Corso ECM I segreti di PubMed: metodologia della ricerca delle informazioni (Roma, giugno 2015 I ed 8-9 luglio 2015 II ed)

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1 Corso ECM : metodologia della ricerca delle informazioni (Roma, giugno 2015 I ed 8-9 luglio 2015 II ed) PubMed Commons: PubMed diviene sociale Gaetana Cognetti cognetti.bib@ifo.it

2 Milioni di nuovi articoli ogni anno. I segreti I di di PubMed Roma, sett.2014

3 Parliamo di: Revisione tra pari dopo pubblicazione (Post publication peer review)

4 Classical peer review: an empty gun? La revisione tra pari prima della pubblicazione è secondo Richard Smith (BMJ): ineffective, slow, expensive, biased, inefficient, anti-innovator, and easely abused lottery....post publication peer review get to work the better Smith Breast Cancer Research 2010, 12(Suppl 4):S13

5 Tre riviste BMJ: revisione dopo pubblicazione (post publication peer reviewed) BMJ offre tre riviste EBM tramite Bibliosan Evidence Based Medicine Evidence Based Nursing Evidence Based Mental Health Bmj produce anche la banca dati Clinical Evidence di rassegne sistematiche(circa 3300) ora disponiamo anche di questa base dati

6 EBM Nursing EBM Medicine EBM Mental Health

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8 Faculty1000Prime Nasce nel 2002 con la collaborazione di 1000 (oggi 5000) membri di facoltà universitarie È una base dati contenente oltre documenti con raccomandazioni e commenti degli esperti I membri delle facoltà selezionano, votano e commentano gli articoli che ritengono più interessanti 2-3% della letteratura biomedica da riviste afferenti a 40 discipline

9 Classificazione dei documenti Gli articolo sono oggetto di commento e di classificazione: Changes clinical practice Good for teaching Novel drug target Controversial ecc.

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11 breast (cancer OR tumor OR tumour OR neoplas*) 1057 risultati usando i sinonimi molto meno se uso solo breast cancer

12 Le raccomandazioni. Sono brevi commenti effettuati dai revisori che evidenziano gli aspetti positivi e/o negativi degli articoli e assegnano un punteggio (stelle) Una stella: buono Due stelle: molto buono Tre stelle: eccellente

13 Posso selezionare le faculties es: Oncology, Cancer biology in cui eseguire la ricerca

14 Gli articoli sono classificati: Posso selezionare le faculties es: Oncology, Cancer biology in cui eseguire la ricerca o il tipo di articolo - changes clinical practice - good for teaching - novel drug target - controversial.. - confirmation -clinical trial RCT -clinical trial non RCT ecc.

15 Articoli più raccomandati negli ultimi 14 giorni

16 Hidden jewels: Gioielli nascosti Si tratta di articoli non pubblicati su riviste al top nelle varie aree mediche ma che costituiscono importanti riferimenti per la ricerca clinica e sperimentale

17 Hidden Jewels: oncology

18 Si possono depositare i Poster

19 La licenza sui poster è del tipo Creative commons con ampia libertà di utilizzo da parte di altri ricercatori I poster possono essere raccomandati accanto agli articoli da Faculty 1000 In alcuni casi di distorsione da pubblicazione (publication bias) è molto Importante pubblicare i poster che documentano esiti negativi di sperimentazioni

20 Faculty 1000 Che cosa ne pensate? E utile la selezione e la valutazione effettuata da ricercatori in ambito accademico? Possono esservi dei problemi o delle criticità?

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22 Faculty1000Prime Nasce nel 2002 con la collaborazione di 1000 (oggi 5000) membri di facoltà universitarie È una base dati contenente oltre documenti con raccomandazioni e commenti degli esperti I membri delle facoltà selezionano, votano e commentano gli articoli che ritengono più interessanti 2-3% della letteratura biomedica da riviste afferenti a 40 discipline

23 Classificazione dei documenti Gli articolo sono oggetto di commento e di classificazione: Changes clinical practice Good for teaching Novel drug target Controversial ecc.

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25 Le raccomandazioni. Sono brevi commenti effettuati dai revisori che evidenziano gli aspetti positivi e/o negativi degli articoli e assegnano un punteggio (stelle) Una stella: buono Due stelle: molto buono Tre stelle: eccellente

26 Si possono depositare i Poster

27 Faculty 1000 Che cosa ne pensate? E utile la selezione e la valutazione effettuata da ricercatori in ambito accademico? Possono esservi dei problemi o delle criticità?

