Prefazione Capitolo 1 Introduzione Capitolo 2 Struttura dei virioni

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1 INDICE Prefazione XI Capitolo 1 Introduzione I virus sono diversi dagli altri organismi viventi 2 Storia della virologia 4 Ospiti viventi animali e vegetali 6 Le colture cellulari 9 Metodi sierologici e immunologici 11 Studi ultrastrutturali 14 Biologia molecolare 21 Bibliografia 27 Capitolo 2 Struttura dei virioni Funzione e formazione della particella virale 28 Simmetria dei capsidi e architettura dei virioni 31 Capsidi elicoidali 32 Capsidi icosaedrici (isometrici) 37 Virus con envelope 44 Virus con strutture complesse 48 Interazioni proteine-acidi nucleici e impacchettamento del genoma 54 Recettori virali: riconoscimento e legame 60 Altre interazioni del capside virale con la cellula ospite 60 Bibliografia 61

2 VI Elementi di virologia molecolare ISBN Capitolo 3 Genomi virali Struttura e complessità dei genomi virali 62 Genetica molecolare 65 Genetica dei virus 70 Mutanti virali 72 Origine dei mutanti virali 72 Mutazioni spontanee 72 Mutazioni indotte 73 Tipi di mutanti virali 74 Soppressione 77 Interazioni genetiche tra virus 77 Interazioni non genetiche tra virus 81 Grandi genomi a DNA 82 Piccoli genomi a DNA 86 Virus a RNA con genoma a filamento positivo 90 Picornavirus 90 Togavirus 91 Flavivirus 92 Coronavirus 93 Virus vegetali a RNA a polarità positiva 93 Virus a RNA con genoma a filamento negativo 94 Bunyavirus 95 Arenavirus 96 Orthomyxovirus 96 Paramyxovirus 96 Rhabdovirus 96 Genomi virali segmentati e genomi virali ripartiti in virioni diversi 97 Retrotrascrizione e trasposizione 101 Evoluzione ed epidemiologia 113 Bibliografia 116 Capitolo 4 Replicazione Schema della replicazione virale 117 Le fasi del ciclo replicativo virale 119 Il ciclo replicativo 124 Attacco 125 Penetrazione 132 Uncoating 135

3 Indice VII Replicazione del genoma ed espressione genica 137 Assemblaggio 141 Maturazione 144 Fuoriuscita dalla cellula 147 Bibliografia 148 Capitolo 5 Espressione Espressione dell informazione genetica 149 Controllo dell espressione genica nei procarioti 150 Controllo dell espressione nel batteriofago l 151 Controllo dell espressione genica negli eucarioti 156 Strategie di codificazione del genoma 159 Classe I: DNA a doppio filamento 159 Poliomavirus e papillomavirus 159 Adenovirus 160 Herpesvirus 160 Poxvirus 161 Classe II: DNA a singolo filamento 162 Classe III: RNA a doppio filamento 164 Classe IV: RNA a singolo filamento di polarità (+) 165 Classe V: RNA a singolo filamento di polarità ( ) 168 Classe VI: RNA a singolo filamento di polarità (+) con intermedio a DNA 170 Classe VII: DNA a doppio filamento con intermedio a RNA 171 Controllo trascrizionale dell espressione 171 Controllo post-trascrizionale dell espressione 177 Bibliografia 186 Capitolo 6 Infezione Infezioni virali delle piante 188 Le risposte immuni alle infezioni virali negli animali 192 Virus e apoptosi 198 Interferoni 201 Evasione della risposta immune da parte dei virus 206 Inibizione della presentazione dell antigene MHC-I-ristretta 207 Inibizione della presentazione dell antigene MHC-II-ristretta 207 Inibizione della lisi delle cellule natural killer 208 Interferenza con l apoptosi 208 Inibizione dell azione delle citochine 208 Evasione dell immunità umorale 209

4 VIII Elementi di virologia molecolare ISBN Evasione della cascata del complemento 209 Interazioni virus-ospite 209 Il decorso delle infezioni virali 220 Infezione abortiva 220 Infezione acuta 220 Infezione cronica 220 Infezione persistente 221 Infezione latente 223 Prevenzione e terapia delle infezioni virali 224 Vaccini a subunità 225 Vaccini inattivati 226 Vaccini con virus vivi (attenuati) 227 Vaccini a DNA e RNAi 228 Vettori virali e terapia genica 229 Chemioterapia delle infezioni virali 230 Bibliografia 237 Capitolo 7 Patogenesi Meccanismi virali responsabili del danno cellulare 241 Virus e immunodeficienza 244 Uccisione cellulare diretta 247 Uccisione indiretta delle cellule infettate da HIV 247 Diversità antigenica 248 Anergia delle cellule T 248 Apoptosi 250 Superantigeni 250 Rapporto T H 1/T H Carica virale e cinetica di replicazione 252 Malattie virus-correlate 254 Batteriofagi e malattie umane 257 Trasformazione cellulare da virus 259 Trasformazione cellulare da retrovirus 263 Trasformazione cellulare da virus a DNA 268 Virus e tumori 272 Virus nuovi ed emergenti 277 Zoonosi 284 Bioterrorismo 285 Bibliografia 286

5 Indice IX Capitolo 8 Agenti subvirali: genomi senza virus, virus senza genomi Satelliti e viroidi 287 Prioni 292 Patologia delle malattie causate da prioni 293 TSE negli animali 294 Scrapie 294 Encefalopatia trasmissibile del visone (TME) 296 Encefalopatia spongiforme del felino (FSE) 296 Malattia cronica cachetizzante (CWD) 296 Encefalopatia spongiforme bovina (BSE) 297 Le TSE trasmesse all uomo 299 Biologia molecolare dei prioni 302 Bibliografia 309 Appendice 1 Glossario 310 Appendice 2 Classificazione di agenti infettivi subcellulari 319 Appendice 3 Storia della virologia 329 Indice analitico 334

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