TERAPIA ANTISENSO DEL DIFETTO DI FATTORE V DELLA COAGULAZIONE. Elisabetta Castoldi

Documenti analoghi
Università degli Studi di Ferrara. UTILIZZO DI U1-snRNA PER LA CORREZIONE DEL DIFETTO SEVERO DI FATTORE VII DELLA COAGULAZIONE

Struttura e funzione dei geni. Paolo Edomi - Genetica

CONGRESSO NAZIONALE TUMORI EREDITARI: dalla biologia molecolare al trattamento Modena, Novembre 2010

DALLA RICERCA DI BASE ALLO SVILUPPO DI TERAPIE INNOVATIVE PER LE MALATTIE GENETICHE. Prof. Mirko Pinotti Dip. Scienze della Vita e Biotecnologie

PRODA Istituto di Diagnostica Clinica

via Santena, Torino - Italy UNIVERSITÀ DEGLI STUDI Tel: Fax: DI TORINO

Dal DNA all RNA. La trascrizione nei procarioti e negli eucarioti

La possibilita di conoscere i geni deriva dalla capacita di manipolarli:

RNA non codificanti ed RNA regolatori

Organizzazione del genoma umano III

MODIFICAZIONI POST-TRASCRIZIONALI. 5 NT non tradotto 3 NT

DOMANDA FREQUENTE: QUALE E LA FUNZIONE DI UNA CERTA PROTEINA? SI AUMENTA O SI DIMINUISCE L ESPRESSIONE DELLA PROTEINA

Il deficit del fatt VIII prevale (5 volte in più rispetto al IX) Prevalenza nel mondo è di 1: :50000 L alta incidenza relativa di Emofilia A è

INTOLLERANZA AL LATTOSIO: ESEMPIO DI BIODIVERSITA GENETICA

Nei sistemi modello approcci di modificazione genetica che producono o sequenze genetiche alterate o espressione genetica alterata fenotipo alterato.

Dal DNA alle proteine: La trascrizione e la traduzione

SINTESI DELL RNA. Replicazione. Trascrizione. Traduzione

sirna Strategie di silenziamento genico post-trascrizionale

DNA - RNA. Nucleotide = Gruppo Fosforico + Zucchero Pentoso + Base Azotata. Le unità fondamentali costituenti il DNA e l RNA sono i Nucleotidi.

Strumenti, obiettivi e frontiere della terapia genica

PCR. PCR o reazione di polimerizzazione a catena. Amplificazione esponenziale di DNA. Puo amplificare un tratto di DNA per piu di 1 milione di volte

Taglia - e - incolla il DNA: Riparare le mutazioni con 'l editing genomico' DNA, RNA e proteina

TIPIZZAZIONE TIPIZZAZIONE HLA

PROGETTO BIOFORM Corso didattico sperimentale. Esercizio. Tipizzazione del gene PV92

REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE GENICA

Trascrizione negli eucarioti

La trasmissione delle malattie genetiche. Anna Onofri

centrale (CNS) causata dall infezione litica degli oligodendrociti da parte del Polyomavirus JC (JCPyV). Ad

Definizione di genoteca (o library) di DNA

Molecular basis of the X-linked Dyskeratosis disease: insights from Drosophila

TRASCRIZIONE

4 modulo didattico - Modalità di trasmissione delle malattie

SEQUENZIAMENTO DEL DNA

L endocitosi dell EGFR

Next-generation sequencing, annotazione, ed espressione genica. Giulio Pavesi Dip. Bioscienze Università di Milano

Carpire il segreto della vita con l informatica Giosuè Lo Bosco Dipartimento di Matematica e Informatica, Università di Palermo, ITALY.

