INFORMATIVA PER L'INDAGINE MEDIANTE MICROARRAY CROMOSOMICI IN EPOCA PRENATALE E POSTNATALE

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1 Modulo MSQ 5.3 : Distanza intestazione dal bordo: 0 cm INFORMATIVA PER L'INDAGINE MEDIANTE MICROARRAY CROMOSOMICI IN EPOCA PRENATALE E POSTNATALE Referenti: Dr.ssa F.Malvestiti, Dr.ssa F.R.Grati Che cosa è l analisi con microarray cromosomici? Cosa si può individuare con i microarray cromosomici? L analisi con microarray cromosomici (CMA, Chromosome Microarray Analysis) è una tecnica in grado di analizzare contemporaneamente tutti i cromosomi in modo maggiormente approfondito rispetto al cariotipo standard: consente di identificare alterazioni cromosomiche molto piccole, che non possono essere evidenziate con la analisi classica del cariotipo. La metodica, tuttavia, come meglio sotto esplicitato, presenta dei limiti e delle problematiche interpretative per cui il suo utilizzo va attentamente valutato, specie in epoca prenatale. Quali sono le indicazioni alla CMA? In epoca prenatale le indicazioni più appropriate e frequenti per l'utilizzo di questa metodica di indagine sono: 1. la necessità di caratterizzare in maniera più approfondita alcune anomalie cromosomiche fetali; 2. il riscontro alla ecografia di anomalie strutturali del feto; 3. un iposviluppo fetale con insorgenza precoce da causa incerta. In epoca postnatale le indicazioni più appropriate e frequenti per l'utilizzo di questa metodica di indagine sono ritardo globale dello sviluppo psicomotorio, ritardo mentale, spettro autistico, epilessia e anomalie congenite. Quali sono i limiti di questa metodica diagnostica? Al pari di qualsiasi metodica diagnostica, anche i CMA presentano dei limiti. Non sono evidenziabili: 1. riarrangiamenti cromosomici bilanciati (es. traslocazioni reciproche e Roberstoniane, inversioni); 2. mosaicismi cromosomici scarsamente rappresentati (< 30%); 3. varianti/anomalie cromosomiche non evidenziabili con la piattaforma di microarray utilizzata; 4. patologie genetiche non causate da duplicazioni/delezioni cromosomiche 5. poliploidie Nei campioni prenatali, l eventuale contaminazione materna (contemporanea presenza nel campione di cellule fetali e materne) può inficiare l'attendibilità del risultato: è quindi necessario escludere una eventuale contaminazione del campione fetale con cellule materne mediante confronto del DNA fetale con il DNA materno. A tale scopo è quindi indispensabile fare pervenire sempre un campione di sangue materno. La presenza di sbilanciamenti può rendere necessario l uso di tecniche aggiuntive per caratterizzare il riarrangiamento e può rendere necessario estendere l analisi ad entrambi i genitori ai fini di una corretta interpretazione del risultato. Per questi motivi è opportuno che il campione (fetale o del probando/a) sia sempre essere accompagnato da un campione ematico dei genitori, che viene utilizzato solo nei casi in cui sia necessario effettuare una comparazione con quello parentale. In questi casi è indispensabile più tempo per le conclusioni diagnostiche. In rari casi, gli esiti dell'esame potrebbero rilevare la non corrispondenza biologica tra il DNA della coppia e quello fetale (ad esempio in caso di fecondazione eterologa o di trapianto). Delle informazioni non corrette sul ruolo biologico della coppia potrebbero impedire una corretta interpretazione del test. L analisi condotta su campioni prenatali è associata ad un tasso di fallimento del 2-6% (Wapner et al, ISPD 2010) a seconda dell origine del campione analizzato. Pagina 1 di 5 : Tipo di carattere: Grassetto, Grassetto, Grassetto, Grassetto

