione dettagliata del LGM che esegue l analisi ü anagrafica del paziente ü identificazione univoca del paziente ü identificazione del medico o della struttura che ha richiesto l analisi ü data del prelievo e data di ricezione del campione (se discordanti) ü tipo materiale ü quesito diagnostico ü descrizione del test genetico eseguito e del metodo utilizzato ü sensibilità e specificità analitiche del metodo utilizzato (se applicabile) ü data del referto, corrispondente alla conclusione dell indagine ü risultato dell analisi (cariotipo definito secondo l edizione più aggiornata dell ISCN, genotipo identificato secondo HGVS) ü commento, interpretazione del risultato, scritto in forma comprensibile anche ai non specialisti; ü segnalazione degli eventuali approfondimenti diagnostici necessari per probando/consanguinei ü eventuale rimando a consulenza genetica ü firma/e del responsabile/i dell analisi/laboratorio 11) Requisiti strutturali Gli spazi devono essere adeguati per garantire la quantità e qualità delle analisi erogate. Il numero e le dimensioni dei locali devono essere proporzionati e adeguati al numero del personale e alla tipologia delle attività svolte secondo quanto previsto dalle norme vigenti. I LGM devono poter disporre di aree idonee allo svolgimento della consulenza collegata ai test genetici ed alla raccolta dei relativi consensi informati, con garanzie di riservatezza e tranquillità, ad uso non esclusivo, anche in spazi non contigui alla attività analitica. a) Attività di Citogenetica devono disporre di almeno: 1 locale, ad uso esclusivo, dedicato unicamente all allestimento e all osservazione della crescita delle colture cellulari in condizioni di sterilità; 1 locale, ad uso esclusivo, dedicato unicamente all allestimento dei preparati cromosomici e all allestimento delle analisi di FISH; inoltre di ulteriori aree per la colorazione dei preparati, per l analisi al microscopio, l acquisizione e l elaborazione delle immagini. Se il laboratorio esegue: analisi di array-cgh/snp-array, test per la valutazione della Disomia Uniparentale (UPD), QF-PCR, MLPA deve essere dotato di aree idonee dedicate all estrazione del DNA, alla marcatura, ibridazione e lavaggio dei microarray, all allestimento delle PCR, all acquisizione ed elaborazione dei dati. b) Attività di Genetica Molecolare devono essere dotati almeno di: 1 locale per preparazione dei reagenti, estrazione degli acidi nucleici e messa a punto della reazione di amplificazione (cosiddetta zona pulita"), anche ad uso non esclusivo a condizione che si tratti delle stesse tipologie di attività 1 locale per esecuzione della reazione di amplificazione, delle varie analisi molecolari e valutazione dei dati ottenuti (cosiddetta "zona sporca"), anche ad uso non esclusivo a condizione che si tratti delle stesse tipologie di attività 4

14 un area per analisi dei dati e consultazione di database qualora la consulenza pre-test preveda anche la visita genetica è necessario disporre di un locale, ad uso non esclusivo, anche in spazi non contigui alla attività analitica. Nel caso in cui nello stesso LGM si svolgano sia analisi di citogenetica sia analisi di genetica molecolare, i locali e le aree dedicate ad analoghe tipologie di attività possono essere condivisi. 12) Ulteriori requisiti I test genetici devono essere eseguiti all interno di percorsi che prevedono la prescrizione del test da parte di uno specialista in Genetica Medica o di branca ed all interno comunque di un percorso di consulenza genetica (pre e post test), come da DGR 2989 del 23/12/