Piattaforma per studi su larga scala di eventi molecolari associati a patologie umane: applicazioni per la scoperta di nuovi farmaci

RIATTIVAZIONE EPIGENETICA DEL GENE FMR1

Il metabolismo dell RNA. Prof. Savino; dispense di Biologia Molecolare, Corso di Laurea in Biotecnologie

MANIPOLAZIONE GENETICA DEGLI ANIMALI

Il genoma dinamico: gli elementi trasponibili

Thalassaemias. Thalassaemia Hb Variants. A group of blood deseases caused by a genetically determined. alteration in globin synthesis

La mutazione c.34g>t del gene KRAS come marcatore precoce delle poliposi associate al gene MUTYH

Novità di ricerca nella mielofibrosi

Le Distrofie muscolari colpiscono i muscoli scheletrici del paziente

NORMATIVA OGM IN ALIMENTI, SEMENTI E COLTURE AGRARIE

Elementi di Patologia Generale Dott.ssa Samantha Messina Lezione: Patologia Genetica

Mendeliana Autosomica Dominante (AD) Autosomica Recessiva (AR) X-linked Recessiva (X-linked R) X-linked Dominante (X-linked D) Y-linked

La gestione della terapia anticoagulante orale.

Lo sviluppo del cancro è un processo complesso che coinvolge parecchi cambiamenti nella stessa cellula staminale. Poiché tutte le cellule staminali

Il test genetico BRCA1/BRCA2

"Ma.Tr.OC: un progetto europeo per studiare la progressione di malignità delle esostosi multiple"

La mutazione è una modificazione della sequenza delle basi del DNA

Diagnosi di portatrice e diagnosi prenatale: counselling genetico

FIACCHEZZA, STANCHEZZA, MALESSERE MORALE. Carenza di ferro molto diffusa e spesso sottovalutata

Pamela Magini Journal Club, Scuola di Specializzazione in Genetica Medica 12 Febbraio 2013, Torino

RNA polimerasi operone. L operatore è il tratto

Indice dell'opera. Prefazione. Capitolo 1 Introduzione alla genetica Genetica classica e moderna Genetisti e ricerca genetica Sommario

C2. Il rilascio del fattore sigma marca il passaggio alla fase di allungamento della trascrizione.

L adattamento dei batteri. Strategie di adattamento

SAGE: Serial Analysis of Gene Expression

La rimozione degli introni e la successiva unione degli esoni devono essere estremamente accurate per gli mrna. Sequenze targets per lo splicing

Il nobel per l interferenza dell RNA

Organizzazione del genoma umano II

Laboratorio di Elementi di Bioinformatica

STENOSI CAROTIDEA. Influenza del controllo glicemico. Este, 29 novembre giuseppe panebianco

DAL mrna ALLA SINTESI PROTEICA

Effetti delle LDL ossidate sull uptake del glucosio in cellule adipocitarie mature

Biologia Molecolare. CDLM in CTF La modificazione dell RNA e la traduzione

TRASCRIZIONE DEL DNA. Formazione mrna

Rassegna stampa. A cura dell Ufficio Stampa FIDAS Nazionale. Venerdì 22 gennaio Rassegna associativa. Rassegna Sangue e emoderivati

L identificazione MODELLI PREDITTIVI. Ileana Carnevali. UO Anatomia Patologica Ospedale di Circolo-Università dell Insubria Varese

Le terapie avanzate nella cura delle malattie rare

Michaela Luconi, PhD

Mutagenesi: introduzione di alterazioni in una sequenza nucleotidica. Mutagenesi random: le mutazioni avvengono a caso su un tratto di DNA.

Cosa è il cancro colorettale

Dott.ssa Ilaria Barchetta

GENOMA. c varia da pochi kb nei virus a milioni di kb in piante e animali

In collaborazione con la Professoressa Antonella Tosti, Bologna e Professore di Dermatologia

Nozioni di base. cromosoma. 2. I cromosomi sono composti dal DNA. Ogni essere vivente è composto di cellule DNA. corpo cellulare

TWO NOVEL MITOCHONDRIAL DNA CONTROL REGION MUTATIONS IN CHILDREN WITH CYCLIC VOMITING SYNDROME

Genoma umano: illusioni, realtà, prospettive

PROGRESS IN STEM CELL BIOLOGY AND MEDICAL APPLICATIONS 12/01/13

Corso di Biologia Molecolare

Aggiornamenti in ambito genetico

Cara1eris4che della Hb

RNA interference. La tecnologia dell RNAi è basata su un processo di inattivazione genica post-trascrizionale, altamente specifico