2 Modulo MSQ 5.3 I risultati forniti dalla metodica sono sempre facili da interpretare? L analisi dei risultati può talora essere problematica, poiché allo studio del genoma mediante CMA possono risultare varianti (chiamate tecnicamente Variazioni del Numero di Copie; CNV) di non facile/immediata interpretazione, quali: A) varianti/cnv rare, per le quali non esistono ancora sufficienti conoscenze per comprendere se siano benigne o potenzialmente associate a patologie di qualche tipo. Queste varianti vengono definite VOUS (varianti di incerto significato); B) varianti/cnv a significato patogenetico, ma non correlate con la condizione per la quale è stata richiesta l'analisi; C) varianti/cnv associate a patologie ad espressività variabile e/o penetranza incompleta (per cui la malattia eventualmente associata al riarrangiamento evidenziato può non manifestarsi oppure manifestarsi con gravità variabile e non prevedibile) oppure a suscettibilità a malattie complesse; D) varianti/cnv che potrebbero avere implicazioni cliniche non correlate con l'indicazione all analisi (es. patologie ad insorgenza tardiva, predisposizione all'insorgenza di tumori,stato di portatore sano di malattie a trasmissione recessiva etc.), occasionalmente a trasmissione familiare. Quali sono le caratteristiche tecniche principali della metodica che verrà impiegata? La tecnica CMA applicata è quella dell array Comparative Genomic Hybridization (acgh). Essa può essere eseguita con due risoluzioni differenti: - una più elevata (180K) consigliata per i casi postnatali e i casi prenatali in cui emerga dalla consulenza genetica la necessità di eseguire l analisi ad una risoluzione più elevata (risoluzione effettiva di 20Kb nelle regioni critiche; risoluzione effettiva di 40Kb nel backbone) - una risoluzione inferiore (37K) consigliata nei casi prenatali allo scopo di ridurre la possibilità di individuare varianti di significato incerto, il test verrà effettuato utilizzando dei filtri tali da ricercare principalmente sbilanciamenti di regioni responsabili di sindromi da microdelezione/microduplicazione e/o contenenti geni-malattia; tutte le altre regioni del genoma saranno comunque analizzate, ma con una risoluzione inferiore (risoluzione effettiva di 40Kb nelle regioni critiche; risoluzione effettiva di 400Kb nel backbone). Un caso analizzato alla risoluzione 37K può essere successivamente rianalizzato a 180K. Quando sarà disponibile l esito del test? - Nei casi prenatali entro circa 10 giorni dall estrazione del DNA dalle cellule fetali (coltura cellulare, frustoli di villi coriali, amniociti); - Nei casi postnatali entro un mese dal ricevimento del campione del/la probando/a. In casi particolari, ove richieste analisi parentali e conferme con secondo esperimento, sono possibili prolungamenti del tempo necessario a fornire una risposta. L esito del test sarà disponibile e verrà consegnato ai genitori/tutori nel corso di una consulenza genetica. Il laboratorio TOMA è certificato ISO 9001:2008, Qualità in Medicina di Laboratorio, SIGUCert2009 e inserita nell albo MIUR. La tecnica di arraycgh è stata oggetto di tutte le tre certificazioni. Dal 2010 il laboratorio TOMA partecipa ai controlli di qualità esterni Europei (CEQAS) per l analisi arraycgh. Pagina 2 di 5, Grassetto, Grassetto, Grassetto

3 Firma degli interessati Firma degli interessati, Grassetto Pagina 3 di 5, Grassetto, Grassetto

4 Pagina 4 di 5 Modulo MSQ 5.3 CONSENSO INFORMATO ALL APPLICAZIONE DIAGNOSTICA DELL ARRAY- CGH (a-cgh) IL/LA/I SOTTOSCRITTO/A/I Nome della Madre.. nata a.. Nome del Padre nato a. Nome del Tutore.. nato/a a Nome del/la Probando/a nato/a a DICHIARA/DICHIARANO di aver ben compreso le informazioni fornite dal consulente genetista in merito a quanto sopra riportato circa i limiti e i vantaggi dell acgh. di aver potuto discutere tali spiegazioni, di porre le domande che hanno ritenuto necessarie e di aver ricevuto risposte esaurienti e comprensibili di acconsentire all utilizzo del campione in eccesso per studi di ricerca e per le relative pubblicazioni (su riviste specializzate o database) in forma anonima atti alla comprensione del significato delle variazioni del genoma; Il/La/I sottoscritto/a/i dichiara/no inoltre di: Volere NON volere rendere partecipe dei risultati il Dott. Il/La/I sottoscritto/a/i dichiara/no che quanto sopra corrisponde a verità e si impegnano a comunicare tempestivamente ogni eventuale cambiamento di opinione in merito. PERTANTO, SULLA BASE DELLE INFORMAZIONI RICEVUTE IL/LA/I SOTTOSCRITTO/A/I acconsente/ono non acconsente/ono all esecuzione del test e al prelievo di un loro campione di sangue periferico per eventuale estensione dell analisi ai genitori. Il/La/I sottoscritto/a/i dichiara/no inoltre di voler ricevere informazioni su: tutte le varianti/cnv evidenziate (VOUS e Patogenetiche) solo varianti/cnv a chiaro significato patogenetico correlate alla indicazione per l'analisi tutte le varianti/cnv a chiaro significato patogenetico correlate e non correlate dalla indicazione per la analisi (specificare) In caso di mancata compilazione di questa sezione verranno riportate tutte le varianti evidenziate (VOUS e Patogenetiche) AAutorizzo il laboratorio TOMA ad eseguire l analisi oggetto del presente consenso. Firma e timbro dello specialista che ha raccolto il consenso informato : Tipo di carattere: 9 pt : Tipo di carattere: 9 pt : Interlinea multipla 1,15 ri : Allineato a sinistra, : Tipo di carattere: 9 pt : Allineato a sinistra, : Tipo di carattere: 9 pt : Allineato a sinistra,, Grassetto, Grassetto, Grassetto

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