28 PubMed diviene sociale PubMed Commons nasce nel 2013 ed è ancora allo stato di progetto Pilota E stato sviluppato dalla NLM col supporto di un gruppo reclutato da Robert Tibshirani della Stanford University Si tratta di una rete sociale (social network) per commentare gli articoli contenuti nella base dati (circa 22 milioni) Il sistema consente di commentare anche tuttli gli articoli contenuti in PubMed anche di riviste che non hanno attivato queste funzioni

29 I commenti sono importanti?

30 I commenti.. Permettono di ricevere molto rapidamente le valutazioni della comunità scientifica sulle ricerche. Quando si aggiorna un documento EBM è essenziale raccogliere i commenti (insieme con gli errata corrige e le retracted publication ) in quanto essi posso evidenziare errori e problemi nella conduzione di una sperimentazione clinica prima che queste valutazioni si depositino in articoli scientifici

31 Importanza di Pubmed Commons Attraverso la rete creata con PubMed Commons è possibile interagire con gli autori dei documenti invitandoli a rispondere ai commenti e a verificare i dati scientifici inseriti negli articoli. Si creano comunità di ricercatori interessati alle stesse problematiche che possono interagire e dialogare integrando anche i dati forniti dagli articoli

32 Il caso di Amanda Capes-Davis Presidente dell International Cell Line Authentication Committee (ICLAC) usa PubMed Commons per informare gli autori di pubblicazioni sulle problematiche della contaminazione delle cellule Per evitare che un grosso lavoro di ricerca sia reso inutile a causa di questo fenomeno Si evita di perpetuare gli errori commessi in alcuni studi attraverso la comunicazione degli stessi negli altri lavori scientifici

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35 Commenti non anonimi Dichiarare conflitti di interesse No spam No discriminazioni No punti di vista politici di parte No plagi ecc. ecc.

36 / Chi commenta resta anonimo

37 about Anche i fondatori di Pubpeer sono anonimi

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39 In primo piano

40 Commenti anonimi o no?

41 Un problema controverso.. Those wanting anonymous posts were concerned that many scientists, especially junior researchers, would be reluctant to make critical comments. But those opposed to anonymous comments believed that the quality of interchange would be higher if commenters were required to identify themselves, he said, adding that the group was very much split on the decision. Mainstreamed/

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44 Se PubMed ha il vostro indirizzo Siete invitati ad entrare in Commons. Dovete incollare il codice inviato rientrando nella pagina di PubMed

45 A questo punto potete attivare Commons Se non riconosce l dovete farvi invitare da un collega/autore in PubMed il codice di verificazione vi viene mandato via e dovete incollarlo qui

46 A questo punto potete attivare Commons Una volta incollato il codice di verificazione siete accettati nel sistema

47 Commons è stato attivato

48 BREAST CANCER PubMed sta sperimentando collegamenti banche dati su stato dell arte per pazienti e professionisti sanitari

49 Posso inserire un commento ad un articolo Posso invitare uno degli autori a commentare

50 Per poter commentare devo essere autore di pubblicazioni e devo registrarmi in My NCBI

51 Gaetana

52 Breast Cancer

53 Il sistema mi riconosce e posso commentare.

54 I commenti possono essere al massimo di caratteri ma link a documenti più ampi sono possibili

55 breast cancer AND has_user_comments[filter]

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57 COGNETTI G[au] Se siete autori di pubblicazioni indicizzate in Pubmed Potete verificare se avete dei commenti

58 Non ho commenti attualmente ma posso richiedere al sistema di aggiornarmi nel caso li riceva. Come?

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60 Additional Filter attivare Pubmed Commons. Per verificare i commenti

61 Lo stesso autore ha risposto ai commenti indicando un link con maggiori informazioni sull argomento. I commenti I segreti non di possono PubMed eccedere gli caratteri ma si possono Roma, inserire 23-24giugno link a documenti 2015 e dati anche molto ampi...

62 Bezouska K: Il commento indica che il lavoro è stato ritirato in quanto troppo simile ad un altro lavoro (plagiarismo) ed indica il link ove si trova la relativa notizia

63 Si tratta dell ottava retrazione per l ultimo autore

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65 Pubmed Commons una rete sociale per i commenti

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