Scala fenotipica. Dominante o recessivo? fenotipo. fenotipo. fenotipo A 1 A 1 A 2 A 2 A 1 A 2

Vettori di espressione

Cellule staminali Cosa sono, come si ottengono e qual è il loro uso nella terapia rigenerativa

PLASMIDI puc ALTRI TIPI DI VETTORI. VETTORI λ

La terapia in utero delle malattie genetiche: cellule staminali, terapia genica

PETIZIONE POPOLARE CONSIDERATO CHE

GENETICA seconda parte

CAMPAGNA DI LOTTA ALLA DIPENDENZA DA TABACCO DEI DISTRETTI SANITARI H1 & H3 SCREENING GRATUITO DELLA SATURAZIONE DI OSSIGENO

Replicazione del DNA

07/01/2015. Come si ferma una macchina in corsa? Il terminatore. Terminazione intrinseca (rho-indipendente)

Cetuximab e mutazione K-Ras nel tumore del colon-retto

GESTIONE DEL PAZIENTE NEFROPATICO

Controllo post-trascrizionale dell espressione genica

Transcript:

TERAPIA ANTISENSO DEL DIFETTO DI FATTORE V DELLA COAGULAZIONE Elisabetta Castoldi Department of Biochemistry Maastricht University (The Netherlands)

DICHIARAZIONE Relatore: Elisabetta Castoldi Posizione di dipendente in aziende con interessi commerciali in campo sanitario: NIENTE DA DICHIARARE Consulenza ad aziende con interessi commerciali in campo sanitario: Fondi per la ricerca da aziende con interessi commerciali in campo sanitario: NIENTE DA DICHIARARE NIENTE DA DICHIARARE Partecipazione ad Advisory Board: NIENTE DA DICHIARARE Titolarietà di brevetti in compartecipazione ad aziende con interessi commerciali in campo sanitario: NIENTE DA DICHIARARE Partecipazioni azionarie in aziende con interessi commerciali in campo sanitario: Altro: NIENTE DA DICHIARARE NIENTE DA DICHIARARE

Fattore V della coagulazione (FV) Glicoproteina prodotta nel fegato Presente nel plasma (80%) e nelle piastrine (20%) Cofattore essenziale nella conversione della protrombina a trombina La completa assenza di FV non è compatibile con la vita (cf. topi knockout), ma la quantità minima necessaria per la sopravvivenza è estremamente bassa (<1%)

Difetto di FV Disordine emorragico raro (1:10 6 ) Tendenza al sanguinamento variabile da lieve a severa Trattamento e profilassi: plasma e/o concentrati piastrinici Ereditarietà autosomica recessiva Mutazioni nel gene F5 (150 descritte) Missense/nonsense (66%) Small ins-dels (21%) Splicing (11%) Gross rearrangements (2%) Source: Human Genome Mutation Database (accessed April 2014)

Patient FV:Ag FV:C Bleeding symptoms Mutation Consequences Female baby Parents distantly related 8% <1% Umbilical bleeding Gum bleeding EX10 1701 G/T (homozygous) Activation cryptic splice site 35-nt deletion in mature mrna Recurrent CNS bleeding PTC Iranian male, 19 years Consanguineous parents 0.5% <1% Mucosal bleeding Recurrent haemarthrosis IVS19 +3 A/T (homozygous) Skipping of exon 19 FV synthesis but no secretion Haematuria Chinese male, 37 years Consanguineous parents 7.2% 1.6% Gingival bleeding Post-operative haemorrhage IVS8-2 A/G (homozygous) Activation cryptic splice site Inclusion 8 additional a.a. Intracranial haemorrhage Chinese male, 18 years - 2%??? IVS8-2 A/G (homozygous) Activation cryptic splice site Inclusion 8 additional a.a. Slovenian male - <1% Gastro-intestinal bleeding Joint & muscle bleeding Intracranial bleeding IVS18-12 T/A (homozygous) Activation cryptic splice site 10-nt insertion in mature mrna 0.1% mrna spliced correctly Iranian female Consanguineous parents 6% 5% Epistaxis IVS8 +6 T/C (homozygous) Skipping of exon 8 NMD of mrna Italian male, 33 years <1% <1% Spontaneous haemothorax Intracranial haemorrhage (2x) IVS8 +268 A>G (homozygous) Inclusion of intronic pseudo-exon with in-frame stop codon Italian male, 54 years 0.1% <1% Died of intracranial bleeding IVS21 +1 G/A (comp. heteroz.) Activation cryptic splice site NMD of mrna Austrian female, 31 years - 3% Muscle haematomas Gastro-intestinal bleeding Macrohaematuria Chinese male, 2 years 1.6% 1.1% Bleeding after mouth injury Epistaxis Soth-African male newborn - 1% Persistent bleeding at heel prick Bleeding post-circumcision Umbilical bleeding IVS24 +1_+4del (comp. heteroz.) IVS16-1 G>T (comp. heteroz.) IVS12 +5 G>A (comp. heteroz.) Activation cryptic splice site FV synthesis but no secretion Skipping of exon 17 Skipping of exon 12 (91.5%) Activation of cryptic donor splice site in intron 12 (6.8%)

Terapia antisenso dell RNA Uso di molecule antisenso per ripristinare lo splicing corretto di trascritti contenenti mutazioni di splicing Oligonucleotidi sintetici con varie strutture chimiche Piccoli RNA nucleari ingegnerizzati (U1snRNA, U7snRNA) Promuovere l uso di segnali di splicing corretti indeboliti da mutazione (U1snRNA) Nascondere segnali di splicing incorretti introdotti per mutazione (oligonucleotidi, U7snRNA)

Il nostro paziente Maschio caucasico di 35 anni Storia di sanguinamento severo (2 emorragie intracraniche) FV plasmatico e piastrinico al di sotto della soglia di detection PPP + PL PRP PRP + collagene Controllo Paziente Castoldi et al. JTH 2011

Analisi genetica Controllo +268 AA Paziente +268 GG ACAGC IVS 8 +268 A CAG G TAAGT Esone 8 Pseudo-esone Introne 8 Esone 9 Sito donatore di splicing Sito accettore di splicing Sito donatore di splicing Sito accettore di splicing Normale (A) Mutato (G) NNSPLICE 0.98 0.90 ND 1.00 0.94 SpliceView 0.86 0.83 ND 0.92 0.79 Human Splicing Finder 0.88 0.88 0.73 1.00 0.81 Castoldi et al. JTH 2011

Effetto della mutazione F5 IVS8 +268A>G mrna normale Esone 8 Esone 9 Esone 10 Esone 11 F5 8F-11R (470 bp) Splicing normale Pre-mRNA Esone 8 Introne 8 Esone 9 Introne 9 Esone 10 Introne 10 Esone 11 Codone di STOP! Splicing aberrante Pseudoesone Esone 11 mrna aberrante Esone 8 Esone 9 Esone 10 F5 8F-11R (581 bp) C P B 581 bp 470 bp Possiamo correggere questo difetto di splicing con la terapia antisenso? Castoldi et al. JTH 2011

Scopo dello studio Disegnare molecole antisenso dirette contro il sito donatore di splicing introdotto dalla mutazione F5 IVS8+268A>G Verificarne la capacità di correggere lo splicing aberrante del pre-mrna del F5 in vitro ed ex vivo Esone 8 Introne 8 Pseudo-esone Introne 8 Esone 9 Splicing normale Esone 8 Esone 9

Molecole antisenso Oligonucleotide antisenso (morfolino) U7snRNA ingegnerizzato psp64 25-mer Delivered to cells using EndoPorter Reagent anti-f5 5 - UCUACUUACCUGUGGCUUUA - 3 Delivered to cells using conventional lipofection Esone 8 Introne 8 Pseudo-esone Introne 8 Esone 9 Splicing normale Esone 8 Esone 9

Modello in vitro Wild-type F5 minigene Mutant F5 minigene Esone 8 Introne 8 Esone 9 Esone 8 Introne 8 Esone 9 * Clonaggio in vettore di espressione Clonaggio in vettore di espressione * Trasfezione Trasfezione Trascrizione Splicing Cellule COS-1 (rene) Cellule HepG2 (fegato) * Trascrizione Splicing mrna analysis mrna analysis Esone 8 Esone 9 mrna normale Esone 8 Esone 9 mrna aberrante

Modello in vitro Wild-type F5 minigene Mutant F5 minigene Esone 8 Introne 8 Esone 9 Esone 8 Introne 8 Esone 9 * Clonaggio in vettore di espressione Clonaggio in vettore di espressione * Trasfezione Molecola antisenso Trasfezione Trascrizione Splicing Cellule COS-1 (rene) Cellule HepG2 (fegato) Molecola antisenso * Transcription Splicing Analisi dell mrna Analisi dell mrna Esone 8 Esone 9 mrna normale Esone 8 Esone 9 mrna normale

Correzione dello splicing con morfolino Mutant F5 minigene Wild-type F5 minigene Mutant F5 minigene M Untr. R-MO 1 µm R-MO 5 µm R-MO 10 µm Blanks M M Untr. R-MO 5 µm C-MO 5 µm Untr. R-MO 5 µm C-MO 5 µm Blanks M Aberrant mrna Normal mrna Mutant F5 minigene Wild-type F5 minigene Mutant F5 minigene Aberrant mrna / Normal mrna 10 1 0.1 0.01 Untr. R-MO 1 µm 15x R-MO 5 µm 34x R-MO 10 µm 103x Aberrant mrna / Normal mrna 10 1 0.1 0.01 Untr. R-MO 5 µm C-MO 5 µm Untr. R-MO 5 µm 28x C-MO 5 µm Nuzzo et al. Blood 2013

Correzione dello splicing con U7snRNA Mutant F5 minigene Wild-type F5 minigene Mutant F5 minigene M Untr. R-U7 0.25 µg R-U7 0.5 µg R-U7 1 µg R-U7 2 µg Blanks M M Untr. R-U7 2µg C-U7 2 µg Untr. R-U7 2 µg C-U7 2 µg Blanks M Aberrant mrna Normal mrna Mutant F5 minigene Wild-type F5 minigene Mutant F5 minigene Aberrant mrna / Normal mrna 100 10 1 0.1 0.01 Untr. R-U7 R-U7 R-U7 R-U7 Untr. R-U7 C-U7 Untr. 0.25 µg 0.5 µg 1 µg 2 µg 2 µg 2 µg 100 10 1 20x 30x 62x 0.1 83x 0.01 Aberrant mrna / Normal mrna R-U7 2 µg 106x C-U7 2 µg Nuzzo et al. Blood 2013

Modello ex vivo (I) Campione di sangue Buffy coat Centrifugazione a 250g per 10 min Stratificazione su Histopaque Cellule mononucleate (incl. progenitori ematopoietici) Cultura cellulare Medium serum-free +TPO & IL-3 5 giorni 10 giorni 15 giorni Radu et al. In preparazione

Modello ex vivo (II) Contrasto di interferenza Staining dei nuclei Staining del FV Controllo normale Paziente con difetto di FV Radu et al. In preparazione

Risultati modello ex vivo Paziente non trattato Paziente 5 µm R-MO Paziente 0.4 µg R-U7 Il trattamento con molecole antisenso specifiche per la mutazione ripristina l espressione del FV nei megacariociti del paziente! Nuzzo et al. Blood 2013

Conclusioni La mutazione F5 IVS8+268A>G introduce un sito donatore di splicing nell introne 8, causando l inclusione di uno pseudo-esone con un codone di stop in-frame nell mrna maturo MO and U7snRNA antisenso diretti contro questo sito di splicing inducono lo splicing normale del pre-mrna mutato in vitro e ripristinano l espressione del FV nei megacariociti del paziente ex vivo Questi risultati forniscono una prova di principio dell efficacia della terapia antisenso nel difetto di FV

Ringraziamenti CARIM, Maastricht University Maastricht, The Netherlands Francesca Nuzzo Connie Duckers Tilman M. Hackeng Jan Rosing Padua University Medical School Padua, Italy Claudia Radu Luca Spiezia Paolo Simioni International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology Trieste, Italy Marco Baralle Francisco E. Baralle VIDI grant no. 917-76-312 Grazie per l attenzione!